细菌细胞外囊泡(EV)是脂质班,在毒力,种间竞争以及诱导宿主免疫反应中起着作用。尽管它们主要是在动物 - 细菌相互作用中进行了研究的,但有关植物细菌电动汽车的知识仍然有限。最近的发现表明,羟基苯甲酸等各种生物因素可以调节电动汽车的产生。羟基霉素(例如阿魏酸)是在植物环境中大量释放的木质素成分,它们会影响许多植物杆菌的生态。azospirillum sp。b510,一种植物素细菌,诱导植物中羟基霉素衍生物的积累,并可以将其代谢为碳源。我们假设在氮杂硫酸属的环境中,阿魏酸的存在。b510将在规模,数量和货物方面影响其电动汽车生产。相反,我们还提出,该植物杆菌的电动汽车会影响植物代谢产物和防御基因表达。我们的结果表明,阿魏酸(模仿植物环境)会影响Azospirillum sp。释放的电动汽车的含量。b510和细菌电动汽车还根据其货物在全身性水平上影响植物生理。这项研究提供了第一个证据,证明了细菌电动汽车对植物的全球作用,并突出了电动汽车介导的植物 - 细菌相互作用的动力学。
非侵入性收集的粪便样品是组织样品的DNA的替代来源,当动物直接采样时,可以在野生动植物的遗传研究中使用。尽管存在几种粪便DNA提取方法,但它们的功效在物种之间有所不同。先前从野生粪粪(Dugong Dugon)粪便中扩增线粒体DNA(mtDNA)标志物的尝试有限,核标记(微片齿)未能成功。这项研究旨在通过修改其他大型草食动物的研究中使用的方法来建立一种从粪便粪便中对MTDNA和核DNA(NDNA)进行采样的工具。首先,开发了一种简化的,具有成本效益的DNA提取方法,该方法能够从大量的粪便中扩增线粒体和核标记。粪便DNA使用新的“高体积 - cetyltrimethyl溴化铵 - 苯酚 - 氯仿 -
摘要:信息提取(IE)是自然语言处理(NLP)和计算机视觉的基本任务,旨在自动从非结构化数据源(例如文本,图像和视频)中提取结构化信息。本文对各种IE技术进行了全面的调查,重点介绍了指定的实体识别(NER),关系提取(RE)和意见分类。我们讨论了基于规则的,无监督,监督和深度学习方法,以突出其优势和局限性。此外,我们还探讨了IE在不同应用中的作用,包括学术文献数据库,商业智能,医疗保健,专利分析和客户服务。此外,我们研究了应用于图像和视频的IE方法,涵盖了视觉关系检测,光学特征识别(OCR)和自动视频摘要。本文还解决了诸如域适应,模棱两可,数据隐私和计算效率之类的挑战。最后,我们概述了未来的研究方向,强调了多模式IE的整合,深度学习的进步和实时处理。关键字:信息提取(IE),命名实体识别(NER),关系提取(RE),意见分类,基于特征的监督学习,IE深度学习,文本挖掘,光学角色识别(OCR)和自然语言处理(NLP)。I.简介信息提取(IE)是从非结构化或半结构化数据源(例如文本文档,图像和视频)中自动识别,提取和构造相关信息的过程。它涉及将原始数据转换为有意义的结构化表示形式的技术,从而促进了下游任务,例如知识图构造,问题答案和信息检索[1]。IE主要着重于提取特定类型的信息,包括:
在将其用于关键应用程序之前,请始终验证使用文档信息提取服务提取的信息。当我们争取最高的准确性和质量时,请注意,提供的提取结果可能并非完全没有错误。此限制适用于标准和自定义文档类型。它也适用于所有可用的提取方法 - 换句话说,该服务的机器学习模型,生成AI和模板。
该方案描述了从多种不同物种的多个不同组织样品中手动提取HMW DNA,不包括植物和真菌,用于使用Qiagen MagAttract HMW DNA提取试剂盒进行长阅读测序。此过程对于生命之树计划所涵盖的各种分类群体都是有效的。该方案对于组织可用性有限的样品特别有用,因为它始终从这些较小的样品中产生的DNA比等效的自动化方法更多。The output of this protocol is HMW DNA, which depending upon yield and the genome size of the species, can be directed towards HMW DNA Pooling, HMW DNA Fragmentation: Diagenode Megaruptor® 3 for LI HiFi, HMW DNA Fragmentation: Diagenode Megaruptor® 3 for LI PacBio or HMW DNA Fragmentation: g-Tube for ULI PacBio.
