Thermo Scientific Genejet基因组DNA纯化试剂盒通过从200 µL血液中分离基因组DNA和5 mg的哺乳动物组织,遵循所述方案来获得资格。纯化的基因组DNA的A260/280比为≥1.7。在琼脂糖凝胶电泳和溴化乙锭染色后,看到一个超过30 kb的单个带。通过限制酶对单拷贝基因和消化的PCR扩增来评估基因组DNA的功能质量。
™DNA多样本Ultra 2.0套件是开发出可从多种样品矩阵的高质量DNA快速纯化的。DNA可以在下游应用的广泛分子生物学中使用,例如测序,基因分型和qPCR。该协议通过使用翠鸟自动隔离DNA自动隔离
工作流程。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。20制备无细胞样品。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。20选项1:裂解样品(使用PK),然后将CFDNA绑定到珠子上。。。。。。。。21选项2:裂解样品(无PK),然后将CFDNA绑定到珠子上。。。。。。。22用洗涤溶液洗涤。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。22用80%乙醇洗涤两次。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>23洗脱cfDNA。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>23 div>
Omega Bio Tek E.Z.N.A. 组织DNA KIT D3396-01 OMEGA BIO TEK MAG-BIND®血液和组织DNA HDQ 96 KIT M6399-00 OMAMGA BIO TEK E.Z.N.A. Kit CMG-196 Promega Wizard Genomic DNA Purification Kit A1120 Promega Wizard SV Genomic DNA Purification System A2360 Promega MagaZorb DNA Mini-Prep Kit MB1004 Promega ReliaPrep gDNA Tissue Miniprep System A2051 Promega Wizard HMW DNA Extraction Kit A2920 Promega ReliaPrep™ Blood gDNA Miniprep System A5081 Qiagen DNEasy Blood and Tissue Kit 69504 Qiagen QIAamp Fast DNA Tissue Kit 51404 Qiagen Puregene Tissue Kit 158063 Qiagen QIAGEN Genomic-tips 20/G 10223 Qiagen MagAttract HMW DNA Kit 67563 Qiagen QIAamp DNA Blood Mini Kit 51104 Qiagen Blood & Cell Culture DNA Mini Kit (25) 13323 Sigma-Aldrich Extract-N-AMP Tissue PCR Kit XNAT2-1KT Sigma-Aldrich GenElute Blood Genomic DNA Kit NA2010-1KT Takara NucleoSpin Tissue 740952.5 Takara NucleoMag Tissue 744300.1 Takara NucleoSpin® 96 DNA RapidLyse 740110.1 Takara NucleoBond HMW DNA 740160.2 Takara NucleoMag DNA Swab 744601.1 Takara NucleoSpin® Blood 740951.5 Takara NucleoMag® Blood 200 µL 744501.1 Thermo DNA Extract All Reagents Kit 4403319 Thermo MagMax DNA Multi-Sample Kit 4413020 Thermo JetFlex Genomic DNA Purification Kit A30700 Thermo GeneJet Genomic DNA Purification Kit K0721 Thermo GeneJet Genomic DNA Purification Kit K0721 Thermo PureLink Genomic DNA Mini Kit K182001 Thermo PureLink Genomic DNA Mini Kit K182001 Thermo ChargeSwitch gDNA Mini Tissue Kit CS11204 Zymo Quick-DNA MiniPrep D3024 Zymo Quick-DNA Miniprep Plus D4068 Zymo Quick-DNA magbead Plus Kit D4081 Zymo Quick-DNA HMW HMW Magbead d6060Omega Bio Tek E.Z.N.A.组织DNA KIT D3396-01 OMEGA BIO TEK MAG-BIND®血液和组织DNA HDQ 96 KIT M6399-00 OMAMGA BIO TEK E.Z.N.A. Kit CMG-196 Promega Wizard Genomic DNA Purification Kit A1120 Promega Wizard SV Genomic DNA Purification System A2360 Promega MagaZorb DNA Mini-Prep Kit MB1004 Promega ReliaPrep gDNA Tissue Miniprep System A2051 Promega Wizard HMW DNA Extraction Kit A2920 Promega ReliaPrep™ Blood gDNA Miniprep System A5081 Qiagen DNEasy Blood and Tissue Kit 69504 Qiagen QIAamp Fast DNA Tissue Kit 51404 Qiagen Puregene Tissue Kit 158063 Qiagen QIAGEN Genomic-tips 