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策划和验证普遍适用的引物，以有效地基于ITS2的DNA条形码
对植物物种的快速准确鉴定越来越多地寻求采用分子技术。ITS2区域在DNA条形码中高度评价，因为它的短长度和易于测序，使其成为物种识别的理想候选者。在这项研究中，通过对广泛植物分类群的底漆序列进行细致的分析和比较，我们策划了一系列具有证明普遍性的底漆，能够有效地扩大不同植物物种的ITS2区域。为了验证识别引物的普遍性，我们均采用了硅和体外方法。在计算机分析中涉及生物信息学工具，以评估公共数据库中可用的大量植物DNA序列的底漆结合位点。随后，使用从各种植物标本中提取的DNA样品进行了体外实验，以验证引物的扩增成功。通过这个全面的验证过程，我们确保了选定的引物用于DNA键编码目的的可靠性和适用性。我们发现的重要性在于使用ITS2区域建立了标准化的DNA栏编码方法，这有助于准确而有效的植物物种识别。通过为研究人员提供一组普遍适用的底漆，我们旨在简化底漆选择过程，从而减少实验设计所涉及的时间和精力。该标准化协议促进了DNA条形码研究中的一致性和可重复性，最终促进了我们对植物生物多样性的理解并有助于保护工作。
东非医学杂志卷。 100 2023年1月1日使用ITS2和RBCL标记的DNA条形码识别Kathryn Wanj
东非医学杂志卷。100号2023年1月1日，使用ITS2和RBCL标记物用于茄科种类识别的DNA条形码kathryn Wanjiku Nderitu，Nairobi大学科学与技术学院生物化学系，P。O.box 30197-00100肯尼亚，精灵阿格尔，科学技术学院，内罗毕大学科学技术学院，P。O。box 30197- 00100，肯尼亚，以西结·梅查（Ezekiel Mecha），内罗毕大学科学技术学院生物化学系框30197- 00100肯尼亚，阿顿nyachieo，灵长类动物研究所，Karen -Nairobi，P。O.框24481- 00502，肯尼亚。通讯作者：内罗毕大学生物化学系Kathryn Wanjiku Nderitu，P。O.框30197 -00100，肯尼亚内罗毕。电子邮件：knderitu276@gmail.com
评估内部转录序列（其）作为DNA条形码的有效性以估计真菌多样性
通用系统发育标记，例如核核糖体内部转录序列（ITS），特别是ITS1和ITS2，通常用于估计环境样品中的真菌多样性。然而，许多研究报告了ITS1和ITS2在记录真菌多样性方面的性能和功效上的差异。为了更好地理解使用ITS1与ITS2的含义，需要对多种真菌分类群的全面表示，对于对它们在多个真菌分类单元中使用的荟萃分析是必要的。为了解决这个问题，进行了详尽的文献综述，以比较和对比ITS1和ITS2作为有效的DNA条形码。公开可用的数据集用于合成代表多种真菌分类群的模拟真菌群落，并测试了两个扩增子的功效，并将其与完整的效果进行了比较。这项研究假设ITS1和ITS2对于解决真菌分类单元的分辨率同样有效。具体来说，当比较系统发育分辨率的ITS1和ITS2时，通过两种方法都确定了一组重叠的分类单元，而某些分类单元则由单个其扩增子更好地解决。此处介绍的评估应使读者可以更好地理解ITS1与ITS2在研究真菌多样性和生态学方面的用途和局限性，并使他们能够开发出改进的方法，以更好地分类分辨率，并有助于识别潜在的新物种。
使用 nrITS 和叶绿体 rbcL 基因序列对印度叶下珠进行 DNA 条形码编码和系统发育分析，以进行分子鉴定
