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IGF 和 FGF 在体外协同建立多能人类细胞的调节性干细胞微环境。Sean C Bendall 1,2,3、Morag H Stewart 1,3、Pablo Menendez 1,4、Dustin George 2、Kausalia Vijayaragavan 1、Tamra Werbowetski-Ogilvie 1、Veronica Ramos-Mejia 1、Anne Rouleau 1、Jiabi Yang 1、Marc Bosse 1、Gilles Lajoie 2 和 Mickie Bhatia 1,5 1 麦克马斯特干细胞和癌症研究所,Michael G. DeGroote 医学院和麦克马斯特大学生物化学系,加拿大安大略省汉密尔顿,L8N 3Z5。2 西安大略大学舒利克医学和牙科学院生物化学系 Don Rix 蛋白质鉴定设施,加拿大安大略省伦敦,N6A 5C1; 4 现地址,西班牙干细胞库安达卢西亚分部,生物医学研究所,格拉纳达,西班牙,18100。关键词:人类胚胎干细胞、生态位、蛋白质组学、自我更新、多能性。 5 通讯地址:Mickie Bhatia 博士 麦克马斯特干细胞和癌症研究所 (SCC-RI) 麦克马斯特大学 Michael G. DeGroote 医学院 1200 Main Street West, MDCL 5029 加拿大安大略省汉密尔顿市 L8N 3Z5 电话:(905) 525-9140,x28687 电子邮件:mbhatia@mcmaster.ca 3 以下作者对这项工作做出了同等贡献 致谢:SCB 获得 CIHR 加拿大研究生奖学金博士奖的资助,MHS 获得干细胞网络研究生奖学金和 CIHR 加拿大研究生奖学金博士奖的资助,M.Bhatia 获得加拿大主席计划的资助,他是加拿大人类干细胞生物学研究主席和 Michael G. DeGroote 干细胞生物学主席。这项工作得到了安大略省研究与发展挑战基金 (ORDCF) 向 GL 提供的资助以及 CIHR 和 NCIC 向 M.Bhatia 提供的资助。我们还非常感谢 L.Gallacher 和 R. Mondeh 提供的培养帮助、罗伯茨的 Krembil 中心以及 M. Sibly 和 J. Trowbridge 提供的有益建议,以及 Andras Nagy、Janet Rossant、Marina Gertsenstein、Kristina Vinterstein、Marsha Mileikovsky 和 Jonathan Draper 提供的 CA1 人类 ESC 系。
摘要:在胚胎发育过程中,细胞敏化的规范产生了组织形成的专用谱系。在构成双膜和脊椎动物的olfactores中,心脏型纤维壁是由心脏和分支肌肉的多能祖细胞形成的。海囊ciona是一个具有细胞分辨率的心咽命运规范的强大模型,因为只有两个双侧双脑脑咽后祖细胞会引起心脏和咽肌肉(也称为咽肌肉(也称为鼻鼻涕siphon siphon suscles assm assm)。这些祖细胞是多琳的,就像它们表达了早期的ASM和心脏特异性文字的结合,这些文字限于其相应的前体,即定向和不对称的划分。在这里,我们确定了引发基因环149相关的基因环(RNF149-R),后来限于心脏祖细胞,但似乎调节心脏咽中脑中咽部中的咽部肌肉命运的规范。CRISPR/CAS9介导的RNF149-R功能的损失会损害心房的虹吸肌肉形态发生,并下调TBX1/10和EBF,这是咽肌命运的两个关键决定因素,同时上调心脏特异性基因的表达。These phenotypes are reminiscent of the loss of FGF/MAPK signaling in the cardiopharyngeal lineage, and an integrated analysis of lineage-specific bulk RNA-seq profiling of loss-of-function perturbations has identified a significant overlap between candidate FGF/MAPK and Rnf149-r target genes.但是,功能交互分析表明RNF149-R不会直接调节FGF/MAPK/ETS1/2途径的活性。相反,我们提出RNF149-R在共享目标上以及通过(a)单独的途径(s)上平行于共享目标的FGF/MAPK信号传递。
