对于图书馆构建,ICELL8 CX系统将DNA提取试剂分配给了过滤器文件指定的单细胞芯片的1,600个候选井。芯片通过ICELL8 CX热循环仪上的DNA提取(在本手册中称为热循环仪)。DNA提取后,分发了包含专有准随机引物的前置化混合物。准随机引物与基因组DNA上的选择性位点结合,然后以线性方式对其进行前序。DNA,从而生成最终的库结构。从芯片中提取结果库并纯化。验证步骤后,库准备在Illumina®平台上进行排序。图1(在接下来的两个页面上)显示了从准备好的单元到创建序列准备就绪库的应用程序的工作流程。
shasta_wga,请参阅用户手册以获取更多选项)•是demultiplex结果目录目录目录的完整路径•是基因组构建的名称(例如,HG38)•是使用Ginkggo使用CNV分析的bin大小。必须是500KB或1MB•是输入数据的读取长度。必须为76bp或151bp•是每个条形码所需的PE读数的最小数量,以保存在下游分析中。•是为分析结果创建的输出目录的完整路径•是Shasta或iCell8 System welllist,Illumina的示例表或TDT/CSV格式文件的完整路径。
shasta_wga,请参阅用户手册以获取更多选项)•是demultiplex结果目录目录目录的完整路径•是基因组构建的名称(例如,HG38)•是使用Ginkggo使用CNV分析的bin大小。必须是500KB或1MB•是输入数据的读取长度。必须为76bp或151bp•是每个条形码所需的PE读数的最小数量,以保存在下游分析中。•是为分析结果创建的输出目录的完整路径•是Shasta或iCell8 System welllist,Illumina的示例表或TDT/CSV格式文件的完整路径。
