1分子药理学计划,斯隆·凯特林研究所,纪念斯隆·凯特林癌症中心,纽约,纽约,10021; 2儿科学系的发展肿瘤中心,纪念斯隆·凯特林癌症中心;纽约,美国,10021; 3巴塞罗那10超级计算中心(BSC),西班牙巴塞罗那,08034; 4小儿运动障碍计划,巴罗神经学研究所,凤凰城儿童医院以及儿童健康,神经病学,遗传学和细胞和分子医学部门,凤凰城,亚利桑那州; 5纽约州纽约市威尔·康奈尔医学院药理学系,10021; 6数学基因组学计划,系统生物学和生物医学信息学部门,哥伦比亚15大学,纽约,纽约; 7 Csiro Health and Biosecurity,澳大利亚澳大利亚澳大利亚E-Health Research Center,澳大利亚布里斯班; 8协助Publique-Hôpitauxde Paris,DépartementdeGénétique,HôpitalPitié-Salpêtrière,法国巴黎,巴黎; 9法国Picardie Jules Verne大学多模式分析研究小组; 10儿科神经生理学单元,法国阿米斯皮卡迪大学医院; 11凤凰儿童医院,亚利桑那州凤凰城; 20 12 Hacettepe University,医学院儿童健康研究所,土耳其安卡拉儿科代谢系; 13洛杉矶新奥尔良路易斯安那州泽维尔大学物理与计算机科学系; 14InstitucióCatalanade Recerca I EstudisAvançats(ICREA),西班牙巴塞罗那,15个儿科,药理学和生理学和生物物理学,Weill Cornell医学院康奈尔大学医学院研究生院;纽约,美国。25
1 1数学建模中心,伦敦卫生与热带医学学院,伦敦,英国,英国2,哈佛人道主义倡议,马萨诸塞州剑桥,美国,美国,波士顿3号,马萨诸塞州波士顿,美国马萨诸塞州波士顿,美国,美国4号部长澳大利亚布里斯班,6加泰罗尼亚州研究与高级研究机构(ICREA),西班牙巴塞罗那; 7巴塞罗那超级计算中心,西班牙巴塞罗那摘要Covid-19的流行动力学是由包括人口行为,政府干预,新变体,疫苗接种运动和免于先前感染的免疫力的复杂因素驱动的。 我们旨在量化多米尼加共和国SARS-COV-2动态的流行驱动因素,即1,080万人中的中上层收入国家,并评估2021年2月在挽救生命和避免住院的疫苗接种运动的影响。 我们使用了年龄结构的多变量传播动态模型来表征多米尼加共和国的流行驱动因素,并探索围绕疫苗接种覆盖范围和人口流动性的反事实情况。 我们将模型拟合到2021年12月的死亡人数,医院床的占用率,ICU床的占用率和血清阳性数据,并在不同的反事实疫苗接种场景下模拟了流行轨迹。 我们估计,在竞选活动的前6个月中,疫苗接种避免了5040次住院(95%CRI:4750-5350),1500 ICU入院(95%CRI:1420-1590)和544例死亡(95%CRI:488-606)。1数学建模中心,伦敦卫生与热带医学学院,伦敦,英国,英国2,哈佛人道主义倡议,马萨诸塞州剑桥,美国,美国,波士顿3号,马萨诸塞州波士顿,美国马萨诸塞州波士顿,美国,美国4号部长澳大利亚布里斯班,6加泰罗尼亚州研究与高级研究机构(ICREA),西班牙巴塞罗那; 7巴塞罗那超级计算中心,西班牙巴塞罗那摘要Covid-19的流行动力学是由包括人口行为,政府干预,新变体,疫苗接种运动和免于先前感染的免疫力的复杂因素驱动的。我们旨在量化多米尼加共和国SARS-COV-2动态的流行驱动因素,即1,080万人中的中上层收入国家,并评估2021年2月在挽救生命和避免住院的疫苗接种运动的影响。