XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemGlioma
通过靶向下一代测序检测到的遗传改变及其在神经母细胞瘤中的临床意义
摘要。背景/目标：本研究研究了替莫唑胺（TMZ）和/或检查点激酶抑制剂AZD7762对人神经胶质瘤细胞的影响。材料和方法：胶质瘤细胞用TMZ和/或AZD7762处理24或48小时，然后研究了细胞存活，并研究了各种蛋白质的表达。结果：TMZ和AZD7762诱导的浓度和时间依赖性细胞毒性作用，以及TMZ和AZD7762（TMZ+AZD）的联合引起了胶质瘤细胞中的协同细胞毒性作用（P <0.05）。AZD7762抑制了O 6-甲基鸟氨酸-DNA-甲基转移酶（MGMT）的表达。tmz+AZD增加了磷酸p53（P-p53），p-p38有丝分裂原激活的蛋白激酶，磷酸酶和Tensin同源物的表达；并降低了胶质瘤细胞中p-细胞信号调节激酶1/2的表达和p-信号传感器和转录3的激活剂。结论：TMZ和AZD7762对人神经胶质瘤细胞的合并诱导的协同细胞毒性作用，并且这种作用可能与AZD7762诱导的MGMT表达抑制和多个信号通路的调节有关。
膜流动性的高通量分析揭示了免疫细胞状态中隐藏的维度
该项目由Hyundai Hope On Wheels Hope Scholar Award（PI：R.D.G，Grant＃716838）资助，并在美国游泳，包括R.D.G和H.E.M.的工资支持。O.P. 获得了NCI刺激获得居住研究（Starr）奖项的支持，该奖项是哥伦比亚癌症研究者研究计划的补充（R38CA231577）。 C-C.W获得了Gary and Yael Fegel Family Foundation（CU21-1080），St.Baldrick's Foundation（SBF CU21-0529），Star and Storm Foundation，Sebastian Strong Foundation和Matheson Foundation（UR010590）。 Flash Iradiator的开发得到了NIAID Grant U19-AI067773的部分支持，以及哥伦比亚大学欧文医学中心和Weill Cornell Medical Center的辐射肿瘤学系，以及Barry Neustein的无限制研究礼物。 ZZ实验室的研究得到NIND的支持（NS 132344）。 这项研究使用了由中心赠款P30CA013696资助的Herbert Irving综合癌症中心（HICCC）的共享资源，特别是分子病理学，流式细胞仪，肿瘤学精确治疗学和成像（Optic），以及基因组学和基因组学和高吞吐量筛选共享资源。 特别感谢流式细胞仪核心的帮助。 内容仅是作者的责任，并不一定代表NIH的官方观点。 致谢我们要感谢Oren J. Becher博士提供的Murine DIPG 4423 Cell系列，以及Jim Sharkey，Ron Drake和James Viera在包括Clinac设置和维护在内的Flash Iradiator上提供了帮助。O.P.获得了NCI刺激获得居住研究（Starr）奖项的支持，该奖项是哥伦比亚癌症研究者研究计划的补充（R38CA231577）。C-C.W获得了Gary and Yael Fegel Family Foundation（CU21-1080），St.Baldrick's Foundation（SBF CU21-0529），Star and Storm Foundation，Sebastian Strong Foundation和Matheson Foundation（UR010590）。Flash Iradiator的开发得到了NIAID Grant U19-AI067773的部分支持，以及哥伦比亚大学欧文医学中心和Weill Cornell Medical Center的辐射肿瘤学系，以及Barry Neustein的无限制研究礼物。ZZ实验室的研究得到NIND的支持（NS 132344）。