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World File Search SystemGBS
优化 GBS 方案以实现牧草物种的有效基因分型
GBS（测序基因分型）以前被证明是一种经济高效且可靠的方法，可用于对几种牧草进行基因分型 [1; 2]。GBS 通过使用限制性酶来限制要扩增和测序的基因组部分（基因座）来降低基因组的复杂性 [3]。在某些情况下，当基因座数量相对于测序工作量而言很高时，就会生成许多基因座缺失数据的基因分型矩阵。因此，需要优化 GBS 协议以获得最多的基因座数量和最少的缺失数据比例。我们测试了几种限制性酶，并评估了在紫苜蓿（Medicago sativa）和鸭茅（Dactylis glomerata）两个物种中获得的基因座数量。对于紫苜蓿，我们还确定了在 1 066 个种质中获得的 SNP 和缺失数据的数量。
全球商业服务（GB）的未来
GBS的人才游戏是残酷的，是该领域领导者的首要挑战（请参阅图表3）。传统对成本效率和过程标准化的关注已将其视为低价值运营功能的看法。这通常会阻止高素质专业人员在GBS中寻求职业，从而将人才库限制在更加交易的心态的人身上。一旦获得人才，保留GBS角色的熟练专业人员可能同样具有挑战性。高流失率可以归因于几个因素，包括有限的职业发展机会，缺乏参与战略计划以及交易工作的单调。
塞拉利昂基本服务交付项目 (AGBSDP) 负责任治理 拨款编号：D8380-SL 发放日期：2024 年 4 月 22 日 任务标题：H
塞拉利昂基本服务交付负责任治理项目 (AGBSDP) 拨款编号：D8380-SL 发放日期：2024 年 4 月 22 日 任务名称：聘请一家咨询公司为 Kambia、Bonthe、Kailahun、Moyamba 和 Koinadugu 区议会制定五 (5) 项“地区收入调动和管理战略” 参考编号：SL-MOFED-421555-CS-CQS 塞拉利昂政府已从世界银行获得资金，用于支付基本服务交付负责任治理项目 (AGBSDP) 的费用，并打算将部分收益用于咨询服务。 活动目标 此项任务的目标是为 Kambia、Bonthe、Kailahun、Moyamba 和 Koinadugu 六个区议会分别制定“地区收入调动和管理战略”。这些针对地区的收入调动和管理战略将扩大地方议会的财政空间，以履行其核心职责。他们将加强资源管理系统，并向社区提供地方发展和其他下放服务。已聘请了一名顾问，为卡伦、博、法拉巴、科诺和普杰洪等区议会编写了《区议会自有收入管理指南》；以及 4（四）份《地区收入调动和管理战略》。编写《区议会自有收入管理指南》的理由在于，各区在管理自有收入方面有很多共同点。《地区收入调动和管理战略》将结合自有收入管理的共同点和特点。它将指导地方议会以一致和可行的方式管理自有收入，从而最大限度地调动自有收入。该活动与中期指标“已制定收入调动战略的区议会”挂钩。它将提高地方议会在各级以公平和可持续的方式调动地方收入的能力。
Guillain -Barré综合征（GBS）临床指南...
