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特刊“表观遗传景观的氧化还原调控”“氧化应激介导的组蛋白翻译后修饰的改变”
2-HG：D-2-羟基戊二酸。4-HNE：4-羟基-2-壬烯醛。4-ONE：4-氧代-2-壬烯醛。BEAS-2B：用 Ad12-SV40 2B 转化的支气管上皮。CAF-1：染色质组装因子-1。CYP2E1：细胞色素 P450 家族 2 亚家族 E 成员 1。DDR：DNA 损伤反应。DSB：双链断裂。EMT：上皮间质转化。ER：雌激素受体。EWS：尤文氏肉瘤。GLO1：乙二醛酶 1。GSH：谷胱甘肽。GSNO：亚硝基谷胱甘肽。HAT：组蛋白乙酰转移酶。HDACi：组蛋白去乙酰化酶抑制剂。HDACs：组蛋白去乙酰化酶。HFD：组蛋白折叠域。 HIRA：组蛋白细胞周期调节剂。HMT：组蛋白甲基转移酶。HUVEC：人脐静脉内膜细胞。IDH：异柠檬酸脱氢酶。IL：白细胞介素。jmjCs：jumonji 蛋白。LOXL2：赖氨酰氧化酶样 2。LSD1：赖氨酸特异性脱甲基酶 1。LTQ：赖氨酸酪氨酸醌结构域。MGO：甲基乙二醛。MnSOD：锰超氧化物歧化酶。MS：质谱法。NAC：n-乙酰半胱氨酸。NSCLC：非小细胞肺癌。ONOO -：过氧亚硝酸盐。oxiPTMs：氧化翻译后修饰。PARP：聚 ADP 核糖聚合酶。PDXs：患者来源的异种移植。PTMs：翻译后修饰。 RNOS：活性氧和活性氮氧化物。ROS：活性氧。SAHF：衰老相关异染色质灶。SAM：S-腺苷甲硫氨酸。SLE：系统性红斑狼疮。TNBC：三阴性乳腺癌细胞。V/ST：伏立诺他/替莫唑胺。α-KG：α-酮戊二酸
癌症相关的卡希克西亚和潜在治疗策略中的异常脂质代谢
糖尿病和动脉粥样硬化（AS）是两个密切相关的疾病，显着影响全球健康（1）。为特征是动脉壁中炎性细胞，脂质和纤维元素的进行性积累，是心血管疾病（CVD）的主要原因（2）。CVD仍然是糖尿病患者发病率和死亡率的主要原因（3）。载脂蛋白E（APOE）是AS的有效抑制剂。apoE-敲除（APOE-KO）小鼠通常在AS研究中使用，因为它们的AS的发展（例如高脂饮食（HFD））（HFD）（4）。最近的研究强调了糖尿病是动脉粥样硬化病变发展和进展的重要危险因素（5）。已知泡沫巨噬细胞和内皮细胞之间的复杂串扰在斑块形成中起着至关重要的作用，斑块形成是AS的标志（6-8）。糖尿病对主要源于慢性高血糖的影响，这会产生一种持续的炎症微环境，从而促进了作为发育的促进（9）。在这种微环境中，巨噬细胞起着至关重要的作用，因为它们不仅有助于斑块形成泡沫细胞，而且还与其他细胞（例如内皮细胞，间质细胞，纤维细胞，纤维细胞和其他免疫细胞）积极相互作用（10）。在这些相互作用期间，巨噬细胞可以响应高血糖症来改变其表型或极化（11）。表观遗传变化发生在巨噬细胞和糖尿病的其他细胞类型中（12）。这些变化是指基因表达中的修改，而不会改变潜在的DNA序列（12），例如组蛋白甲基转移酶（HMTS），组蛋白脱乙酰基酶（HDACS）和DNA甲基转移酶（DNMTS）（DNMTS）（13）。这些酶调节促炎基因，脂质代谢基因和细胞粘附分子的表达，有助于动脉粥样硬化病变的发展和进展（13）。了解这些表观遗传调节剂在与糖尿病相关的动脉粥样硬化中的特定作用可以帮助确定用于预防和治疗的新型治疗靶标。此外，已经研究了在糖尿病与动脉粥样硬化的背景下，不同表观遗传调节剂与其他因素（例如氧化应激和晚期糖基化终产物（年龄））之间的相互作用（14）。在糖尿病中的发展过程中，巨噬细胞经历表观遗传学改变，例如DNA甲基化和组蛋白修饰，这些改变会影响其激活，极化和功能（12）。例如，特定促弹性基因的启动子区域可能表现出降低的DNA甲基化，从而导致表达增强并促进亲动氏源性环境（12）。此外，可能会发生不同的翻译后修饰，以改变染色质结构和可访问性以影响基因表达（12）。在与糖尿病相关的AS的背景下，巨噬细胞可能会在涉及炎症，脂质代谢和细胞粘附的基因上表现出改变的组蛋白修饰模式（15）。在促炎基因上增加的组蛋白乙酰化或甲基化可能会促进这些基因的表达，从而进一步加剧AS（16）。
