迅速增加的人口,加上气候变化以及对合成肥料过度依赖的数十年,导致了两个紧迫的全球挑战:粮食不安全和土地退化。因此,至关重要的是,实践可以使土壤和植物健康以及可持续性更加积极地追求至关重要。可持续性和土壤生育能力包括诸如改善贫困和干旱土壤中植物生产力,保持土壤健康的生产力,并最大程度地减少对贫困土壤管理带来的生态系统的有害影响,包括农业化学品和其他污染物的径流。促进细菌(PGPB)的植物生长可以通过多种方式改善粮食生产:通过促进宏观和微量营养素的资源获取(尤其是N和P),调节植物激素水平,拮抗致病因素并维持土壤生育能力。PGPB包括属于多个门的细菌的不同功能和分类群,包括蛋白质细菌,富公司,细菌,细菌和静脉细菌等。本综述总结了这些有益的土壤细菌用来促进植物健康的机制和方法,并询问它们是否可以进一步发展为有效的,潜在的商业植物刺激剂,这些植物刺激剂实质上降低或替换了涉及食品生产和生态系统稳定性的各种有害实践。我们的目标是描述有益植物 - 微生物相互作用涉及的各种机制,以及它们如何帮助我们实现可持续性。
摘要M依赖依词学涉及遗传材料提取和直接从环境样本中进行测序,以获得微生物及其周围环境之间存在的见解和关系。在包括在坦桑尼亚阿鲁沙地区发现的苏打湖等极端环境中进行的研究很少。这项研究记录了确认湖泊末端的高pH值和盐度值。全长16S rRNA读取通过PACBIO测序的读数用于揭示细菌群落的首次宏基因组快照,从海岸线水域的10个随机点。结果表明,蛋白细菌和企业的优势分别为98.46%和70.46。α-杆菌(93.59%),拟杆菌(23.80%)和杆菌(23.19%)是最主要的类别。Oceanibaculaceae(52.43%),Rhizobiaceae(66.62%)和Izemoplasmataceae(12.50%)是最主要的家庭。主属分别为Oceanibaculum(52.44%),Allorhizobium(65.59%)和Izimaplasma(12.50%)。多样性指数显示出高水平的社区多样性,大量物种,稀有物种的存在以及在抽样点中细菌的平均分布。这项研究提供了有关纳特隆湖中各种分类单元的首次报告,但建议进行功能性元基因组分析,以进一步研究已鉴定物种的生态和生物技术意义。关键字:宏基因组学; PACBIO测序;细菌多样性;苏打湖;纳特隆湖简介
早期断奶会导致犊牛的断奶压力,从而阻碍了健康的生长和发育。作为在食物中施用的出色甜味剂,甜叶菊糖苷(Ste)也已显示出在单胃动物中表现出阳性的生物学活性。因此,这项研究旨在评估将Ste作为饮食补充剂对瘤胃的瘤胃发育,发酵和微生物瘤的影响。这项研究选择了24个健康的荷斯坦牛犊,并将其随机分为两组(Con和Ste)。结果表明,补充组的饲料改善了断奶犊牛的瘤胃发育,这表明瘤胃的重量显着增加,以及瘤胃乳头的长度和表面积。与CON组相比,Ste组的总挥发性脂肪酸(TVFA),丙酸丁酯和瓣膜的浓度较高。此外,Ste治疗增加了对门水平上富公司和静脉细菌的相对丰度。在属水平上,Ste组显示出相对丰度的相对丰度,lachnospireaceae_nk3a20_组和Olsenella的相对丰度,与CON组相比,杆菌的相对丰度降低。pusillimonas,lachnospiraceae_nk3a20_group,Olsenella和琥珀酸酯在补充Ste后在瘤胃中显着富集,如Lefse分析所证明的那样。总体而言,我们的发现表明,瘤胃细菌群落因补充Ste的饮食而改变,在此期间,这些群落中的一些细菌分类群可能会对瘤胃的发展产生积极影响。
肠道微生物组越来越受到动物健康的主要调节剂的赞赏。然而,鸟类肠道微生物组的研究通常集中在经济重要性的鸟类上,猛禽的肠道微生物组仍然没有被逐渐倍增。在这里,我们通过对16S rRNA基因的V4区域进行测序,研究了29名圈养猎鹰的肠道菌群(具有历史重要性的宣传者)。我们的结果表明,进化的历史和饮食与禽类中的鸟类肠道菌群显着相关,而饮食在塑造猎鹰肠道菌群中起着重要作用。多次分析表明,肠道微生物的多样性,组成和关键饮食区分细菌属的相对丰度与猎鹰肠道中的细菌属相对类似于食肉动物的肠道肠道,而不是其最接近的系统发育亲戚。此外,猎鹰微生物群以浓汤为主,并在可观的水平上含有沙门氏菌。sal-monella的存在与猎鹰肠道微生物的功能能力改变有关,因为它的丰度与参与蛋白质质量积累,肌肉维持和富集抗微生物化合物降解的多种预测代谢途径的消耗有关,从而增加了抗微生物的降解,从而增加了Falcon Gut的致病潜力。我们的结果表明,有必要在圈养鸟类中筛查沙门氏菌和其他人类病原体,以保护猎鹰的健康和与这些鸟类接触的人的健康。
