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针对 SARS-CoV-2 主要蛋白酶和刺突糖蛋白模型对近期 FDA 批准的抗癌药物进行潜在探索：一项计算研究
摘要：COVID-19 已成为全球几乎所有国家医疗保健系统的全球风险，该病毒起源于中国武汉。迄今为止，尚无可用于治疗该疾病的特定药物。SARS-CoV-2 的确切来源尚不清楚，尽管早期病例与华南华南海鲜市场有关。本文报告了最近 FDA 批准的抗癌药物（Capmatinib、Pemigatinib、Selpercatinib 和 Tucatinib）的计算机分子建模，以了解它们对 COVID-19 靶标的抑制作用。将选定的抗癌药物对接在 SARS-CoV-2 主蛋白酶（PDB ID：6LU7）和 SARS-CoV-2 刺突糖蛋白（PDB ID：6M0J）上，以确定这些药物的结合能力。评估了药物的 ADMET 参数，此外，还进行了 DFT 计算以研究药代动力学、热参数、偶极矩和化学反应性描述符。讨论了对接能 (ΔG) 和相互作用的氨基酸残基。已经得出了有希望的分子对接结论，证明了所选抗癌药物具有开发用于对抗 COVID-19 的合理药物的潜力。对该药物的进一步优化可能会支持缓解疫情所急需的快速反应。
真菌基因组学和进化中的巨大挑战
尽管健康的免疫系统能够识别和消除新兴的癌细胞，但已建立的肿瘤却擅长避免免疫监测。免疫抑制细胞表面碳水化合物的改变和特异性表达，也称为“肿瘤糖座”，是一种突出的机制，肿瘤可以逃避抗肿瘤免疫。鉴于它们持续且均匀的表达，肿瘤相关的聚糖是有望被利用为生物标志物和治疗靶标的靶标。然而，由于它们的免疫原性，免疫抑制特性以及在常规的主要组织相容性复合物（MHC）限制的方式中，对这些聚糖的剥削一直是一个挑战。尽管如此，表达T细胞受体（γδT细胞）的T表达伽马和三角洲链的T细胞的子集存在，具有MHC无限制的抗原识别和有效固有的抗肿瘤特性的能力。在这篇综述中，我们讨论了与肿瘤相关的聚糖在抗肿瘤免疫中的作用，并重点介绍了γδT细胞靶向肿瘤糖座的潜力。了解这种相互作用的许多方面具有解锁在新型治疗干预措施中使用肿瘤相关的聚糖和γδT细胞的新方法。
文章评估糖基化的FLPA和SODB作为针对鸡弯曲杆菌的亚基疫苗
摘要：弯曲杆菌空肠是全球人类胃炎的主要原因，并且处理或消费受污染的家禽肉是感染的关键来源。C.空肠蛋白FLPA和SODB和含有J. jejuni n -Glycan的糖缀合物分别据报道是鸡的部分保护性疫苗。在这项研究中，由蛋白质聚糖偶联技术产生的两种新型糖蛋白 - G-FLPA和G-SODB（分别具有两个和三个N-糖基化位点） - 通过相对于其Unglycosylsy-c. jejuni菌株M1的鸡肉菌菌株对鸡肉的肠道结构进行了评估。进行了两项相同设计的独立试验，以10 7菌落形成单位（CFU）或最低挑战剂量为10 2 CFU的Jejuni M1的高挑战剂量。在两项试验中都检测到抗原特异性血清Igy，但未观察到Jejuni M1的盲肠定植降低，并且疫苗抗原的糖基化对结果没有影响。我们的数据突出了在空肠梭菌疫苗接种试验结果中的不一致，该试验可能会反映抗原，挑战菌株，疫苗给药，辅助和鸡系特异性的差异。通过增加糖基化水平或使用高度免疫原性蛋白载体来改善糖结轭疫苗可以改善其效率。通过增加糖基化水平或使用高度免疫原性蛋白载体来改善糖结轭疫苗可以改善其效率。
糖酵解 - 炎症反应的关键人物
炎症反应涉及几种细胞类型的激活，以使其由大量药物引起的侮辱，并维持组织同种异体。一方面，涉及促炎性反应的细胞，例如炎性M1巨噬细胞，Th1和Th17淋巴细胞或活化的小胶质细胞，必须迅速提供能量以燃料燃料流量，这基本上是由糖溶解和高乳液产生来完成的。是涉及免疫调节和炎症分辨率的调节性T细胞或M2巨噬细胞，优先使用TCA循环将脂肪酸氧化作为能量生产的主要来源。在这里，我们讨论了糖酵解代谢在炎症反应的不同步骤中的影响。最后，我们回顾了多种分子机制，这些机制可以解释糖酵解代谢产物与促炎性弹药的关系之间的关系，包括信号事件，表观遗传重塑，转移后调节调节和后转化后的修改。炎症过程是许多与年龄相关疾病（例如心血管和神经退行性疾病）的共同特征。发现免疫代谢可能是炎症的主要调节剂，可以通过操纵血管和免疫细胞代谢的操纵来扩展用于治疗炎症相关病理的大道。
通过免疫信息学设计针对 nCOVID-19 的核衣壳磷蛋白 (N) 和刺突糖蛋白 (S) 的多肽疫苗