• 1 ml mm i - 澳大利亚海军联盟
联邦委员会首席赞助人 Hi* EneeUtncy 总督 PraairJenl F Geotlrey Evar* OBE VRO Vrce-PreelOenta：R*a' Arjm.rai A j Robedion AO DSC FUN I Rid I JonnB-d Hon 秘书：John WaXni PO Boi 269 Bonwood V.k^ M*a*»> 4 Eleanor Court Donvate W 3111 电话 841 7064 昆士兰分部 赞助人：Ha' Enceeency。Oueenaiaid 州长 Pteaident IM friMH 荣誉牧师：HD Poulon HFD PO Bo. 170 Cleveland OW 4163 Ptwic 3452)74 澳大利亚首都领地分部 赞助人。 Arjm.rai Sri Vrclor Smrth AC KBE.C8 DSC RAM (Fhol Pteeidenl HA Joiephs AM 荣誉牧师 EM Mahonev 45 Skinner Street Cook ACT 2614 电话 251 1833 南澳大利亚分部 赞助人 Hs E«oaeency 州长 Soutfi Ausl'aha Praaidant：OM Sdrapei 荣誉牧师：Mru JEG* GPO Bo. 1529 Adeie-Je SA 5001 电话 347 1985 塔斯马尼亚分部 赞助人 Hs Eicaaancy 州长 Tasmania Preaident MJ Cooper 荣誉牧师：Mn JM Coope' 42 Amy Road Launtealon Tas 7250 电话 44 1531 西澳大利亚分部 赞助人 Hn E.ce«en<-y 卫斯理总督 AuiDaiia Praaidant：AH Hewrti JP Hon Sacratary：G Hewn 23 La* 女士
naringin通过刺激脂肪的热生成和褐变来改善肥胖，并调节饮食诱导的肥胖小鼠的肠道菌群
naringin是一种主要在柑橘类水果中发现的天然黄酮，由于其公认的抗氧化，抗炎和心脏保护属性，人们引起了人们的注意。但是，纳林蛋白在调节能量消耗中的功能知之甚少。在本研究中，我们观察到补充十二周的纳林蛋白补充剂基本上重塑了高脂饮食（HFD）喂养小鼠的代谢特征，通过抑制体重增加，减轻肝脏体重和改变身体成分。值得注意的是，Naringin通过增强棕色脂肪组织（BAT）（BAT）和刺激腹股沟白色脂肪组织（IWAT）刺激褐变的肉基因活性来增强测试小鼠的全身能量消耗的能力。此外，我们的结果表明，补充纳林蛋白改变了肠道菌群的组成，SPE逐渐增加了双歧杆菌和lachnospiraceae_bacterium_28-4，同时减少了lachnospiraceae_bacacterium_baccetterium_bactterium_bacterium_bacterium_bacterium_bacterium_bacterium_dww59 and dubosecress_n。随后，我们还发现，补充纳尔·英丁（Nar Ingin）通过显着促进牛磺酸，酪醇和胸腺的产生，改变了粪便代谢物谱，它们充当热量调节的有效活化剂。有趣的是，纳林蛋白的代谢作用通过抗生素干预消除了肠道菌群消耗，同时导致纳林蛋白诱导的热生成的消失以及对饮食诱导的肥胖症的保护作用。这一发现揭示了肠道细菌和脂肪组织之间的新型食物驱动的横截面通信。collective，我们的数据表明，补充纳林蛋白会刺激蝙蝠的热发生，改变脂肪分布，促进褐变过程，从而抑制体重增加。重要的是，这些代谢作用需要肠道细菌的参与。
polyphenols-as As调制剂，成立的gut- ...
