XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemGLYCAN
基于聚糖工程抗体的癌症治疗
引用：Bakare KM，Nkeiruka AM，Matthew Uo，Ebong GN，Oyekunle D等。（2024）免疫疗法对人体的影响：基于聚糖工程抗体的癌症治疗。J Comm Med and Pub
衰老的聚糖时钟 - 分析精度和时间 -
用于精确分析，在四26天内分析了三个不同的等离子体池，总共有312个。在短期可变性分析中，分析了两个队列：26个健康个体的阿斯利康MFO队列（中位年龄20岁）和70名青春期前中国妇女（中位年龄22.5）的队列在3个月内监测。长期可变性分析涉及两名47岁和57岁的成年男性，分别监测了5和10年。分别每3个月零3周收集样本。IgG n-聚糖分析遵循了独立的方法，通过分离IgG，其随后的变性和脱糖基化，然后进行聚糖清理和标记。毛细血管凝胶电泳用激光诱导的荧光（CGE-LIF）和超级性能液相色谱分析用于聚糖分析。统计分析
通过NMR光谱和分子动力学建模
摘要：人类唾液 - 酸性结合免疫球蛋白样凝集素-9（SIGLEC-9）是在几个免疫细胞上表达的糖免疫检查点受体。SIGLEC-9与含糖酸（唾液聚糖）的唾液酸的结合已充分记录，以调节其作为抑制受体的功能。在这里，我们首先使用良好的三维核磁共振（NMR）方法分配了SIGLEC-9 V-SET结构域（Siglec-9 D1）的氨基酸骨架。然后，我们将溶液NMR和分子动力学模拟方法结合在一起，以解释Siglec-9与天然配体α2,3和α2,62,6 siAllyl乳糖胺（SLN）（SLN）（SAIALYL LEWIS X（SALEX）（SALEX）和6-O硫的分子细节，并与两个固定型结合，并将其与两个固定型结合。正如预期的那样，在规范的唾液酸结合位点的F和Gβ链之间容纳了neu5ac。在NEU5AC的C9位置添加杂型支架9 N -5-（2-甲基噻唑-4-基）噻吩磺酰胺（MTTS）会产生与位于Siglec-9的N-末端区域的疏水性残基的新相互作用。同样，在neu5ac的C5位置添加芳族取代基（5- n-（1-二苯基 - 1 H-1 H- 1,2,3-三唑-4-基）甲基（BTC））稳定在SigleC-9中存在长长的B'-c loop的构象。这些结果暴露了负责SIGLEC-9对这两个改良的唾液聚糖的增强的亲和力和特异性的基本机制，并阐明了针对Siglec-9的下一代修改后的Sialoglycans的合理设计。■简介
FUT8 指导的 N-糖核心岩藻糖基化受糖结构和蛋白质环境调控
摘要：FUT8 是一种必需的 α -1,6-岩藻糖基转移酶，可使 N-糖链最内层的 GlcNAc 发生岩藻糖基化，这一过程称为核心岩藻糖基化。在体外，FUT8 表现出对双触角复合 N-糖寡糖 (G0) 的底物偏好，但 N-糖链所附着的底层蛋白质/肽的作用仍不清楚。在这里，我们用一系列 N-糖寡糖、N-糖肽和 Asn 连接的寡糖探索了 FUT8 酶。我们发现底层肽在少甘露糖（低甘露糖）和高甘露糖 N-糖链的岩藻糖基化中发挥作用，但对复合型 N-糖链不起作用。使用饱和转移差异 (STD) NMR 光谱，我们证明 FUT8 可识别 G0 N-糖链的所有糖单元和大多数氨基酸残基 (Asn-X-Thr)，这些残基可作为寡糖基转移酶 (OST) 的识别序列。在存在 GDP 的情况下观察到最大的 STD 信号，这表明 FUT8 必须先与 GDP-β-L-岩藻糖 (GDP-Fuc) 结合才能最佳地识别 N-糖链。我们利用 CHO 细胞的糖基化能力基因工程来评估 FUT8 在具有一组特征明确的治疗性 N-糖蛋白的细胞中对高甘露糖和复合型 N-糖链的核心岩藻糖基化。这证实了核心岩藻糖基化主要发生在复合型 N-糖链上，尽管显然只发生在选定的糖基位点上。