白质消失 (VWM) 是一种由 eIF2B 亚基隐性变异引起的白质营养不良。目前,尚无治愈性治疗方法,患者常常英年早逝。由于其单基因特性,VWM 是开发 CRISPR/Cas9 介导的基因治疗的有希望的候选对象。在这里,我们在 VWM 小鼠中测试了一种双 AAV 方法,该方法编码 CRISPR/Cas9 和 DNA 供体模板以纠正 Eif2b5 中的致病变异。我们进行了测序分析以评估基因纠正率,并检查了对 VWM 表型(包括运动行为)的影响。序列分析表明,在目标基因座处超过 90% 的 CRISPR/Cas9 诱导的编辑是插入或缺失 (indel) 突变,而不是通过同源定向修复从 DNA 供体模板进行的精确校正。大约一半的 CRISPR/Cas9 治疗动物过早死亡。 VWM 小鼠在 7 个月大时运动技能、体重或神经系统评分均未改善,而 CRISPR/Cas9 处理的对照组则表现出诱导的 VWM 表型。总之,CRISPR/Cas9 在 Eif2b5 基因座处诱导的 DNA 双链断裂 (DSB) 未导致 VWM 变异的充分校正。此外,Eif2b5 中的插入/缺失形成会加剧 VWM 表型。因此,DSB 独立的策略(如碱基编辑或主要编辑)可能更适合 VWM 校正。
摘要 为了帮助制造企业实现人工智能 (AI) 的价值,我们开始了为期六年的研究和实践,以增强流行且广泛使用的 CRISP-DM 方法。我们通过添加“操作和维护”阶段以及嵌入基于任务的框架将任务与技能联系起来,将 CRISP-DM 扩展为 AI 解决方案的连续、主动和迭代生命周期。我们的主要发现涉及操作和维护 AI 解决方案和管理 AI 漂移的艰难权衡和隐性成本,以及确保在整个 CRISP-DM 阶段中存在领域、数据科学和数据工程能力。此外,我们展示了数据工程如何成为 AI 工作流程中必不可少但经常被忽视的一部分,对这三种能力的参与轨迹提供了新颖的见解,并说明了如何将增强的 CRISP-DM 方法用作 AI 项目的管理工具。
棕榈科植物包括 200 个属,2500 多个品种,在农业食品生产和工业应用领域仅次于禾本科 (Poaceae) 和豆科 (Fabaceae)。椰子 (Cocos nucifera L.)、槟榔 (Areca catechu L.)、油棕 (Elaeis guineensis Jacq.) 和枣椰子 (Phoenix dactylifera L.) 是棕榈科中具有重要经济价值的多年生植物。椰子通常被称为“生命之树”,因其在食品、营养、医药和各种工业用途中的广泛应用而闻名 (Ramesh et al., 2021)。椰子产品包括从椰仁或种皮中提取的食用油、嫩椰子水、椰仁、椰干、椰子壳、椰子饼、木质产品、椰壳髓以及各种增值过程产生的物品。未开放的佛焰苞被挖掘以提取花序汁液(neera),可进一步加工成棕榈糖、糖、醋和各种副产品(Hebbar 等人,2022 年)。槟榔(Areca catechu L.)是热带亚洲和东非部分地区的一种作物。在印度,它是一种重要的经济作物,也有重要的医学价值,主要种植在该国的几个邦。尽管如此,其商业产品分布在整个印度,该国在种植面积和产量方面无疑处于领先地位,占世界产量的 54%。槟榔棕榈的果实或坚果,俗称槟榔或 supari,在印度人民中作为咀嚼产品使用已有悠久历史,可以追溯到吠陀时期。因此,槟榔与印度的历史和社会遗产深深交织在一起。在全球范围内,仅亚洲就有多达 6 亿人食用槟榔。另一方面,椰枣生长在埃及、伊朗、沙特阿拉伯和阿联酋等干旱地区(Aljohi 等人,2016 年)。除了果实外,椰枣种子也是食用油的新来源,进一步拓展了其工业应用(Ali 等人,2015 年)。油棕是一种具有经济重要性的棕榈树种,供应着全球约 35% 的植物油。油棕的遗传改良可能在全球营养安全中发挥关键作用。