缩写：Alt，丙氨酸氨基转移酶；猿，苹果多酚提取物； apoe /，载脂蛋白E； AST，天冬氨酸氨基转移酶； BMI，体重指数； BW，体重； CD，克罗恩病； CRC，结直肠癌； CRP，C反应蛋白； CTR，控制； DGGE，变性梯度凝胶电泳； DP，聚合程度； DSS，硫酸葡萄糖钠； EGCG，epigallocatechin Gallate； EGCG3-ME，Epigallocatechin 3- O-（3- O-甲基）透足； f，分数； f/b，企业/杀菌剂； GMCSF，粒细胞巨噬细胞群刺激因子； GRO，生长调节的癌基因； GSPE，葡萄种子原腺苷提取物； GTE，绿茶提取物； HBA1C，血红蛋白A1C； HFD，高脂饮食； HFHSD，高脂高蔗糖折叠； HTS，高通量测序； IBD，炎症性肠病；国际益生菌和益生元科学协会Isapp； LDLR /，LDL受体缺陷; LFD，低脂饮食； LPS，脂多糖； MCD，蛋氨酸 - 胆碱缺乏；大都会，代谢综合征； NAFLD，非酒精性脂肪肝病；纳什，非酒精性脂肪性肝炎； PACS，低聚蛋白酶蛋白； PCR-DGGE，聚合酶链反应构成梯度凝胶电泳； PFE，pyracantha fortuneana果实提取物； PPEP，果皮桃萃取的多酚； SASP，磺胺丙嗪； SCFA，短链脂肪酸； TLR4，像受体4一样收费； TMAO，三甲胺-N-氧化物； TNB，2,4,6-三硝基苯磺酸； TPC，总多酚的含量； UC，溃疡性结肠炎； w/v，重量/体积。
调节肠道干细胞体内平衡的营养代谢
图2饮食模式调节肠道干细胞（ISC）功能。（a）禁食，快速恢复和卡路里限制。禁食通过启动脂肪酸氧化（FAO）程序来增强ISC功能，并取决于肉碱棕榈酰转移酶1A（CPT1A）。其他调节器（例如PRDM16和HNF4A/G）也通过调节粮农组织来调节ISC。快速恢复后刺激MTORC1并通过多胺代谢程序激活蛋白质合成。结果，ISC增殖和肿瘤发生都升高。在卡路里限制期（CR）期间，由于雷帕霉素复合物1（MTORC1）的机理靶标降低，paneth细胞旁分泌因子循环ADP核糖（CADPR）。CADPR进入ISC，并通过SIRT/MTORC1-S6K1信号传导促进ISC和Paneth细胞的增殖。CR还增强了储备ISC中的DNA损伤性，从而保留了再生能力。（b）高脂，高脂/高糖和生酮饮食。高脂饮食（HFD）通过过氧化物酶体增殖物 - 活化受体δ（PPARδ）和LXR/FXR信号传导激活β-蛋白酶靶基因，从而促进ISC增殖。此外，PPARδ使祖细胞能够恢复干细胞特征，从而促进肿瘤发生。高脂/高糖饮食（HFHSD）通过激活固醇调节性元件结合蛋白1（SREBP1，用于脂肪酸合成），PPARγ信号传导和胰岛素受体-FR-FR-FR-AKT途径来诱导粘膜变化和肠道疾病。酮体衍生自生酮饮食（KTD）或禁食会影响ISC茎和通过3-羟基-3-甲基戊二核酸COA合成酶2（HMGCS2）-Class-Class-Class 1组蛋白脱乙酰基酶（HDAC） - NOTCH信号的分化。
antofact：通过本体驱动的强化学习揭示了LLM的奇妙事实 - 骨骼
大型语言模型（LLM）表现出了信息检索的熟练程度，而它们容易产生与现实冲突的不正确反应，这种现象被称为固有幻觉。关键挑战在于经过大量数据训练的LLM中不清楚和不可靠的事实分布。vreva-liment方法将事实检测任务视为一个问题 - 回答范式，在其中询问了LLMS有关FACTUAL知识并检查正确性的问题。但是，研究主要侧重于仅从几个特定领域（例如电影和运动）中得出测试用例，从而限制了对知识缺失的全面观察和对意外幻觉的分析。为了打扮这个问题，我们提出了构造，这是一个自适应框架，用于检测LLM的未知事实，致力于挖掘缺失知识的本体论级骨架。特定说明，我们认为LLM可以在缺失的事实中公开基于本体的相似性，并将五个代表知识图（kgs）作为基准。