20/G 10223 Qiagen MagAttract HMW DNA Kit 67563 Qiagen QIAamp DNA Blood Mini Kit 51104 Qiagen Blood & Cell Culture DNA Mini Kit (25) 13323 Sigma-Aldrich Extract-N-AMP Tissue PCR Kit XNAT2-1KT Sigma-Aldrich GenElute Blood Genomic DNA Kit NA2010-1KT Takara NucleoSpin Tissue 740952.5 Takara NucleoMag Tissue 744300.1 Takara NucleoSpin® 96 DNA RapidLyse 740110.1 Takara NucleoBond HMW DNA 740160.2 Takara NucleoMag DNA Swab 744601.1 Takara NucleoSpin® Blood 740951.5 Takara NucleoMag® Blood 200 µL 744501.1 Thermo DNA Extract All Reagents Kit 4403319 Thermo MagMax DNA Multi-Sample Kit 4413020 Thermo JetFlex Genomic DNA Purification Kit A30700 Thermo GeneJet Genomic DNA Purification Kit K0721 Thermo GeneJet Genomic DNA Purification Kit K0721 Thermo PureLink Genomic DNA Mini Kit K182001 Thermo PureLink Genomic DNA Mini Kit K182001 Thermo ChargeSwitch gDNA Mini Tissue Kit CS11204 Zymo Quick-DNA MiniPrep D3024 Zymo Quick-DNA Miniprep Plus D4068 Zymo Quick-DNA magbead Plus Kit D4081 Zymo Quick-DNA HMW HMW Magbead d6060
方法:就本研究而言,来自肺,肝,结肠和肾脏的人FFPE活检组织是从单个中心的生物座席中获得的。基因喷气基因组DNA纯化试剂盒(目录#K0722)从Thermo Fisher Scientific和Recocousal kecouseall总核酸分离试剂盒中获得了从生活技术中获得的总核酸分离试剂盒,并分别用于提取DNA和RNA。简要地,修改涉及扩展试剂孵育时间,增加样品体积和洗涤步骤,并增加最终核酸的恢复和浓度步骤。将每个组织样品的8-10μm厚约8-10μm,并用于提取。使用纳米体分光光度计验证了获得的核酸的纯度。
囊性纤维化(CF)患者的肺肺部容易受到铜绿假单胞菌的感染(1)。cf肺通常由形成生物膜的非粘液铜绿假单胞菌菌株定植,并且在粘液菌株过量产生藻酸盐的出现后发生慢性感染(2)。他们的生物膜对抗生素和IMUNE介质具有高度抗性,并导致肺部下降(2,3)。铜绿假单胞菌菌株是从慢性感染的成年CF患者的痰液样本中分离出来的,并在法国南特的中心医院大学中心。由于这些痰样品仅用于分离细菌,但不用于人类细胞或人类DNA,因此法国法律(2016-1537,2016年11月16日)不要求由机构伦理委员会审查和批准该研究或参与者提供书面或言语知情的同意。细菌,并使用基质辅助激光解吸离子 - 流量质量光谱法(MALDI-TOF MS [VITEK; VITEK; BIOMERIERIEUX; BIOMERIERIEUX,MARCY-LECELANCE,france)鉴定为铜绿假单胞菌。使用了每个患者的单个分离株。主要基于它们的生物膜结构和粘液表型,分离株MUC-N1,MUC-N2,MUC-P4和MUC-P5被选择构成用于测试抗体FILM化合物的应变板(M. Simon,E.Pernet,E.Pernet,E.Pernet,E.Jouault,A.Jouault,E.Portier,E.M.Boukigb,S.Boukig,S。Pinaud,C。 POC-Duclairoir,M。G。J. Feuilloley,O。Lesouhaitier,J。Caillon,S。Chevalier,A。Bazire和A. Dufour,提交出版),促使我们对其基因组进行了测序。在37°C下在液体LB培养基中生长在LB琼脂板中挑选的单个菌落接种的液体LB培养基中生长,并使用基因组基因组DNA纯化试剂盒(Fisher Fisher Scientifip,France,France)使用基因组基因组DNA纯化的基因组DNA,并使用手机的推荐并评估了双重态度(There the)。量子液计(Thermo Fisher Scientifim,美国)和1%琼脂糖凝胶电泳。 使用Illumina Nextera XT DNA库准备套件制备了测序库,按照制造商的协议。 在Miseq仪器(LMSM基因组平台,Rouen Normandy University,Evreux,France,France,France)上进行了测序,并使用Miseq Reagent Kit Kit Kit v.3(2 250 BP)进行了双指数配对末端读数。 默认参数用于所有软件,除非另有说明。 使用Trimmomatic V.0.36(4)对读数进行修剪,并使用Multiqc 检查其质量在LB琼脂板中挑选的单个菌落接种的液体LB培养基中生长,并使用基因组基因组DNA纯化试剂盒(Fisher Fisher Scientifip,France,France)使用基因组基因组DNA纯化的基因组DNA,并使用手机的推荐并评估了双重态度(There the)。量子液计(Thermo Fisher Scientifim,美国)和1%琼脂糖凝胶电泳。使用Illumina Nextera XT DNA库准备套件制备了测序库,按照制造商的协议。在Miseq仪器(LMSM基因组平台,Rouen Normandy University,Evreux,France,France,France)上进行了测序,并使用Miseq Reagent Kit Kit Kit v.3(2 250 BP)进行了双指数配对末端读数。默认参数用于所有软件,除非另有说明。使用Trimmomatic V.0.36(4)对读数进行修剪,并使用Multiqc
