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Mendelian随机分析三甲胺N-氧化物及其前体与帕金森氏病之间的因果关系
简介：先前的研究报告了三甲胺N-氧化物（TMAO）和帕金森氏病（PD）之间的潜在关联。这项研究的目的是检查循环TMAO及其前体的水平与使用两样本的孟德尔随机化（MR）方法之间的潜在关系。材料和方法：我们从三个全基因组社会研究（国际帕金森氏病基因组学，帕金森氏病，帕金森的研究：有组织的遗传学计划和Genepd和Finngen）中汇总了数据，以提取与单核苷酸多态性（SNP）（SNP）与TMAO，Carnitine，Carnitine和Betnitine的循环浓度相关。这些SNP被用作随机效应模型中的仪器变量，以评估TMAO循环浓度及其前体的循环浓度与帕金森氏病的风险，并通过估计的优势比与伴随的95％置信区间来评估循环变量。主要分析采用了反向差异加权（IVW）方法，该方法与MR-Egger回归分析相辅相成。结果：使用IVW方法进行的分析，该方法汇总了三个数据库的数据，并未显示循环浓度TMAO及其前体之间的因果关系，并且PD的风险（P> 0.05）。MR-Egger分析的结果进一步证实了这一发现。灵敏度分析表明，结果不受任何偏见的影响，异质性测试表明SNP之间没有显着差异。有必要进行进一步的调查，以确定这种关联是否确实存在。结论：这项研究没有发现循环浓度或其原始物质与PD风险之间的因果关系的任何结论性证据。
孕育糖尿病和不良怀孕结果
摘要背景：据信怀孕的高血糖与妊娠阴性结局有关。然而，由于传统观察性研究固有的局限性，建立糖尿病（DM）和不良怀孕结果之间的因果关系是具有挑战性的。方法：我们的研究使用了两样本的孟德尔随机化（MR）技术来检查植物前糖尿病（PGDM）对不良妊娠结局的可能影响。摘要级数据来自欧洲血统和Finngen Biobank的基因组广泛关联研究（GWAS）。主要分析采用了随机效应乘法逆差异加权（IVW）技术来评估PGDM和不良结果之间的因果关系。异质性和多效性。灵敏度分析。另外，应用了包括MR-Presso和RadialMR在内的离群检测技术。结果：IVW方法的结果表明，PGDM和死产（SB）之间没有显着因果关系（OR（SE）= 0.99（0.001）； P值= 0.992），流产（MIS）（或（se）= 0.97（0.97（0.016）; P值= 0.125）； 0.125），和02.02（或02） p值= 0.014）。多效性和异质性测试没有发现SB，MIS和PTB多效性的证据（MR – Egger截距P值= 0.296、0.525和0.532），没有观察到的SB，MIS和PTB的异质性异质性（Q-P值0.992999929，and MIS和PTB值），没有观察到的异质性。分别为0.931、0.999和0.065）。结论：我们的发现表明，PGDM与MIS，SB和PTB的可能性之间没有直接的因果关系。关键字：堕胎，糖尿病，母体糖尿病，妊娠结局，早产，自发性，死产，这篇文章为：hantoushzadeh S，hantoushzadeh S，Zaki-Dizaji M，Zaki-Dizaji M，Habibi D，Habibi D，Sahebi L，Sahebi L，Saheidian L，Saeidian Ah，Saeidian Ah，Dashtkoo Hah，Dashtkoo Hai M.Et。孕育糖尿病和不良妊娠结果：孟德尔随机研究。伊朗大四。2025; 28（2）：81-87。 doi：10.34172/aim.33461
2型糖尿病和血糖特征不是del妄的因素：两样本的孟德尔随机分析
这项研究旨在探索2型糖尿病（T2D）和血糖性状（禁食葡萄糖[FG]，禁食胰岛素[FI]和糖化血红蛋白[HBA1C]）之间的遗传因果关系。从IEU OpenGWAS数据库中获得了T2D和血糖性状的基因组广泛关联研究（GWAS）摘要数据。GWAS的deli妄摘要数据是从Finngen联盟获得的。所有参与者都是欧洲血统。此外，我们将T2D，FG，FI和HBA1C用作曝光和del妄作为结果。随机效应方差加权模型（IVW），Egger先生，加权中位数，简单模式和加权模式用于执行MR分析。此外，使用MR-IVW和MR-EGGER分析来检测MR结果中的异质性。使用MR-EGGER回归和MR多效性残留总和和离群值（MR-Presso）检测到水平多效性（MR-Presso）。MR- PRESSO还用于评估离群的单核苷酸多态性（SNP）。“放出一个”分析用于研究MR分析结果是否受到单个SNP的影响并评估结果的鲁棒性。在这项研究中，我们进行了两样本的MR分析，并且没有证据表明T2D和血糖性状（T2D，FG，FI和HBA1C）之间的遗传因果关系有关（p> 0.05）。MR-IVW和MR-EGGER测试在我们的MR结果中没有异质性（所有P值> 0.05）。此外，MR-EGGER和MR-PRESSO测试在我们的MR结果中没有水平多效性（所有P> 0.05）。MR-Presso结果还表明，MR分析过程中没有异常值。此外，“放出一个”测试并未发现分析中包含的SNP可能会影响MR结果的稳定性。因此，我们的研究不支持T2D和血糖性状（FG，FI和HBA1C）对del妄风险的因果影响。
