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一步FFPE RNA提取套件 - 用户指南
首先，FFPE样品进行了优化的非链接，然后进行组织裂解，PAR伴侣和去污剂去除。在短离心后，将下水相转移到新的管中，并用DNase处理以去除基因组DNA。然后将裂解物进行创新的一步纯化技术。样品被加载到保留细胞碎屑和杂质的纯化中，而RNA则通过基质自由迁移到流通液中。该方法仅需要一个快速离心步骤，与传统的二氧化硅方法相比，在整体和动手时间上都显着降低了。由于传统的结合洗流行程序被一步纯化取代，因此也会导致塑料废物的减少。此外，该协议利用了较少的危险试剂。
用于表观遗传学研究的 FFPE 肿瘤样本的规模化制备
图 4. Charles River Laboratories 共享了小鼠模型患者来源的异种移植瘤 (PDX) 的 FFPE 卷轴。来自 2 名患者样本的 PDX 肿瘤被嵌入 1 至 7 年的石蜡块中。使用 Qiagen AllPrep DNA/RNA FFPE 试剂盒从核材料中提取 gDNA，并通过 Agilent TapeStation 评估 DNA 完整性评分 (DIN)。K562 对照 A (未固定) gDNA 由 Qiagen AllPrep DNA/RNA FFPE 试剂盒提取，K562 对照 B (未固定) gDNA 由 Zymo Quick-DNA/RNA 纯化试剂盒提取，以提供来自 2 个 DNA 提取试剂盒的高质量样本示例。顶部代表性图像：明场碎片。底部代表性图像核标记：碘化丙啶。
Petunjuk PenggunaanQiaamp®DSPDNA FFPE组织...
包含：盐酸鸟苷和马来酸。警告！如果被吞下或吸入可能是危险的。引起皮肤刺激。引起严重的眼睛刺激。可以对皮肤引起过敏反应。如果仍然发生眼睛刺激：获取医疗建议/护理。如果暴露在眼睛上：用水小心地冲洗几分钟。删除隐形眼镜（如果有的话）。继续冲洗。脱下污染的衣服并洗涤，然后再次穿着。如果暴露在皮肤上：用肥皂和流水洗涤。如果出现皮肤刺激：获得医疗建议/治疗。戴防护手套/防护服/眼保护器/面部保护器。
ez2®AllPREP®DNA/RNA FFPE套件和EZ1＆2™CCFDNA套件
商标：Qiagen®，样本到Insight®，AllPrep®，EZ1＆2™，EZ2®（Qiagen Group）。注册名称，商标等。在本文档中使用的，即使没有明确标记，法律也不被认为不受保护。
instruçõesde uso（手册）doqiaamp®dsp dna ffpe ...
含有：盐酸鸟嘌呤和马来酸。警告！如果摄入或吸入可能是有害的。引起皮肤刺激。引起严重的眼睛刺激。它可能对皮肤引起过敏反应。如果眼睛刺激持续存在：请咨询医生。如果要进行眼神接触：用水小心地冲洗几分钟。删除隐形眼镜，如果有的话，易于删除。继续冲洗。取出污染的衣服并将其洗涤，然后再佩戴。如果与皮肤接触：用水清洗和肥皂丰富。如果有皮肤刺激：请咨询医生。戴防护手套/眼部保护/面部保护衣服。
天然分子的全基因组测序，简短片段CfDNA和FFPE DNA
优化与碎片模板一起使用的ONT SQK-LSK110连接协议改善了测序性能。修改降低了自由适配器的量，并增加了完全适配器绑扎的分子与最终文库中半适配器绑扎和非适应器绑扎分子的比率。
使用 Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment 检测 FFPE 肿瘤样本中的罕见体细胞变异
将组织活检基因组分析的结果与补充液体活检数据相结合，可以全面了解肿瘤生物学。Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment 是一种多功能文库制备试剂盒，可用于从循环无细胞 DNA (cfDNA) 或从 FFPE 组织样本中提取的基因组 DNA (gDNA) 制备可用于测序的文库 (图 1)。该工作流程包括用于纠正错误和减少假阳性的唯一分子标识符 (UMI)，从而能够准确、灵敏地检测 FFPE 肿瘤样本中的低频突变。Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment 与 Illumina 和第三方富集探针或面板兼容，以支持灵活的实验设计。本应用说明展示了 Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment 在生成高质量 NGS 文库和从 FFPE 样本中鉴定低频体细胞变异方面的优异性能。
使用富集
组织活检的基因组分析结果与液体活检的互补数据的结合提供了有关肿瘤生物学的详尽信息。用富集来照亮无细胞的DNA制备是一种多功能试剂盒，可用于准备准备从循环DNA（CFDNA，无细胞DNA）和基因组DNA（GDNA，GDNA，基因组DNA）从FFPE织物中提取的书架（图1）。工作流程包括唯一的分子标识符（UMI，唯一的分子标识符），以校正误差和误报降低，从而可以准确且敏感地检测FFPE肿瘤样品中的低频突变。用ENRIGHMP照亮无细胞的DNA Prep与探针或富集面板照明和第三方，以支持灵活的实验设计。该应用程序上的注释表明，在高质量的NGS书店的一代中，没有光明细胞的DNA准备表现出色，并确定了FFPE冠军的低频体细胞变体。
ez2®AllPREP®DNA/RNA FFPE套件
商标：Qiagen®，样本到Insight®（Qiagen Group）。注册名称，商标等。在本文档中使用的，即使没有明确标记，法律也不被认为不受保护。