消除细胞中复合型糖基化能力（KO mgat1）表明，当转化为高甘露糖时，具有复合型 N-糖的糖基位点会失去核心岩藻糖基化。然而有趣的是，对于在有效获取四天线 N-糖方面并不常见的促红细胞生成素，在高甘露糖 N-糖上，三个 N-糖基化位点中有两个获得了岩藻糖基化。对几种蛋白质晶体结构的 N-糖基化位点的检查表明，核心岩藻糖基化主要受 N-糖的可及性和性质的影响，而不是受底层肽序列的性质的影响。这些数据进一步阐明了细胞体外和体内不同的 FUT8 受体底物特异性，揭示了促进核心岩藻糖基化的不同机制。关键词：FUT8、核心岩藻糖基化、N-糖基化、STD NMR、酶动力学、高甘露糖N-聚糖、复合N-聚糖、寡甘露糖型N-聚糖■ 引言
通过难治性癌症中的聚糖裂解开发治疗性抗体增强剂
2008 年，我开始研究参与代谢调节的信号分子的作用机制，并发现氨基葡聚糖（一种葡聚糖）促进活性受体复合物的形成。2011 年，由于日本东部大地震，我的研究活动被迫停止。我的导师告诉我 RIKEN 的灾难受害者支持计划。我很幸运地被录取进入了这个项目，并加入了一个专门从事葡聚糖有机合成的实验室，继续我的研究工作 10 个月。在此期间，我与专门从事合成有机化学的化学家进行了多次讨论，我认识到从化学角度了解生物功能的好处。这让我有机会探索我之前一直在研究的分子生物学和细胞生物学方法，并将生物化学视角融入我对葡聚糖内在参与机制的研究中。
糖苷酶抑制剂对GcMAF的保护作用及Gc蛋白的聚糖结构研究
摘要：Gc蛋白中的O连接α-N-乙酰半乳糖胺（α-GalNAc）对巨噬细胞活化至关重要，因此Gc蛋白的GalNAc连接形式称为Gc巨噬细胞活化因子（GcMAF）。人血浆Gc蛋白中的O连接聚糖主要由三糖组成。Gc蛋白上的聚糖被α-Sia酶和β-Gal酶水解，剩下α-GalNAc，即产生GcMAF。GcMAF上存在的α-GalNAc水解后，该蛋白失去巨噬细胞活化作用。相反，我们合成的吡咯烷型亚氨基环多醇具有很强的体外α-GalNAc酶抑制活性。在本研究中，我们研究了亚氨基环多醇通过抑制α-GalNAc酶活性对GcMAF的保护作用。详细的质谱分析揭示了抑制剂对GcMAF的保护作用。此外，使用胰蛋白酶消化后的糖基化肽的串联质谱（MS/MS）分析获得了有关糖基化位点和聚糖结构的结构信息。
DNA，蛋白质，肽，糖，抗体和适体微阵列的开发和应用的最新进展
摘要：微阵列是过去二十年的开拓性技术之一，并且在生物学的所有相关领域都表现出了重要性。他们被广泛探索以筛选，识别和获得对生物分子（单独或复杂解决方案）特征性状的见解。A wide variety of biomolecule-based microarrays (DNA microarrays, protein microarrays, glycan microarrays, antibody microarrays, peptide microarrays, and aptamer microarrays) are either commercially available or fabricated in-house by researchers to explore diverse substrates, surface coating, immobilization techniques, and detection strategies.这篇评论的目的是探索自2018年以来的基于生物分子的微阵列应用程序的开发。在这里，我们涵盖了不同的印刷策略，底物表面修饰，生物分子固定策略，检测技术和基于生物分子的微阵列应用。2018 - 2022年期间着重于使用基于生物分子的微阵列识别生物标志物，病毒的检测，多种病原体的分化等。微阵列的一些潜在应用可能用于个性化医学，候选疫苗筛查，毒素筛查，病原体鉴定和翻译后修饰。
通过NMR光谱和分子动力学建模
