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GEDpm-cg：谷氨酸棒杆菌点突变构建基因组编辑自动化设计平台
机器人系统辅助基因组编辑技术和计算机辅助设计工具的进步极大地促进了微生物细胞工厂的发展。尽管目前已有多种独立的软件解决方案可用于载体DNA组装、基因组编辑和验证，但迄今为止仍然缺乏可以为整个基因组改造过程提供一站式服务的完整工具。这使得大量基因改造的设计，特别是构建那些需要严格精确的基因操作的突变，成为一个费力、耗时且容易出错的过程。在此，我们开发了一个称为GEDpm-cg的免费在线工具，用于设计谷氨酸棒杆菌的基因组点突变。选用自杀质粒介导的反选择点突变编辑方法和基于重叠的DNA组装方法来确保谷氨酸棒杆菌染色体上任何位置上的任何单核苷酸的可编辑性。设计结果提供了用于遗传修饰载体 DNA 组装和测序验证所需的引物，以满足所有实验需求。超过 10,000 个单点突变的计算机设计任务可以在 5 分钟内完成。最后，在 GEDpm-cg 的指导下，在谷氨酸棒杆菌中成功构建了三个独立的点突变，这证实了计算机设计结果可以准确无缝地与体内或体外实验衔接。我们相信该平台将提供一个用户友好、功能强大且灵活的工具，用于通过机器人/软件辅助系统对工业主力谷氨酸棒杆菌进行大规模突变分析。
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战术领域弱势网格的 SOA 建议
1.0 简介 1 1.1 范围 1 1.2 IST-118 团队介绍 1 1.3 本报告的范围和结构 1 2.0 方法 2 2.1 目的 2 2.2 螺旋方法 3 2.3 场景 4 2.4 网络类型 4 2.5 测试和评估 6 3.0 服务 6 3.1 NATO 核心服务 6 3.1.1 技术背景 7 3.1.2 W3C 的 Web 服务 – NATO 的选择 7 3.2 选定的核心服务 8 4.0 核心服务建议 8 4.1 跨层适配 10 4.1.1 哪些优化是可能的？ 10 4.1.2 IST-118 在跨层适配领域的贡献 10 4.1.3 前进的方向是什么？ 11 4.2 消息服务 11 4.2.1 请求/响应服务 11 4.2.2 发布/订阅服务 13 4.3 CIS 安全服务 15 4.3.1 使用哪些标准？ 15 4.3.2 这项服务在战术领域面临的主要挑战是什么？ 16 4.3.3 可以进行哪些优化？ 16 4.3.4 IST-118 在 CIS 安全服务领域的贡献 16 4.3.5 CIS 安全服务建议 17
参与社区计划 - 俄亥俄州斯普林菲尔德市
发展 38 创建社区发展公司 39 案例研究：NECIC：曼斯菲尔德北区 39 确定发展的起点 40 在资源和合作伙伴关系允许的情况下扩大发展力度 41 创建新公园 - 并非所有公园都适合小规模发展 43 案例研究：激活空白 45 尽早修复细节 46 案例研究：David Byrne 的自行车架 46 让历史重演 47 战略性地突出门槛 48 南喷泉历史街区的北入口和南入口 49 修复和改善主要交叉路口 50 创建共享箭头 51 粉刷街道 51 在人行横道处发出信号 51 减小半径并添加 ADA 人行道路缘坡道 52 添加交通信号灯 52