guillain-barré综合征（GBS）是周围神经系统（PNS）的炎症性疾病，是急性松性瘫痪的最常见原因，每年的全球发病率约为每100,000人年。这种疾病在儿童和青少年中稀少得多，每100,000 PYS的发生率为0.62 -0.75例。在大多数患者中，神经系统症状的急性发作是感染性疾病。这是单相疾病。
epiGBS 与 WGBS 结果比较
DNA 胞嘧啶甲基化是一种表观遗传机制，参与调节植物对生物和非生物胁迫的反应，其改变能力随胞嘧啶出现的序列环境（CpG、CHG、CHH，其中 H = 腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶）而变化。模型植物物种中的 DNA 甲基化定量通常通过全基因组亚硫酸盐测序（WGBS）进行，这需要高质量的参考基因组。精简代表性亚硫酸盐测序 (RRBS) 是一种经济有效的潜在替代方案，适用于基因组资源有限且实验设计规模大的生态研究。在本研究中，我们首次全面比较了 RRBS 和 WGBS 的输出，以表征 DNA 甲基化对给定环境因素的反应变化。具体而言，我们使用 epiGBS（最近优化的 RRBS）和 WGBS 来评估 Populus nigra cv. 无性系中昆虫和人工食草后的整体和序列特异性差异甲基化。 'italica'。我们发现，在两种食草处理中的任何一种之后，CHH 中的全局甲基化百分比都会增加，并且只有 epiGBS 检测到这种转变具有统计学意义。至于食草引起的位点特异性差异甲基化（epiGBS 中的胞嘧啶和 WGBS 中的区域），两种技术都表明昆虫和人工食草引起的反应具有特异性，并且 CpG 中的低甲基化和 CHH 中的高甲基化频率更高。当存在于 CpG 和 CHG 中时，甲基化变化主要发现在基因体和基因间区域，而在 CHH 环境中则发现在转座因子和基因间区域。因此，epiGBS 成功地表征了伦巴第杨对食草反应的全局全基因组甲基化变化。我们的研究结果支持 epiGBS 在旨在探索非模型植物物种对多种环境因素反应的表观遗传变化的大型实验设计中特别有用。
使用WGBS中的CNN模型召回低覆盖部位的DNA甲基化水平
DNA甲基化是基因转录的重要调节剂。WGB是DNA甲基化定量碱基分辨率的金标准方法。它需要较高的测序深度。许多CPG位点在WGBS数据中覆盖不足，导致单个位点的DNA甲基化水平不足。提出了许多图案计算方法来预测缺失值。但是，许多方法都需要其他OMICS数据集或其他跨样本数据。，其中大多数仅预测DNA甲基化状态。在这项研究中，我们提出了RCWGB，可以将相邻侧面DNA甲基化水平的缺失（或低覆盖率）值算。深度学习技术被用于准确的预测。H1-HESC和GM12878的WGBS数据集被下采样。RCWGB预测的12×深度的DNA甲基化水平之间的平均差异分别在H1-HESC和GM2878细胞中> 50倍深度的平均差异分别小于0.03和0.01。rcwgb的表现都比Methimpute更好。我们的工作将有助于处理低测序深度的甲基化数据。对于研究人员来说，通过计算方法节省了测序成本并改善数据利用是有益的。
通过分子对接，MM/GBSA计算，MD模拟和ADMET分析，从天然产物中鉴定自然产物的潜在人胰腺淀粉酶抑制剂
人胰腺α-淀粉酶（HPA）是碳水化合物水解的催化剂，是控制2型糖尿病的可行靶标之一。抑制α-淀粉酶低葡萄糖水平，有助于减轻高血糖并发症。在此，我们通过分子建模系统地从天然产物库中系统地筛选了潜在的HPA抑制剂。建模包括分子对接，MM/GBSA结合能计算，MD模拟和ADMET分析。This research identified new- boulaside B, newboulaside A, quercetin-3-O- β -glucoside, and sasastilboside A as the top four potential HPA inhibitors from the library of natural products, whose Glide docking scores and MM/GBSA binding energies range from -9.191 to -11.366 kcal/mol and -19.38 to -77.95 kcal/mol。基于模拟，其中newboulaside b被发现为最佳的HPA抑制剂。在整个模拟过程中，偏差为3Å（Acarbose =3Å），它与ASP356，ASP300，ASP197，THR163，ARG161，ASP147，ALA106和GLN63相互作用。此外，全面的ADMET分析表明，它具有良好的药代动力学特性，没有急性毒性，适中的生物利用和非抑制剂的性质，并且对细胞色素p450。所有结果表明，Newboulaside B可能是针对2型糖尿病的药物发现的有前途的候选人。