摘要：人类唾液 - 酸性结合免疫球蛋白样凝集素-9（SIGLEC-9）是在几个免疫细胞上表达的糖免疫检查点受体。SIGLEC-9与含糖酸（唾液聚糖）的唾液酸的结合已充分记录，以调节其作为抑制受体的功能。在这里，我们首先使用良好的三维核磁共振（NMR）方法分配了SIGLEC-9 V-SET结构域（Siglec-9 D1）的氨基酸骨架。然后，我们将溶液NMR和分子动力学模拟方法结合在一起，以解释Siglec-9与天然配体α2,3和α2,62,6 siAllyl乳糖胺（SLN）（SLN）（SAIALYL LEWIS X（SALEX）（SALEX）和6-O硫的分子细节，并与两个固定型结合，并将其与两个固定型结合。正如预期的那样，在规范的唾液酸结合位点的F和Gβ链之间容纳了neu5ac。在NEU5AC的C9位置添加杂型支架9 N -5-（2-甲基噻唑-4-基）噻吩磺酰胺（MTTS）会产生与位于Siglec-9的N-末端区域的疏水性残基的新相互作用。同样，在neu5ac的C5位置添加芳族取代基（5- n-（1-二苯基 - 1 H-1 H- 1,2,3-三唑-4-基）甲基（BTC））稳定在SigleC-9中存在长长的B'-c loop的构象。这些结果暴露了负责SIGLEC-9对这两个改良的唾液聚糖的增强的亲和力和特异性的基本机制，并阐明了针对Siglec-9的下一代修改后的Sialoglycans的合理设计。■简介
精确的聚糖补充：在高应力商业环境中提高母鸡的性能和肠道健康的策略
时机和管理。兽医记录，175（1），19。https：// doi。org/10.1136/vr.102327 Bergstrom，K。S. B.，＆Xia，L。（2013）。粘蛋白 - o-聚糖及其在肠内稳态中的作用。糖生物学，23（9），1026 - 1037。https：// doi.org/10.1093/glycob/glycob/cwt045 Blokker，B.，Bortoluzzi，Bortoluzzi，C.，Iaconis，C.，Iaconis，C. （2022）。在肠内挑战下对肠肝脏健康标志物的新型精密生物评估和肉鸡的生长表现。动物：MDPI，12（19），2502。https：//doi.org/10的开放访问期刊。3390/ani12192502 Bolyen，E.，Rideout，J.R.，Dillon，M.R.，Bokulich，N.A. A.，Brislawn，C.J.，Brown，C.T.，Callahan，B.J.，Caraballo -Rodríguez，A.M.，Chase，J.，…Caporaso，J.G。（2019）。使用Qiime 2。自然生物技术，37（8），852 - 857。https：//doi.org/10.10.1038/s41587-019-019-019-019-0209-9 Bortoluzzi，C.，Tamburini（2023）。微生物组调节，微生物组蛋白代谢指数和补充具有精度生物的肉鸡的生长性能。家禽科学，102（5），102595。https：//doi.org/10.1016/j.psj.2023.102595 Bright，A。，A。，＆Johnson，E。A.（2011）。在商业自由范围内植物中窒息：初步研究。A.，＆Holmes，S。P.（2016）。（2013）。（2020）。（2018）。兽医记录，168（19），512。https：//doi.org/10.1136/vr.c7462 Broecker，F.，Martin，C。E.合成脂肪甲酸聚糖是潜在的候选疫苗，可防止艰难梭菌感染。细胞化学生物学，23（8），1014 - 1022。https：//doi.org/10.1016/j.chembiol.2016.07.009 Callahan，B.J.，McMurdie，P.J.dada2：来自Illumina Amplicon数据的高分辨率样本推断。自然方法，13（7），581 - 583。