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基于结构的发现针对人多巴胺转运蛋白的新型变构抑制剂
摘要：人多巴胺转运蛋白（HDAT）调节细胞外多巴胺（DA）的再摄取，是中枢神经系统（CNS）疾病的必不可少的治疗靶标。数十年来已经确定了HDAT的变构调制。然而，运输基础的分子机制仍然难以捉摸，这阻碍了变构调节剂对HDAT的合理设计。在这里，进行了一种基于系统的结构方法，以探索内向开放（IO）构象中HDAT上的变构位点，并筛选具有变构亲和力的化合物。首先，基于最近报道的人类5-羟色胺转运蛋白（HSERT）和高斯加速分子动力学（GAMD）仿真的模型构建了HDAT结构的模型。然后，处理了HDAT上潜在的可药物变构位点，处理了七个Enamine化学库的虚拟筛查（〜440,000种化合物），导致10化合物用于体外测定法，并发现了Z1078601926，并发现了Z1078601926，发现了hdate hdat（IC 500.527）。 Nomifensine被引入为正构体配体。最后，使用额外的GAMD模拟和延迟自由能分析探索了Z1078601926和Nomifensine对HDAT的变构抑制的协同作用。■简介多巴胺转运蛋白（DAT）是属于较大的神经发射器钠钠共孢子（NSSS）的溶质载体6（SLC6）家族的成员。6这项工作中发现的命中化合物不仅为铅优化提供了一个良好的起点，而且还证明了该方法基于结构的发现的可用性，可以发现其他治疗靶标的新型变构调节剂。1 DAT功能通过将突触裂缝的多巴胺（DA）回收为突触前神经元，从而降低了多巴胺能系统的活性。2 DAT的失调被认为与抑郁症，注意力缺陷多动障碍（ADHD）和帕金森氏病（PD）等精神疾病有关。3，4此外，可卡因和甲基苯丙胺的药物滥用，这是一个广泛关注的公共卫生问题，也是由DAT功能障碍引起的。5因此，DAT被视为中枢神经系统（CNS）疾病的基本治疗靶点。
抑制剂和5-脂氧合酶之间的相互作用
摘要：炎症是由外部刺激触发的一种保护应力反应，5-脂氧合酶（5LOX）作为白细胞素（LTS）炎症途径的有效介质起着关键作用。Nordihydroguaiarovicac（NDGA）充当5LOX的天然正常抑制剂，而3-乙酰基-11-酮β-β-β-β-β-oboswordic Acid（AKBA）起着天然的变构抑制剂的靶向5LOX。但是，抑制的确切机制尚不清楚。在这项研究中，使用高斯加速分子动力学（GAMD）模拟来阐明5LOX上NDGA和AKBA的抑制作用机制。发现正构抑制剂NDGA紧密结合在蛋白质的活性口袋中，占据了活性位点，并通过竞争性抑制抑制了5LOX酶的催化活性。变构抑制剂AKBA的结合引起了远端活性位点的显着变化，从而导致残基168-173从环向α-螺旋变为α-螺旋，以及残基285-290和375-400之间的显着负相关运动，从而减少了这些细分之间的距离。在模拟中，蛋白质稳定构象中的活性腔体积减少，阻碍了底物进入活性腔，从而通过变构效应抑制了蛋白质活性。最终，Markov状态模型（MSM）用于识别和分类蛋白质的亚稳态状态，从而揭示了不同构象状态之间的过渡时间。总而言之，这项研究提供了Akba和NDGA对5LOX抑制机制的理论见解，为开发专门针对5LOX的新型抑制剂提供了新的观点，对抗炎药发育具有潜在的影响。