哺乳动物细胞中的遗传筛选通常专注于功能丧失方法。为了评估额外基因拷贝的表型后果,我们使用了辐射杂种(RH)细胞的大量分离分析(BSA)。,我们构建了六个RH细胞池,每个池由约2500个独立克隆组成,并将池放置在带有或没有紫杉醇的培养基中。低通序测序鉴定859个生长基因座,38个紫杉醇基因座,62个相互作用基因座和3个基因座,用于跨基因组的明显限度,用于线粒体丰度。分辨率被测量为约30 kb,接近单基因。差异性特性,反驳了平衡假设。此外,在RH池中,人类丝粒的保留增强表明,这些染色体元素的功能解剖方法是一种新的方法。对RH细胞的合并分析显示出高功率和分辨率,应该是哺乳动物遗传工具包的有用补充。
图 1:HPV 阳性和 HPV 阴性癌症患者第一疗程治疗后的临床结果比较。(b)饼图显示 HPV 阳性和 HPV 阴性癌症患者第一疗程治疗后的生命体征。(c)癌症样本中 HPV 亚型的频率。颜色显示 HPV 病毒 DNA 整合到宿主基因组中的样本的分布。(d)患有 HPV 阳性宫颈癌的患者不同年龄段肿瘤的 HPV 亚型分布。(e)在 HPV 阳性癌症中测量的标准化 E6 剪接 mRNA 转录本和标准化 E6 未剪接 mRNA 转录本之间的 Pearson 线性相关性。针对 HPV 亚型 18 和 16 分别绘制了回归线。标记形状显示基于主要 HPV 病毒 DNA 整合到宿主基因组的标记。 (f)E6 未剪接标准化计数 e6 与 E6 剪接标准化计数。颜色显示有关 HPV 亚型的详细信息。标记大小显示受感染患者总生存期(以月为单位)的详细信息。标记标有总生存期。
Mary H. Wertz,2、3 Mollie R. Mitchem,2、3 S. Sebastian Pineda,3、7、8 Lea J. Hachigian,1、2、3 Hyeseung Lee,2、3 Vanessa Lau,2、3 Alex Powers,2、3 Ruth Kulicke,2、3 Gurrein K. Madan,1 Medina Colic,4 Martine Therrien,2、3 Amanda Vernon,1、2、3 Victoria F. Beja-Glasser,1、3、5 Mudra Hegde,3 Fan Gao,2、6 Manolis Kellis,3、7 Traver Hart,4 John G. Doench,3 和 Myriam Heiman 1、2、3、9、* 1麻省理工学院脑与认知科学系,美国马萨诸塞州剑桥 02139 2 皮考尔学习与记忆研究所,美国马萨诸塞州剑桥 02139 3 麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所,美国马萨诸塞州剑桥 02142 4 德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心,美国德克萨斯州休斯顿 77030 5 麻省理工学院麦戈文脑研究所,美国马萨诸塞州剑桥 02139 6 加州理工学院贝克曼研究所生物信息学资源中心,美国加利福尼亚州帕萨迪纳 91125 7 麻省理工学院计算机科学与人工智能实验室,美国马萨诸塞州剑桥 02139 8 麻省理工学院电气工程与计算机科学系,美国马萨诸塞州剑桥 02139 9 主要联系人 *通信地址:mheiman@mit.edu https://doi.org/10.1016/j.neuron.2020.01.004
Thomas W Dennison,1,2,3 Rachel d Edgar ,4,5 Felicity Payne payne ,1,2 Komal M Nayak,1,2 Alexander DB Ross,1,2,6 Aurelie Cenier,2,7 Claire Glemas,1,8 Claire Glemas,1,8 Federica,giaser,juc thris,3岁,3岁,3岁Salvestrini,8 Georgia Stavrou,2 Franco Torrente,8 Kimberley Brook,8 Claire trayers,10 Rasa Elmentaite,9 Gehad Youssef,3 BálintTél Jenke,15.16 Natasha G,8 Natasha Thomas,2 Erasmo Miele,17 Abdulrahman al-Mohammad,2 Greta Guarda,18 Subra Kugathasan,19.20 Suresh venkates Clawar,212 Menna Tomas,23 Stro-Dopopico,21 Ond popopico,21 suke suriio strio Okjun Lee,1,3 Xingze Xu,1,3 Erica Bello,3 Namshik Han,3,26 Daniel R. Zerbino,4 Sarah A Teichmann,28岁,Robert Heusch,28岁,Nysch Francesca Perrone,1,2 Matthias Zilbauer
