该文件计划于 2025 年 2 月 5 日在《联邦公报》上公布,并可在 https://federalregister.gov/d/2025-02234 和 https://govinfo.gov 上查阅。
乳腺癌是影响女性健康的最常见疾病之一。近年来对乳腺癌的研究取得了进展,但仍然是一个主要的健康问题。研究表明,翻译起始因子EIF4A3与肿瘤的发生和发育密切相关,但特定机制尚不清楚。在这项研究中,我们旨在探索EIF4A3的特定分子机制,以促进体内和体外乳腺癌的恶性过程。我们的结果表明,在乳腺癌中,EIF4A3的表达显着上调,EIF4A3的过表达可以加速乳腺癌细胞的生长。RIP-SEQ和RIP-RT-QPCR分析表明,EIF4A3可以与CDC5L的mRNA结合并影响其表达。 从catrapid中,我们预测EIF4A3-蛋白可以与Cdc5l-MRNA的5705-5954区域结合Cdc5l。 CDC5L是EIF4A3的下游效应子。 这些结果表明EIF4A3-CDC5L轴促进了乳腺癌细胞的增殖。 这项研究为理解EIF4A3在乳腺癌的恶性过程中的作用提供了理论基础。RIP-SEQ和RIP-RT-QPCR分析表明,EIF4A3可以与CDC5L的mRNA结合并影响其表达。从catrapid中,我们预测EIF4A3-蛋白可以与Cdc5l-MRNA的5705-5954区域结合Cdc5l。CDC5L是EIF4A3的下游效应子。这些结果表明EIF4A3-CDC5L轴促进了乳腺癌细胞的增殖。这项研究为理解EIF4A3在乳腺癌的恶性过程中的作用提供了理论基础。
DNA是一种用于在生物体中携带遗传信息的核酸。这是一种由两个可能的氮基形成的双链分子,即抑制碱(腺嘌呤和鸟嘌呤)和嘧啶(胞嘧啶 - 胸腺素)和两个化学上极性末端,即5'和3'。watson -Crick互补(WCC)的关系,其特征为C = T,G C = C,反之亦然,用于结合DNA的碱基。在1994年,Adleman [1]讨论了使用DNA分子的汉密尔顿路径问题。通过在DNA分子中编码一个小图来解决此(NP完整)问题,其中使用标准方案(例如WCC关系)进行了所有操作。由于大规模的并行性,DNA计算成为研究人员中有强大的工具,以解决计算上的困难问题。此外,对合成的DNA和RNA分子进行了实验,以控制其组合约束,例如恒定的GC - 含量和锤击距离。线性代码已探索了近三十年,但是该研究领域在Hammons等人的出色工作之后经历了惊人的速度。[2]当他们在z 4上建立线性代码与其他非线性二进制代码之间的关系时。之后,许多作者[3-6]都考虑了具有环结构的字母,并通过特定的灰色图发现了许多有限端的线性代码。在线性代码类别中,由于其理论丰富性和实际实现,环状代码是关键和研究最多的代码。最近,许多作者[7 - 13]使用环上的环状代码构建了DNA代码。例如,Bayram等。[7]和Yildiz和Siap [13]分别探索了环F 4 + V F 4,V 2 = V和F 2 [V] /⟨V 4-1⟩的DNA代码。在2019年,Mostafanasab和Darani [12]讨论了链环F 2 + U F 2 + U 2 F 2上的环状DNA代码的结构。Liu等。 [14]在f 4 [u] /⟨u 3⟩上的奇数长度的循环DNA代码上工作。 另一方面,Boucher等人。 [15]引入了偏斜的循环代码,并发现了许多新的线性代码。 此外,在[16,17]中,已经建立了这些代码的更多特性。 最近,Gursoy等。 [18]使用偏斜的循环代码研究了可逆的DNA代码。 后来,Cengellenmis等。 [19]从环上的偏斜循环代码f 2 [u,v,w]研究了DNA代码,其中u 2 = v 2 + v = w 2 + w =Liu等。[14]在f 4 [u] /⟨u 3⟩上的奇数长度的循环DNA代码上工作。另一方面,Boucher等人。[15]引入了偏斜的循环代码,并发现了许多新的线性代码。此外,在[16,17]中,已经建立了这些代码的更多特性。最近,Gursoy等。[18]使用偏斜的循环代码研究了可逆的DNA代码。后来,Cengellenmis等。[19]从环上的偏斜循环代码f 2 [u,v,w]研究了DNA代码,其中u 2 = v 2 + v = w 2 + w =
