1 肿瘤干细胞研究实验室,生物化学和生物信息学系,科学研究所,GITAM 视为大学,维沙卡帕特南 530045,印度;pchittin@gitam.in (PC);sphoortichalumuri98@gmail.com (SSC) 2 CSIR-细胞和分子生物学中心 (CCMB),海得拉巴 500007,印度;avtarjeph@gmail.com 3 生命科学和农业系,武装部队大学-ESPE,圣多明各 230101,厄瓜多尔;janeira1@espe.edu.ec (JANM); snsanchez@espe.edu.ec (SNSL) 4 奎韦多州立技术大学工业与生产科学学院,km 11/2 via Santo Domingo,奎韦多 120301,厄瓜多尔 5 约吉夫马纳大学生物化学系,Kadapa 516005,印度;reddyprbiotech@yvu.edu.in 6 马来西亚吉兰丹大学农业科学系,农业基础工业学院,Jeli 17600,马来西亚 * 通讯地址:dpandran@gitam.edu (SLP);jgooty@espe.edu.ec (GJM);aurifullah@umk.edu.my (AM)
摘要在这项研究中,我们分析了双向S. cerevisiae jinesin-5 Motor,CIN8的颈链(NL)变体的细胞内功能和运动特性。我们还通过建模 - 在NL对接过程中检查了H键的配置。只要在n束束位置处的保守的骨干H键(提议稳定NL的对接构象)仍然完好无损,稳定的H键数量会导致部分功能变体。 消除这种保守的H键导致产生非功能性CIN8变体。 令人惊讶的是,通过通过加上端端的定向运动蛋白-5 EG5替换NL CIN8产生的N-LATCH位置的其他H键稳定,也产生了非功能性变体。 在CIN8中存在的N-LATCH ASPARAGINE用甘氨酸的单个替代>中,如CIN8中所存在,消除了额外的H键稳定化并挽救了功能缺陷。 我们得出的结论是,NL对接过程中的确切的N闩锁稳定对于双向驱动蛋白-5 CIN8的功能至关重要。稳定的H键数量会导致部分功能变体。消除这种保守的H键导致产生非功能性CIN8变体。令人惊讶的是,通过通过加上端端的定向运动蛋白-5 EG5替换NL CIN8产生的N-LATCH位置的其他H键稳定,也产生了非功能性变体。在CIN8中存在的N-LATCH ASPARAGINE用甘氨酸的单个替代>中,如CIN8中所存在,消除了额外的H键稳定化并挽救了功能缺陷。我们得出的结论是,NL对接过程中的确切的N闩锁稳定对于双向驱动蛋白-5 CIN8的功能至关重要。
。cc-by 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。这是该版本的版权所有,该版本于2024年4月25日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.02.21.529387 doi:biorxiv preprint
摘要:候选药物在体外合理设计的候选药物通常是由于低组织的可用性或由于不必要的侧面影响而导致体内效率低。要克服体外有理药物设计的局限性,需要在细胞环境中评估候选药物与目标的结合。在这里,我们应用了细胞内NMR来研究一组批准的药物与活体细胞中碳酸酐酶(CA)的同工型II的结合。某些化合物最初是针对其他靶标的开发的,后来被发现抑制CAS。我们观察到剂量和时间依赖性的结合显着不同,其中一些药物比其他药物表现出更复杂的行为。特别是,即使在外部培养基中存在游离化合物的情况下,一些化合物也显示出与细胞内Ca II逐渐解开的,因此可以防止稳定的蛋白质 - 配体配合物的定量形成。这种观察结果可以与这些化合物的已知靶靶性结合活性相关,这表明这种方法可以在多白素药物设计的早期阶段提供有关铅候选者的药代动力学专业培训的信息。■简介
通过多米尼科·蒙特萨诺(Domenico Montesano)49,80131 Naples,意大利B 891,BB生物学,化学和药物科学和技术系(RUISCEF) -Cnr, Ugo La Malfa 153, Palermo 90146, Italy D University of Granada, Department of Pharmacy and Pharmaceutical Technology, Faculty of Pharmacy, 18071 Granada, Spain and Andalusian Institute of Earth Sciences, Csic-Ugr, 18100 Armilla, Granada, Spain Fo Laboratory for Molecular Photonics, Department of Chemistry, University of Miami, 1301 Memorial Drive,Coral Gables 33146-0431,佛罗里达州佛罗里达州G,美国分子医学和医学生物技术部,通过塞尔吉奥·潘西尼(Sergio Pansini)5,80131 naples,意大利h意大利化学科学系,Viale Andrea Doria 6,95125 CATANIA,意大利,意大利,意大利,意大利,意大利,意大利,通过多米尼科·蒙特萨诺(Domenico Montesano)49,80131 Naples,意大利B 891,BB生物学,化学和药物科学和技术系(RUISCEF) -Cnr, Ugo La Malfa 153, Palermo 90146, Italy D University of Granada, Department of Pharmacy and Pharmaceutical Technology, Faculty of Pharmacy, 18071 Granada, Spain and Andalusian Institute of Earth Sciences, Csic-Ugr, 18100 Armilla, Granada, Spain Fo Laboratory for Molecular Photonics, Department of Chemistry, University of Miami, 1301 Memorial Drive,Coral Gables 33146-0431,佛罗里达州佛罗里达州G,美国分子医学和医学生物技术部,通过塞尔吉奥·潘西尼(Sergio Pansini)5,80131 naples,意大利h意大利化学科学系,Viale Andrea Doria 6,95125 