背景:门静脉肿瘤血栓形成(PVTT)是晚期肝细胞癌(HCC)的频繁而严重的并发症,通常会导致预后不良。尽管PVTT具有显着的临床相关性,但驱动其形成的分子机制尚不清楚。长的非编码RNA(LNCRNA)已成为PVTT进展的潜在贡献者,促使这项研究探索LNCRNA作为PVTT的潜在生物标志物。方法:我们分析了来自基因表达综合的公开可用数据集,以识别三个比较的差异表达的LNCRNA和mRNA:正常与HCC,正常与PVTT和HCC与PVTT。转录曲线,并使用在线数据库筛选了与HCC和PVTT特异性LNCRNA相互作用的蛋白质,表明所有相互作用的蛋白质都是转录因子(TFS)。我们通过从每次比较中与TF靶基因与差异表达的基因(DEG)相交的LNCRNA – TF – TF -TARGAT基因调节网络。蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)网络分析以识别关键簇和集线器基因,并突出显示了AR和ESR1之类的TF。进行了基因本体分析,以了解调节网络的生物学功能。结果:该研究确定了正常,HCC和PVTT样品的不同转录曲线。构建了涉及LNCRNA,TFS和靶基因的关键调节网络,并将包括AR和ESR1在内的重要集线器基因确定为潜在的治疗靶标。PPI网络分析揭示了与PVTT进展相关的重要集群,而基因本体分析则提供了对相关生物学功能的见解。结论:本研究提出了一个新的理解LNCRNA – TF介导的基因调节的框架。它确定了潜在的治疗靶标和预后生物标志物,这些靶标可以促进PVTT的靶向疗法的开发,从而提供新的机会来改善临床结果。
摘要。背景:针对头颈部鳞状细胞癌 (HNSCC) 的靶向治疗受到广泛研究。在 HNSCC 中检测到了属于成纤维细胞生长因子 (FGF) 家族的基因的不同突变。在本研究中,我们使用人乳头瘤病毒 (HPV) 阳性和阴性 SCC 系,在体外检查了用小分子酪氨酸激酶抑制剂 (TKI) 和雷帕霉素机制靶点抑制剂 (mTOR) 治疗后 FGF1 和 FGF2 的表达。材料和方法:将两种人类 HPV 阴性细胞系 (UMSCC-11A/-14C) 和一种 HPV 阳性细胞系 (CERV196) 的细胞与 20 μmol/l 厄洛替尼、吉非替尼、尼洛替尼、达沙替尼或依维莫司孵育 24-96 小时。通过增殖试验评估细胞增殖,通过夹心酶联免疫吸附试验评估 FGF1 和 FGF2 的蛋白质浓度。为了进行统计分析,将结果与未处理的 HPV 阴性 SCC 细胞的结果进行比较。结果:在三种测试细胞系中均检测到 FGF1 和 FGF2。测试的 TKI 在前 24 小时内显着(p<0.05 降低)UMSCC-11A 细胞系中的 FGF1 表达。在之后的时间点,测试的 TKI 和依维莫司显着(p<0.05)增加了 HPV 阴性和阳性癌细胞系中的 FGF1 和 FGF2 表达。在 HPV 阳性细胞系中效果更强。结论:FGF 信号传导的改变被认为是
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。它是制作
成纤维细胞生长因子(FGFS)在各种信号通路内充当信号分子,从而调节了软结缔组织,神经,上皮组织和骨骼的产生,迁移和分化。FGF家族由22个成员组成,具有酸性成纤维细胞生长因子(AFGF/ FGF-1)和基本成纤维细胞生长因子(BFGF/ FGF-2)的主要意义。本文探讨了不同FGF的生化和生物学特性,从而阐明了它们在各种生物过程中的作用。Additionally, it delves into the interactions between FGFs and Re- ceptor tyrosine kinases (RTKs), which activate several cell signaling cascades, such as the RAS/MAPK (Mitogen-activated Protein Kinase) pathway, PI3K (phosphoinositide 3-kinase)/AKT (v-akt murine thymoma viral oncogene homolog) path- way, PLC-γ(磷脂酶C-γ)途径以及转录(STAT)途径的信号转换器和激活因子,以促进多种细胞功能。本文还研究了工程FGF的方法,包括N端截断,点突变或其组合,用于在组织再生,血管生成和修复受损的组织(例如软骨,骨骼,骨,韧带和皮肤)中的治疗应用。最后,它以讨论FGF的输送系统的讨论,包括脚手架,水凝胶以及纳米和微观局促方法。关键字:血管生成,工程FGF,成纤维细胞生长因子,RAS/MAP激酶途径,组织再生
研究成果の概要(英文):我们已经建立了诺贝尔角质形成细胞菌株,该细胞菌株显示出多能细胞分化。使用DNA谱和干细胞标记分析,该细胞应变与MSC相似。间充质干细胞。EGF,FGF和PDGF对该细胞菌株显示出生长刺激。 在无血清条件下,该细胞菌株显示出多能细胞分化。EGF,FGF和PDGF对该细胞菌株显示出生长刺激。在无血清条件下,该细胞菌株显示出多能细胞分化。
缩写:AKT,蛋白激酶B; Cldn18.2,Claudin-18同工型2; ctDNA,循环肿瘤DNA; DKK-1,Dickkopf-1; DMMR,缺乏不匹配的维修; EBV,爱泼斯坦 - 巴尔病毒; EHR,电子健康记录; FGF,成纤维细胞生长因子; FGFR,FGF受体; FGFR2,FGF受体2; FGFR2B,FGFR2同工型IIIB; g/geJ,胃/胃管交界处; HER2,人表皮生长因子受体2; IHC,免疫组织化学; ITIM,免疫受体酪氨酸抑制基序; MAPK,有丝分裂原激活的蛋白激酶; MSI,微卫星不稳定性; MTOR,雷帕霉素的哺乳动物靶标; NTRK,神经营养酪氨酸受体激酶; PD-1,程序性细胞死亡蛋白1; PD-L1,程序性细胞死亡配体1; PI3K,磷酸肌醇3-激酶;拉斯,老鼠肉瘤; Tigit,T细胞免疫球蛋白和ITIM结构域; TMB,肿瘤突变负担;美国,美国; VEGFR-2,血管内皮生长因子受体2。