这项研究使用了由中心赠款P30CA013696资助的Herbert Irving综合癌症中心（HICCC）的共享资源，特别是分子病理学，流式细胞仪，肿瘤学精确治疗学和成像（Optic），以及基因组学和基因组学和高吞吐量筛选共享资源。特别感谢流式细胞仪核心的帮助。内容仅是作者的责任，并不一定代表NIH的官方观点。致谢我们要感谢Oren J. Becher博士提供的Murine DIPG 4423 Cell系列，以及Jim Sharkey，Ron Drake和James Viera在包括Clinac设置和维护在内的Flash Iradiator上提供了帮助。此外，我们要感谢哥伦比亚大学的放射学研究加速器设施（RARAF）设施在闪光照射实验方面的帮助。
MAPK 抑制治疗儿童低级别胶质瘤的耐药性、反弹和复发再生长模式：一种改进的德尔菲法建立基于国际共识的定义-国际儿童低级别胶质瘤联盟
摘要 儿童低级别胶质瘤 (pLGG) 是最常见的儿童脑肿瘤组。当无法进行根治性切除时，其自然病程是一种慢性疾病，肿瘤稳定期和肿瘤进展期交替出现。虽然总体存活率很高，但许多患者会经历严重的、可能终生的疾病。由于突变事件，大多数 pLGG 具有潜在的 RAS/MAPK 通路激活，导致在临床试验中使用分子靶向疗法，最近监管机构批准了 BRAF 和 MEK 抑制组合用于 BRAFV600E 突变的 pLGG。尽管活动令人鼓舞，但由于药物耐药性，治疗期间可能会发生肿瘤复发，停止治疗后可能会出现肿瘤复发，或者据报道，一些患者在停止靶向治疗后 3 个月内出现快速反弹生长。在 pLGG 中，这些再生模式的定义尚未得到很好的描述。因此，国际儿童低级别胶质瘤联盟（一个由全球医生和科学家组成的团体）成立了耐药性、反弹和复发 (R3) 工作组，以研究耐药性、反弹和复发。采用改良的德尔菲方法，针对 pLGG 的再生模式制定了基于共识的定义和建议，并特别提到了靶向治疗。
机器学习在区分胶质瘤与脑转移瘤中的应用——系统综述
1 耶鲁大学医学院放射学和生物医学成像系，333 Cedar Street，PO Box 208042，纽黑文，CT 06510，美国；leon.jekel@yale.edu（LJ）；waverly.brim@yale.edu（WRB）；marc.vonreppert@yale.edu（MvR）；lawrence.staib@yale.edu（LS）；gabriel.cassinellipetersen@yale.edu（GCP）；sara.merkaj@yale.edu（SM）；harry.subramanian@yale.edu（HS）；tal.zeevi@yale.edu（TZ）；sam.payabvash@yale.edu（SP）；mingde.lin@yale.edu（ML）；jcui527@gmail.com（JC）；amit.mahajan@yale.edu（AM）； michele.h.johnson@yale.edu (MHJ)；ajay.malhotra@yale.edu (AM) 2 DKFZ 德国癌症联盟 WTZ 转化神经肿瘤学部，DKTK 合作站点，埃森大学医院，45147 埃森，德国；b.scheffr@dkfz-heidelberg.de 3 德国癌症研究中心，69120 海德堡，德国 4 约翰霍普金斯大学惠廷工程学院计算机科学系，3400 North Charles Street，巴尔的摩，马里兰州 21218，美国 5 Visage Imaging GmbH，Lepsiusstraße 70，12163 柏林，德国； kbousabarah@visageimaging.com 6 Visage Imaging Inc.，12625 High Bluff Dr，San Diego，CA 92130，美国 7 耶鲁大学医学院 Harvey Cushing/John Hay Whitney 医学图书馆，333 Cedar Street，New Haven，CT 06510，美国；alexandria.brackett@yale.edu 8 耶鲁大学医学院神经内科，15 York St Ste LCI702，New Haven，CT 06510，美国；antonio.omuro@yale.edu 9 耶鲁大学医学院神经外科系，New Haven，CT 06510，美国；veronica.chiang@yale.edu 10 耶鲁大学医学院治疗放射学系，New Haven，CT 06510，美国 * 通信地址：mariam.aboian@yale.edu