肌萎缩性横向硬化症中的多面基因 -
Building on the fi rst Volume of Multifaceted Genes in Amyotrophic Lateral Sclerosis- Frontotemporal Dementia, this new Research Topic includes papers focusing on the most common genetic cause of amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and frontotemporal dementia (FTD) in European ancestry populations, the C9orf72 hexanucleotide repeat expansion mutation.Broce等。通过鉴定出与C9ORF72相似的区域共表达模式的基因，探索了ALS-FTD光谱中共有遗传风险的神经解剖学基础。旨在阐明为什么某些大脑区域易受C9ORF72连接的ALS -FTD中神经退行性的影响，作者发现了C9ORF72相关的基因网络，该网络也跟踪了C9ORF72重复扩张载体中的皮质厚度。最后，他们表明该网络富含脑细胞群体和已知在ALS-FTD中有选择性易受伤害的区域，并研究了所涉及的分子途径。另一个有趣的方面涉及c9orf72 Als-ftd中的中间长度重复等位基因。它们的精确作用仍然未知，但是这些等位基因比重复扩展要频繁得多。因此，如果他们构成疾病风险，那么ALS患者的显着比例可能会受益于针对C9ORF72重复扩张的发育治疗方法。在芬兰人口中，Kaivola等人。识别一个单倍型，其中包含一个中等长度等位基因的子集，从而增加了ALS的风险。作者还在Finngen Biobank队列中表明，这种单倍型会降低80岁以后的生存，这可能对ALS-FTD以外的其他神经退行性疾病有影响。该研究主题还集中于其他造成疾病的遗传基因座。特别是Miura等人的研究。报告了携带p的ALS-FTD的零星案例。 VCP基因中的ARG89TRP错义变体。VCP遗传变异物被预测会改变这种氨基酸残基，以前已经在被诊断为FTD-DISTAL肌病的患者中发现，并且使用ALS，进一步证明该基因可以引起表型多效性。这强调了在ALS和FTD患者中研究VCP遗传变异的重要性，即使在没有这些疾病家族史的患者中。
同行评审文件
同行评审文件文章信息：https://dx.doi.org/10.21037/tcr-24-1503 #Reviewer A 该研究采用蛋白质组范围的孟德尔随机化 (MR) 方法，利用冰岛人大规模 GWAS 的遗传关联来确定结直肠癌 (CRC) 及其亚型的潜在靶点。主要发现包括鉴定出 31 种与 CRC 具有强有力因果关联的蛋白质，其中一些显示出解剖位点特异性，凸显了 CHDRL2 作为 CRC 及其亚型的共同靶点的重要性。方法学优势在于使用 MR 来最大限度地减少混杂因素和验证 FinnGen 研究的结果。局限性包括潜在的水平多效性和人口结构偏差，因为该研究主要关注欧洲人群，这可能会限制普遍性。尚未解决的问题涉及已识别蛋白质影响CRC发展和进展的确切生物学机制，以及这些发现的临床适用性，特别是关于CRC及其亚型的靶向治疗和个性化治疗策略。我建议作者准确指出靶标的类型，例如治疗靶点。 评论1：在摘要中，作者需要描述工具变量的识别，以及主要的统计分析。 回复1：谢谢您的审阅，我们在摘要中添加了IV信息和MR方法以及相关的统计阈值 正文更改：第32行、35-38行 评论2：在引言的第一段中，将早期识别和新的治疗靶点联系起来很容易引起混淆，因为早期诊断和治疗是不同的。 回复2：谢谢您的审阅，我们在这一部分没有说清楚。因为之前的研究已经证实了循环蛋白与肿瘤之间的相关性（可能具有诊断潜力），所以这些蛋白也是重要的潜在耐药靶点。我们在文章中添加了 正文修改：第89-90行 评论3：在方法论中，请提供MR分析的更多细节，包括工具变量的使用和敏感性分析。 回复3：感谢您的评论，MR-Egger回归和MR-PRESSO用于检测相关的水平多效性。MR-Egger回归使用从回归分析中获得的截距来确定水平多效性。我们假设如果截距等于零，则不存在相关的水平多效性。MR-PRESSO使用失真测试来检测可能表现出水平多效性的异常值，并通过删除异常值进一步校正IVW估计值。这项分析是在我们第一次处理IV时进行的，我们用于通过FDR进一步筛选的数据都是通过MR-PRESSO测试的数据。 正文修改：第152-155行 评论4：在讨论中，作者需要对研究结果的临床意义有更详细的评论。请考虑引用几篇相关论文：