•将胰腺外分泌细胞转化为糖尿病治疗的新β小岛细胞•将耳蜗非感官细胞转化为新毛细胞,以恢复听力损失•我们使用生物信息学和高吞吐量组合筛选以识别mRNA组合以识别细胞重编程
一个部门基因和环境,麦克斯·普朗克精神病学研究所,德国慕尼黑80804。b国际马克斯·普朗克(Max Planck)转化精神病学研究院(RIVS-TP),80804,德国慕尼黑。C计算生物学研究所,计算健康中心,Helmholtz Munich,85764,德国Neuherberg。 d Tum Life Sciences Weihenstephan,慕尼黑技术大学,85354,德国Freising。 e瑞典斯德哥尔摩卡罗林斯卡研究所生理学和药理学系。 f生理基因组学,生物医学中心(BMC),LMU慕尼黑医学学院,82152,PlaneGG-Martinsried,德国。 G Max Planck精神病学研究所,德国慕尼黑80804。 H TUM计算,信息和技术学院,慕尼黑技术大学,85748,德国Garching Bei Muenchen。C计算生物学研究所,计算健康中心,Helmholtz Munich,85764,德国Neuherberg。d Tum Life Sciences Weihenstephan,慕尼黑技术大学,85354,德国Freising。e瑞典斯德哥尔摩卡罗林斯卡研究所生理学和药理学系。f生理基因组学,生物医学中心(BMC),LMU慕尼黑医学学院,82152,PlaneGG-Martinsried,德国。G Max Planck精神病学研究所,德国慕尼黑80804。H TUM计算,信息和技术学院,慕尼黑技术大学,85748,德国Garching Bei Muenchen。
1)瑞士苏黎世大学实验免疫学研究所。2)瑞士苏黎世大学疾病分子机制。3)瑞士苏黎世分子生命科学系4)奥地利科学学院(IMBA)的分子生物技术研究所,维也纳生物中心(VBC),维也纳,奥地利,奥地利。5)欧洲分子生物学实验室,EMBL罗马 - 意大利蒙特诺多的表观遗传学和神经生物学单位。6)荷兰乌得勒支大学生物学与生物复杂研究所,生物动力与生物复杂研究所,荷兰乌特雷赫特生物学系。7)新星科学技术学院,葡萄牙2829 - 516年,新星科学技术学院生命科学学院,诺维亚科学与技术学院生命科学系, 7)。 8)副实验室I4HB - 诺斯博亚大学科学技术学院卫生与生物经济学研究所,葡萄牙2829-516 CAPARICA,葡萄牙7)。8)副实验室I4HB - 诺斯博亚大学科学技术学院卫生与生物经济学研究所,葡萄牙2829-516 CAPARICA,葡萄牙
*信函的作者:patrick.laufs@inrae.fr A.N.,P.L。和A.M.C.构思了该项目和P.L.监督该项目。A.N. 在P.L.,A.M.C.,A.M.B。和M.S.的帮助下进行了大多数实验。 在S.B的监督下执行了Y1H屏幕。 A.M.C. 进行了初步的遗传分析。 B.A. 有助于产生双突变体和转基因线。 L.C. 构思了整个原位协议并监督A.N. 为此。 yu.l. 在Y.L的监督下进行了凝胶移位实验。 J.B.写了荧光平均脚本。 A.N. 和P.L. 用AMC的输入写了这篇文章。 根据作者指示(https://academic.up.com/plcell)中描述的政策,负责分配本文提出的材料积分不可或缺的材料的作者。A.N.在P.L.,A.M.C.,A.M.B。和M.S.的帮助下进行了大多数实验。在S.B的监督下执行了Y1H屏幕。A.M.C. 进行了初步的遗传分析。 B.A. 有助于产生双突变体和转基因线。 L.C. 构思了整个原位协议并监督A.N. 为此。 yu.l. 在Y.L的监督下进行了凝胶移位实验。 J.B.写了荧光平均脚本。 A.N. 和P.L. 用AMC的输入写了这篇文章。 根据作者指示(https://academic.up.com/plcell)中描述的政策,负责分配本文提出的材料积分不可或缺的材料的作者。A.M.C.进行了初步的遗传分析。B.A. 有助于产生双突变体和转基因线。 L.C. 构思了整个原位协议并监督A.N. 为此。 yu.l. 在Y.L的监督下进行了凝胶移位实验。 J.B.写了荧光平均脚本。 A.N. 和P.L. 用AMC的输入写了这篇文章。 根据作者指示(https://academic.up.com/plcell)中描述的政策,负责分配本文提出的材料积分不可或缺的材料的作者。B.A.有助于产生双突变体和转基因线。L.C. 构思了整个原位协议并监督A.N. 为此。 yu.l. 在Y.L的监督下进行了凝胶移位实验。 J.B.写了荧光平均脚本。 A.N. 和P.L. 用AMC的输入写了这篇文章。 根据作者指示(https://academic.up.com/plcell)中描述的政策,负责分配本文提出的材料积分不可或缺的材料的作者。L.C.构思了整个原位协议并监督A.N.为此。yu.l.在Y.L的监督下进行了凝胶移位实验。J.B.写了荧光平均脚本。A.N. 和P.L. 用AMC的输入写了这篇文章。 根据作者指示(https://academic.up.com/plcell)中描述的政策,负责分配本文提出的材料积分不可或缺的材料的作者。A.N.和P.L.用AMC的输入写了这篇文章。根据作者指示(https://academic.up.com/plcell)中描述的政策,负责分配本文提出的材料积分不可或缺的材料的作者。