叶下珠属植物因其生态和治疗意义而闻名。准确识别这些物种对于保护和研究目的至关重要。由于植物的表型可塑性以及在检测植物产品中的替代品或掺假物方面存在挑战，传统的分类学鉴定往往不够完善。因此，通过 DNA 条形码进行分子鉴定已成为草药产品质量控制和国际草药贸易的新标准。本研究使用 DNA 条形码工具来识别印度叶下珠属物种，重点关注 nr 内部转录间隔区 2 (ITS2) 和叶绿体 rbcL 基因。系统发育分析显示高度的遗传相似性和很强的系统发育关系。这些发现证实了与全球同类的遗传亲缘关系，突出了进化模式。ITS2 区域的结构使用最小自由能计算来验证物种鉴定。这项研究展示了如何将 rbcL 基因分析与基于 ITS2 的 DNA 条形码相结合来准确识别印度叶下珠属物种，这种方法增强了这些宝贵植物资源的可持续利用，确保了产品质量，最大限度地减少了掺假，并支持生物多样性保护。
珊瑚表现出独特的微生物重组模式，以在极端的近海环境中茁壮成长
来自环境更为温和的珊瑚礁栖息地的同种生物。我们分别通过 ITS2 和 16S rRNA 测序研究了全生物生理学以及珊瑚相关微生物（共生藻科和细菌）的可塑性。我们假设泻湖和相邻珊瑚礁栖息地之间的珊瑚相关微生物（共生藻科和细菌）的差异可能支持珊瑚宿主的生产力，并最终支持珊瑚在极端环境中生存的能力。在泻湖中，所有珊瑚物种都表现出降低光合作用与呼吸比率 (P/R) 的代谢调整，但这伴随着高度分化的珊瑚宿主特异性微生物关联。这通过不存在共享的 ITS2 类型谱（共生藻科基因型的代理）得到证实。我们
induzierbares crispr-kill-system zur zelltypspezifischen ...
基于CRISPR/CAS系统，CRISPR-kill系统可以通过同时诱导真核生物保存高度保存，功能活性的基因组区域的多个DNA双链（DSB）来转换细胞死亡的启动（图1，[1]）。在同一时间使用了45S核糖体DNA（rDNA）或ZEN Tromeric卫星的大量序列分辨率。是拟南芥中泛素启动子（Pubi）在泛素启动子（PUBI）下系统地表达的SACAS9核酸酶，它在强烈的静脉效果下，内部转换的隔离剂2（ITS2）的内部转移垫片2（ITS2） - 序列的序列。用于在组织工程中使用，通过简单地替换Pubi启动子作为组织特异性启动子的诱导诱导可将细胞死亡的诱导限制为已证明细胞类型，并且会爆炸器官发生。，使用根特异性木质部极周围启动子（PXPP），侧根的形成可以通过在xylempoles上的pxpp-positis side Founder细胞的消融来阻止[1]。是已经在早期或几个开发阶段活跃的启动子，这是CRISPR-KILL系统的构成表达，
靶向核糖体生物发生是一种克服EMT相关
Target Gene Forward Reverse Bop1 GGTCTCGGAGGAAGAGCACC ACCGCCAAATAGTCCCCTCG Gapdh GGTCCTCAGTGTAGCCCAAG AATGTGTCCGTCGTGGATCT Gemin4 CCTCACAGGTCCACGAAGGG TGCCCACATCCATCACCAGA Its1 TCCATCTGTTCTCCTCTCTCT ATCGGTATTTCGGGTGTGAG Its2 CTGCCTCACCAGTCTTTCTC ACCTCGACCAGAGCAGAT Ecad ACACCGATGGTGAGGGTACACAGG ACACCGATGGTGAGGGTACACAGG Ncad AAAGAGCGCCAAGCCAAGCAGC TGCGGATCGGACTGGGTACTGTG Nop58 acagcagaagcatagcagca cgacagccaggggttcatgg npm1 gcgagagatctcctgcgcgaccat acttcggtgtgtggggagaagcc cascl tgctaaggcagttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttctagtagttagta AAGGAAATGCCCTGAAGCCG Rpl29 GCAGTGAGGGAAGCTTTTCCG