摘要 成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR)和CRISPR相关蛋白(Cas)是细菌和古菌中对抗入侵核酸和噬菌体的适应性免疫系统。根据效应蛋白的组成,CRISPR/Cas大致分为多种类型和亚型。其中,VI型CRISPR/Cas系统尤受关注,有VI-A、VI-B、VI-C和VI-D四个亚型,被认为从转座子进化而来。这些亚型在结构架构和机制上表现出差异,具有多种Cas13a(C2c2)、Cas13b1(C2c6)、Cas13b2(C2c6)、Cas13c(C2c7)和Cas13d效应蛋白。CRISPR/Cas13 核糖核酸酶将前 crRNA 加工成成熟的 crRNA,后者在病毒干扰过程中靶向并敲除噬菌体基因组的单链 RNA。这种蛋白质的高特异性 RNA 引导和 RNA 靶向能力使其能够与多种效应分子融合,为 Cas13 介导的 RNA 靶向、追踪和编辑领域开辟了新途径。CRISPR/Cas13 具有靶向包括植物在内的 RNA 的独特功能,因此可以用作一种新的工具,用于工程干扰植物病原体(包括 RNA 病毒),具有更好的特异性,并可用于植物中的其他 RNA 修饰。荧光探针标记的失活可编程 Cas13 蛋白可用作体外 RNA 研究的替代工具。工程化的 Cas13 也可用于可编程的 RNA 编辑。CRISPR/Cas13 的高靶向特异性、低成本和用户友好的操作使其成为多种基于 RNA 的研究和应用的有效工具。因此,本章的重点是 CRISPR/Cas 系统的分类、VI 型 CRISPR/Cas 系统的结构和功能多样性,包括其发现和起源、机制以及 Cas13 在植物 RNA 编辑中的作用。
1 柑橘研究中心“Sylvio Moreira” – 农学研究所 (IAC),Cordeiro ´ polis,巴西,2 生物研究所,坎皮纳斯州立大学 (Unicamp),坎皮纳斯,巴西,3 甘蔗研究中心 – 农学研究所 (IAC),里贝朗普雷图,巴西,4 里贝朗普雷图医学院,圣保罗大学 (USP),里贝朗普雷图,巴西,5 坎皮纳斯农学研究所 (IAC) 咖啡中心,坎皮纳斯,巴西,6 Embrapa 咖啡,巴西农业研究公司,巴西利亚,联邦区,巴西,7 生物学系,哲学、科学与文学学院,圣保罗大学 (USP),里贝朗普雷图,巴西,8 遗传学系,路易斯·德·凯罗斯农业学院 (ESALQ),圣保罗大学 (USP),皮拉西卡巴,巴西
研究成果概要(中文):CRISPR-Cas9 是一种多功能技术,可应用于医疗。在 DNA 双链断裂后的修复途径中,与模板 DNA 同源重组 (HDR) 的修复有助于精确编辑,但同时,涉及碱基缺失或插入的 NHEJ 也以高频率发生。我使用 Traffic Light Reporter 系统进行了基于细胞的 HDR 增强因子筛选,该系统可以同时检测具有 HDR 和 NHEJ 的细胞,并确定了与 NHEJ 衍生细胞相比,HDR 衍生细胞中表达较高的几个基因。对这些基因的进一步基因本体分析表明,它们与 DNA 修复和细胞周期有关。
随着手机摄像头的质量开始在现代智能手机中发挥关键作用,人们越来越关注用于改善手机照片各个感知方面的 ISP 算法。在这次移动 AI 挑战赛中,目标是开发一个基于深度学习的端到端图像信号处理 (ISP) 管道,该管道可以取代传统的手工制作的 ISP,并在智能手机 NPU 上实现近乎实时的性能。为此,参赛者获得了一个新颖的学习到的 ISP 数据集,其中包含使用索尼 IMX586 Quad Bayer 移动传感器和专业的 102 兆像素中画幅相机拍摄的 RAW-RGB 图像对。所有模型的运行时间都在联发科 Dimensity 1000+ 平台上进行评估,该平台配备专用的 AI 处理单元,能够加速浮点和量化神经网络。所提出的解决方案与上述 NPU 完全兼容,能够在 60-100 毫秒内处理全高清照片,同时实现高保真效果。本文提供了本次挑战赛中开发的所有模型的详细描述。
活动:我观察到托德·阿隆索博士的日常工作。他帮助我制定了一个培训时间表,涵盖了我希望在这么短的时间内学习的一切。在BDC,我被教导如何从诊断出来从整体上治疗儿童期糖尿病。令人着迷的是,看到完整的医疗专业人员,糖尿病教育者,营养师,护士从业人员,社会工作者和心理学家如何合作,为新诊断的儿童及其家人提供日常教育计划。他们的杰出团队不仅可以帮助家庭有效地管理糖尿病,还激发了他们这样做。他们彻底的糖尿病教育工作和支持是惊人的。即使是其他有T1D多年的父母也承认他们希望他们早日访问BDC,因为以前没有人对他们进行如此彻底的教育。
○ 哪些基因编码了红细胞镰状化?○ CRISPR-Cas9 在原核生物(如细菌)中的自然机制是什么,它是如何被修改并用于编辑真核生物(有细胞核的生物)中的基因的?○ CRISPR 基因编辑技术如何应用于镰状细胞病患者?
CRISPRMED24 摘要书_2024-04-30 首届 CRISPR 医学会议,丹麦哥本哈根,2024 年 4 月 23 日至 25 日(4 月 22 日虚拟活动)