我们使用了年龄结构的多变量传播动态模型来表征多米尼加共和国的流行驱动因素,并探索围绕疫苗接种覆盖范围和人口流动性的反事实情况。我们将模型拟合到2021年12月的死亡人数,医院床的占用率,ICU床的占用率和血清阳性数据,并在不同的反事实疫苗接种场景下模拟了流行轨迹。我们估计,在竞选活动的前6个月中,疫苗接种避免了5040次住院(95%CRI:4750-5350),1500 ICU入院(95%CRI:1420-1590)和544例死亡(95%CRI:488-606)。我们还发现,使用具有较高疗效的产品延迟疫苗接种可比延迟疫苗接种。我们调查了疫苗接种覆盖范围的变化与人口流动性之间的权衡,以了解在大流行的后期疫苗接种的社会疏远措施的放松程度。我们发现,如果未发生疫苗接种,则需要额外减少10-20%的人口流动性才能维持相同的死亡和住院治疗。我们发现,多米尼加共和国的SARS-COV-2传播动力学是由大流行的头两年中大量免疫积累驱动的,但是尽管如此,疫苗接种对于能够恢复到大流行前移动水平而不产生相当大的发病率和死亡率至关重要。引言在2020-22期间,许多国家遭受了Covid-19的重大负担,并实施了非药物干预措施(NPI),旨在控制SARS-COV-2传播。尽管如此,各国经历了显着不同的流行动态,这是由人口行为,政府干预,新变体的引入,推出
1 瑞士洛桑莱曼癌症中心。2 瑞士洛桑大学计算生物学系。3 英国伦敦癌症研究所乳腺癌托比罗宾斯研究中心。4 英国伦敦癌症研究所乳腺癌研究部乳腺表观遗传可塑性和进化实验室。5 英国伦敦帝国理工学院外科和癌症系。6 英国剑桥大学医学研究委员会毒理学部。7 英国剑桥大学医院 NHS 基金会组织病理学系。8 荷兰阿姆斯特丹荷兰癌症研究所 Oncode 研究所肿瘤生物学和免疫学部。9 英国欣克斯顿威康桑格研究所。10 英国剑桥大学医院 NHS 基金会。11 英国剑桥大学儿科系。 12 瑞士洛桑路德维希癌症研究所。13 纽约基因组中心,纽约,纽约。14 纽约威尔康奈尔医学院医学系和迈耶癌症中心血液学和医学肿瘤学分部,纽约,纽约。15 威尔康奈尔医学院计算生物医学研究所,纽约,纽约。16 西班牙巴塞罗那科学技术研究所生物医学研究所 (IRB Barcelona)。17 西班牙马德里卡洛斯三世健康研究所癌症红细胞生物医学研究中心 (CIBERONC)。18 西班牙巴塞罗那加泰罗尼亚先进治疗和研究中心 (ICREA)。19 德国柏林亥姆霍兹联合会马克斯德尔布吕克分子医学中心、柏林医学系统生物学研究所。 20 比利时鲁汶 VIB 癌症生物学中心分子癌症生物学实验室。21 比利时鲁汶鲁汶大学肿瘤学系分子癌症生物学实验室。22 德国癌症研究中心分子神经生物学系
1 瑞士洛桑莱曼癌症中心。2 瑞士洛桑大学计算生物学系。3 英国伦敦癌症研究所乳腺癌托比罗宾斯研究中心。4 英国伦敦癌症研究所乳腺癌研究部乳腺表观遗传可塑性和进化实验室。5 英国伦敦帝国理工学院外科和癌症系。6 英国剑桥大学医学研究委员会毒理学部。7 英国剑桥大学医院 NHS 基金会组织病理学系。8 荷兰阿姆斯特丹荷兰癌症研究所 Oncode 研究所肿瘤生物学和免疫学部。9 英国欣克斯顿威康桑格研究所。10 英国剑桥大学医院 NHS 基金会。11 英国剑桥大学儿科系。 12 瑞士洛桑路德维希癌症研究所。13 纽约基因组中心,纽约,纽约。14 纽约威尔康奈尔医学院医学系和迈耶癌症中心血液学和医学肿瘤学分部,纽约,纽约。