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TRUSIGHT ONCOLOGY 500 (TSO500) DNA 面板基因列表
ARID2 CDK4 EPHA7 FLI1 HNF1A MAGI2* NOTCH3* PPP2R2A SETBP1 TMPRSS2
硫酸肝素蛋白聚糖代谢失调促进尤文氏肉瘤肿瘤生长
摘要 尤文氏肉瘤家族是一类影响儿童、青少年和年轻人的恶性小圆蓝细胞肿瘤 (SRBCT)。这些肿瘤的特点是染色体相互易位，产生嵌合融合致癌基因，其中最常见的是 EWSR1-FLI1。转移性或复发性疾病患者的生存率极低，目前尚无针对这种疾病的分子靶向治疗方法。缺乏可靠的尤文氏肉瘤遗传动物模型妨碍了对体内肿瘤细胞/微环境相互作用的研究。我们基于野生型斑马鱼中 Cre 诱导的人类 EWSR1-FLI1 表达开发了一种新的尤文氏肉瘤遗传模型，这会导致高渗透性时 SRBCT 快速发病。肿瘤表达典型的 EWSR1-FLI1 靶基因，并对已知的尤文氏肉瘤标记物（包括 CD99）进行染色。肿瘤的生长与 MAPK/ERK 通路的激活有关，我们认为该通路与细胞外基质代谢失调有关，特别是与硫酸肝素蛋白聚糖分解代谢有关。使用特定的硫酸肝素拮抗剂 Surfen 靶向硫酸肝素蛋白聚糖可降低 ERK1/2 信号传导并降低尤文氏肉瘤细胞在体外和体内的致瘤性。这些结果强调了细胞外基质在尤文氏肉瘤肿瘤生长中的重要作用，以及靶向蛋白聚糖代谢的药物作为这种疾病的新疗法的潜力。
尤文氏肉瘤的新兴疗法
尤文氏肉瘤是一种侵袭性肉瘤，可发生在骨骼或软组织中，在青少年和青年人 (AYA) 中发病率最高。尤文氏肉瘤的治疗需要多模态疗法，包括强化多药化疗和局部治疗（手术、放射治疗或两者兼有）。在 AYA 人群中，这种罕见疾病的发病率为每百万 1.5 人，其治疗进展主要来自国家和国际合作临床试验，这些试验旨在解决化疗问题并更好地定义风险人群，以便制定更有针对性的治疗策略。在这种情况下，局部疾病患者的无事件生存率现在接近 75%；然而，治疗与严重的急性和长期毒性有关，转移性或复发性疾病患者的预后仍然很差。因此，仍然存在大量未满足的需求，需要更好地定制治疗并确定新的疗法以改善预后。尤文氏肉瘤的定义是 EWSR1 基因与 ETS 基因家族之一发生特异性易位，最常见的是 EWSR1::FLI1 [1]。迄今为止，直接针对融合基因的尝试
胰岛素样生长因子 2 mRNA 结合蛋白 3 通过调节 CD164-CXCR4 轴来调节尤文氏肉瘤的侵袭性
尤文氏肉瘤 (EWS) 是儿童和年轻人中第二常见的骨和软组织相关恶性肿瘤。它由融合致癌基因 EWS/FLI1 驱动，具有快速生长和早期转移的特征。我们之前发现，mRNA 结合蛋白 IGF2BP3 是 EWS 的重要生物标志物，因为原发性肿瘤中 IGF2BP3 高表达预示着 EWS 患者预后不良。我们还证明 IGF2BP3 可增强 EWS 细胞的锚定非依赖性生长和迁移，这表明 IGF2BP3 可能作为 EWS 进展的分子驱动因素和预测因子。本研究旨在进一步确定 IGF2BP3 在 EWS 进展中的作用。我们证明，在特征明确的 EWS 肿瘤标本中，高 IGF2BP3 mRNA 表达水平与 EWS 转移和疾病进展相关。 IGF2BP3 水平较高的 EWS 肿瘤具有富含趋化因子介导的信号通路的特定基因特征。我们还发现 IGF2BP3 通过 CD164 调节 CXCR4 的表达。值得注意的是，在 CXCL12 刺激下，CD164 和 CXCR4 在 EWS 细胞的质膜上共定位。我们进一步证明，IGF2BP3、CD164 和 CXCR4 表达水平在临床样本中具有相关性，并且 IGF2BP3/CD164/CXCR4 信号通路促进了 EWS 细胞在 CXCL12 和缺氧条件下的运动性。呈现的数据将 CD164 和 CXCR4 确定为新的 IGF2BP3 下游功能效应物，表明 IGF2BP3/CD164/CXCR4 致癌轴可能作为 EWS 侵袭性的关键调节因子。此外，IGF2BP3、CD164 和 CXCR4 表达水平可能构成预测 EWS 进展的新型生物标志物组。
胰腺粘液表皮样癌患者CASEREPO RT靶向基因测序及生物信息学分析：病例报告及文献
背景：原发性胰腺粘液表皮样癌（MEC）是一种极为罕见的恶性肿瘤，病因和发病机制不明。1959年至2020年发表的英文论文中仅有11例报道。MEC通常发生在涎腺中，但也有发生在胰腺的病例报道。尽管胰腺MEC被认为是一种低度惰性癌，但它常侵犯周围淋巴结并发生转移。胰腺MEC的预后不理想。迄今为止，胰腺MEC的基因改变、突变基因之间的机制关系和信号通路尚不清楚。患者和方法：本文介绍了一例罕见的原发性胰腺MEC病例，患者为56岁的男性，伴有肝转移。对两个肝转移灶进行了远端胰腺切除和射频消融（RFA）的根治性手术。利用靶向基因测序和生物信息学分析工具，包括STRING、DAVID、cBioPortal、DGidb和人类蛋白质图谱数据库（HPA），阐明胰腺MEC中突变基因的生物学功能和特点。结果：观察到8个基因突变（TP53、KRAS、ATR、FLI1、FLT4、MAGI2、RBM10和TNFAIP3），通过靶向基因测序计算出胰腺MEC的肿瘤突变负荷（TMB）为5.6 muts/Mb。患者随后接受辅助化疗，并在手术三个月后死亡。构建的基因-基因相互作用网络显示8个突变基因之间存在显著的相互作用。本文根据GO和KEGG对8个基因突变的功能和通路进行了20个肿瘤相关结果的分析，并进一步将胰腺MEC与胰腺导管腺癌的生物学功能和特点进行了比较。结论：胰腺MEC需要早期有效的治疗，淋巴结转移和多器官转移是预后不良因素。胰腺MEC可以与其他具有特征性临床表型、分子改变、功能信息和富集途径的胰腺癌进行比较。关键词：胰腺粘液表皮样癌，靶向基因测序，生物信息学分析