https：//doi.org/10.1038/nmeth.3869Corthésy，B。粘膜表面分泌IgA的多相功能。免疫学领域，4，185。https：//doi.org/10.3389/fimmu.2013.00185 Falker- Gieske，C.，Mott，A.，Preuß，S.，S.，Franzenburg，S.分析脑转录组的分析母鸡分发作用于羽毛啄食的线条。BMC基因组学，21（1），595。https：//doi.org/10.1186/s12864-020-07002-1 Gornatti- C. D.鸡和火鸡的坏疽性皮炎。兽医诊断调查杂志，30（2），188 - 196。https：//doi.org/10.1177/ 1040638717742435 de Gussem，M。（2010）。肉鸡和火鸡中细菌性肠炎的宏观评分系统。WVPA会议01/04/2010。Merelbeke，比利时。 Herbert，G。T.，Redfearn，W。D.，Brass，E.，Dalton，H。A.，Gill，R.，Brass，D.，Smith，C.，Rayner，A.C。，＆Asher，L。（2021）。 兽医记录，188（12），E245。Merelbeke，比利时。Herbert，G。T.，Redfearn，W。D.，Brass，E.，Dalton，H。A.，Gill，R.，Brass，D.，Smith，C.，Rayner，A.C。，＆Asher，L。（2021）。 兽医记录，188（12），E245。Herbert，G。T.，Redfearn，W。D.，Brass，E.，Dalton，H。A.，Gill，R.，Brass，D.，Smith，C.，Rayner，A.C。，＆Asher，L。（2021）。兽医记录，188（12），E245。在反复的窒息爆发中躺下母鸡的极端拥挤。https://doi.org/10.1002/vetr.245 Jacquier，V.，Walsh，M.C.，Schyns，G.，Clypool，J.，Blokker，B.（2022）。<精确生物对生长性能，福利指标，阿曼尼亚产量和肉鸡质量的审判。动物：MDPI，12（3），231。Kobierecka，P。A.，Wyszy可能J.和Jagustyn -Krynicka，E。K.（2017）。乳酸杆菌的体外特征。菌株从鸡肉挖掘拖拉段及其在抑制弯曲杆菌定殖的作用中的作用。微生物学，6（5），E0https://doi.org/10.1002/mbo3.512 Marcobal，A.，Southwick，A.M.，Earle，K.A。，＆Sonnnburg，J.L。（2013）。 精致的口感：肠道中宿主聚糖的细菌消耗。https://doi.org/10.1002/mbo3.512 Marcobal，A.，Southwick，A.M.，Earle，K.A。，＆Sonnnburg，J.L。（2013）。精致的口感：肠道中宿主聚糖的细菌消耗。
血浆蛋白，IgG和IgA n- ...
禁食胰岛素与众多聚糖性状表现出显着的关联，包括血浆蛋白半乳二糖基化，递糖化，分支，分支，核心葡萄糖基化和一分化，与IgG核心构成构成，脉络基分解，分成二偶联（FA2B）和抗性（FA2B）和抗性的（faSyyy） （A3G3S3）GLYCAN（P adj范围：4.37x10 -05 –4.94x10 -02）。胰岛素分析标记HOMA2-IR和HOMA2-％B主要与禁食胰岛素相同的聚糖结构相关。这两个标记均与高支流等离子体聚糖（P ADJ = 1.12x10 -02和2.03x10 -03）呈正相关，并且与低分支血浆聚集群（P ADJ = 1.21x10 -02 -02和2.05x10 -03）和负相关。此外，HOMA2-％B指数与描述IgG溶解度的糖基化特征显着相关。多个血浆蛋白IgG和IgA聚糖显示与总