仅研究使用。不适用于诊断程序。©2024加利福尼亚州的太平洋生物科学(“ PACBIO”)。保留所有权利。本文档中的信息如有更改,恕不另行通知。PACBIO对本文档中的任何错误或遗漏不承担任何责任。某些通知,条款,条件和/或使用限制可能与您使用PACBIO产品和/或第三方产品有关。请参阅适用的PACBIO销售条款和条件以及PACB.com/license的适用许可条款。太平洋生物科学,PACBIO徽标,PACBIO,Circulomics,Omniome,Smrt,Smrt,Smrtbell,Iso-Seq,Sequel,sequel,Nanobind,sbb,sbb,sbb,revio,onso,apton,apton,kinnex,peretarget和sprq是Pacbio的商标。
NucleOmag®HMWDNA试剂盒设计用于从细胞,组织和植物材料中分离出高分子量DNA。此外,还显示了全血(EDTA),唾液,颊拭子以及细菌和酵母样品的兼容性。该程序基于在适当的缓冲液条件下核酸对顺磁珠的可逆吸附。样品裂解是使用裂解缓冲液HM1或HMB和蛋白酶K进行酶促的。用于将核酸与顺磁珠,结合缓冲液HM2和核瘤®B-珠的结合添加到转移和清除的裂解物中。磁分离后,使用洗涤缓冲液HM3,HM4和70%乙醇洗涤顺磁珠以去除污染物和盐分。使用冲洗缓冲液HM5去除以前的洗涤步骤的残留乙醇。接下来,高度纯化的DNA用洗脱缓冲液HM6洗脱,可直接用于下游应用。可以手动使用NucleOmag®HMWDNA试剂盒,也可以在标准的液体处理仪器和自动磁分离器上自动化。
NucleOmag®HMWDNA试剂盒设计用于从细胞,组织和植物材料中分离出高分子量DNA。此外,还显示了全血(EDTA),唾液,颊拭子以及细菌和酵母样品的兼容性。该程序基于在适当的缓冲液条件下核酸对顺磁珠的可逆吸附。样品裂解是使用裂解缓冲液HM1或HMB和蛋白酶K进行酶促的。用于将核酸与顺磁珠,结合缓冲液HM2和核瘤®B-珠的结合添加到转移和清除的裂解物中。磁分离后,使用洗涤缓冲液HM3,HM4和70%乙醇洗涤顺磁珠以去除污染物和盐分。使用冲洗缓冲液HM5去除以前的洗涤步骤的残留乙醇。接下来,高度纯化的DNA用洗脱缓冲液HM6洗脱,可直接用于下游应用。可以手动使用NucleOmag®HMWDNA试剂盒,也可以在标准的液体处理仪器和自动磁分离器上自动化。
Nanobind HT CBB 试剂盒有足够的试剂进行 96 次提取,可采用以下格式之一运行:1 次运行 x 96 个样本、2 次运行 x 48 个样本或 4 次运行 x 24 个样本。我们不建议每次运行少于 24 个样本,因为该试剂盒设计为最多可容纳 4 次运行(4 次运行 x 24 个样本)的死体积。
仅研究使用。不适用于诊断程序。©2024加利福尼亚州的太平洋生物科学(“ PACBIO”)。保留所有权利。本文档中的信息如有更改,恕不另行通知。PACBIO对本文档中的任何错误或遗漏不承担任何责任。某些通知,条款,条件和/或使用限制可能与您使用PACBIO产品和/或第三方产品有关。请参阅适用的PACBIO销售条款和条件以及PACB.com/license的适用许可条款。太平洋生物科学,PACBIO徽标,PACBIO,Circulomics,Omniome,Smrt,Smrtbell,Iso-Seq,Secel,Sequel,Nanobind,sbb,Revio,Revio,Onso,Apton,Apton,Kinnex和Puretarget是Pacbio的商标。
如果紫外线纯度在该特定样品类型的预期范围内,则需要它。通常,人类全血DNA的紫外线纯度为260/230> 1.3和260/280> 1.8。紫外线纯度略微超出此范围的样品可能仍然很好地序列。紫外线纯度远远超出此范围的样品应谨慎对待。•DNA纯度可能会受到不当解冻和/或在开始
注意紫外线纯度如果在该特定样品类型的预期范围内。通常,从培养的哺乳动物细胞中提取的DNA导致260/230> 1.7和260/280> 1.8的紫外线纯度。紫外线纯度略微超出此范围的样品可能仍然很好地序列。紫外线纯度远远超出此范围的样品应谨慎对待。•由于细胞输入过高导致的裂解不足,纯度可能会降低。我们建议输入
本协议描述了通过生命HMW DNA提取方案制备的样品中的HMW DNA的离心介导的HMW DNA片段化。该协议使用Covaris g-tube产生8–10 kb尺寸范围的片段。剪切的DNA适用于下游长读取测序,包括超低输入(ULI)库制备后的PACBIO测序。这个过程对于生命树计划中所有分类学组的DNA提取物非常有效。该协议的输出是剪切的DNA,可以使用手动或自动SPRI协议将其针对碎片的DNA清除。
Monarch 组织 HMW DNA 提取试剂盒提供了一种快速可靠的方法,可从各种组织和细菌以及其他样本类型(包括酵母、昆虫和两栖动物)中提取高分子量 (HMW)、完整的基因组 DNA。优化的组织提取方案利用杵均质化和蛋白酶 K 消化并搅拌以裂解样品,然后进行蛋白质去除步骤并将提取的 DNA 沉淀到大玻璃珠的表面上。稍微修改的细菌提取方案利用溶菌酶在蛋白酶 K 消化之前有效裂解细菌细胞壁。对于标准方案,DNA 大小范围为 50 – ≥ 500 kb,可以调整以产生更长的 DNA,使其达到 Mb 范围,适用于软器官组织和细菌。纯化的 DNA 产量高,纯度极佳,几乎完全去除了 RNA。对于组织和细菌,处理时间约为 90 分钟。组织和细菌的纯度比通常为 1.8-1.9 (A 260 /A 280 ) 和 2.1-2.5 (A 260 /A 230 )。纯化的 HMW gDNA 适用于各种下游应用,包括长读测序 (Oxford Nanopore Technologies ® 和 Pacific Biosciences ® )、光学映射 (Bionano Genomics ® ) 和链接读基因组组装 (10X Genomics ® )。