基于图像的胶质瘤分级的机器学习工具及其报告质量：挑战与机遇
1 耶鲁大学医学院放射学和生物医学成像系，333 Cedar Street，PO Box 208042，纽黑文，CT 06520，美国；sara.merkaj@uni-ulm.de（SM）；ryan.bahar@yale.edu（RCB）；tal.zeevi@yale.edu（TZ）；mingde.lin@yale.edu（ML）；ichiro.ikuta@yale.edu（II）；gabriel.cassinellipetersen@yale.edu（GICP）；lawrence.staib@yale.edu（LS）； sam.payabvash@yale.edu (SP) 2 乌尔姆大学神经外科系，Albert-Einstein-Allee 23, 89081 Ulm，德国 3 Visage Imaging, Inc.，12625 High Bluff Dr, Suite 205，San Diego，CA 92130，美国 4 Visage Imaging, GmbH.，Lepsiusstraße 70, 12163 Berlin，德国；kbousabarah@visageimaging.com 5 加州大学旧金山分校放射学和生物医学成像系，505 Parnassus Ave.，San Francisco，CA 94143，美国；john.mongan@ucsf.edu (JTM)；soommee.cha@ucsf.edu (SC) * 通信地址：mariam.aboian@yale.edu；电话：+650-285-7577 † 这些作者对这项工作做出了同等贡献。
评估用于跨医院的胶质瘤放射基因组研究的多功能机器学习模型
1个人工智能研究中心，美国国立高级工业科学技术研究所，2-3-26 AOMI，东京Koto-ku，东京135-0064，日本； rkawaguc@cshl.edu 2分子修改和癌症生物学部，国家癌症中心研究所，5-1-1 Tsukiji，Chuo-ku，东京104-0045，日本； satoshi.takahashi.fy@riken.jp（S.T。）; rhamamot@ncc.go.jp（R.H.）; sesejun@humanome.jp（J.S。）3美国纽约州冷春港1号冷泉港实验室，美国4个神经外科和神经肿瘤科，国家癌症中心医院，5-1-1 Tsukiji，Chuo-ku，toku-ku，东京104-0045，日本； yonarita@ncc.go.jp 5日本东京104-0045号库库（Chuo-ku）5-1-1 Tsukiji国家癌症中心医院诊断部。 mmiyake@ncc.go.jp 6神经外科部，大阪大学医学院研究生院，2-2 Yamadaoka，Sita 565-0871，日本； mail@manabukinoshita.com 7癌症转化研究团队，Riken高级情报项目中心，1-4-1 Nihonba-Shi，Chuo-ku，Tokyo，东京103-0027，日本8脑肿瘤转化研究所，国家癌症中心研究所，5-1-1 Tsukiji，Chuo-Ku，Toku-Ku，日本，日本Tsukiji 5-1-1 kichimur@ncc.go.jp 9 Humanome实验室，2-4-10 Tsukiji，Chuo-ku，东京104-0045，日本 *通信：masataka@ncc.go.jp;电话。： +81-3-3542-2511†由于他们参与了这项研究，因此第一作者。
超材料形式化方法可提高对脑组织活检中胶质瘤区域的识别