摘要:尽管金属果用于治疗各种人类疾病并表现出显着的治疗特性,但它们仅占目前市场上所有药物的少数。这种不受欢迎的情况必须部分归因于我们普遍缺乏理解金属果的命运在血液中极为丰富的配体环境中。可以通过应用“金属学工具”来克服对这些生物无机过程的了解的挑战,这些工具涉及生物液的分析(例如血浆)具有分离方法与多元素特定探测器结合使用。为此,我们开发了一种基于与电感耦合等离子体原子发射光谱仪(ICP-AES)的尺寸排斥色谱(SEC)的金属学工具。成功地应用了SEC-ICP-AE在分析内源性铜,铁和锌 - 甲甲蛋白的血浆后,随后将其用于探测血浆中多种基于金属的抗癌药物的代谢。The versatility of this metallomics tool is exemplified by the fact that it has provided insight into the metabolism of individual Pt-based drugs, the modulation of the metabolism of cisplatin by sulfur-containing compounds, the metabolism of two metal-based drugs that contain different metals as well as a bimetallic anticancer drug, which contained two different metals.这种独特的能力允许对血浆中金属药物的命运进行全面了解,并可以扩展到体内研究。在将药理学相关剂量的金属果剂量添加到血浆中后,Secp-AES对等分试样的时间分析允许观察金属 - 蛋白质加合物,金属脱脂衍生的降解产物和父级金属dy剂。因此,该金属学工具在血浆中探测新型金属复合物的命运,这些新型金属复合物的命运具有所需的生物学活性的潜力,有可能将更多的基于金属的药物推向动物/临床前研究,以充分探索金属dmelodrugs固有提供的潜力。
3 Oxford Immune Algorithmics, Reading, UK ABSTRACT This study employs systems medicine approaches, including complex networks and machine learning- driven discovery, to identify key biomarkers governing phenotypic plasticity in pediatric high-grade gliomas (pHGGs), namely, IDHWT glioblastoma and H3K27M diffuse intrinsic pontine glioma (DIPG).通过整合单细胞转录组学和组蛋白质量细胞术数据,我们将这些侵略性肿瘤概念化为复杂的自适应生态系统,该系统由被劫持的oncofetal发育程序和病理吸引力动力学驱动。Our analysis predicts lineage-plasticity markers, including KDM5B (JARID1B), ARID5B, GATA2/6, WNT, TGFβ, NOTCH, CAMK2D, ATF3, DOCK7, FOXO1/3, FOXA2, ASCL4, PRDM9, METTL5/8, RAP1B, CD99, RLIM, TERF1, and LAPTM5, as drivers of细胞命运控制论。此外,我们确定了内源性生物电特征,包括Grik3,Grin3,Slc5a9,Nkain4和KCNJ4/6,是潜在的重编程靶标。此外,我们验证了先前发现的可塑性基因,例如PDGFRA,EGFR靶标,OLIG1/2,FXYD5/6,MTSSS1,SEZ6L,MTRN2L1和SOX11,证实了我们复杂系统方法的鲁棒性。此系统肿瘤学框架为精确医学提供了有前途的途径,通过指导由单细胞多摩学告知的组合疗法来优化患者的结果,并以PHGG表型可塑性为治疗性脆弱性。此外,我们的发现表明肿瘤表型可塑性(即过渡疗法)和PHGG生态系统中疾病的表观遗传重编程性能朝向稳定的,转分化的状态。因此,了解关键字:小儿神经胶质瘤;表型可塑性;癌症多组学;数据科学;系统医学;精度肿瘤学。引言小儿高级神经胶质瘤(PHGGS)代表致命疾病,没有任何精确诊断,有效的治疗或预防(Swanton等,2024)。这些侵略性肿瘤破坏了发育过程和组织稳态,导致形态发生,对治疗的抵抗力和免疫逃避(Senft等,2017; Jessa等,2019)。对其病理学的中心是表型可塑性 - 细胞在谱系身份之间适应响应微环境压力的能力。