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Agarwood以香气而闻名,被认为是最昂贵的树木之一。通过涉及注射微生物或损害树木的昂贵过程获得了这种香气。大约15岁的阿加伍德树在印度尼西亚西苏门答腊省的萨瓦伦托的一个以前的煤矿区蓬勃发展。这种特定的树发出芬芳的香气,而无需任何注射过程。环境特征似乎会影响阿加木生长期间的代谢系统。在这项研究中,使用气相色谱法和质谱法(GC/MS)表征了萨瓦·伦托(Sawah Lunto)以前的煤矿开采中种植的琼脂中的化合物。还使用X射线光谱法分析了土壤肖像。此外,已在体外测试了来自Agarwood的提取物的抗菌能力。结果,研究地点的土壤包含多个要素,包括AI(2.81%),SI(11.79%),S(0.16%),K(0.99%),CA(0.73%),Ti(0.31%),MN(0.31%),MN(0.08%),Fe(4.57%),Fe(4.57%),Ba(4.57%),Ba(0.11%)和0.11%和0.11%(0.11%)。分析结果表明,琼脂中的化合物可能是由于高铁引起的环境压力引起的。此外,源自琼脂树的sapwood的琼脂二次代谢物被鉴定为1,2-二氢-8-羟基羟基学,而9,10-二氢脱氧化烯醇,这意味着它是Agarwood的特定化合物,具有特定的高量高浓度。此外,提取的树脂具有抗菌特性,这证明了其能够打击具有强活性的大肠杆菌细菌。©2025 SPC(SAMI Publishing Company),《亚洲绿色化学杂志》,用于非商业目的。
要通过分子方法研究海洋环境中的微生物群落,重要的是要以足够的量和纯度提取DNA。样品中抑制剂的存在可能导致虚假的阴性结果或信息丢失,但可以通过实验中的过程控制来突出显示。我们比较了海洋样品上的七种细菌DNA提取方法:鱼皮,g和胆量,软体动物肉,浮游植物和浮游动物。在一半的样品中添加了一个过程控制(单核细胞增生李斯特菌)。比较了DNA提取方法的性能,以产生针对细菌TUF基因和过程控制Hlya基因的QPCR扩增的更纯和浓缩的DNA。通过分光光度法测定测定DNA的纯度和浓度。结果表明,使用PowerBiofilm和Purelink微生物组试剂盒获得了最高纯度和浓度DNA。QPCR数据证实了这些试剂盒以更高的扩增效率产生了更好的细菌DNA纯度和浓度。在某些样品中,通过靶向Hlya基因的QPCR检测到抑制剂的存在,表明样品是被抑制剂污染的异质性。DNA提取物适用于海洋环境中的遗传下游应用。
与研磨过程。我通常更喜欢类似于水稻颗粒的沉淀尺寸,无论是冷冻的还是新鲜的。我去除了多余的液体,因为它使磨石变得困难(藻类倾向于漂浮!)。我检查了显微镜下的样品,以评估磨削的进展,并观察CTAB溶液的绿色。通常,我将每个样品磨碎大约一分钟。•或者,您可以使用自动涡流适配器(例如Mobio)同时处理多个样本。沉淀后,将二氧化硅砂和细胞与CTAB放在管中。让其在架子上站立5分钟,然后将其转移到热块20分钟。如果CTAB缓冲区在此步骤之后没有变成绿色,请重复涡旋过程。一般规则,尤其是在仅氯仿提取物中,添加更多的组织可以产生更多的DNA到一定点,但它还增加了样品中污垢或杂质的量。DNA中的残基可以氧化样品,从而导致降解,并且可能会干扰下游应用中使用的酶。因此,必须在所用的组织量与提取的DNA质量之间找到适当的平衡,以确保在进一步的实验中获得可靠的结果。
添加到1.5毫升管中。血液:在13,000rpm处离心血液样本约1分钟(到颗粒样品)。用牙签从乙醇中取出样品,然后将其印迹到组织中。几乎干燥后,将牙签转移到1.5ml管中,然后摇晃以脱落血液。取出牙签并放入消毒剂中。拭子:乙醇干燥并放入1.5毫升管中。从交换的末端扣下来,以便盖子可以关闭。羽毛:将1-3羽羽毛的鱿鱼切成小块,在无菌玻璃板上用无菌剃刀刀片切成小块,然后再添加到管中。如果羽毛很小并且尖端上存在血斑,则可以添加羽毛。