使用的缩写:ACK,激活的CDC42相关酪氨酸激酶; GEF,鸟苷核苷酸交换因子; PH,Pleckstrin同源性; DH,DBL同源性; PIP 2,磷脂酰肌醇4,5-双磷酸;间隙,GTPase激活蛋白; GDI,鸟苷核苷酸解离抑制剂; SRF,血清反应因子; NF-κB,核因子κB; Jnk,c-jun n末端激酶;婴儿床,cdc42/rac-Interactive结合; REM,Rho ectector同源性; RKH,ROK – Kinectin同源性; MLC,肌球蛋白轻链; PI-4-P5K,磷脂酰肌醇-4-磷酸5-激酶; GTP [s],鸟嘌呤5« - [γ -thio]三磷酸; MAP激酶,有丝分裂原激活的蛋白激酶; MLK,混合细胞激酶; ACC,反平行线圈; BTK,布鲁顿的酪氨酸激酶; MBS,肌球蛋白结合亚基; ERM,Ezrin/radixin/Moesin; FH,形态学;黄蜂,Wiskott-Aldrich-Syndrome蛋白;波浪,黄蜂样的垂直蛋白质蛋白; lim激酶; EGF,表皮生长因子; TNFα,肿瘤坏死因子α; Mekk,地图激酶激酶激酶; PAK,P21激活的激酶; PKN,蛋白激酶N; MRCK,肌发育症激酶相关的CDC42结合激酶。1应向谁致辞(电子邮件Anne.bishop!ucl.ac.uk)。
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2025年3月7日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.03.02.641080 doi:Biorxiv Preprint
复原 我们建议在打开前先短暂离心此小瓶,使内容物沉至底部。请使用去离子无菌水复原蛋白质至浓度为 0.1-1.0 mg/mL。我们建议添加 5-50% 甘油(最终浓度)并分装以在 -20°C/-80°C 下长期储存。我们默认的甘油最终浓度为 50%。客户可以将其作为参考。
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感染反应和其他免疫相关基因(ILG)首先在秀丽隐杆线虫中命名 - 基于病原体挑战的表达,但是当脂质代谢受到干扰时,许多人也会上调。为什么病原体攻击和代谢变化两个增加ILGS尚不清楚。我们发现,当秀丽隐杆线虫中分泌细胞器的膜膜的磷脂酰胆碱(PC)水平变化时,ILG被激活。RNAi靶向ADP-核糖基化因子ARF-1(破坏高尔基体和分泌功能)也激活了ILGS。低PC限制ARF-1功能,这表明通过脂质代谢进行ILG激活的机制,这是作用于ER外的膜应激反应的一部分。RNAi在两个GFP替代者的分泌中发现了缺陷,并积累了病原体响应的补体C1R/C1S,UEGF,BMP1(CUB)域融合蛋白。我们的数据认为,某些ILG的上调是对贩运变化的协调反应,并且可能采取行动来抵消对分泌功能的压力。
背景:K-Ras 基因突变是各种癌症中最常见的基因变异之一,抑制 RAS 信号传导在治疗实体瘤方面显示出良好的效果。然而,寻找能与 RAS 蛋白结合的有效药物仍然具有挑战性。这促使我们探索可以抑制肿瘤生长的新化合物,特别是对于携带 K-Ras 突变的癌症。方法:我们的研究使用生物信息学技术,如 E-药效团虚拟筛选、分子模拟、主成分分析 (PCA)、超精度 (XP) 对接和 ADMET 分析,以确定 K-Ras 突变体 G12C 和 G12D 的潜在抑制剂。结果:在我们的研究中,我们发现阿法替尼、奥希替尼和羟氯喹等抑制剂对 G12C 突变体有强烈的抑制作用。同样,羟嗪、珠氯噻嗪、氟奋乃静和多沙普仑是 G12D 突变体的有效抑制剂。值得注意的是,这六种分子都对突变结构中存在的 H95 隐蔽沟表现出高结合亲和力。这些分子在分子水平上表现出独特的亲和机制,疏水相互作用进一步增强了这种亲和机制。分子模拟和 PCA 揭示了在开关区域 I 和 II 内形成了稳定的复合物。这在三种复合物中尤为明显:G12C-奥希替尼、G12D-氟奋乃静和 G12D-珠氯哌噻吨。尽管 K-Ras 中的开关 I 和 II 具有动态特性,但抑制剂的相互作用保持稳定。根据 QikProp 结果,与 sotorasib 相比,所选分子的性质和描述符在可接受范围内。结论:我们成功地鉴定了 K-Ras 蛋白的潜在抑制剂,为开发针对 K-Ras 突变驱动的癌症的靶向疗法奠定了基础。
1德国汉诺威汉诺威医学院病毒学研究所; 2抵抗 - 卓越群,德国汉诺威汉诺威医学院; 3德国慕尼黑慕尼黑技术大学病毒学研究所; 4德国弗莱堡大学弗莱堡大学医学中心病毒学研究所; 5美国普林斯顿大学普林斯顿大学分子生物学系; 6 MRC人类免疫学部门,MRC Weatherall分子医学研究所,Radcliffe医学系,牛津大学,牛津大学,英国; 7德国汉诺威 - 布劳恩斯乔格合作伙伴网站德国感染研究中心(DZIF),德国汉诺威; 8德国汉诺威汉诺威医学院的研究核心单位激光显微镜; 9德国慕尼黑的德国感染研究中心(DZIF),德国慕尼黑1德国汉诺威汉诺威医学院病毒学研究所; 2抵抗 - 卓越群,德国汉诺威汉诺威医学院; 3德国慕尼黑慕尼黑技术大学病毒学研究所; 4德国弗莱堡大学弗莱堡大学医学中心病毒学研究所; 5美国普林斯顿大学普林斯顿大学分子生物学系; 6 MRC人类免疫学部门,MRC Weatherall分子医学研究所,Radcliffe医学系,牛津大学,牛津大学,英国; 7德国汉诺威 - 布劳恩斯乔格合作伙伴网站德国感染研究中心(DZIF),德国汉诺威; 8德国汉诺威汉诺威医学院的研究核心单位激光显微镜; 9德国慕尼黑的德国感染研究中心(DZIF),德国慕尼黑