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证下可用(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2024 年 3 月 30 日发布。;https://doi.org/10.1101/2024.03.27.586949 doi:bioRxiv 预印本
Strom,Nora,I。1,2,3,4 *; Gerring,Zachary,F。5,6 *; Galimberti,Marco 7,8 *; Yu,Dongmei 9,10 *; Halvorsen,Matthew,W。11; Abdellaoui,Abdel 12; Rodriguez-Famtenla,克里斯蒂娜13,14; Sealock,Julia,M。15; Bigeli,Tim 16,17;科尔曼(Coleman),乔纳森(Jonathan),R。18,19; Mahjani,Behrang 20,21;索普,杰克逊,G。22,23; BEY,KATHARINA 24;伯顿(Burton),克里斯蒂(Christie),L。25; Luykx,Jurjen,J。26,27; Zai,Gwyneth 28,29; Alemany,Silvia 30,31,32;安德烈,克里斯汀33; Askland,Kathleen,D。34; Banaj,Nerisa 35; Barlassina,克里斯蒂娜36;贝克·尼森(Becker Nissen),朱迪思(Judith)37,38; Bienvenu,O。Joseph39;黑色,唐纳德40; Bloch,Michael,H。41;鲍伯格,朱莉娅3; Børte,Sigrid 42,43,44;博世,罗莎45,46;布雷恩,迈克尔47,48,49; Brennan,Brian,P.33,50;布伦塔尼,海伦娜51; Buxbaum,Joseph,D。20; Bybjerg-Grauholm,乔纳斯52;伯恩(Byrne),恩达(Enda),M。53; Cabana-Dominguez,Judit 30,31,32; Camarena,Beatriz 54; Camarena,Adrian 55; Cappings,Carolina 56,57; Carracedo,Angel 58,59,60;卡萨斯,米格尔61,62;卡瓦利尼,玛丽亚·克里斯蒂娜63; Ciullo,Valentina 35;库克,埃德温(Edwin),H。64;克罗斯比,杰西33,50; Cullen,Bernadette,A。65,66; De Schipper,Elles,J。3; Delormme,理查德67; Djurovic,Srdjan 44,68; Elias,Jason,A。 69,70; Sumtivill,Xavier 71; Falkenstein,Martha,J。 33,50; Fundin,Bengt,T。72;加纳(Lauryn)33;德语,克里斯73;吉伦达(Gironda),克里斯蒂娜(Christina)33;去,费尔南多,S。74; Grados,Marco,A。 134; Ripke,Stephan 135,136,137; Rosário,Maria,C。138; Sampaio,Aline,S。139; Schiele,Miriam,A。 182,183; Gatian,J,M.184,185; Geller,Dan,A。 186,50; Grabe,Hans,J。 111;里奇特(Richter),玛格丽特(Margaret),A。69,70; Sumtivill,Xavier 71; Falkenstein,Martha,J。33,50; Fundin,Bengt,T。72;加纳(Lauryn)33;德语,克里斯73;吉伦达(Gironda),克里斯蒂娜(Christina)33;去,费尔南多,S。74; Grados,Marco,A。134; Ripke,Stephan 135,136,137; Rosário,Maria,C。138; Sampaio,Aline,S。139; Schiele,Miriam,A。182,183; Gatian,J,M.184,185; Geller,Dan,A。 186,50; Grabe,Hans,J。 111;里奇特(Richter),玛格丽特(Margaret),A。182,183; Gatian,J,M.184,185; Geller,Dan,A。186,50; Grabe,Hans,J。 111;里奇特(Richter),玛格丽特(Margaret),A。