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通过 ONE-seq 进行全球范围的 CRISPR 基因编辑器特异性分析，确定了人群-1
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可，根据 提供（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2021 年 4 月 5 日发布。；https://doi.org/10.1101/2021.04.05.438458 doi：bioRxiv 预印本
靶向 CRISPR 筛选确定 PRMT5 为具有合成致死组合靶点
未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者（此版本于 2020 年 5 月 26 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.05.25.112896 doi：bioRxiv preprint
IPF成纤维细胞灶的转录组分析标识
Edwards 2，Ross Haggart 3，Gino Mile 3，Robin J. Mcanulty 1，Toby M. Maher 4，Robert E. Hyds 5，Edwards 2，Ross Haggart 3，Gino Mile 3，Robin J. Mcanulty 1，Toby M. Maher 4，Robert E. Hyds 5，
Google DeepMind 开发基于 AI 的解码器，可识别量子计算错误
过去几年，谷歌人工智能部门一直在开发和研究一款名为 Sycamore 的量子计算机。为了进行量子计算，它使用多个硬件量子位创建单个逻辑量子位，这些量子位用于运行程序，同时执行错误校正。在这项新工作中，该团队开发了一种查找和纠正此类错误的新方法，并将其命名为 AlphaQubit
gwas和荟萃分析确定了临界covid-19 的49个遗传变异
gbA2抗糖基糖酶对降低糖脂脂的降低gbA3 a腹葡萄糖基酰胺酶，降低糖磷脂脂糖gpx1 ebselen谷胱甘肽过氧化物酶过氧化物酶诱导的氧化应激GPX2 EBSELENE粘液酶GPX2 EBSELENE氧化物GPX2 E氧气氧化剂GPX3 E氧化剂氧化剂氧化剂GPX3 induced oxidant stress GPX4 Ebselen Glutathione peroxidase induced oxidant stress GPX5 Ebselen Glutathione peroxidase induced oxidant stress GPX6 Ebselen Glutathione peroxidase induced oxidant stress GPX7 Ebselen Glutathione peroxidase induced oxidant stress HIF1A 2-deoxy-D-glucose glucose metabolism - hypoxia-inducible factor-1 𝛼 HRH2 Famotidine Histamine response in inflammation HTR1A Cyproheptadine Serotonin and histamine receptor binding HTR2A Cyproheptadine Serotonin and histamine receptor binding HTR3A Cyproheptadine Serotonin and histamine receptor binding HTR2C Cyproheptadine Serotonin and组胺受体结合
磷酸蛋白质组学分析将Tyro3鉴定为转移性胸腺瘤中舒尼替尼抗性的介体
简单摘要：最初对经验性放射化学化学疗法做出反应后，大多数胸腺癌和胸腺癌变为难治性，需要二线疗法。多靶性酪氨酸激酶抑制剂Sunitinib是少数几种选择之一，尤其是在胸腺癌患者中，并且导致部分缓解并延长总体生存率。但是，舒尼替尼的活性有限，并非所有患者都受益。更好地理解其作用方式和预测生物标志物的定义将有助于选择最适合的患者。使用一组定义的sunitinib敏感和耐药细胞系中的实时多重酪氨酸磷酸化测定法，该测定法中含有144种激酶底物，我们产生了sunitinib响应指数（SRI）。然后使用同一SRI分类器将来自胸腺瘤的蛋白质裂解液和夏替尼的胸腺癌与潜在的反应者与非反应者进行分类。生物信息学预测和对激活上游激酶的进一步实验分析鉴定为舒尼替尼抗性的有效介质，在转移性胸腺瘤中特别有效。tyro3既可以用作舒尼替尼耐药性的生物标志物，又可以作为潜在的治疗靶标，可以帮助定制治疗决策并克服晚期胸腺瘤和胸腺癌的治疗耐药性。
全基因组碱基编辑器筛选鉴定酵母中蛋白质丰度的调节剂
摘要 蛋白质是细胞中的关键分子，其丰度不仅在基因表达水平而且在转录后水平受到广泛调控。在这里，我们描述了一种酵母基因筛选方法，该方法能够系统地表征蛋白质丰度调控在基因组中的编码方式。该筛选方法结合了 CRISPR/Cas9 碱基编辑器来引入点突变，并对内源性蛋白质进行荧光标记以方便流式细胞仪读数。我们首先使用单个 gRNA 以及正向和负向选择筛选对酵母中的碱基编辑器性能进行了基准测试。然后，我们研究了 16,452 种基因扰动对代表各种细胞功能的 11 种蛋白质丰度的影响。我们发现了数百种调控关系，包括 GAPDH 同工酶 Tdh1/2/3 与 Ras/PKA 通路之间的新联系。许多已识别的调节因子特定于这 11 种蛋白质中的一种，但我们还发现了一些基因，这些基因在受到扰动时会影响大多数测试蛋白质的丰度。虽然更具体的调控因子通常作用于转录，但广泛的调控因子往往在蛋白质翻译中发挥作用。总的来说，我们的新筛选方法为蛋白质调控网络的组成部分、规模和连通性提供了前所未有的见解。
新诊断多发性骨髓瘤患者相似性网络可识别患者
多发性骨髓瘤显著的遗传异质性对患者的正确预后和临床管理提出了重大挑战。在这里，我们介绍了 MM-PSN，这是第一个多组学骨髓瘤患者相似性网络。MM-PSN 能够准确剖析疾病的遗传和分子图谱，并确定了 12 个不同的亚组，这些亚组由 655 名患者的基因组和转录组分析生成的五种数据类型定义。MM-PSN 确定了以前未描述的患者亚组，这些亚组由特定的改变模式定义，富含特定的基因脆弱性，并与潜在的治疗方案相关。我们的分析表明，与 t(4;14) 作为单一病变相比，t(4;14) 和 1q 增益同时出现可确定患者的复发风险明显更高且生存期更短。此外，我们的结果表明，1q 增益是最重要的单一病变，具有高复发风险，并且可以改进当前的国际分期系统 (ISS 和 R-ISS)。
通过玻璃体内注射靶向灵长类动物视网膜的定向演变
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2021年6月25日发布。 https://doi.org/10.1101/2021.06.24.449775 doi：biorxiv preprint
全面的SARS-COV-2基因组分析确定了药物重新利用的潜在目标
严重的急性呼吸综合症冠状病毒2（SARS-COV-2），这是一种新型的人类冠状病毒菌株（HCOV），最初于2019年12月在中国武汉市报道。这种急性感染会导致肺炎样症状和其他呼吸道疾病。其更高的传播和感染率已成功地使其在很小的时间内具有全球范围。涉及SARS-COV-2的主要问题之一是突变率，它增强了病毒的进化和基因组变异性，从而使治疗剂的设计变得困难。在这项研究中，我们从单倍型网络中确定了最常见的单倍类型。分析了保守的基因和种群水平的变异。非结构蛋白10（NSP10），核蛋白，类木瓜蛋白酶样蛋白酶（PLPRO或NSP3）和3-偶联蛋白酶（如蛋白酶）（3ClPro或NSP5），它们在最高阈值中保守，用作分子动力学模拟的药物靶标。div> darifena- cin，Nebivolol，Bictegravir，Alvimopan和Irbesartan是潜在的药物，建议进行进一步的临床前和临床试验。这项特定的研究提供了保守基因的预定靶向。我们还确定了整个病毒基因组的突变频率。