摘要：早期发现肿瘤使患者最终战胜癌症并康复的可能性更大。广义的癌症诊断的主要目标是确定患者是否患有肿瘤、肿瘤位于何处以及肿瘤的组织学类型和严重程度。癌症感染组织的主要特征是样本中存在神经胶质瘤细胞。目前的诊断方法主要侧重于微生物学、免疫学和病理学方面，而不是疾病的“超材料几何”。随着有效介质近似技术的发展，确定生物组织样本的有效特性并将其视为无序超材料介质已成为可能。它们的优势在于能够将生物组织样本视为具有经过充分研究的特性的超材料结构。在这里，我们首次介绍了有关生物组织超材料特性的研究，以识别脑组织中的健康和癌症区域。结果表明，超材料的特性会因组织类型（健康或不健康）的不同而有很大差异。获得的有效介电常数值取决于各种因素，例如样本中不同细胞类型的数量及其分布。基于这些发现，我们根据其有效介质特性对癌症感染区域进行了识别。这些结果证明了超材料模型能够识别癌症感染区域。所提出的方法可以对精确识别病理组织的方法学方法的发展产生重大影响，并可以更有效地检测与癌症相关的变化。
使用 CRISPR-dCas9-dnmt3a 系统进行 hTERT 基因修饰作为治疗胶质瘤的方法
背景：据报道，各种疾病（包括不同的癌症）中都存在异常的 DNA 甲基化模式。CRISPR/Cas9 是一种低成本、高效的基因编辑工具，最近彻底改变了生物技术。研究表明，CRISPR/Cas9 系统可以有效地靶向和纠正甲基化。目的：端粒酶对癌细胞的生存起着重要作用。它由 hTERT 基因编码。本研究评估了 CRISPR/Cas9 靶向 hTERT 治疗胶质瘤癌细胞的有效性。方法：使用携带 sgRNA 和 Cas9 杂交体的 EF1a-hsaCas9-U6-gRNA 载体转染 U87 胶质瘤细胞。研究了 4 和 8 µ g/mL 聚凝胺浓度以提高转染效率。使用实时 PCR 评估经过亚硫酸氢盐修饰的 hTERT 的表达水平。还使用流式细胞术和蛋白质印迹法来确定细胞中是否存在端粒酶。采用高分辨率熔解分析（HRM）检测hTERT启动子的甲基化情况，流式细胞术检测转染U87细胞凋亡率。结果：结果表明，gRNA显著提高了转染效果，4µg/mL聚凝胺和80µg/mL转染后，U87细胞中hTERT的表达与未转染gRNA和基底细胞相比有显著差异，流式细胞术显示转染细胞中hTERT水平降低，转染gRNA后U87细胞凋亡率高于未转染gRNA组。结论：设计的CRISPR/Cas9系统可以降低hTERT表达和端粒酶活性，从而抑制神经胶质瘤细胞生长。
BET 溴结构域抑制剂 HMBA 与 MEK 抑制剂协同作用治疗恶性胶质瘤
。CC-BY 4.0 国际许可，根据 提供（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者，此版本于 2020 年 1 月 2 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.01.01.891739 doi：bioRxiv 预印本
使用多阶段 Attention-GAN 进行高组织对比度 MRI 合成以进行胶质瘤分割
磁共振成像 (MRI) 基于强磁场提供内脏器官的不同组织对比度图像。尽管 MRI 在频繁成像方面具有非侵入性优势，但目标区域中的低对比度 MRI 图像使组织分割成为一个具有挑战性的问题。本文展示了图像到图像转换技术生成合成高组织对比度 (HTC) 图像的潜在优势。值得注意的是，我们采用了一种具有注意机制的新型循环生成对抗网络 (CycleGAN) 来增加底层组织内的对比度。注意力模块以及对 HTC 图像的训练引导我们的模型收敛到某些组织。为了提高 HTC 图像的分辨率，我们采用多阶段架构将焦点集中在一种特定组织作为前景，并在每个阶段滤除不相关的背景。这种多阶段结构还通过减小源域和目标域之间的差距来减轻合成图像的常见伪影。我们展示了我们的方法在脑部 MRI 扫描（包括胶质瘤）中合成 HTC 图像的应用。我们还在端到端和两阶段分割结构中使用 HTC MRI 图像来确认这些图像的有效性。在 BraTS 2018 数据集上对三个竞争性分割基线进行的实验表明，将合成的 HTC 图像纳入多模态分割框架中可分别将整个肿瘤、肿瘤核心和增强肿瘤的平均 Dice 得分提高 0.8%、0.6% 和 0.5%，同时从分割过程中消除了一个真实的 MRI 序列。