背景:铁铁作用是一种依赖铁的编程细胞死亡模式,该模式是由磷脂过氧化的有毒积累引起的。尽管已知它会影响肿瘤的起始和生长,但尚未建立与铁毒相关基因(FRGS)(FRGS)(FRGS)(SCLC)之间的关联。方法:我们使用基因表达综合(GEO)和铁毒数据库(FERRDB)来获取有关SCLC及其相关FRG的信息。随后,使用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)和支持向量机递归特征Eilmination(SVM-RFE)算法鉴定出标记基因,并分析单基因函数和途径富集。使用药物 - 基因相互作用数据库(DGIDB),我们确定了针对六个标记基因的40种药物。竞争性的内源性RNA(CERNA)网络揭示了基于标记基因的长期非编码RNA(LNCRNA) - microRNA(miRNA) - 梅纳(miRNA) - 梅纳(miRNA) - 通用RNA(mRNA)。结果:将六个差异表达的FRG(ATG3,MUC1,RRM2,IDH2,PARP1和EZH2)鉴定为具有准确诊断能力的标记基因。根据单基因功能和途径富集分析,这些标记基因可能与免疫调节和细胞周期有关,以及与肿瘤发生相关的许多途径,包括JAK-Stat和PPAR信号途径。此外,Cibersort分析表明,MUC1和PARP1表达可能会影响SCLC中的免疫微环境。现在必须在临床应用之前通过进一步的研究来确认这些结果的准确性。结论:我们使用逻辑回归模型确认了标记基因诊断SCLC的准确性,从而提供了进一步研究与SCLC相关机制的机会。
(1)难治性或复发性 (R/R) AML 患者,尤其是老年患者,治疗选择有限,生存率仍然很低 (1, 2)。基因组分析有助于揭示 AML 的生物学基础、异质性和克隆进化,并突出了新的治疗靶点和亚组 (3–6)。FLT3 抑制剂 (FLT3i) 米哚妥林 (7) 和吉特替尼 (8)、IDH1 突变抑制剂 ivosidenib (9) 和 IDH2 突变抑制剂 enasidenib (10) 为 AML 患者提供了新的基因指导治疗选择。然而,只有一小部分患者携带这些突变,对基因指定的治疗有反应的患者就更少了 (11, 12)。此外,通常没有可操作的突变来指导治疗决策,许多疗法甚至没有任何已证实的(基因组)生物标记 (13, 14)。例如,BCL2 抑制剂 (BCL2i) venetoclax 可在 AML 治疗中提供显著的临床益处,但我们缺乏有效的生物标志物来识别可能受益的患者 (15–17)。我们和其他人已经利用高通量离体测试 AML 细胞来功能性地识别药物反应模式 (18–24)。Beat AML 研究报告了在 562 个生物库 AML 患者样本中结合基因组分析对 122 种小分子抑制剂进行功能测试的情况 (23)。Snijder 和同事应用基于图像的药物测试检测 (药镜检查) 来证明该检测可以预测化疗的临床反应 (21)。流式细胞术也已用于量化不同细胞亚群的反应 (19, 25–27)。然而,其中许多研究都是回顾性的,缺乏功能和分子数据的整合。需要在临床决策过程中前瞻性地实施这些检测。在这里,我们在 AML 患者细胞中对多达 347 种新兴和 168 种已批准的抗癌药物进行了体外药物敏感性和耐药性测试 (DSRT)。对个别患者的分子和功能数据进行了解释和整合,以考虑 R/R AML 患者的新治疗方案。为了实时将结果用于临床转化,我们设计了一种多学科功能精准医学
急性髓样白血病(AML)是一种克隆疾病,是由造血祖细胞中获得的体细胞突变引起的,导致分化失调和造血细胞的增殖[1,2]。积累的证据表明,许多基因组改变,例如染色体重排。基因扩增,缺失和突变对于AML分类至关重要[1-6]。此外,遗传病变的鉴定在AML患者的预后和治疗中起着越来越多的作用[1-4]。下一代测序(NGS)以及全基因组示例(WGS)最近已纳入临床实践,从而使AML患者的风险分层更好。实际上,NGS方法的常规使用已使超过90%的AML患者中一个或多个体细胞突变的鉴定[1-9]。最常见的突变基因包括NPM1,FLT3,DNMT3A,IDH1,IDH2,TET2,RUNX1,TP53,WT1,NRAS,NRAS和CEBPα。然而,在正常的核型AML中,遗传突变的预后预测性显性更为重要[4,10,11]。这些畸变可能有助于确定克隆优势的AML途径和可以帮助血液学家靶向精确医学疗法的转变[7-9]。在过去的几年中,人们对触发AML发展的分子像差以及新型分子生物学技术的使用增加了越来越多的了解,从而促进了针对驱动器基因突变的研究药物的发展[7-9]。基于这种考虑,可以考虑到识别“可药物”突变为使用新型靶向疗法铺平了道路[12]。本期癌症的特刊侧重于用于管理AML的新型诊断和治疗工具,其主要目的是提高我们在AML [10-17]领域的知识。二十年前,发现伊马替尼用于治疗慢性髓样白血病及其出色的活性,这对AML的有针对性疗法产生了类似的好处。在过去的几年中,已经提出了一些血液学恶性肿瘤在内的精确药物,包括急性白血病,在AML中已经确定了100多种不同的靶标,使其成为实验性临床研究的最佳候选者[18-22]。靶向FMS,例如酪氨酸激酶-3(FLT-3),已成为临床可作用突变的第一个例子,使其成为血液学家以及制药和生物技术公司开发新型药物的吸引力[23]。在过去的几年中,在临床试验中已经开发并测试了大量FLT-3靶向药物[24,25]。使用FLT-3靶向化合物的主要考虑因素与以下观点有关,即FLT3基因的内部串联复制(FLT3- ITD-MUT)表征了AML案例的显着数量(25-30%),并且代表了较差的预测因子,而较差的预测因素与增加的风险相关。在批准试验中,将中端龙添加到daunorubucine-和Celtarabine-基于基于daunorubucine的诱导疗法(所谓的“ 3 + 7”方案),从而显着改善了
