XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemFragm
IDT_使用 Alt-R CRISPR-Cas9 系统和 Megamer ssDNA 片段进行同源性定向修复参考指南 (RUO21-0211_002 02/22)
30 多年来，IDT 的创新工具和基因组学应用解决方案一直在推动进步，激励科学家敢于梦想，实现下一个突破。IDT 开发、制造和销售核酸产品，为学术和商业研究、农业、医学诊断和药物开发等领域的生命科学行业提供支持。我们拥有全球业务，提供个性化的客户服务。
排队的动态和状态空间崩溃，零散的限制顺序簿市场
摘要。在现代股票市场中，参与者可以选择许多交易的交易所。交换通常在价格时间优先级规则下作为电子限制订单书籍运行，然后可以将其建模为第一届首次排队排队系统。具有多个交流的市场可以被认为是一个分散的平行排队系统。提交限额订单的异质交易者选择交易所（即队列），在该交易所中，通过对预期延迟进行交易，直到他们的订单可能会订购，可以通过对预期延迟进行交易。可以将这些限制订单视为等待服务的工作。同时，提交市场订单的交易者选择哪种交换（即队列）指导其订单。这些市场订单触发了排队限制订单的瞬时服务完成。以这种方式，服务器是自我感兴趣的，原子交易者提交市场订单的汇总。考虑到投资者跨交易所的订单决策的影响，我们发现该分散市场的平衡表现出州太空崩溃的财产，在该财产中（a）不同交流的队列长度以直觉的方式耦合； （b）市场的行为是通过一维过程来捕获的，该过程可以看作是在所有交易所中的加权总队列长度； （c）可以通过绘制汇总的市场深度过程来推断每个交易所的行为，该过程考虑了异质交易者特征。与队列长度本身相比，这种耦合现象的关键驱动力预计会延迟。在一个月的时间内分析贸易和报价数据集的股票样本，我们发现了对预测的状态空间崩溃的经验支持。单独使用纳斯达克（Nasdaq）自2015年自然收费实验之前和之后的数据，我们再次找到观察到的市场行为与该模型对费用变化的预测之间的协议。
解密人类基因组编辑调节景观的碎片
在发现所谓的CRISPR-CAS技术之后，基因组编辑技术引起了人们越来越兴趣。它引起了全球骚动，涉及其在人类中的使用，尤其是在2018年宣布中国科学家的宣布后，他使用CRISPR来编辑了双胚胎的基因。的确，尽管不是唯一的问题，但最大的关注点之一是使用基因组编辑技术来修改人类种系。在这种科学和技术背景下，法律在构建应允许或禁止的内容以及在哪些条件下起着关键作用，以确定安全和可访问的创新待遇与根据社会价值观和选择的基本权利之间的平衡。在欧盟内部，一些机构考虑了人类基因组编辑提出的问题，几个法律文本参与了适用于人类基因组编辑的欧洲监管框架的建立。然而，我们在本文中争辩说，既定的监管格局是在被分割，拆分或分段的意义上分散的。由于历史和技术原因，这种破碎化可能是不可避免的，它就适用于人类基因组编辑的当前监管框架的作用产生了影响。着眼于欧盟和法国治理层面，我们讨论了如何通过鉴定人类基因组编辑碎片监管景观的决定因素来进行这种分裂。我们认为，应该将其视为一个过程，该过程对人类基因组编辑的反应更具反应反映不断变化的政治和法律背景。
FAME：基于片段的条件分子生成，用于表型药物发现
摘要 由于化学空间的复杂性，从头分子设计是药物发现中的一个关键挑战。随着分子数据集的可用性和机器学习的进步，许多深度生成模型被提出来生成具有所需特性的新分子。然而，现有的大多数模型只关注分子分布学习和基于靶标的分子设计，从而阻碍了它们在实际应用中的潜力。在药物发现中，表型分子设计比基于靶标的分子设计具有优势，特别是在同类首个药物发现中。在这项工作中，我们提出了第一个针对表型分子设计，特别是基于基因表达的分子设计的深度图生成模型（FAME）。FAME 利用条件变分自动编码器框架从基因表达谱中学习条件分布生成分子。然而，由于分子空间的复杂性和基因表达数据中的噪声现象，这种分布很难学习。为了解决这些问题，首先提出了一种采用对比目标函数的基因表达去噪 (GED) 模型来降低基因表达数据中的噪声。然后设计 FAME 将分子视为片段序列并学习以自回归的方式生成这些片段。通过利用这种基于片段的生成策略和去噪的基因表达谱，FAME 可以生成具有高有效率和所需生物活性的新型分子。实验结果表明，FAME 优于现有的表型分子设计方法，包括基于 SMILES 和基于图的深度生成模型。此外，我们研究中提出的降低基因表达数据噪声的有效机制可应用于一般的组学数据建模，以促进表型药物的发现。关键词：片段、条件生成、基因表达、变分自动编码器、对比学习。
基于片段和结构的药物发现，用于开发针对 DNA 损伤反应的治疗剂
