XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemIhc
生殖组织中蛋白质的空间表征
通过出现高通量抗体分析和测序方法，人类细胞的分子构建块已越来越多地映射到大型项目中。这些转变努力在解决许多人类细胞中蛋白质的表达水平和空间位置方面表现出了显着的进步。本论文旨在表征人类生殖组织，睾丸和输卵管（FT）的单细胞水平上的空间蛋白表达，并研究如何在非小细胞肺癌（NSCLC）中重新表达的睾丸蛋白如何影响免疫微环境。在纸I中，睾丸中有500多种RNA表达水平升高的蛋白在具有免疫组织化学（IHC）的八种不同的细胞类型中进行了分析。在精子发生的各个阶段，在细胞类型的水平上定位了几种特征性较差的蛋白质，即所谓的“缺失蛋白质”，从而提供了对其可能功能的新见解。在论文II中，通过组合单细胞转录组学和多重IHC来创建人类精子发生的时空图。高通量图像分析确定了近500种蛋白质的细胞状态特异性蛋白表达。通过检查RNA和蛋白质相关动力学，我们强调了人类睾丸的复杂时空景观。这些蛋白质是功能研究的靶标。在论文III中，IHC介绍了基于RNA水平升高的FT中升高的蛋白质编码基因，大多数蛋白质在功能上与纤毛运动有关，这是创建对受精至关重要的管状流动所必需的机制。，大多数是纤毛细胞独有的，其中包括以前在纤毛中未描述的几种蛋白质。在纸IV中，IHC在300多名免疫表型NSCLC患者中以IHC为特征。 ctas通常在睾丸和港口免疫原性中表达，由于NSCLC中异常表达而可能用作治疗靶标。 CTA与免疫谱有关，例如巨噬细胞和浆细胞浸润，可能表明原位免疫原性作用。 这些关联可以作为潜在的免疫疗法靶标进行研究和利用。 本论文在单细胞分辨率下定义了生殖组织的空间蛋白质组，并鉴定了许多蛋白质的蛋白质，并且具有先前未知功能的蛋白质。 在分子水平上绘制组织特异性细胞多样性的综合方法表明，将RNA和蛋白质检测方法结合在一起。 论文开发了新兴方法，例如多重染色和生物图像分析，这对大规模努力有希望。 这项工作显着有助于生殖组织的细胞图中，历史上没有得到充分研究。在纸IV中，IHC在300多名免疫表型NSCLC患者中以IHC为特征。ctas通常在睾丸和港口免疫原性中表达，由于NSCLC中异常表达而可能用作治疗靶标。CTA与免疫谱有关，例如巨噬细胞和浆细胞浸润，可能表明原位免疫原性作用。这些关联可以作为潜在的免疫疗法靶标进行研究和利用。本论文在单细胞分辨率下定义了生殖组织的空间蛋白质组，并鉴定了许多蛋白质的蛋白质，并且具有先前未知功能的蛋白质。在分子水平上绘制组织特异性细胞多样性的综合方法表明，将RNA和蛋白质检测方法结合在一起。论文开发了新兴方法，例如多重染色和生物图像分析，这对大规模努力有希望。这项工作显着有助于生殖组织的细胞图中，历史上没有得到充分研究。
三阴性乳腺癌的治疗进展
三阴性乳腺癌 (TNBC) 是指缺乏雌激素受体 (ER)、孕激素受体 (PR) 和人表皮生长因子受体 2 (HER2) 表达的乳腺癌。TNBC 比其他类型的乳腺癌更具侵袭性。尽管免疫疗法（与化疗联合）可用于表达程序性细胞死亡配体 1 (PD-L1) 的晚期 TNBC，但与其他乳腺癌亚型（即 ER 阳性、HER2 阳性亚型）相比，TNBC 尚无获批的靶向治疗方法。在本综述中，我们将“三阴性”定义为 ER 和 PR 表达 (IHC) ≤ 1% 且 HER2 (IHC) 为 0 至 1+ 或 IHC 为 2+ 且荧光原位杂交 (FISH) 为阴性（未扩增）的癌症，符合美国临床肿瘤学会/美国病理学家协会 (ASCO/CAP) 指南 [ 1 – 3 ]。虽然 TNBC 的诊断和治疗基本原则与一般乳腺癌相似，但许多方面（包括风险因素、分子和病理特征、自然史和化疗敏感性）都是 TNBC 所独有的，本文将对此进行总结。关于手术治疗、新辅助化疗、非转移性乳腺癌的辅助化疗以及转移性乳腺癌的治疗的更广泛讨论将单独讨论。流行病学——三阴性乳腺癌约占全球乳腺癌确诊病例的 15%，每年约有 20 万例 [4]。与激素受体阳性乳腺癌相比，三阴性乳腺癌更常见，
