XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemIGV
VMIX™平台：量身定制的miRNA基因疗法...
5 Van Zundert B. Neurosci Lett 2017; 636：32-9; 6 Bravo-Hernandez M. Nat Med 2020; 26：118–30。 缩写：ALS：肌萎缩性侧硬化；方差分析：方差分析； ATXN2：ataxin-2; BP：基对； FTD：额颞痴呆； IGV：综合基因组学观众； mRNA：Messenger RNA； mirna：microRNA； PBS：磷酸盐缓冲盐水； NT：核苷酸； NS：不重要； SD：标准偏差； SOD1：超氧化物歧化酶1； WT：野生类型的致谢和披露：这项研究由Aviadobio Ltd. CA，RE，AU，AG，AG，DO，LO，LO，ZW，YB，AA，AA，PH，SC，PC，PC，CM，RJ，JI，JI，JI和CS是Aviadobio Ltd.的员工和股东Aviadobio Ltd.是Aviadobio Ltd.的雇员。 根据国际医学杂志编辑委员会（ICMJE）的建议，作者符合作者身份标准。 医学写作和社论支持由英国Costello Medical的David Morgan和Oliver Palmer，BSC（荣誉），并由Aviadobio Ltd. RJ资助。 CA已从伦敦大学学院和惠康信托基金会获得赠款/合同。5 Van Zundert B. Neurosci Lett 2017; 636：32-9; 6 Bravo-Hernandez M. Nat Med 2020; 26：118–30。缩写：ALS：肌萎缩性侧硬化；方差分析：方差分析； ATXN2：ataxin-2; BP：基对； FTD：额颞痴呆； IGV：综合基因组学观众； mRNA：Messenger RNA； mirna：microRNA； PBS：磷酸盐缓冲盐水； NT：核苷酸； NS：不重要； SD：标准偏差； SOD1：超氧化物歧化酶1； WT：野生类型的致谢和披露：这项研究由Aviadobio Ltd. CA，RE，AU，AG，AG，DO，LO，LO，ZW，YB，AA，AA，PH，SC，PC，PC，CM，RJ，JI，JI，JI和CS是Aviadobio Ltd.的员工和股东Aviadobio Ltd.是Aviadobio Ltd.的雇员。根据国际医学杂志编辑委员会（ICMJE）的建议，作者符合作者身份标准。医学写作和社论支持由英国Costello Medical的David Morgan和Oliver Palmer，BSC（荣誉），并由Aviadobio Ltd. RJ资助。CA已从伦敦大学学院和惠康信托基金会获得赠款/合同。
用于飞机、旋翼机和无人机的电动燃气涡轮发动机
飞机或旋翼机燃气涡轮发动机某些关键子系统的电气化为下一代航空发动机提供了许多宝贵的优势，如减轻重量、降低能耗、提高子系统和整个推进系统的效率、加快响应速度、更快更容易维修、比液压和气动系统可靠性更高、减少油耗、提高有效载荷能力、降低总生命周期成本、提高可维护性、发动机维护和操作更清洁、更好地分配机载资源、为维护和客户提供实时数据、提高健康监测能力等。发动机子系统的电气化还可以开发新的创新型飞机和发动机配置，例如，去除笨重而复杂的（发动机和/或飞机）附件驱动变速箱（ADG）或为 IGV、推力反向器门或任何其他可变几何部件引入和使用更多的 EMA（机电执行器）。在发动机和子系统（如润滑系统）中集成更多更智能的传感器是另一个明显的优势（例如油渣监测传感器或油箱液位传感器）。还将讨论更多电气子系统的集成，并了解与电源和热管理相关的固有风险（参见 AVT-RTG-333“将推进、电源和热子系统模型集成到飞行器概念设计中”）。因此，建议对涡扇和涡轴子系统电气化的当前趋势进行分析，并组织关于此主题的 RSM，目的是将 AVT 小组定位在此技术发展的前沿。背景