肠道分子对于人体来说是必不可少的。据估计,我们体内的微生物共同占人类细胞数量的十倍(Qin等,2010)。最近的证据强烈表明,这些微生物的功能几乎像额外的器官,积极参与塑造和维持我们的生理学(Qi等,2021)。肠道微生物群在调节激素水平,对宿主激素的反应甚至产生其激素方面起关键作用(Sudo,2014年)。因此,它被认为是完全闪烁的内分泌器官,其作用范围延伸至遥远的器官和途径(Qi等,2021)。微生物群和激素之间的复杂关系对健康,行为,代谢,免疫和繁殖的各个方面具有深远的影响(Neuman等,2015)。健康的肠道微生物群由6个门组成,包括富公司,细菌植物,肌动杆菌,proteeobacteria,fusobacteria和verrucomicrobia(Crudele等,2023; Hamjane et al。,2024)。两个门的富公司和细菌剂占肠道菌群的90%(Hamjane等,2024)。菌群组成的变化会显着影响健康。这些变化可以在原因或后果的背景下进行评估。然而,不可否认的是,肠道菌群与我们身体的系统协同作用,以深刻影响健康。微生物群和激素之间的相互作用是双向的。在William的评论中所证明的是,激素具有直接影响菌群多样性和组成的能力,而相反,微生物群可以调节激素的产生并介导激素功能(Williams等,2020)。肠道菌群的组成因性激素,下丘脑 - 垂体 - 肾上腺(HPA)轴和胰岛素的失调,喂养行为和肥胖(Yoon and Kim,2021; Farzi et al。,2018; Kelly et al。,2018; Kelly et al。,2015; rusch et;肠道菌群通过与胰岛素,生长素素和GLP-1等激素相互作用,在调节喂养行为和代谢中起关键作用(Williams等,2020)。研究肠道菌群与肥胖之间关系的研究解释了肠道微生物群可以改变宿主代谢以及不疾病的肠道肠菌群在肥胖发展中的作用(Qi等,2021; Angelakis等,2012; Everard et el。,Everard等,2013; Everard等,2013)。肠道菌群产生的数十种代谢产物会影响能量调节和胰岛素敏感性(Qi等,2021;Wahlström等,2016)。代谢物,例如短链脂肪酸(SCFA)和胆汁酸在代谢综合征的中心病理中起重要作用,例如胰岛素抵抗;这些代谢物是影响能量平衡和胰岛素敏感性的肠道菌群的产物(Wahlström等,2016; Den Besten等,2015)。此外,抗糖尿病药物通过促进负责SCFA产生的微生物群生长,从而对丁酸酯和丙酸酯的水平产生积极影响。了解肠道细菌代谢物在内分泌疾病发展中的各种影响对于发现针对代谢疾病的新靶标和新药的发展至关重要。这些微生物群驱动的效应的潜力是深刻的,需要进一步研究其基础。
方法论/主要发现:我们根据粪便样品的全元素shot弹枪测序对185名中国成年人的肠道菌群进行了分析。我们的研究重点是评估三个级别的性别,年龄和BMI对肠道微生物群的影响:多样性,基因/系统发育组成和功能组成。我们的发现表明,与肠型相比,这些表型对构成肠道微生物组的影响很小,它们在样本内或样本之间的多样性内或样本间多样性内无显着相关性。我们确定了大量与表型相关的基因和宏基因组链接组(MLG),表明肠道微环形组成的变化。特别是,在老年人和BMI较高的人群中,我们观察到有益的公司微生物,例如Eubacterium,Roseburia,Roseburia,Faecalibacterium和Ruminococcus spp。随着年龄的增长而增加。此外,Blautia和Dorea spp。随着BMI的增加而增加,与先前的研究保持一致。令人惊讶的是,年龄较大或超重的个体表现出缺乏细菌植物,这是人类肠道菌群中的主要门,包括机会性病原体,而某些众所周知的益生菌的某些物种则富集在这些组中,暗示了这些细菌的复杂相互作用。关于性别,雌性中的几种来自细菌,副细胞杆菌,梭状芽胞杆菌和阿克米西的MLG富含雌性。功能分析显示了许多与表型相关的KEGG直系同源物(KOS)。