caris-publishes-large阶段示威 -
发表在JCO Precision肿瘤学上，该研究是由Caris与领先的癌症中心合作进行的，包括Caris Precision Ancology Alliance™（Caris POA）中的研究。结果表明，在广泛的癌症类型中，MMR（NGS-MSI）的NGS评估（NGS-MSI）评估（NGS-MSI）与MMR（IHC-MMR）的免疫组织化学分析之间的一致性很高。此外，调查结果表明，NGS提供了超出MMR状态的其他可行的生物标志物的有价值的信息。“准确的MMR评估对于确保患者获得最合适的治疗至关重要，但是对最佳方法进行了行业辩论，” Caris的MD，EVP和Caris首席医疗官和研究作者的George W. Sledge，Jr。和首席医疗官说。“ Caris通过利用其广泛的诊所基因组数据库和全面的分子分析专业知识来解决这个问题，以证明NGS不仅是IHC-MMR的强大替代方案，而且还提供了额外的优势，例如识别其他生物标志物对指导治疗选择至关重要的能力。” MMR有缺陷会导致DNA误差的积累，从而使基因组不稳定并推动癌症发展。IHC-MMR检测到有缺陷的MMR蛋白，而NGS-MSI测量MSI，这是DMMR的基因组结果。 通过直接比较NGS-MSI和IHC-MMR的一致性导致由单个实验室测试的肿瘤样品，Caris为迄今为止提供了最全面的证据，支持NGS-MSI与IHC-MMR的非效率，以识别DMMR驱动的肿瘤。 “ NGS可以检测IHC错过的DMMR情况，而IHC可以识别一些NG可能不会的情况。IHC-MMR检测到有缺陷的MMR蛋白，而NGS-MSI测量MSI，这是DMMR的基因组结果。通过直接比较NGS-MSI和IHC-MMR的一致性导致由单个实验室测试的肿瘤样品，Caris为迄今为止提供了最全面的证据，支持NGS-MSI与IHC-MMR的非效率，以识别DMMR驱动的肿瘤。“ NGS可以检测IHC错过的DMMR情况，而IHC可以识别一些NG可能不会的情况。在对191,767种实体瘤的分析中，NGS-MSI和IHC-MMR之间仅观察到0.31％的不一致，而不一致的肿瘤之间的总体存活率没有差异。“我们的研究强调了NGS对综合分子分析的重要性及其对IHC的非自卑而在鉴定MMR驱动的癌症方面的重要性。尽管两家技术都无法捕获所有DMMR案例，但我们的发现显示
eribulin是乳腺癌中的一种免疫增强剂，通过诱导点头样受体上调人类白细胞抗原I类表达
fi g u r e 1用eribulin治疗的乳腺癌病例。（a）用eribulin治疗的乳腺癌病例的总体存活。Kaplan-临时分析用嗜中性粒细胞与淋巴细胞比率（NLR）<3对埃里布林治疗的患者的总生存率分析<3对≥3。（b）人类白细胞抗原（HLA）I类分子的免疫组织化学（IHC）染色。使用抗HLA I类抗体的苏木精和曙红（HE）染色和IHC染色的代表性图像。放大倍数，×200。两例在eribulin治疗前后分析。案例1是59岁（Y.O.）女性，侵入性导管癌（IDC）病例。案例2是56岁的女性IDC案例。alc，绝对淋巴细胞计数； CI，置信区间；人力资源，危险比； PR，孕酮受体；恢复，实体瘤的反应评估标准； TTP，进展的时间。
对分选的食管腺癌细胞进行靶向测序揭示了分离亚群中的已知和新突变
结果 38 个 EAC 中有 35 个携带至少一种基质细胞中不存在的体细胞突变；73.7%、10.5% 和 10.5% 分别携带肿瘤蛋白 53、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂 2A 和 SMAD 家族成员 4 的突变。此外，在 38 例病例中的 2 例中发现了肝细胞核因子-1α 的 2 个新突变。肿瘤蛋白 53 基因异常比 p53 IHC 更具信息量。相反，SMAD4 的缺失在 IHC 中更常见（53%）并且与更高的复发率相关（P=0.015）。仅通过细胞分选，我们才能检测到 7 个 EAC 中存在超二倍体和伪二倍体亚克隆，它们表现出不同的突变负荷和/或额外的拷贝数扩增，表明这些癌症具有高度的遗传异质性。