结核分枝杆菌复合物的估算的祖先参考基因组更好地捕获了基于参考的ALI
收到2023年8月31日； 2023年12月7日接受；于2024年1月4日出版了作者分支：1麦吉尔大学医学系，蒙特利尔，魁北克H4A 3J1，加拿大； 2个细菌共生体进化，加拿大魁北克H7V 1B7，Inrs-Centre-Centre Armand-FrappierSantéBiotechnologie； 3宾夕法尼亚州立大学宾夕法尼亚州立大学动物科学系16802-3500； 4 McGill International TB Center，McGill University，蒙特利尔，魁北克H4A 3S5，加拿大。*信件：路加·哈里森（Luke B.基于参考的对齐；参考基因组。缩写：AIC，Akaike的信息标准； ATCC，美国类型文化收藏；床，浏览器可扩展数据； GATK，基因组分析工具包； Hal，分层对齐； IGV，综合基因组观众； MRCA，最终的共同祖先； MTBC，结核分枝杆菌复合物； NCBI，国家生物技术信息中心； NGS，下一代测序； PGAP，原核基因组注释管道； PHAST，具有空间/时间模型的系统发育分析； Rd，差异区域； RVD，[H37] RV-DETEATION; SNP，单核苷酸多态性； SRA，序列阅读档案； TBD1，结核分枝杆菌 - 特异性缺失1。数据语句：文章或通过补充数据文件中提供了所有支持数据，代码和协议。本文的在线版本可以使用五个补充表和三个补充数据。001165©2024作者
CRISPR Cas9 的全基因组脱靶分析 - ...
目标。利用人类 T 细胞的力量进行治疗已导致出现新兴免疫治疗策略的当前范式。T 细胞受体 (TCR) 的基因工程可重定向特异性、消除同种反应性并为新兴的过继性 T 细胞转移 (ACT) 方法带来重大进展和现成的选择。DNA 中的靶向 CRISPR/Cas9 介导的双链断裂可实现敲除或敲入工程。方法。在这里，我们使用治疗相关的核糖核蛋白 (RNP) 递送方法进行 CRISPR/Cas9 介导的 TCR 敲除，以评估基因工程 T 细胞产品的安全性。进行全基因组测序以分析 TCR 基因座处 CRISPR/Cas9 介导的 DNA 双链断裂是否与人类原代 T 细胞中的脱靶事件有关。结果。TCR a 链和 TCR b 链敲除导致高靶向 InDel 频率和功能性敲除。所有预测的脱靶位点都无法通过实验得到确认，而全基因组测序和手动整合基因组学查看器 (IGV) 审查揭示了全基因组范围内 9 个潜在的低频脱靶事件。随后在 7 个可评估位点中的 7 个中进行扩增和靶向深度测序未证实这些低频 InDel。因此，脱靶事件不太可能由 CRISPR/Cas9 工程引起。结论。全基因组测序和靶向深度测序的组合方法证实了使用 CRISPR/Cas9 介导的 TCR 敲除进行的高度特异性基因工程，而没有潜在有害的外显子脱靶效应。
通过诱导seq
图2：与替代性DSB测序技术相比，诱导seq表现出无与伦比的灵敏度和动态范围。（a）诱导seq同时检测高度复发的诱导DSB和低级内源性DSB，并以高分辨率。基因组浏览器视图（IgV）诱导seq读取映射到HEK293T细胞的10MB部分，随后与限制性核酸内核酸内切酶Hindiii进行原位裂解。（顶部面板）高度复发性酶诱导的断裂表示在低分辨率（10MB，0-1000读物）时的绝大多数读数。（底部面板）高分辨率视图（粉红色的亮点，500kb，0-20读取）显示出未处理样品中存在的低水平的单源性断裂，以及在复发性印度诱导的突破（绿色亮点）中。（b）诱导seq读取的映射在Hindiii目标位点显示了断裂两侧的单核苷酸断裂映射的精度。（c）对经过治疗和对照样品的每个细胞测量的断裂定量。诱导seq在样品之间的3个数量级上定量检测到每个细胞的断裂。