15 威尔康奈尔医学院计算生物医学研究所,纽约,纽约。16 西班牙巴塞罗那科学技术研究所生物医学研究所 (IRB Barcelona)。17 西班牙马德里卡洛斯三世健康研究所癌症红生物医学研究中心 (CIBERONC)。18 西班牙巴塞罗那加泰罗尼亚临床与临床研究中心 (ICREA)。19 德国柏林亥姆霍兹联合会马克斯·德尔布吕克分子医学中心、柏林医学系统生物学研究所。 20 比利时鲁汶 VIB 癌症生物学中心分子癌症生物学实验室。21 比利时鲁汶鲁汶大学肿瘤学系分子癌症生物学实验室。22 德国癌症研究中心分子神经生物学系
2。ICREA,加泰罗尼亚研究与高级研究机构巴塞罗那,西班牙10号加泰罗尼亚。11 12 *这些作者对这项工作也同样贡献13#铅接触:alejo.rodriguez-fraticelli@irbbarcelona.org 14 15摘要:16 17癌细胞,即使患有相同18个突变的患者,癌细胞也显示出广泛的表型变化。原始细胞的差异提供了潜在的解释,但是这些19种测定在传统上依赖于表面标记,缺乏克隆分辨率来区分20个茎和祖细胞的异质子集。为了应对这一21个挑战,我们开发了Strack,这是一个无偏的框架,纵向追踪22个克隆基因表达和膨胀动力学,并在获得23个癌症突变之前和之后。我们研究了两个不同的白血病驱动突变,即DNMT3A-24 R882H和NPM1CA,发现对这两种突变的响应在不同的干细胞状态下均为25个变量。具体而言,通常随时间越来越多的分化26个偏置干细胞可以有效地随两个突变扩展27。npm1c突变令人惊讶地逆转了克隆蛋白的内在偏置28,茎偏置的克隆会引起更加成熟的恶性29个州。我们提出了一个克隆的“反应规范”,其中预先存在的克隆状态30决定了不同的癌症表型潜力。31 32关键字:单细胞,癌症开始,原始细胞,谱系跟踪,DNMT3A,33 NPM1C,克隆造血症,髓样恶性肿瘤34 35 36亮点:37-单细胞在克隆级别的癌症开始(strack)。43 4438-离体扩展文化维持内在和可遗传的HSC异质性。39-预启示性突变增强了高输出干细胞的自我更新,40增加了其生存概率。41-转化突变重编程低输出干细胞命运到更成熟的42个恶性状态。
1 神经科学和医学研究所 (INM-1), 于利希研究中心, Jülich 52425, 德国, 2 C. & O. Vogt 脑研究所, 杜塞尔多夫大学医院, 海因里希-海涅大学杜塞尔多夫, 杜塞尔多夫 40225, 德国, 3 Laboratorio Cajal de Circuitos Corticales, Centro de Tecnología Biomédica, Universidad马德里理工大学,马德里 28223,西班牙,4 卡哈尔研究所,高级科学研究委员会 (CSIC),马德里 28002,西班牙,5 阿姆斯特丹大学斯瓦默丹生命科学研究所认知与系统神经科学组,阿姆斯特丹,1098 XH,荷兰,6 国家科学研究中心,神经科学研究所(NeuroPSI),巴黎萨克雷大学,Gif sur Yvette 91400,法国,7 国家研究委员会生物物理研究所,巴勒莫 90146,意大利,8 临床神经科学系,沃州大学中心医院,洛桑 CH- 1011,瑞士,9 计算机科学系,曼彻斯特大学,曼彻斯特 M13 9PL,英国,10 信息学系,慕尼黑工业大学,加兴 385748,德国,11 丹麦技术委员会基金会,哥本哈根,2650 Hvidovre,丹麦,12 基础医学科学研究所,奥斯陆大学,奥斯陆,挪威,13 