核衣壳蛋白 QIGYYRRATRRIRGG HLA-DRB1*11:01 IGYYRRATRRRGGD HLA-DRB1*11:01 GYYRRATRRRIGGDG HLA-DRB1*11:01 TPSTWLTYTGAIKL HLA-DRB1*07:01 DQIGYYRRATRRIRG HLA-DRB1*11:01 PQIAQFAPSASAFFG HLA-DRB1*09:01 WPQIAQFAPSASAFF HLA-DRB1*09:01 QIAQFAPSASAFFGM HLA-DRB1*09:01 IAQFAPSASAFFGMS HLA-DRB1*09:01 AALALLLLDRLNQLE HLA-DRB4*01:01，HLA-DPA1 03:01/DPB1*04, HLA-DRB3*01:0, HLA-DRB1*13:02, HLA-DRB1*11:0, HLA-DRB1*04:04, HLA-DRB1*01:01, HLA-DRB1*04, HLA-DPA1*02:01/DPB1*01:01, HLA-DPA1*01:03/DPB1*02:01, HLA-DRB1*04:05, HLA-DRB1*03:01, HLA-DRB1*08:02, HLA-DRB1*15:01, HLA DQA1*01:01/DQB1*05:01 ALALLLLDRLNQLES HLA-DRB4*01:01, HLA-DPA1*03:01/DPB1*04:02, HLA-DRB3*01:01、HLA-DRB1*13:02、HLA-DRB1*11:01、HLA-DRB1*04:04、HLA-DRB1*04:01、HLA-DRB1*01:01、HLA-DRB1*03:01、HLA-DRB1*04:05、HLA-DPA1*02:01/DPB1*01:01、HLA-DPA1*01:03/DPB1*02:01、HLA-DRB1*08:02、HLA-DRB1*15:01、HLA-DQA1*01:01/DQB1*05:01 PRWYFYYLGTGPEAG HLA-DRB1*07:01 RWYFYYLGTGPEAGL HLA-DRB1*01:01尖峰糖蛋白 AAEIRASANLAATKM HLA-DQA1*05:01/DQB1*03:01 NAQALNTLVKQLSSN HLA-DRB1*11:01 EVFNATRFASVYAWN HLA-DPB1*02:01、HLA DPB1*04:02、HLA-DPB1*05:01、 HLA-DQA1*01:02、HLA-DQA1*05:01、HLA-DQB1*03:01、HLA-DQB1*06:02、HLA-DRB1*01:01、HLA-DRB1*04:04、HLA-DRB1*04:05、HLA-DRB1*07:01、 HLA-DRB1*08:02、HLA-DRB1*09:01、 HLA-DRB1*11:01, HLA-DRB1*15:01, HLA-DPA1*03:01, HLA-DPB1*01:01, HLA-DPA1*01:03, HLA-DPA1*02:01 VFRSSVLHSTQDLFL HLA-DRB1*07:01, HLA-DRB1*01:01, HLA-DRB1*09:01, HLA-DRB1*04:05, HLA-DRB1*04:01, HLA-DRB1*03:01, HLA-DQA1*01:02/DQB1*06:02, HLA-DPA1*03:01/DPB1*04:02, HLA-DRB1*13:02, HLA-DPA1*02:01/DPB1*01:01、HLA-DRB4*01:01、HLA-DQA1*05:01/DQB1*02:01、HLA-DRB1*04:04、HLA- DPA1*01:03/DPB1*02:01、HLA-DQA1*05:01/DQB1*03:01 等位基因 HLA-DRB3*01:01、HLA-DRB4*01:01、HLA-DRB5*01:01 不可用，因此未将其纳入计算。
番茄中组成性甾体糖苷生物碱的生物合成受 IIIe 分支碱性螺旋-环-螺旋转录因子 MYC1 和 MYC2 调控
（未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2020 年 1 月 28 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.01.27.921833 doi：bioRxiv preprint
聚乙烯乙二醇对DNA吸附和杂交对
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一个极化编码的光子到旋转界面
摘要。心力衰竭和骨骼肌弱是糖基因论11型的主要临床特征，这是由酸A-葡萄糖苷酶缺乏引起的溶酶体储存障碍。在我们的研究中，我们已经在大鼠心脏灌注灌注系统中调查了酸A-葡萄糖苷酶是否可以从血管系统中吸收到心脏病中。将大鼠心脏用含有含磷酸盐的甘露糖含有甘露糖的含酸A-葡萄糖苷酶灌注，从Bovine睾丸纯化时，获得了3至4倍的酶活性。灌注含有含有甘露糖的6-磷酸盐识别标记物的人胎盘酸A-葡萄糖酶没有这种作用。通过免疫印迹证明了牛睾丸酸A-葡萄糖苷酶在心脏组织中的存在。免疫细胞化学为摄取心肌细胞溶酶体的外源性酶提供了证据。讨论了这些发现与I1型糖原病中酶治疗的相关性。（Pe-Diatr Res 28：344-347，1990）