111;里奇特(Richter),玛格丽特(Margaret),A。75;格罗夫,雅各布4、76、77、78; Guo,Wei 79;哈维克,1月80日,81岁;哈根,克里斯蒂安82,83,84;哈灵顿,凯利85,86; Havdahl,Alexandra 87,88;霍夫勒(Höffler),Cyra,D。68,89,90; Hounie,Ana,G。91;哈克斯,唐纳德92;克里斯蒂娜21岁的霍尔曼; Janecka,Magdalene 93,94; Jenike,Eric 33;卡尔森(Carlsson),埃利诺(Elinor),K。95,96;凯利,卡拉33;克拉沃,朱莉娅1,97; Krasnow,Janice,E。98;克里斯(Crebs),克里斯蒂(Kristi)99;兰格,克里斯托夫100,101; Lanzagorta,Nuria 102;莱维,丹尼尔103,104;城镇,克斯汀105,106; MacCiard,Fabio 107; Maher,Brion 108; Mathes,布列塔尼33;麦克阿瑟(McArthur),埃文(Evonne)109;麦格雷戈,纳撒尼110;朋友和C. 111,112;碧昂斯,桑德拉113; Miguel,圣洁的C. 114; Mulhern,莫琳24;晚上,保罗,圣115; Nurmi,Erika,L。116; O'Connell,Kevin,S。117,118; Osiicki,丽莎119,120;威尔士,老威尔士80,121;帕尔维安,Teemu 122;费德(Feder),南希(Nancy),L。21; Piras,物质35;皮拉斯(Piras),费德里卡(Federica)123; Pottice,Syramy 33; Rabiones,Rabones 124,125,126;拉米雷斯(Ramires),alfreed 127,128,129,130,131;劳赫,斯科特132;到达亚伯拉罕133;谜语,马克,A。187;格林伯格,本杰明,D。188、189、190;汉娜(Hanna),格雷戈里(Gregory),191;希基,伊恩,B。192;幸福,大卫,M。52,76;凯瑟曼(Kathmann),诺伯特(Norbert)1;肯尼迪,詹姆斯29;莱,东丁193;土地,迈克尔21,194;赫拉德,斯蒂芬195,68;勒博耶(Leboyer),马里恩(Marion)196;洛奇纳(Lochner),克里斯汀(Christine)197; McCraken,James,T。116; Medland,Sarah,E。198; Mortenes,Preben,B。216,29; Rosenberg,David,R。217;鲁尔曼,斯蒂芬218;塞缪尔(Jack),F。219; Sadden,Sven 21,20;沙,保罗29; Spalletta,Gianfranco 35,220; Stein,Dan,J。221; Stewart,S。Eve 222,223,224; Storch,Eric,A。140; Skoghhhh,Anne Heidi 141; Seliman,Laura G Selier,G。20; Smit,142年1月; Soler Artis,Marí30,31,32,143;托马斯,劳伦特,F。144、145、146、147; Tifft,Eric 33; Vallada,Homero 148,149;柯克(Nathanial)150,151; Veenstra-Vader Weeels,Jeremy 152,153; Fink,Ninks,N。154;沃克,克里斯托弗,第155页;王,156; Wendland,Jens,R。157; Winsvold,Bandk,S。42,158,159; Yao,阴160;周,悬挂161,162,163; 23DME研究团队73; VA百万退伍军人计划;爱沙尼亚生物库; COGA重新研究团队; ipsypy;亨特撤回团队;北欧撤退团队; Agrawal,Arpaana 164;阿隆索,皮诺165,166,167,168;贝尔比奇,戈茨169; Bucholz,Kathleen,K。170; Book,Cynthia,M.171,21,172; Cath,Danielle 173,174;否认,达米安175; Eapen,Valsam 176,177;埃登伯格,霍华德178; Falkai,彼得179,180; Fernandez,Thomas,V。181; Fyer,Abby,J。76,199,200; Neale,Benjamin,M.201,202; Nicolini,Humberto 203,204; Nordtor,会见205,206;帕托,米歇尔207;帕托,卡洛斯207; Pauls,David,L。