雅典研究与创新中心,雅典 12125,希腊,14 信息学与电信系,雅典国立和卡波迪斯特里安大学,157 84 雅典,希腊,15 高级模拟研究所 (IAS),于利希超级计算中心(JSC),于利希研究中心,于利希 52425,德国,16 ICREA 和系统神经科学,生物医学调查研究所 August Pi i Sunyer,巴塞罗那 08036,西班牙,17 认知神经科学系,认知神经科学系,心理学和神经科学学院,马斯特里赫特大学,马斯特里赫特 6229 EV,荷兰,18 艾克斯马赛大学,国家健康与医学研究所,系统神经科学研究所 (INS) UMR1106,马赛 13005,法国
1 神经科学和医学研究所 (INM-1), 于利希研究中心, Jülich 52425, 德国, 2 C. & O. Vogt 脑研究所, 杜塞尔多夫大学医院, 海因里希-海涅大学杜塞尔多夫, 杜塞尔多夫 40225, 德国, 3 Laboratorio Cajal de Circuitos Corticales, Centro de Tecnología Biomédica, Universidad马德里理工大学,马德里 28223,西班牙,4 卡哈尔研究所,高级科学研究委员会 (CSIC),马德里 28002,西班牙,5 阿姆斯特丹大学斯瓦默丹生命科学研究所认知与系统神经科学组,阿姆斯特丹,1098 XH,荷兰,6 国家科学研究中心,神经科学研究所(NeuroPSI),巴黎萨克雷大学,Gif sur Yvette 91400,法国,7 国家研究委员会生物物理研究所,巴勒莫 90146,意大利,8 临床神经科学系,沃州大学中心医院,洛桑 CH- 1011,瑞士,9 计算机科学系,曼彻斯特大学,曼彻斯特 M13 9PL,英国,10 信息学系,慕尼黑工业大学,加兴 385748,德国,11 丹麦技术委员会基金会,哥本哈根,2650 Hvidovre,丹麦,12 基础医学科学研究所,奥斯陆大学,奥斯陆,挪威,13 雅典研究与创新中心,雅典 12125,希腊,14 信息学与电信系,雅典国立和卡波迪斯特里安大学,157 84 雅典,希腊,15 高级模拟研究所 (IAS),于利希超级计算中心(JSC),于利希研究中心,于利希 52425,德国,16 ICREA 和系统神经科学,生物医学调查研究所 August Pi i Sunyer,巴塞罗那 08036,西班牙,17 认知神经科学系,认知神经科学系,心理学和神经科学学院,马斯特里赫特大学,马斯特里赫特 6229 EV,荷兰,18 艾克斯马赛大学,国家健康与医学研究所,系统神经科学研究所 (INS) UMR1106,马赛 13005,法国
a 人体运动控制科,NINDS,NIH,贝塞斯达,MD,美国 b 阿姆斯特丹 UMC,阿姆斯特丹自由大学,神经病学系,阿姆斯特丹神经科学,De Boelelaan 1117,阿姆斯特丹,荷兰 c 脑与认知中心,计算神经科学组,信息和通信技术系,Universitat Pompeu Fabra,Roc Boronat 138,巴塞罗那 08018,西班牙 d Institució Catalana de la Recerca i Estudis Avançats (ICREA),Passeig Lluís Companys 23,巴塞罗那 08010,西班牙 e 神经心理学系,马克斯普朗克人类认知和脑科学研究所,04103 Leipzig,德国 f 莫纳什大学心理科学学院,墨尔本,克莱顿,VIC 3800,澳大利亚 g 神经病学和临床神经生理学系,汉诺威医学院,汉诺威,德国h 神经内科,IRCCS 综合诊所 A. Gemelli 基金会,罗马,意大利 i MOV'IT 科(运动调查和治疗学),巴黎脑研究所(CNRS/INSERM UMR 7225/1127),巴黎索邦大学,法国 j 实验电生理学和神经影像学实验室(xENi),神经内科,汉堡埃彭多夫大学医学中心(UKE),Martinistr。 