This plasticity arises from epigenetic dysregulation, such as oncohistone mutations like H3K27M (H3F3A) and driver mutations like TP53, ACVR1, etc., which destabilize chromatin structure, trapping cells in metastable, multipotent states and impairing their differentiation hierarchy (Shpargel et al., 2014; Paugh et al., 2011; Jessa et al., 2019)。实际上,这些塑料状态促进了肿瘤的进展和耐药性作为新兴行为,从而创造了不稳定的生态系统。
[14 C] -Izencitinib。在人粪便,血浆和尿液中的代表性放射击图如图s1至S3。在血浆中,观察到以下代谢产物,并总结在表1:M1(N-甲基化),M6(羟基化)(羟基化),M9(甲基化,环化和氧化),M10(甲基化和环化),M11(Formylation和Dimeration和Dimeration),M12(M12(M12)(M12(Hydroxylation))和M18(盐)和M18(盐)和M18。在血浆中没有代谢物在与药物相关的总暴露量的10%或更高时期循环。不变的Izencitinib占总循环放射性的7.2%,两种最丰富的代谢产物代表7.8%(M18)和5.3%(M12)的循环放射性。几个
mTORC1 和 AMPK 是相互拮抗的营养和能量状态传感器,与许多人类疾病有关,包括癌症、阿尔茨海默病、肥胖症和 2 型糖尿病。社会性变形虫 Dictyostelium discoideum 的饥饿细胞会聚集并最终形成由柄细胞和孢子组成的子实体。我们关注如何实现细胞命运的这种分歧。在生长过程中,mTORC1 高度活跃,而 AMPK 相对不活跃。饥饿时,AMPK 被激活而 mTORC1 被抑制;细胞分裂被阻止并诱导自噬。聚集后,少数细胞(前柄细胞)继续表达与聚集期间相同的发育基因集,但大多数细胞(前孢子细胞)切换到前孢子程序。我们描述了表明过表达 AMPK 会增加前柄细胞比例的证据,抑制 mTORC1 也会增加前柄细胞的比例。此外,刺激细胞内酸性区室的酸化同样会增加前柄细胞的比例,而抑制酸化则有利于孢子途径。我们得出结论,细胞分化的前柄途径和前孢子途径之间的选择可能取决于 AMPK 和 mTORC1 活性的相对强度,这些活性可能受细胞内酸性区室/溶酶体 (pHv) 的酸度控制,pHv 低的细胞具有高 AMPK 活性/低 mTORC1 活性,pHv 高的细胞具有高 mTORC1/低 AMPK 活性。深入了解这种转换的调节和下游后果应该会提高我们对其在人类疾病中潜在作用的理解,并指出可能的治疗干预措施。
间充质干细胞 (MSC) 分化为不需要的谱系可能会在临床试验中产生潜在问题。因此,了解此过程中涉及的分子机制将有助于防止意外并发症。在转录后水平上调节基因表达是细胞疗法的一种新方法。PUMILIO 是一种保守的转录后调节剂。然而,在脊椎动物干细胞中,PUMILIO 的潜在机制仍然难以捉摸。在这里,我们表明 PUMILIO2 (PUM2) 的消耗会阻止 MSC 脂肪生成并增强成骨作用。我们还证明 PUM2 通过直接结合作为 JAK2 和 RUNX2 的 3' UTR 的负调节剂。CRISPR/CAS9 介导的 Pum2 基因沉默抑制了斑马鱼幼虫的脂质积累并诱导了过度的骨形成。我们的研究结果揭示了 PUM2 在 MSC 中的新作用,并为相关疾病提供了潜在的治疗靶点。
神经干细胞(NSC)由于其强大的神经保护性和再生性质而成为细胞治疗的候选者的非常重要的希望。使用NSC的临床前研究表明,有足够的令人鼓舞的结果,可以对更深入的临床应用进行更深入的研究。 然而,我们对神经发生及其潜在机制的了解仍然不完整。 为了更好地理解它们,似乎有必要表征神经干细胞生态位的所有组成部分,并发现它们在生理和病理学中的作用。 使用NSC在体内带来挑战,包括有限的细胞存活和宿主组织内的整合不足。 识别可能影响这些结果的被忽视因素变得关键。 在这篇综述中,我们对大脑中存在的基本元素,脑脊液(CSF)的影响进行了更深入的研究,该元素仍然相对尚未探索。 其在神经发生中的作用可能有助于帮助找到神经系统疾病的新型治疗解决方案,最终促进了我们对中枢神经系统(CNS)再生和修复的知识。使用NSC的临床前研究表明,有足够的令人鼓舞的结果,可以对更深入的临床应用进行更深入的研究。然而,我们对神经发生及其潜在机制的了解仍然不完整。为了更好地理解它们,似乎有必要表征神经干细胞生态位的所有组成部分,并发现它们在生理和病理学中的作用。使用NSC在体内带来挑战,包括有限的细胞存活和宿主组织内的整合不足。识别可能影响这些结果的被忽视因素变得关键。在这篇综述中,我们对大脑中存在的基本元素,脑脊液(CSF)的影响进行了更深入的研究,该元素仍然相对尚未探索。其在神经发生中的作用可能有助于帮助找到神经系统疾病的新型治疗解决方案,最终促进了我们对中枢神经系统(CNS)再生和修复的知识。