2015 - 2018 “ METRICS - Methodologies and technologies for the management and rehabilitation of historic centers and its ancient buildings ”, funded by the European Community and MIUR (Italian Department of University Research) , Assistant of Project Leader 2014 -2015 “ PON R&C – METROPOLIS - Methodologies and Technologies for Sustainable and Integrated adaptation and of Urban Systems Security ”, funded by the MIUR (Italian Department大学研究),2014年至2020年研究部门,“ OSDE(EEIG),脱离了Della Oxford University(英国), - 环境监测的卫星技术,英国欧洲社区,16789/14年,首席研究员,2016 -2018“ Enel&Pegaso Univ。 Enel Italy,首席研究员,2016年-2018“ Aeffe/Bosch Enterprise&Pegaso Univ。, - Bosch,Bosch,Bosch,EU,首席研究员2016 -2018” Delmare Group/Bosch Enterprise&Bosch Enterprise&Pegaso Univ。 MIT“ Sismabonus,Bosch,欧盟,首席研究员2016 -2020” 3D Markers Ltd&Pegaso Univ。 MIUR(意大利大学研究系),研究部门
关键词:定向进化,酶工程我们创建的酶催化了在生物系统中未知的反应。我们通过从现有蛋白质的“混杂”活性开始,指导新酶的演变,从而确定合成化学可能已知的催化活性,但尚未(尚未发现)。我们发现,血红素蛋白是新生物化学的绝妙来源:工程化的细胞色素P450和其他血红素蛋白催化了广泛的合成有用的碳和硝酸盐转移反应,从烷烃环丙烷从SI-C键形成到CH键的SI-C键形成,直达C-H键的氨化。观察大自然的巨大蛋白质目录的成员如何进化(只有几个突变)如何以高效率和选择性催化这些反应,甚至形成生物学中未知的化学键。这些结果表明,进化可以创新并使生活能够应对新的挑战或机遇的轻松。将来这些完全遗传编码的催化剂可能会进入生命未探索的大量化学空间。这些催化剂已经为使用化学计量试剂,罕见的过渡金属催化剂和有机溶剂提供了有效,成本效益,绿色的生物催化替代品,可在生产各种精美的化学品和药物中间体中生产有机溶剂。“用于碳硅键形成的细胞色素C的定向演变:将硅变成生命” S.B.J. Kan,R。D。Lewis,K。Chen,F。H。Arnold。 科学354,1048-1051(2016)。 Forte,D。Rozzell,J。 A. McIntosh,F。H。Arnold。 J.J. Kan,R。D。Lewis,K。Chen,F。H。Arnold。科学354,1048-1051(2016)。Forte,D。Rozzell,J。A. McIntosh,F。H。Arnold。 J.A. McIntosh,F。H。Arnold。J.“高度立体选择性的生物催化合成钥匙环丙烷中间至Ticagrelor” K。E. Hernandez,H。Renata,R。D. Lewis,S。B. J. Kan,C。Zhang,C。Zhang,J。J.ACS催化6,7810-7813(2016)。“酶控制的氮原子转移使C-H氨酸恢复”A. McIntosh,F。H。Arnold。 am。 化学。 Soc。 136,15505-15508(2014)“化学仿生生物催化:利用辅助因子依赖性酶的合成潜力来产生新的催化剂” C。K. Prier,F。H. Arnold。 J. am。 化学。 Soc。 137,13992-14006(2015)A. McIntosh,F。H。Arnold。am。化学。Soc。136,15505-15508(2014)“化学仿生生物催化:利用辅助因子依赖性酶的合成潜力来产生新的催化剂” C。K. Prier,F。H. Arnold。J.am。化学。Soc。137,13992-14006(2015)
2都灵大学,系理论物理学和INFN,通过朱里亚1、10125的意大利动机AP-2转录因子是发育调节的DNA结合蛋白的家族。它们由五个不同的基因(Alpha,beta,Gamma,delta和Epsilon)编码,但它们在DNA结合域中具有非常常见的结构。他们可以充当同二聚体或异二聚体。它们与富含GC的DNA序列结合,显然对不同的同工型没有任何特异性。AP-2通过调节特定基因在生长,分化,粘附和迁移中起相关的作用。方法为了鉴定新的AP-2Alpha调节基因,我们通过RNAi在上皮肿瘤细胞中下调了AP-2α的表达,我们通过微阵列分析(整个人类基因组44K,Agilent)研究了基因表达。结果我们发现,与对照细胞相比,在AP-2Alpha siRNA的细胞中719个差异表达的基因(FC> 1.5 PV <0.01):308上调-411下调。我们通过定量实时PCR验证了其中14个基因。然后,我们分析了寻找AP-2α结合位点的所有调制基因的调节区域。为此,我们确定了人和小鼠中每个蛋白质编码基因上游的15KB区域,并使用wublast局部比对程序进行了分析,以便用假定的调节作用定义人和小鼠之间的保守非编码块(CNB)。然后,我们对旨在鉴定调节元件的候选结合位点的这些区域中的寡核苷酸频率进行了统计分析。电子邮件:francesca.orso@ircc.it特别是,对于每一个可能的5至9个核苷酸长的DNA基序,我们都确定了一组人类基因,该基因在保守的上游区域中包含一个或多个代表过多的基序。然后,我们过滤了这些基因集,以独立于其基因本体论注释,寻找过度代表性的差异表达基因。通过这种方式,我们能够为AP-2定义许多推定的结合位点,并列出其他转录因子,这些因素可以与AP-2合作。非常重要的是,在我们的微阵列实验中调节的基因表现出高度不同的转录调节词汇。作为我们结果的测试,我们能够确认AP-2alpha与基因的调节区域的结合,例如内皮和平滑肌细胞衍生的神经蛋白类(ESDN),快速激酶(FastK)和ERERGULIN(EREG)和染色质免疫蛋白免疫蛋白(Chromatin Immununopitation)(Chip)。我们目前正在对表达AP-2GAMMA siRNA的细胞进行微阵列分析,以揭示该同工型的基因表达谱。我们的未来目标是确定可能的同工型特定AP-2结合基序。