52,20246 汉堡,德国 k 科隆大学医院神经内科、神经科学和医学研究所 - 认知神经内科(INM-3)、德国于利希研究中心 l 拉德堡德大学医学中心、唐德斯大脑、认知和行为研究所、认知神经影像中心,荷兰奈梅亨 m 牛津大学精神病学系,英国牛津 n 奥胡斯大学临床医学系大脑音乐中心,丹麦 o 米尼奥大学医学院生命与健康科学研究所(ICVS),4710-057 布拉加,葡萄牙 p 巴黎高等研究院,法国 q 神经科学和神经康复系,脑连接实验室,IRCCS San Raffaele Pisana,意大利罗马 r 中欧理工学院 - CEITEC 和癫痫中心及圣安妮神经内科捷克共和国布尔诺马萨里克大学医学院及大学医院 t 中国北京首都医科大学宣武医院国家老年疾病临床研究中心帕金森病影像研究科
1 瓦尔帕莱索神经科学跨学科中心,瓦尔帕莱索大学,2360103,瓦尔帕莱索,智利。 6 2 剑桥大学心理学系,剑桥 CB2 3EB,英国 7 3 伦敦玛丽女王大学心理学系,伦敦 E1 4NS,英国 8 4 伦敦帝国理工学院脑科学系迷幻药研究中心,伦敦 SW7 2DD,英国。 9 5 伦敦帝国理工学院数据科学研究所,伦敦 SW7 2AZ,英国 10 6 伦敦帝国理工学院复杂性科学中心,伦敦 SW7 2AZ,英国 11 7 剑桥大学临床神经科学系和麻醉科,剑桥,CB2 0QQ,英国 12 8 剑桥大学利华休姆未来智能中心,剑桥,CB2 1SB,英国 13 9 阿兰图灵研究所,伦敦,NW1 2DB,英国 14 10 布宜诺斯艾利斯大学布宜诺斯艾利斯物理研究所和物理系,布宜诺斯艾利斯,阿根廷 15 11 圣安德烈斯大学,布宜诺斯艾利斯,阿根廷 16 12 大脑和流体研究所,ICM,F-75013,巴黎,法国 17 13 拉丁美洲脑健康研究所(BrainLat),布宜诺斯艾利斯大学Adolfo Iba˜nez,智利圣地亚哥 18 14 牛津大学精神病学系,牛津 OX3 7JX,英国。 19 15 奥胡斯大学临床医学系大脑音乐中心,奥胡斯 15 8000,丹麦。 20 16 米尼奥大学医学院生命与健康科学研究所,布拉加 4710-057,葡萄牙。 21 17 CIMFAV-Ingemat,瓦尔帕莱索大学工程学院,瓦尔帕莱索,智利。 22 18 巴黎萨克雷神经科学研究所综合与计算神经科学系,国家研究中心 23 科学中心,伊维特河畔吉夫,法国 24 19 大脑与认知中心,计算神经科学组,信息与通信技术系,Universitat 25 Pompeu Fabra, Roc Boronat 138, 巴塞罗那, 08018, 西班牙。 26 20 加泰罗尼亚研究研究所 (ICREA), 巴塞罗那 08010, 西班牙。 27 21 马克斯·普朗克人类认知和脑科学研究所神经心理学系,莱比锡 04103,德国。 28 22 莫纳什大学心理科学学院,墨尔本,Clayton VIC 3800,澳大利亚。 29 * rubenherzog@ug.uchile.cl, ** 同等最后作者贡献 30