50; Piacentini,约翰208;皮滕纳(Pittenner),克里斯托弗(Christoper)209; Postthhuma,Danielle 210,211; Ramos-Qiroga,Josep Antoni 212,213,214,215;拉斯穆斯(Rasmuss),史蒂文(Steven),A。225;奇怪,芭芭拉,E。226,227;毛利里,毛里佐228;佩戴,托马斯229,230; Andreass,Ole,A。231,232; Børglum,Anders,D。4,233,234; Waltza,Susanne 235,236,237; Hveem,克里斯蒂安159,238,239;汉森(Bjaarne),K。240,241;鲁克(Rück),克里斯蒂安(Christian),第3页;马丁,尼古拉斯,G。242;米兰,莉莉99; Mors,Ole 243; Reichborn-Kjen Nerd,Ted 244,245; Ribasés,Marta 30,246,32,143;客户,戈德83,247; Matiax-Cols,David 3; Domsk,Kathharina 248,249; Grünball,Edna 250,236,
对SARS-COV-2 mRNA疫苗接种的免疫反应性降低了肾脏移植受者(KTRS)。先前的报告指出了霉酚酸(MPA)的作用。我们的观测队列研究包括苏黎世大学医院的所有KTR,在移植后6个月以上接受了两种SARS-COV-2 mRNA疫苗剂量,通过测量抗尖峰免疫球蛋白G(IgG)评估。我们应用了治疗药物监测(TDM)的原理将MPA暴露和淋巴细胞计数与SARS-COV-2 IgG相关联。MPA槽水平在KTR中的中位数为3.1 mg/L(范围为0.7 - 9.5 mg/L)。84 ktr中的34个(40%)在两种疫苗剂量后形成了阳性SARS-COV-2 IgG。KTRS出现了阳性SARS-COV-2 IgG,表现出明显更高的EGFR(P <0.001),MPA槽水平较低(P <0.001)和更高的CD19 +淋巴细胞(P <0.001)。mpa槽水平<2.5 mg/l和CD19 +
Hua Tian, 1 , 2 , 10 , * Presha Rajbhandari, 3 , 10 Jay Tarolli, 4 Aubrianna M. Decker, 3 Taruna V. Neelakantan, 5 Tina Angerer, 6 , 7 Fereshteh Zandkarimi, 5 Helen Remotti, 8 Gilles Frache, 6 Nicholas Winograd, 9 and Brent R. Stockwell 3 , 5 , 8 , 11 , * 1环境和职业健康,匹兹堡,宾夕法尼亚州匹兹堡,15261年,美国2儿童神经科学研究所,医学院,宾夕法尼亚州匹兹堡,宾夕法尼亚州匹兹堡15224,美国3哥伦比亚大学生物科学系,纽约,纽约,纽约,纽约10027,10027卢森堡科学技术研究所,4362 Esch-Sur-Alzette,卢森堡7号药物系,乌普萨拉大学,乌普萨拉大学,751 05 UPPSALA,瑞典8病理学与细胞生物学系,哥伦比亚大学艾尔维尔大学医疗中心,纽约州哥伦比亚大学医疗中心,纽约州伊利诺伊大学,外科医生学院,纽约州,伊利诺伊斯大学。大学公园,宾夕法尼亚州16802,美国10这些作者同等贡献11个铅联系 *通信:hut17@pitt.edu(H.T.),bstockwell@columbia.edu(b.r.s.)https://doi.org/10.1016/j.devcel.2024.01.025
Didier Decaudin、Estelle Frisch Dit Leitz、Fariba Nemati、Malcy Tarin、Adnan Naguez 等人。药物组合的临床前评估确定 Bcl-2/XL/W 和 MDM2 的共同抑制可作为葡萄膜黑色素瘤的潜在治疗方法。《欧洲癌症杂志》,2020 年,126,第 93-103 页。�10.1016/j.ejca.2019.12.012�。�hal-03489891�
(a)实验设置和集成的概述。(b)1p染色体上的信号。左:在 +DSB条件下的单细胞热图(RPKM),其顶部为 +DSB(有色)和–DSB(灰色)条件的单细胞聚集体。右:带有覆盖MSR调用的单细胞线图。asisi主题用黑线注释,红色三角形表示经常裂解(或“顶部”)位点。(c)所有修复频率≥10%的ASISI位点的条形图,每个位点的修复频率(目标蛋白质和方法)颜色为颜色。通过增加绝对修复频率(即任何数据集中的最高频率)来订购(在X轴上)。每个站点,通过增加每个数据集的维修频率(前后;即未堆叠栏)来排序条。底部水平条表示先前的(缺乏)注释作为顶部位点。(d)一个代表性核的共聚焦图像显示DAPI,RAD51 DAMID M6 A-TRACER和内源性γH2AX免疫荧光染色。(e)信号共定位(Manders的A和B每个核)的定量,n = 33核。