（d和e）通过酶Hindiii和ecorv检测体外裂解限制位点时诱导seq和dsbapture之间的比较。（d）使用诱导seq映射到测序和对齐基因组的读取和对齐基因组的比例更大。（e）使用少800倍的细胞，诱导seq鉴定了与DSBCAPTURE确定的ECORV（93.7％）相似的Hindiii限制位点（92.7％）。（f）使用诱导seq的诱导DSB检测的动态范围。除了在印度内目标序列（AAGCTT）上鉴定出的断裂外，还确定了多个1BP和2BP不匹配靶向位点。诱导seq测得的诱导的休息事件，跨越了8个数量级，从在印度内靶标地点确定的约1.5亿次断裂到最少频繁的脱离目标的5个断裂。（g）在检测ASISI诱导的活细胞中诱导的疾病，DSBCAPTURE和BLISS之间的比较。将测序的读取数（顶部面板）与每个实验（底部面板）识别的ASISI位点的数量进行了比较。诱导seq使用比DSBCAPTUE少的40倍读数检测到最大数量的ASISI位点，而读取的读数比Bliss少23倍。
crispr/cas9介导的VPREB1基因的敲除在骨髓瘤细胞中诱导细胞毒性作用
在过去的十年中，由于开发了可以在一线或复发阶段使用的新疗法策略，因此对MM的处理已更改[1]。目前，六种不同的药物，即烷基剂，类固醇，蛋白酶体抑制剂，免疫调节剂，组蛋白脱乙酰基酶抑制剂和单克隆抗体用于不同的治疗方案，要么是双次，三倍，三胞胎，也可以将其结合到自动型茎细胞替代型（2）[2] [2]尽管有不同的治疗方案的可用性，但患者表现出良好的反应，某些情况显示复发。与接受化学治疗剂的患者相比，接受造血干细胞移植的患者观察到的生存率更好[3]。强烈需要为MM患者开发新的治疗方法以改善治疗结果。基因编辑最近在实验水平上尝试治疗包括血液恶性肿瘤在内的恶性疾病[4]。簇状的常规间隔短篇小学重复重复序列（CRISPR-CAS9）是细菌和相关生物的辅助免疫系统。CRISPR-CAS9由编程的单链引导RNA“ SGRNA”和Cas9核酸内切酶组成，该核酸酶在序列特异性位点生成双链DNA断裂（DSB）[5]。基因组的修饰是通过不同的方法进行的，例如：通过非同源末端连接（NHEJ）或同源性修复（HDR）路径的插入或缺失小序列“ indels” [5-7]。蛋白质由位于Chr22：22上的VPREB1基因编码。2016年，在中国推出了使用CRISPR-Cas9介导的基因编辑的首次临床试验。评估了编程的细胞死亡蛋白1（PD-1）基因敲除工程T细胞，以管理转移性非小细胞肺癌[8-10]。CRISPR/CAS9已被测试为多种血液疾病的潜在治疗，包括编辑β-丘脑中贫血中的β-珠蛋白（HBB）基因突变[11]和镰状细胞疾病中GLU6VAL突变的有效控制[12，13]。此外，通过编辑患者衍生成纤维细胞[14]的点突变[14]和出血疾病，例如新生儿自身免疫性血小板减少症和后液压减少症和后传播puransfula [15]，血液磷[16]，疾病[16]，von-wille brandbrandbrandbrandbrandbrand [17]，将这项技术用于治疗范科尼贫血。V-stet前B细胞替代光链1“ VPREB1”（也称为CD179A）蛋白质属于免疫球蛋白（IG）超家族，其分子量为16-18 kDa，由126个氨基酸组成。它在早期B细胞的表面表达，即概率和早期preb细胞[18]。该基因编码与IG-MU链相关的IOTA多肽链，以在Pre-B细胞表面形成分子复合物[19]。在B细胞分化的早期步骤中，VPREB1 /IG-MU链复合物调节Ig基因重排[20]。CD179A的结构包括一个类似IGV结构域的结构，该结构缺少正常V结构域的β（beta 7），但具有与其他蛋白质相顺序连续性的羧基末端[20]。在这个复合物中，CD179A的不完整V域CD179B与“ Lambda 5”结合使用，该“ Lambda 5”具有类似IgC域的结构，称为易于轻链的结构，称为替代轻链或伪轻链[21]。