癌症将直接影响超过三分之一人口的生活。DNA 损伤反应 (DDR) 是一个复杂的系统，涉及损伤识别、细胞周期调控、DNA 修复以及最终的细胞命运决定，在癌症病因和治疗中发挥着核心作用。涉及 DDR 靶向的两种主要治疗方法包括：采用抗癌基因毒性剂的组合治疗；以及合成致死，利用偶发性 DDR 缺陷作为癌症特异性治疗的机制。尽管许多 DDR 蛋白已被证明“无法用药”，但基于片段和结构的药物发现 (FBDD、SBDD) 已推进治疗剂的识别和开发。FBDD 已导致 4 种药物（约 50 种药物处于临床前和临床开发阶段），而 SBDD 估计已为 200 多种 FDA 批准药物的开发做出了贡献。基于蛋白质 X 射线晶体学的片段库筛选，尤其是针对难以捉摸或“无法用药”的靶标，可以同时生成命中结果以及蛋白质-配体相互作用和结合位点（正构或变构）的详细信息，从而为化学可处理性、下游生物学和知识产权提供信息。使用一种新颖的高通量基于晶体学的片段库筛选平台，我们筛选了五种不同的蛋白质，命中率约为 2-8%，晶体结构约为 1.8 至 3.2 Å。我们考虑了当前的 FBDD/SBDD 方法以及设计工作的一些典型结果
叙利亚领土分裂与依赖的政治经济学
伊拉克库尔德地区政府 (KRG)。一家伊拉克-库尔德-土耳其-德国公司似乎主导了大部分进口商品，这些进口商品主要来自土耳其，但也来自伊朗。在 NWS，出口微薄。然而，NWS 每年从土耳其的进口额超过 13 亿美元，这一数额与叙利亚冲突前从土耳其进口的全部商品水平相当（图 2）。5 阿扎兹、巴卜和阿勒颇以北其他城市的军阀拥有通过 Bab al-Salam 边境口岸进口的土耳其许可证，他们与萨尔玛达和伊德利卜周边其他城市的军阀竞争，后者通过 Bab al-Hawa 边境口岸进口商品，该口岸也用于人道主义援助。第一组军阀与阿夫林的“幼发拉底河之盾”行动和“橄榄枝”行动的不同战斗派系有直接联系；后者与“解放组织”（HTS，前身为“努斯拉阵线”）有直接联系。
片段 - 印第安纳大学印第安纳波利斯分校 ScholarWorks
癌症将直接影响超过三分之一人口的生活。DNA损伤反应 (DDR) 是一个复杂的系统，涉及损伤识别、细胞周期调控、DNA 修复以及最终的细胞命运决定，在癌症病因和治疗中发挥着核心作用。涉及 DDR 靶向的两种主要治疗方法包括：采用抗癌基因毒性剂的组合疗法；以及合成致死，利用散发性 DDR 缺陷作为癌症特异性治疗的机制。尽管许多 DDR 蛋白已被证明“无法用药”，但基于片段和结构的药物发现 (FBDD、SBDD) 已推进了治疗剂的鉴定和开发。FBDD 已促成 4 种药物（另有约 50 种药物处于临床前和临床开发阶段），而据估计，SBDD 已促成 200 多种 FDA 批准药物的开发。基于蛋白质 X 射线晶体学的片段库筛选，特别是针对难以捉摸或“无法用药”的靶标，可以同时生成命中结果以及蛋白质-配体相互作用和结合位点（正构或变构）的详细信息，从而为化学可处理性、下游生物学和知识产权提供信息。使用一种新型的高通量基于晶体学的片段库筛选平台，我们筛选了五种不同的蛋白质，命中率约为 2 e 8%，晶体结构约为 1.8 至 3.2 Å。我们考虑了当前的 FBDD/SBDD 方法和一些设计针对 DDR 核酸酶减数分裂重组 11（MRE11，又名 MRE11A）、无嘌呤/无嘧啶核酸内切酶 1（APE1，又名 APEX1）和 flap 核酸内切酶 1（FEN1）的抑制剂的示例性结果。© 2020 作者。由 Elsevier Ltd. 出版。这是一篇根据 CC BY-NC-ND 许可协议 ( http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ ) 开放获取的文章。
分段
癌症将直接影响超过三分之一人口的生活。DNA损伤反应 (DDR) 是一个复杂的系统，涉及损伤识别、细胞周期调控、DNA 修复以及最终的细胞命运决定，在癌症病因和治疗中发挥着核心作用。涉及 DDR 靶向的两种主要治疗方法包括：采用抗癌基因毒性剂的组合疗法；以及合成致死，利用散发性 DDR 缺陷作为癌症特异性治疗的机制。尽管许多 DDR 蛋白已被证明“无法用药”，但基于片段和结构的药物发现 (FBDD、SBDD) 已推进了治疗剂的鉴定和开发。FBDD 已促成 4 种药物（另有约 50 种药物处于临床前和临床开发阶段），而据估计，SBDD 已促成 200 多种 FDA 批准药物的开发。基于蛋白质 X 射线晶体学的片段库筛选，特别是针对难以捉摸或“无法用药”的靶标，可以同时生成命中结果以及蛋白质-配体相互作用和结合位点（正构或变构）的详细信息，从而为化学可处理性、下游生物学和知识产权提供信息。使用一种新型的高通量基于晶体学的片段库筛选平台，我们筛选了五种不同的蛋白质，命中率约为 2 e 8%，晶体结构约为 1.8 至 3.2 Å。我们考虑了当前的 FBDD/SBDD 方法和一些设计针对 DDR 核酸酶减数分裂重组 11（MRE11，又名 MRE11A）、无嘌呤/无嘧啶核酸内切酶 1（APE1，又名 APEX1）和 flap 核酸内切酶 1（FEN1）的抑制剂的示例性结果。© 2020 作者。由 Elsevier Ltd. 出版。这是一篇根据 CC BY-NC-ND 许可协议 ( http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ ) 开放获取的文章。