CATGTCTGCACGGTAACCCG Rpl8 ACAGAGCTGTTCATCGCAGC ACGATCGTACCCTCAGGCAT Rps24 ACACAGTAACCATCCGGACCA TTTTGGCCAGCTTTTCCCGA Rps28 GATATCCAGAACCCCACCAGC AATGTCAAAGGCCCCGTTCG Rps9 GTCTCGGGCCTGAGTTCGTA CCTGCGCAGTAAAGTGTCGT S100a4 CCTGTCCTGCATTGCCATGAT CCCACTGGCAAACTACACCC Setd4 GGAACTGCGCGTCCTTGTG gtaacaaaaacgccctcgcgca蜗牛Actggtgagaagccattctcct ctggcactggtatctcttcaca utp6 agggcatttgggggggggggggggggggggggggggtgggggggggggggtgggtctgtctctctcagt vim
怀孕期间肠道菌组动力学的景观及其与宿主代谢和妊娠健康的关系
抽象目标在怀孕期间的肠道霉菌组（IE，真菌）的重塑及其对宿主代谢和妊娠健康的潜在影响仍然很大程度上尚未探索。在这里，我们的目的是检查孕妇肠道真菌的特征，并揭示肠道菌组合，宿主代谢组和妊娠健康之间的关联。基于中国中部的前瞻性出生队列（2017年至2020年）的设计：Tongji-Huaxi-Shuangliu出生队列，我们包括4800名参与者，他们在怀孕期间提供了ITS2测序数据，饮食信息和临床记录。此外，我们建立了一个由1059名参与者组成的子幼虫，其中包括514名妇女，这些妇女生育着早产，低出生体重或宏观疾病婴儿，以及545个随机选择的对照。在此子体内，共有750、748和709名参与者的参与者分别在所有三个固定器中分别提供了2个测序数据，16S测序数据和血清代谢组数据。结果与肠道细菌中观察到的变化相比，肠道真菌的组成从早期到晚期急剧变化，表现出更大程度的可变性和个性。多组学数据提供了肠道菌组，生物功能，血清代谢产物和妊娠健康中网络的景观，从而指出了粘膜与不良妊娠结局之间的联系。孕前超重状态是影响肠道菌组合体组成改变和妊娠期间代谢重塑模式的关键因素。结论本研究提供了怀孕期间肠道菌果实的动力学的景观及其与宿主代谢和妊娠健康的关系，这奠定了未来肠道肠菌组织健康妊娠调查的基础。
马来西亚Glycycometus malaysiensis的鉴别（首次）...
摘要 热带布洛米亚螨和屋尘螨在引发过敏方面起着重要作用。马来西亚布洛米亚螨在敏感人群中引起 IgE 反应，但在家用灰尘中很少见，因为它在形态上与热带布洛米亚螨相似，使得这些物种的鉴定很困难。螨虫的鉴定主要基于形态学，这是一种耗时且不明确的方法。在此，我们描述了一种基于核糖体 DNA 的多重聚合酶链反应 (mPCR) 检测方法，该方法能够鉴定热带布洛米亚螨、屋尘螨和马来西亚布洛米亚螨的混合培养物，和/或从环境灰尘中鉴定这些物种。为此，对 5.8S 和 28S 基因部分序列两侧的内部转录间隔区 2 (ITS2) 区域进行了 PCR 扩增、克隆和测序。将获得的序列与 GenBank 数据库中可用的同特异性序列比对，以进行引物设计和系统发育研究。选择三对引物组成 mPCR 检测，用于验证巴西萨尔瓦多家庭屋尘样本 (n = 20) 中不同螨虫的频率。Blomia tropicalis 是最常见的，在 95% 的样本中发现，其次是 G. malaysiensis (70%) 和 D. pteronyssinus (60%)。除了首次报道 G. malaysiensis 在巴西的出现之外，我们的结果还证实了 ITS2 区域对于螨虫识别的良好分辨率。此外，mPCR 检测被证明是一种快速可靠的工具，可用于在混合培养物中识别这些螨虫，并可应用于未来的流行病学研究，以及用于通用螨虫提取物生产的质量控制。