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溶菌酶抑制剂作为溶菌酶分析的工具
摘要：溶菌酶是动物先天免疫系统的通用成分，它们通过水解其主细胞壁聚合物肽聚糖而杀死细菌。已经确定了三个主要的溶菌酶家族，称为鸡（c） - ，鹅（g）和无脊椎动物（i）-type。在反应中，细菌对三个溶菌酶家族中的每一个都进化了特定的蛋白抑制剂。在这项研究中，我们开发了由三个由C-，G-和I型型抑制剂功能化的三个Af-fiential矩阵的序列阵列，用于溶菌酶键入，即检测和区分溶菌酶从动物中流动或提取物。该工具在蓝贻贝（Mytilus Edulis）上进行了验证，其基因组具有多种推定的I-，G-和C型溶菌酶基因。血淋巴等离子体包含I-和G型，但不含C型溶菌酶。此外，分别分析了缺乏或过量产生I-type或G-type溶菌酶抑制剂的嗜水和大肠杆菌菌株的血淋巴存活，以研究两种溶菌酶在先天免疫中的作用。结果表明，G型溶菌酶在蓝贻贝的先天免疫中发挥了积极作用，但未能显示I-type溶菌酶的贡献。使用基于抑制剂的AFINIDE色谱法进行溶菌酶填充将是研究动物先天免疫的有用新工具。
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嵌合末端标记（METa）组装技术高效构建功能性宏基因组文库
摘要 功能性宏基因组文库是一种物理细菌文库，可以高通量捕获和表达微生物组基因，在无需测序和不依赖培养的宏基因组探索中发挥了重要作用。然而，这些文库的制备往往受到其高 DNA 输入要求和低克隆效率的限制。在这里，我们描述了一种新方法，即镶嵌末端标记 (METa) 组装，用于高效的功能性宏基因组文库制备。我们将标记技术应用于来自土壤和肠道微生物组的宏基因组 DNA，以制备 DNA 插入物，从而高通量克隆到功能性宏基因组文库中。所得 DNA 片段中镶嵌末端序列的存在与基于同源性的组装克隆协同作用，使克隆效率与传统的基于平头克隆的协议相比提高了 300 倍。我们表明，与使用最新协议制备的已发表文库相比，METa 组装的效率平均高出约 20 到 200 倍，只需 200 ng 输入 DNA 即可制备千兆碱基大小的文库。我们首先通过使用标准 5 mg 质量的土壤宏基因组 DNA 制备出一个 700 Gb 的文库来展示 METa 组装的实用性，这使得我们发现了新的诺尔丝菌素抗性基因和一种潜在的新抗性模式；其次通过使用仅 300 ng 的鹅粪便宏基因组 DNA 制备出一个 27 Gb 的文库，该文库捕获了大量四环素和粘菌素抗性基因。METa 组装为制备功能性宏基因组文库提供了一种简化、灵活且有效的方法，为低生物量或稀缺微生物组的遗传和生化研究开辟了新途径。
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简介：文化之战
“战争，笨蛋！战争随时都会爆发，你认为战争爆发时我们谁也不会留在大学里，对吧？”（米切尔 2）。这些台词出自玛格丽特·米切尔 1936 年的历史小说《乱世佳人》的开头，是小说中两位渴望参加美国内战的男士之一对女主角斯嘉丽·奥哈拉说的。斯嘉丽沮丧地回答道：“你知道不会有战争的……这只是说说而已……不会有战争的，我已经厌倦了听到这些话”（2）。这些人用更加沮丧的语气向斯嘉丽保证，战争确实会发生，而南部邦联（一群在亚伯拉罕·林肯总统就职后脱离联邦的美国南部州）将会击败“北方洋基”，向世界展示南部邦联的力量和勇气。斯嘉丽不会接受这一切；她的回答明确而直接：“如果你再说一次‘战争’，我就进屋关上门。我这辈子从来没有像‘战争’这样厌倦过任何一个词。”（3）。像斯嘉丽·奥哈拉一样，几个世纪以来，许多人通过政治论文、哲学论文、各种文化表达形式和其他表达方式表达了对战争的厌恶、不满和憎恶。尽管这些反战言论和言论多年来赢得了广大民众的支持，但战争仍然
学术共享引文 学术共享引文 Schwarz, Kurt A.，“利用增材制造技术对飞机加油门铰链进行制造和装配分析及重新设计”（2015 年）。学位论文。 283. https://commons.erau.edu/edt/283
图 1：光聚合物分层系统 (Wikipedia.org)。.............................................................. 2 图 2：使用相交激光束的光雕塑过程 (Swainson, 1977)。......... 3 图 3：塔式喷嘴固体自由成型技术 (drajput.com).................................... 4 图 4：简单的分层铸造模具 (DiMatteo, 1976)。.............................................................. 4 图 5：粉末选择性激光烧结工艺 (Wikipedia.org)。................................................ 5 图 6：FDM 工艺图 (Reprap.org)。.................................................................... 7 图 7：DFA 分析软件用户界面 (Boothroyd et al, 2011)。.................................... 11 图 8：MakerBot 的 MakerWare 用户界面。(Makerbot.com) .................................... 14 图 9：简化的挤压系统，说明轴位置 (Wikipedia.org)。........... 20 图 10：GE Aviation 的增材制造燃油喷嘴 (Rockstroh 等人，2013)。......... 21 图 11：通过 DMLS (EADS) 优化和制造的两个航空航天支架。....... 23 图 12："Over-the-wall" 设计方法的说明 (Munro & Associates，1989)。...... 24 图 13：成本与影响图“谁投下的阴影最大？” （Munro & Associates，1989）。...................................................................................................................................... 24 图 14：显示不同材料和制造方法之间兼容性的图表（Boothroyd & Dewhurst，2011）............................................................................................. 26 图 15：alpha 和 beta 旋转对称值（Boothroyd et al，2011）。................... 28 图 16：影响零件处理的几何（左）和其他（右）特征（Boothroyd et al，2011）。...................................................................................................................................... 28 图 17：提高组装简易性的示例（Boothroyd et al，2011）。................................ 28 图 18：影响插入时间的零件特征原始分类系统 (Boothroyd Dewhurst, Inc. 1999)。...................................................................................................................... 30 图 19：影响手动处理时间的零件特征原始分类系统 (Boothroyd Dewhurst, Inc. 1999)。................................................................................................ 31 图 20：原始控制器组件（Boothroyd 等人，2011 年）。...................................................... 32 图 21：分析前（左）和分析后（右）的控制器组件（Boothroyd 等人，2011 年）。........................................................................................................................................... 34 图 22：当前门铰链的组件。........................................................................................................... 35 图 23：两个已安装铰链的 CATIA 模型和负载分析方向（湾流宇航）。.................................................................................................................................... 36 图 24：弹簧球和铰链止动器的特写............................................................................. 37 图 25：重新设计的用于增材制造的门铰链。.................................................... 39 图 26：鹅颈加固前后的视觉对比。........... 41 图 27：重新设计前后球柱塞壳体的视觉对比。........... 41 图 28：原始铰链组件上用于插入计算的投影槽。......... 43 图 29：重新设计的铰链组件上用于插入计算的投影槽。.... 43