引言三阴性乳腺癌(TNBC)是由缺乏雌激素受体(ER),孕酮受体(PR)或人表皮生长因子受体2(HER2)所定义的异质乳腺癌组,并将其最小分类为4个基因组亚型(1)。TNBC患者在用新辅助蒽环类药物/含巨烷烷烷/含巨烷的治疗方案(2)治疗时,患者的病理完全反应(PCR)为30%至53%,最近,在用免疫检查点阻断(ICB)(ICB)治疗后,在一部分患者的PCR率中,PCR率得到了改善(3)。在用抗体毒物结合物(4)或ICB结合PD-L1 + TNBC中的化学疗法(5,6)中,也有最近改进的改进。但是,迫切需要确定可以增强对化疗和免疫疗法反应的治疗脆弱性和治疗方法。
上皮增殖和异常的Wnt信号通路可调节粘液卵巢癌的化学抗性(10-12)。环手指蛋白43(RNF43)是位于17q22染色体的E3泛素连接酶基因,对Wnt信号通路负面控制(13)。RNF43的失调导致Wnt信号通路的持续激活(14)。RNF43基因突变经常在卵巢和其他器官的粘液肿瘤中发现(15-21)。研究表明,Wnt信号通路靶向治疗可能是对癌症的有效治疗方法,尤其是在RNF43突变的癌症中(22-27)。RNF43蛋白表达功能的功能丧失可以预测胃癌,结肠癌,胆管癌和神经胶质瘤患者的预后不良(28-31)。但是,关于RNF43和MOC作为预后因素的关联的研究很少。因此,本研究的目的是评估MOC中的表达RNF43蛋白并评估预后意义。
(a)果蝇和D. ananassae中eIF4E1基因组社区的同步比较。薄的下面箭头指示了DNA链,其中基因– EIF4E1位于D. melanogaster(顶部)和D. ananassae(底部)基因组中。指向左侧的细箭头表明eif4e1在D. ananassae和D. melanogaster中的负( - )链上。指向EIF4E1的方向相同方向的宽基因箭头相对于薄的下层箭头在相同的链上,而指向EIF4E1相反方向的宽基因箭头相对于薄的底层箭头相反。白色基因箭头D. Ananassae表示与Melanogaster中相应基因的矫形学。D. ananassae基因箭头中给出的基因符号表示D. melanogaster中的直系同源基因,而基因座标识符是特定于D. ananassae的。(b)GEP UCSC轨道数据中心中的基因模型(Raney等,
摘要 克罗恩病 (CD) 患者的肠粘膜被粘附侵袭性大肠杆菌 (AIEC) 异常定植。AIEC 感染后,宿主细胞中会诱导自噬以抑制细菌细胞内的复制。但其潜在机制仍然未知。在这里,我们研究了 EIF2AK4-EIF2A/eIF2 a -ATF4 通路在 AIEC 感染自噬反应中的作用。我们发现,用 AIEC 参考菌株 LF82 感染人肠上皮 T84 细胞会激活 EIF2AK4-EIF2A-ATF4 通路,磷酸化 EIF2AK4、磷酸化 EIF2A 和 ATF4 水平升高就是明证。EIF2AK4 耗竭抑制了 LF82 感染后自噬激活,导致 LF82 细胞内复制增加和促炎细胞因子产生增加。从机制上讲,EIF2AK4 耗竭抑制了 LF82 诱导的 ATF4 与多个自噬基因(包括 MAP1LC3B、BECN1、SQSTM1、ATG3 和 ATG7 )的启动子结合,进而抑制了这些基因的转录。LF82 感染野生型 (WT) 而非 eif2ak4 ¡ / ¡ ,小鼠激活了 EIF2AK4-EIF2A-ATF4 通路,诱导了肠细胞中的自噬基因转录和自噬反应。因此,eif2ak4 ¡ / ¡
摘要:肝细胞癌 (HCC) 是一种原发性肝脏肿瘤,死亡率高,全球发病率不断上升。虽然肿瘤切除或肝移植在疾病早期有效,但晚期 HCC 的治疗选择仍然有限,且益处是暂时的。因此,迫切需要新的治疗靶点和更有效的治疗方法来对抗这种致命的癌症。在这里,我们研究了真核起始因子 4A1 (eIF4A1) 在这种肿瘤类型中的致病和治疗作用。我们观察到与非肿瘤周围肝组织相比,HCC 病变中 eIF4A1 持续上调。此外,eIF4A1 水平与 HCC 患者的预后呈负相关。在 HCC 系中,暴露于各种 eIF4A 抑制剂会引发增殖显著下降和细胞凋亡增强,同时抑制几种致癌途径。值得注意的是,eIF4A1 抑制剂在纳摩尔浓度下即可达到抗生长效果,同时使用泛 mTOR 抑制剂 Rapalink-1 可进一步增强抗生长效果。总之,我们的研究结果强调了 eIF4A1 在 HCC 中的致病相关性,并建议进一步评估基于 eIF4A 和 mTOR 抑制剂的药物组合在治疗这种侵袭性肿瘤方面的潜在用途。