我们进一步设计了一种复杂的本体驱动的强化学习（ORL）机制，以自动与特定实体和关系产生易错的测试用例。Orl Mechamenism奖励KGS朝着可行的方向导航，以揭示事实错误。此外，经验努力表明，无论是否包括这些知识，主导的LLM都倾向于回答是的，而不是否定。使用32个代表性LLM的5个数据集上的实验结果表明，当前LLMS总体上缺乏事实。为了减轻LLM的过度自信，我们利用了无幻觉检测（HFD）策略来解决基线之间的不公平比较，从而提高了结果的稳健性。值得注意的是，CHATGPT在DBPEDIA上的事实错误率分别为51.6％，Yago的错误率分别为64.7％。另外，ORL机制显示出令人鼓舞的误差预测分数，大多数LLM的F1分数范围从70％到90％。与详尽的测试相比，ORL的平均召回率为80％，同时将评估时间降低35.29％至63.12％。
mitigasi nigella sativa dan Moringa oleifera terhadap fragmentasi dna sperma
肥胖已成为全球健康问题，并且对生殖健康的影响尤其是在男性中引起了人们的关注。这项研究使用雄性小鼠作为模型动物来研究Nigella sativa（NS）和Moringa oleifera（MO）治疗潜力，以解决与肥胖相关的不育问题。这项研究的重点是N. sativa和M. oleifera的抗氧化特性及其减少精子DNA的氧化应激和碎片化的潜力，这都是由肥胖引起的男性不育症问题的主要原因。本研究使用36个Sprague Dawley雄性大鼠分为两个主要组，分别由对照组和治疗组，每个组由6只小鼠组成。对照组也分为三个亚组：正常的，阴性组（大鼠是肥胖症没有治疗的肥胖）和阳性（肥胖诱导的大鼠，给予10 mg/kg/day orlistat）。治疗组分为三个亚组，即NS200（200 mg/kg/day），MO400（400 mg/kg/day）和MO400 + NS200（MO（400 mg/kg/kg/kg/kg/kg/kg/kg/day） + NS（200 mg/kg/day）（治疗40天）除正常组以外的所有研究小鼠都是肥胖，含有高脂饮食（HFD），直到在接受治疗前达到超过310的Lee指数值。该决定提供了有关NS和Mo Herb的抗氧化作用机制的重要信息，它们能够在肥胖症的背景下保护男性生殖健康。关键字：精子DNA的碎片； Moringa oleifera; Nigella sativa;肥胖，氧化应激结果表明，在用NS，MO和MO + NS HERBs治疗的小鼠中，SOD酶（P <0.05）的特异性活性（P <0.05），氧化应激标志物（MDA）显着降低（MDA）（P <0.05）（P <0.05）（P <0.05）以及显着降低了精子DNA片段化（P <0.05）（P <0.05）。
引用：McGrath KC、Li X、Twigg SM、Heather AK (2020) 载脂蛋白-AI 模拟肽 D-4F 和 L-5F 可减轻 C57BL/6 小鼠的肝脏炎症并增加胰岛素敏感性。PLoS ONE 15(1): e0226931。 https://doi.org/10.1371/ journal.pone.0226931
高密度脂蛋白 (HDL) 的抗炎和抗氧化特性的发现引发了一个问题：HDL 是否可用于治疗疾病中的炎症。胰岛素抵抗主要依赖于肝脏炎症，研究表明，组成性活性肝核因子 κB (NF- κ B)（驱动炎症反应的中枢介质）会导致小鼠模型中的胰岛素抵抗状态 [ 1 ]。我们之前证明，单独（无脂质）或作为含有 PLPC 的重组 HDL（rHDL）的一部分施用载脂蛋白 A-I (apoA-I) 可预防肝脏炎症并改善高脂喂养的 C57Bl/6 小鼠的胰岛素抵抗 [ 2 ]。虽然结果令人鼓舞，但 apoA-I 颗粒的产生很大且耗时。