免疫检查点抑制剂结肠炎（ICIS结肠炎）
•IHC是护理标准•在福尔马林固定的，石蜡包裹的（FFPE）肿瘤组织•活检和/或被切除的手术样品•内部控制和外部控制•PCR•如果DMMR/MSI-H，则如果dmmr/msi-h•遗传•遗传：lynch综合征：lynch综合症：lynch cyndrome•s-s draff in n ngs ng/ng ng/ng/ng ng/ng ng/ng/ng。
JAB-3312，一种有效的变构 SHP2 抑制剂，可增强 KRAS G12C 抑制剂 Glecirasib 的疗效 王鹏 1 ，康迪 1 ，孙鑫 1 ，魏杰
图 3 A. 用格列西拉西、JAB-3312 或二者联合处理 SW837 细胞 2 小时后，p-ERK 的蛋白质印迹分析。B. 格列西拉西与 JAB-3312 联合用于携带 KRAS G12C 突变的一组 CDX 和 PDX 模型的体内疗效。JAB-3312：SW837 和 MIA PaCa-2 中为 0.5 mg/kg；CR6243、CR6256 和 LU6405 中为 1 mg/kg。格列西拉西：MIA PaCa-2 中为 3 mg/kg；SW837 中为 10 mg/kg；CR6243、CR6256 和 LU6405 中为 100 mg/kg。联合用药中，JAB-3312 剂量为 0.5 mg/kg，格列西拉西与单药剂量相同。 C. 在 LU6405 异种移植中，绘制了肿瘤生长随治疗时间的变化。D. 在 LU6405 异种移植中，分别通过 IHC 和 qPCR 评估 41 天联合治疗后 FFPE 组织的 p-ERK 水平和 DUSP6 mRNA 表达。E. 显示了代表性 IHC 图像（放大 200 倍）。显示了平均肿瘤体积 ±SEM。
胚胎横纹肌肉瘤中的 ERBB2（HER2）扩增：罕见病例中的潜在治疗目标？
图 1 两例 ERBB2 扩增的横纹肌肉瘤 (RMS) 的形态学、免疫组织化学 (IHC) 和遗传特征。 (A) 病例 1 中 ERBB2 扩增子范围的全基因组视图 (顶部) 和详细视图 (底部)。 (B) Circos 图描绘了 17 号染色体 (病例 1) 中的结构变异。请注意 17q 染色体臂中两个扩增子之间的交换。17q 中的两个扩增子以红色注释。 (C) IHC 显示病例 1 (左) 和病例 2 (右) 中 HER2 (ERBB2) 蛋白的细胞质表达强烈。 (D) 17 例儿童 RMS 中 ERBB2 的 mRNA 表达水平；两例 ERBB2 扩增的病例的表达值比无扩增的 RMS 高 50 倍以上。y 轴显示 log2 转换中的表达值。 （E）对病例 1 的培养细胞的间期细胞核进行荧光原位杂交 (FISH)，表明扩增的序列被组织成双微体 (dmin)
鸟苷酸环化酶 2C (GUCY2C) 的表达和……
• 在 Caris Life Sciences（亚利桑那州凤凰城）使用下一代测序对 CRC（N = 15,285）、EJC（N = 3,276）和 GA（N = 2,420）肿瘤进行 DNA（592 个基因或全外显子组）和 RNA（全转录组）检测。• 通过 IHC 评估 PD-L1+ 表达（22C3：TPS ≥ 1% [CRC] 或 28-8：≥ 2+，≥ 80% [EJC，GA]）。• 使用 IHC 和 NGS 组合评估缺陷错配修复/微卫星不稳定性高（-MSI，稳定：-MSS）。• GUCY2C -高（H）和 -低（L）（每百万转录本，TPM）分别针对每个分子定义的亚型定义为上四分位数和下四分位数。• 通过 QuantiSEQ 估计细胞浸润。适当时应用 Mann-Whitney U 和 χ2/Fisher 精确检验（p < .05，根据多重比较进行调整）。• 从保险索赔中获得现实世界的总生存期 (OS) 和自开始 ICI 以来的生存期，并计算分子定义的患者的 Kaplan-Meier 估计值。