对于大多数生物体,DNA采用了负超螺旋的状态[( - )SC],该状态已知促进DNA螺旋的疾病,从而促进与关键细胞过程有关的分子机械获得遗传信息的获取(1)。相比之下,在DNA复制和转录机械之前生成正涂层[(+)SC](2)。在没有放松(+)SC的拓扑异构酶的情况下,这些基本过程受到阻碍(3)。IIA型DNA拓扑异构酶(topoiia)是进化保守的大分子,通过通过短暂的双链断裂,使DNA弛豫,衰减和脱节来调节DNA拓扑,从而调节DNA拓扑。拓扑素酶是用于传染病和癌症治疗的治疗剂的主要靶标(5,6)。
本质上,芳香族寡酰胺的行为就像分子变色龙一样,它们可以符合蛋白质和DNA中存在的α-螺旋,并介入蛋白质蛋白质和蛋白质核酸复合物。自然也以膀胱二胺和阿昔霉素的形式出现在这种类型的特权结构[15]中,但也可以在此处列出Netropsin。cystobactamids首先由Müller和同事[16]描述,他们将它们与囊肿属的粘菌病分离出来。CBV34。后来,它们也被发现在囊肿,粘膜球菌和冠状球菌的菌株中。囊肿 - 二酰胺4 - 8 [17]可以分为两个子类,这些子类携带同甲氧蛋白酶或β-甲氧基 - 帕拉金部分连接到寡酰亚胺的子类(图3)。在已知的自然存在的膀胱胺中,861-2(8)是最活跃的成员,它抑制了几种临床相关的革兰氏阳性和革兰氏阴性菌株(baumannii:mic =0.5μg/ ml,cintrobacter freundii:mic = 0.06μg/ ml,mic =0.5μg/ ml WT-III marR Δ 74bp: MIC = 0.5 μ g/mL, carbapenem-resistant P. aeruginosa CRE: MIC = 1.0 μ g/mL, and Proteus vulgaris : MIC = 0.25 μ g/mL) [17] whereby the activity of bacterial type IIa topoisomerases is inhibited.已经报道了膀胱菌的几种总合成[17,18]以及衍生物的文库,作为药物化学计划的一部分。[19]
使用该酶的浓度。应在将使用的DMSO的最终浓度下进行酶的初始滴定(请参见上面的注1)。可以使用5-10%(v/v)DMSO(最终浓度),但这将导致活动巨大损失。在存在DMSO的情况下,需要添加更多酶,以允许其抑制作用。例如,如果酶在5%DMSO的存在下仅具有50%的活性,则是两倍(即2U)将需要添加以获得完整的超螺旋。在这种情况下,可能需要添加更多的抑制剂才能获得50%的抑制作用。4)稀释缓冲液含有高浓度的甘油,因此添加了总稀释缓冲液