将大型 DNA 序列精确插入基因组的技术对于各种研究和治疗应用至关重要。大型丝氨酸重组酶 (LSR) 可以介导多千碱基 DNA 序列的直接、位点特异性基因组整合,而无需预先安装着陆垫,但目前的方法存在插入率低和脱靶活动率高的问题。在这里,我们提出了一个全面的工程路线图,用于联合优化 DNA 重组效率和特异性。我们结合定向进化、结构分析和计算模型来快速识别附加突变组合。我们通过供体 DNA 优化和 dCas9 融合进一步提高了性能,从而实现了同时招募目标和供体。顶级工程 LSR 变体在内源性人类基因座上实现了高达 53% 的整合效率和 97% 的全基因组特异性,并有效整合大型 DNA 货物(测试高达 12 kb),以在具有挑战性的细胞类型(包括非分裂细胞、人类胚胎干细胞和原代人类 T 细胞)中稳定表达。这种合理设计 DNA 重组酶的蓝图使得精确的基因组工程成为可能,而不会产生双链断裂。
加速材料插入 (AIM) 计划提供了将材料开发周期缩短高达 50% 的机会,从而减少了新材料和新工艺所需的前置时间。该计划的成立是为了彻底改变设计师和材料工程师的互动方式,实现计算材料科学应用和与设计工程工具集成的飞跃,并创建一个设计/材料团队可以学习和借鉴先前开发成果的环境。AIM 系统的核心是设计师知识库,它提供了一个框架,用于管理实验数据、执行描述处理、微观结构、属性和可生产性的链接模型,以及计算系统预测的置信区间。
EGFR 外显子 20 插入突变 (Ex20ins) 和 HER 2 突变是非小细胞肺癌 (NSCLC) 的致癌基因依赖亚型的特征,通常与从不吸烟或少量吸烟史、女性和腺癌组织学有关。尽管如此,Ex20ins 突变和 HER 2 突变晚期 NSCLC 仍然难以治疗,原因多种多样。首先,需要先进的诊断工具(例如下一代测序)来识别这些相对罕见的分子驱动因素。其次,需要高活性靶向药物,当用作一线疗法时,这些药物可能会显著改变患者的预后。事实上,尽管迄今为止已有少数靶向药物被证实对这些患者具有抗肿瘤活性,主要是选择性人类表皮受体酪氨酸激酶抑制剂,如波齐替尼和莫博赛替尼(用于两种分子改变)、单克隆抗体,如阿米凡他单抗(用于 Ex20ins),以及抗体-药物偶联物,如曲妥珠单抗德鲁替康(用于 HER2 突变体),但它们大多仅限于临床用于接受过治疗的患者。最后,Ex20ins 靶向药物或 HER2 靶向药物可能难以在全球不同国家或地区获得。
收到2022年9月14日; 2023年3月23日接受; 2023年4月17日出版作者分支:1广州林业与景观建筑研究所,广州510405,中国公关; 2广东工业理工学院的生态环境技术学院,纳海校区,佛山528225,中国公关; 3州生物控制和广东植物资源主要实验室的国家主要实验室,生命科学学院,孙子森大学,广州510275,公关中国。*通信:changchao Xu,Xuchangchao12345@aliyun。com关键字:磷酸盐溶解化; T-DNA插入;烯醇酶。缩写:AD,任意退化底漆; ATMT,农杆菌Tumefaciens介导的转化;棒,伴侣抗性基因;凸轮,醋酸纤维素膜;挖掘,二高氧素蛋白; DW,干重; EGFP,增强的绿色荧光蛋白; GCD,葡萄糖脱氢酶基因; GFP,绿色荧光蛋白; GUS,β-葡萄糖醛酸酶; HPH,Hygromycin B磷酸转移酶基因; HPLC,高性能液相色谱; IM,感应培养基; LB,Luria – Bertani培养基; MES,2-(N- morpholino)乙磺酸; NCM,硝酸纤维素膜; PDA,马铃薯葡萄糖琼脂; PDB,马铃薯葡萄汤; PEG,聚乙烯乙二醇; PQQ,吡咯喹啉喹酮合成基因; PSM,磷酸盐溶解微生物; PVK,Pikovskaya Medium;尾-PCR,热不对称交错PCR; T-DNA,转移DNA。已将核苷酸烯醇酶基因的核苷酸序列和相应的cDNA序列沉积在国家生物技术信息中心(NCBI)核苷酸数据库(https://wwwww.ncbi.nlm.nlm.nih.gov/nuccore/)无访问量表上的核苷酸数据库(https://wwwww.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/)。001325©2023作者†这些作者同样为这项工作做出了同样的贡献,三个补充数据和本文的在线版本提供了两个补充表。
