一锅法组装来自多个组成部分的长 DNA 序列是快速生成现代合成生物学构建体的关键。一锅法组装由短悬垂结构(例如 Golden Gate)连接的多个片段的方法取决于准确和无偏的连接。迄今为止,连接点的设计很大程度上取决于经验法则和经验成功,而不是连接酶保真度和偏向性的详细数据。在本研究中,我们应用 Pacific Biosciences 单分子实时测序技术在一次实验中直接测量每个可能的 5′-四碱基悬垂结构配对的连接频率。该综合数据集已用于预测使用 IIS 型限制性酶 BsaI 的 Golden Gate 组装 (GGA) 的准确性。根据连接数据设计了十个片段组装,其中连接点预测会导致高或低保真度组装。实验结果不仅证实了总体准确性,还证实了观察到的特定错配连接错误及其相对频率。这些数据还用于设计 12 或 24 个片段的乳糖操纵子组装体,结果表明组装体具有高保真度和高效率。因此,连接酶保真度数据可以预测高精度突出端对集,设计灵活性比经验法则更高,即使在定义的编码区域内也可以在高精度连接点组装 20 多个片段,而无需修改天然 DNA 序列。
多个组件部分的长DNA序列的一锅组装是现代合成生物学构建的迅速产生的关键。的一锅组装方法的方法是由短悬垂链接的多个片段(例如金门)取决于准确和公正的连接。迄今为止的连接设计很大程度上取决于使用经验法则和经验成功的使用,而不是有关连接酶保真度和偏见的详细数据。在这项研究中,我们应用了太平洋生物科学单分子实时测序技术来直接测量单个实验中每个可能的5'基础悬垂配对的连接频率。使用IIS类型限制酶BSAI,已应用此综合数据集来预测金门组装(GGA)的准确性。基于连接数据设计的十个片段组件,其连接数据预计会导致高或低的保真度组件。实验结果不仅证实了总体准确性,还确认了观察到的特定不匹配连接误差及其相对频率。数据进一步用于设计LAC操纵子的12-或24-片段组件,这些组件被证明以高忠诚度和效率组装。因此,连接酶保真度数据允许预测高准确的悬垂对套件的设计比经验法则更大的灵活性,即使在定义的编码区域内,也可以在没有天然DNA序列修改的情况下,在高准确的连接点上安装> 20个片段。
额定负载电流 (2) 70 3 J A 44 88 1 0 6 浪涌电流 (3) A 1 1 1 1 5 5 1 6 4 1 4 6 199 2 1 7 风扇电机尺寸 KW 2x0.53 2x0.53 2x1.3 2x1.3 4x0.53 4x1.3 l-an 速度 Rev/sec.10.8 12.1 蒸发器水容量 升 45 45 40 62 66 95 R22 运行充注量 3B a a 千克 至 1 8 1 9 34 单位运行重量 千克 750 860 920 1'�I'10 1 380 Ioou (1) 一套 2 台歧管折叠式压缩机 尺寸 102、103、104,2 套尺寸 205 - 206 - 207 12) 415/3150,5 ba 吸入压力, 25 ba 排气压力 (3) 一个或三个压缩机运行,最后一个压缩机启动。