(A) 果蝇 (Drosophila melanogaster) 和果蝇 (D. yakuba) 中 eIF4E1 基因组邻域的同源性比较。细箭头表示果蝇 (D. melanogaster) (顶部) 和果蝇 (D. yakuba) (底部) 基因组中参考基因 eIF4E1 所在的 DNA 链。指向右侧的细箭头表示 eIF4E1 在果蝇 (D. melanogaster) 中位于正 (+) 链上,指向左侧的细箭头表示 eIF4E1 在果蝇 (D. yakuba) 中位于负 (-) 链上。指向与 eIF4E1 相同方向的宽基因箭头相对于细箭头位于同一链上,而指向与 eIF4E1 相反方向的宽基因箭头相对于细箭头位于相反链上。果蝇 (D. yakuba) 中的白色基因箭头表示与果蝇 (D. melanogaster) 中相应基因的直系同源。 D. yakuba 基因箭头中给出的基因符号表示 D. melanogaster 中的直系同源基因,而基因座标识符特定于 D. yakuba。(B)GEP UCSC Track Data Hub 中的基因模型(Raney 等人,2014 年)。D. yakuba 中 eIF4E1 的编码区显示在用户提供的 Track(黑色)中;CDS 用粗矩形表示,内含子用细线表示,箭头表示转录方向。后续证据轨迹包括 NCBI RefSeq 基因的 BLAT 比对(深蓝色,D. yakuba 的 Ref-Seq 基因比对)、D. melanogaster 蛋白质的 Spaln(紫色,D. melanogaster 的 Ref-Seq 蛋白质比对)、TransDecoder 预测的转录本和编码区(深绿色)、成年雌性和成年雄性的 RNA-Seq(分别为红色和浅蓝色;D. yakuba 的 Illumina RNA-Seq 读段比对)以及使用 D. yakuba RNA-Seq (SRP006203 - Graveley et al, 2010) 通过 regtools 预测的剪接点。显示的剪接点分别具有 232、500-999 和 >1000 的读取深度,支持读取为粉色、棕色和红色。 (C) 果蝇 (D. melanogaster) 中的 eIF4E1-PB (x 轴) 与果蝇 (D. yakuba) 中的直系同源肽 (y 轴) 的点图。左侧和底部表示氨基酸编号;顶部和右侧表示 CDS 编号,CDS 也以交替颜色突出显示。序列相似性降低的区域用红色圈出。 (D) 果蝇 (D. melanogaster) 中的 eIF4E1-PC (x 轴) 与果蝇 (D. yakuba) 中的直系同源肽 (y 轴) 的点图。序列相似性降低的区域用红色圈出。
其他人Maimuna S Paul,Anne。 Agolini, Antonio Neveli, Ulrique, Tobias B Haack, Wolfram Heinritz, Eva Matzker, Alhaddad Bader, Rami Abou Jamra, Tobias Bartolomaeus, Saber AlHamdan, Raphael Carapito, Bertrand Isidor, Seamak Bahram, Ortal Barel,Bruria Begrup,Deanna Alexis Carere,Sureni V Mullama,Timothy Blake Palcullic,Daniel G Camegame,Schwaness。 Izmayilova,Banka Siddharth,Low-Tuan和Pankaj B Agrawal