载脂蛋白 A-I (apoA-I) 模拟肽已被开发和设计，其功能类似于全长 apoA-I，但效力更强，药代动力学特征也比全长 apoA-I 更好 [ 3 , 4 ]。这些模拟肽比 rHDL 有许多优势，包括成本相对较低、生产简单，并且能够修改其结构以允许口服给药。ApoA-I 模拟肽的特点是其苯丙氨酸残基附着，苯丙氨酸残基的增加与疏水性的增加及其与磷脂结合的能力相关 [ 4 ]。根据序列中疏水性苯丙氨酸残基的数量，研究最深入的是 4F 和 5F apoA-I 模拟肽。它们具有与 apoA-I 相同的 A 类两亲性螺旋结构 [ 5 ]。D-4F 和 L-5F 的区别在于两亲性螺旋疏水面上存在的苯丙氨酸数量，并且 D-4F 由 D-氨基酸合成，而 L-5F 由 L-氨基酸合成。对于口服给药，与 L-氨基酸相比，D-氨基酸被发现更能抵抗酶促降解。然而，吸收后，D-氨基酸不会降解，这可能导致毒性和其他副作用 [ 6 ]。L-氨基酸在循环中的毒性较小，但它们不能抵抗口服的酶促降解。两者都曾在生物学研究中使用过，据报道具有强大的抗炎和抗氧化作用 [ 7 – 12 ]。我们表明，模拟治疗显着在本研究中，我们直接测试了使用 apoAI 模拟肽 D-4F 和 L-5F 治疗是否可以改善高脂饮食 (HFD) 喂养小鼠的胰岛素敏感性，从而降低肝脏炎症。
引文 Canová N, Šípková J, Arora M, Pavlíková Z, Ku čera T, Šeda O, Šopin T, Vacík T 和 Slana ř O (2025) 雷公藤红素对心脏和
神经肽甘丙肽是所谓甘丙肽系统的重要成员。尽管自其发现以来已经过去了 40 年（Tatemoto 等人，1983 年），但仍有许多生物过程中甘丙肽的作用尚未完全了解（Jiang 和 Zheng，2022 年；Zhu 等人，2022 年）。甘丙肽作为神经递质的多效性作用包括参与调节睡眠和觉醒过程、行为过程、焦虑、学习和记忆、疼痛和伤害感受以及其他过程。甘丙肽系统还被发现在许多外周器官功能中发挥重要作用，特别是在心脏和心血管系统、胰腺和胃肠系统以及骨骼、结缔组织和皮肤中（Lang 等人，2015 年；Š ípková 等人，2017 年）。甘丙肽的多种作用不仅在典型的生理条件下明显，而且在病理环境中也很明显（Gopalakrishnan 等人，2021 年）。甘丙肽介导的信号传导的多效性和复杂性基于三种不同的 G 蛋白偶联受体（GPCR）的存在，即 GalR1、GalR2 和 GalR3，它们通过不同的途径传递生物信号（Jiang 和 Zheng，2022 年）。此外，多年来发现了与甘丙肽分子具有部分同源性的新配体：GALP（甘丙肽样肽）和阿拉林。根据目前的知识，只有 GALP 能够激活甘丙肽受体，即 GalR2/GalR3，而阿拉林却不能，尽管它们具有部分同源性。阿拉林的特定受体尚不清楚（Fang 等人，2020 年；Abebe 等人，2022 年）。甘丙肽系统的最新成员是 spexin，它是一种具有多效性功能的小肽，可以激活人类 GalR2 和 GalR3 受体（Behrooz 等人，2020 年）。有多项研究描述了甘丙肽系统在代谢、食物摄入和肥胖中的重要作用。甘丙肽通过刺激 GalR1 在下丘脑中的活动会导致脂肪摄入增加。此外，它还有刺激正反馈的能力，从而导致过量脂肪摄入和肥胖（Marcos 和 Coveñas，2021 年）。这种失调可能会导致葡萄糖不耐受，从而导致 2 型糖尿病 (T2DM) 和代谢综合征（Fang 等人，2012 年）。类似地，脂肪摄入和摄食行为也可以通过 GALP 的活性进行改变 ( Takenoya 等人，2018 年)。最后，还证实了 spexin 在调节食物摄入、饱腹感以及随后的肥胖风险方面的作用 ( Behrooz 等人，2020 年)。Spexin 还被证明可以在体内和体外减轻高脂饮食 (HFD) 诱发的小鼠肝脂肪变性 ( Jasmine 等人，2016 年)。