Alu 是高拷贝数散在重复序列,在灵长类和人类进化过程中积累在基因附近。它们是现代人类结构变异的普遍来源。Alu 插入对基因表达的影响尚不明确,但有些影响与表达数量性状位点 (eQTL) 有关。在这里,我们直接测试多态性 Alu 插入与相同单倍型上的其他变体分离的调控作用。为了筛选具有此类影响的插入变体,我们使用了异位荧光素酶报告基因检测并评估了 110 种 Alu 插入变体,其中 40 多种可能在疾病风险中发挥作用。我们观察到了一系列效应,其中有显著的异常值会上调或下调荧光素酶活性。使用一系列报告基因构建体(包括 Alu 周围的基因组背景),我们可以区分 Alu 破坏另一个调节器的情况和 Alu 引入新调节序列的情况。接下来,我们重点研究了与乳腺癌相关的三个多态性 Alu 基因座,这些基因座在报告基因检测中表现出显著的影响。我们使用 CRISPR 修改内源序列,建立 Alu 基因型不同的细胞系。我们的研究结果表明,Alu 基因型可以改变与癌症风险有关的基因的表达,包括 PTHLH 、 RANBP9 和 MYC 。这些数据表明,常见的多态性 Alu 元素可以改变转录水平并可能导致疾病风险。
∗ 通讯作者 † 航空航天工程系助理教授,elena.fantino@ku.ac.ae。‡ 副研究教授,UPC 北校区,Gran Capitán s/n,rflores@cimne.upc.edu。§ 正教授,空间动力学组,Pza. Cardenal Cisneros 3,j.pelaez@upm.es。¶ 博士,空间动力学组,Pza. Cardenal Cisneros 3,v.raposo.pulido@upm.es。
仪器验证 两个简单的测试可为您的智能质量流量计提供完整的“现场验证”。第一个测试检查系统电子元件、线性化和微处理器功能,通过注入已知输入值并确认流量计输出预期值来执行。第二个测试验证仪器的主要传感元件是否未偏离其原始校准,通过测量速度和温度传感器的电阻并将结果与流量计提供的 NIST 可追溯校准数据进行比较来完成。综合起来,这些测试确认您的仪表正在工作校正,校准变量没有漂移、移动或改变值。
囊性纤维化 (CF) 是由分布在 CFTR 基因位点约 25 万个碱基对上的多种突变引起的,其中至少有 382 个是致病突变 (CFTR2.org)。尽管现在有多种编辑工具可用于校正单个突变,但可以强烈支持一种更通用的基因插入方法,原则上能够校正几乎所有的 CFTR 突变。如果这种方法能够有效校正气道上皮的相关干细胞,那么它就有可能为肺部提供终身校正。在本文中,我们重点介绍了将基因有效插入气道上皮干细胞的几个要求。此外,我们重点关注转基因构建体和内源性 CFTR 位点的特定特征,这些特征会影响插入的基因序列是否会在气道上皮中产生强大且生理相关的 CFTR 功能水平。最后,我们考虑如何将体外基因插入方法应用于直接体内编辑。
本文探讨了自由区在实现这些不同目标方面的效力。换句话说,它们能否成为发展政策的持久焦点?为了回答这个问题,本文的第一部分描述了自由区发展的最新趋势,这些趋势不仅以就业人数的快速增长为特征,而且以地理和行业的高度集中为特征。第二部分从理论角度和对一些案例的实证研究的角度分析了此类区域的就业创造和经济增长潜力。第三部分评估了建立自由区的法规与各种多边协议之间的兼容性,同时提出了一些关于此类区域未来发展的想法。
1 Clin Chem. 2006; 52:2180-2181。2 Blanco 等人 Int J Chron Obstruct Pulmon Dis. 2017。3 Eur Respir J. 2017;50.1700198。* 严重 AATD 定义为具有 Pi*ZZ 基因型的个体(Silverman 等人,NEJM,2009)