候选生物合成基因簇(BGC)的数量远远超过了迄今为止在结构上表征(目前约80个结构)的套管肽的数量。12 - 14与许多天然产品的BGC一样,培养天然生产者细胞可能会具有挑战性。此外,缺乏相关的生物学理解,可以防止BGC在本机生产者中的转录激活。在拉索肽生物合成中,前体肽A(固定铅肽和核心肽的征为)是由蛋白酶B首先处理的,该蛋白酶b裂解了领位肽的裂解。在来自静脉细菌和坚果类似物的某些拉索肽的生物合成中,蛋白酶B是一种包含蛋白B1的酶复合物(RIPP前体肽识别元件的例子,RRE RRE)14,15和蛋白B2。a r型肽肽的裂解,所谓的“核心肽”是由环酶C酶催化的N末端大分子环形成的底物,从而产生成熟的宽松肽产物(图。1b)。尽管B/C蛋白采用的精确催化机制仍然没有表征,但有报道表明它们表现出一定程度的底物滥交。16 - 22这为使用基因工程方法提供了有效产生套索肽衍生物的机会。也就是说,只要可以通过下游加工B/C蛋白来耐受核心肽的氨基酸残基。在与本地生产者的BGC合作时回顾上述问题,毫不奇怪,这样的
抽象的慢性耳鸣是一种中枢神经系统疾病。当前,肠道菌群对耳鸣的影响仍未探索。为了探索肠道菌群与耳鸣之间的联系,我们在70名耳鸣和30名健康志愿者的患者组中进行了16S rRNA测序,对粪便菌群和血清代谢组分分析进行了16s rRNA测序。我们使用加权基因共表达网络方法来分析肠道菌群与血清代谢产物之间的关系。随机森林技术被用来选择代谢物和肠道分类单元来构建预测模型。耳鸣组中明显的肠道营养不良,其特征是细菌多样性降低,富公司/细菌的比率增加,并且包括气或细菌在内的一些机会性细菌富含。相比之下,一些有益的肠道益生菌减少了,包括乳杆菌和乳杆菌科。在血清MIC分析中,耳鸣患者和这些差异代谢产物的血清代谢障碍富含神经炎症,神经递质活性和突触功能的途径。预测模型在测试集中表现出出色的诊断性能,达到0.94(95%CI:0.85-0.98)和0.96(95%CI:0.86-0.99)。我们的研究表明,肠道微生物群的变化可能会影响耳鸣的发生的出身和慢性,并通过血清代谢产物的变化发挥调节作用。总体而言,这项研究提供了对肠道微生物群和血清代谢产物在耳鸣的发病机理中潜在作用的新看法,并提出了“肠道 - 脑耳 - 耳朵”的概念,作为耳鸣的病理机制,具有明显的临床诊断含义和治疗潜力。
摘要:体育活动与肠道菌群组成之间关系的证据正在稳步增加。该研究的目的是比较一组精英男性足球运动员的肠道菌群组成,其中一组身体活动水平不同。对91名健康的年轻男性进行了横断面研究:17名精英足球运动员(23.7±4.2岁,BMI,BMI 23.2±1.2 kg/m 2); 14具有高水平的体育锻炼(24.5±5.6岁,BMI 22.7±0.8 kg/m 2); 23体育训练水平中等(29.3±3.9岁,BMI 22.5±0.8 kg/m 2);和37名没有运动习惯的健康男性(28.1±5.9岁,BMI 22.4±1.0 kg/m 2)。相对微生物群的组成。使用量子荧光计评估提取的DNA的质量和数量。使用单向方差分析分析了受试者人群之间的差异,并采用了Bonferroni的事后测试来识别局部效应。精英足球运动员和体育锻炼水平较高的受试者显示,分析的9个微生物群体的患病率明显高于中度体育锻炼或久坐的受试者。在不同的研究人群中,企业与杆菌比的比率没有发现差异。本研究首次报告了精英足球运动员的肠道菌群参数。此外,它为不同水平的体育活动对肠道菌群组成的影响带来了新的见解。
缩写:Alt,丙氨酸氨基转移酶;猿,苹果多酚提取物; apoe /,载脂蛋白E; AST,天冬氨酸氨基转移酶; BMI,体重指数; BW,体重; CD,克罗恩病; CRC,结直肠癌; CRP,C反应蛋白; CTR,控制; DGGE,变性梯度凝胶电泳; DP,聚合程度; DSS,硫酸葡萄糖钠; EGCG,epigallocatechin Gallate; EGCG3-ME,Epigallocatechin 3- O-(3- O-甲基)透足; f,分数; f/b,企业/杀菌剂; GMCSF,粒细胞巨噬细胞群刺激因子; GRO,生长调节的癌基因; GSPE,葡萄种子原腺苷提取物; GTE,绿茶提取物; HBA1C,血红蛋白A1C; HFD,高脂饮食; HFHSD,高脂高蔗糖折叠; HTS,高通量测序; IBD,炎症性肠病;国际益生菌和益生元科学协会Isapp; LDLR /,LDL受体缺陷; LFD,低脂饮食; LPS,脂多糖; MCD,蛋氨酸 - 胆碱缺乏;大都会,代谢综合征; NAFLD,非酒精性脂肪肝病;纳什,非酒精性脂肪性肝炎; PACS,低聚蛋白酶蛋白; PCR-DGGE,聚合酶链反应构成梯度凝胶电泳; PFE,pyracantha fortuneana果实提取物; PPEP,果皮桃萃取的多酚; SASP,磺胺丙嗪; SCFA,短链脂肪酸; TLR4,像受体4一样收费; TMAO,三甲胺-N-氧化物; TNB,2,4,6-三硝基苯磺酸; TPC,总多酚的含量; UC,溃疡性结肠炎; w/v,重量/体积。