CATANIA,意大利,意大利,意大利,意大利,意大利,意大利,通过多米尼科·蒙特萨诺(Domenico Montesano)49,80131 Naples,意大利B 891,BB生物学,化学和药物科学和技术系(RUISCEF) -Cnr, Ugo La Malfa 153, Palermo 90146, Italy D University of Granada, Department of Pharmacy and Pharmaceutical Technology, Faculty of Pharmacy, 18071 Granada, Spain and Andalusian Institute of Earth Sciences, Csic-Ugr, 18100 Armilla, Granada, Spain Fo Laboratory for Molecular Photonics, Department of Chemistry, University of Miami, 1301 Memorial Drive,Coral Gables 33146-0431,佛罗里达州佛罗里达州G,美国分子医学和医学生物技术部,通过塞尔吉奥·潘西尼(Sergio Pansini)5,80131 naples,意大利h意大利化学科学系,Viale Andrea Doria 6,95125 CATANIA,意大利,意大利,意大利,意大利,意大利,意大利,通过多米尼科·蒙特萨诺(Domenico Montesano)49,80131 Naples,意大利B 891,BB生物学,化学和药物科学和技术系(RUISCEF) -Cnr, Ugo La Malfa 153, Palermo 90146, Italy D University of Granada, Department of Pharmacy and Pharmaceutical Technology, Faculty of Pharmacy, 18071 Granada, Spain and Andalusian Institute of Earth Sciences, Csic-Ugr, 18100 Armilla, Granada, Spain Fo Laboratory for Molecular Photonics, Department of Chemistry, University of Miami, 1301 Memorial Drive,Coral Gables 33146-0431,佛罗里达州佛罗里达州G,美国分子医学和医学生物技术部,通过塞尔吉奥·潘西尼(Sergio Pansini)5,80131 naples,意大利h意大利化学科学系,Viale Andrea Doria 6,95125 CATANIA,意大利,意大利,意大利,意大利,意大利,意大利,通过多米尼科·蒙特萨诺(Domenico Montesano)49,80131 Naples,意大利B 891,BB生物学,化学和药物科学和技术系(RUISCEF) -Cnr, Ugo La Malfa 153, Palermo 90146, Italy D University of Granada, Department of Pharmacy and Pharmaceutical Technology, Faculty of Pharmacy, 18071 Granada, Spain and Andalusian Institute of Earth Sciences, Csic-Ugr, 18100 Armilla, Granada, Spain Fo Laboratory for Molecular Photonics, Department of Chemistry, University of Miami, 1301 Memorial Drive,Coral Gables 33146-0431,佛罗里达州佛罗里达州G,美国分子医学和医学生物技术部,通过塞尔吉奥·潘西尼(Sergio Pansini)5,80131 naples,意大利h意大利化学科学系,Viale Andrea Doria 6,95125 CATANIA,意大利,意大利,意大利,意大利,意大利,意大利,
101 肽合成。使用 2-氯三苯甲基氯树脂,按照 104 Fmoc/t Bu 合成策略,手工合成 103 hv6pep、pw14、sCH9 和 p17 肽配体的羧基荧光素衍生物。使用二异丙基碳二酰亚胺 (DIC) 和 HOBt · H 2 O 作为偶联剂 105 进行肽延伸,并通过用 107 哌啶/DMF(2:8,v/v)处理进行 Fmoc 消除。肽序列延伸 108 完成后,将每个肽基树脂分成两部分。一部分 109 用直接连接到肽配体序列 N- 110 末端的羧基荧光素 (CF) 衍生化。另一部分,将 Fmoc-6-氨基己酸间隔基引入肽序列的 N 端,随后在先前消除 Fmoc 保护基后用 CF 进行修饰。通过用三氟乙酸 (TFA/H 2 O/TIS,95:2.5:2.5) 进行酸解处理,将肽从树脂上切下。采用收敛策略,使用两个受保护的肽片段 (片段 F3A (1-15) 和片段 F3B (16-30)) 合成了羧基荧光素化的肽配体 F3。两个肽片段均在 Liberty Lite 微波炉上合成
我们的方法利用非病原性大肠杆菌在递送和呈递抗原时模仿细胞内病原体的布鲁氏菌融合体来刺激TH1和CTL反应。大肠杆菌通常是细胞外的,而布鲁氏菌是细胞内细菌。因此,我们启动了大肠杆菌(DH5α),以表达含有耶尔森氏菌的INV基因的质粒,单核细胞增生李斯特氏菌的基因和HLY基因[31]。通过结合αβ1-整合素异二聚体来引入宿主细胞的大肠杆菌侵袭。整合素的聚类后,Inva-sin激活了信号级联。一种信号通路会导致局灶性粘附组分的激活,包括SRC,局灶性粘附激酶和细胞乳蛋白蛋白,导致形成伪足,使细菌吞噬细菌进入宿主细胞。侵入蛋白与β1-整合蛋白的结合是必要的,并且足以诱导细菌的吞噬,即使是非专业的吞噬细胞。第二个途径,包括Rac1,NF-κB的激活和有丝分裂原激活的蛋白激酶,导致促炎细胞因子的产生[32]。互隔化后,将大肠杆菌带入发生细菌裂解的吞噬体/溶酶体。HLY基因产物以及其他细菌蛋白被释放到乳胶囊泡中。硫酸激活的Hly,也称为李斯特氏蛋白酶O(LLO)是一种在低pH值下的结合和孔形吞噬体膜的孔形成细胞溶胶蛋白酶。此批判步骤将抗原从大肠杆菌出口到细胞质细菌的细胞质含量可以通过LLO产生的孔中逃脱到乳腺细胞的胞质区室。
在诸如血脑屏障之类的生物屏障中传递大分子,限制了它们在体内的应用。先前的工作表明,弓形虫弓形虫是一种自然从人肠道传播到中枢神经系统(CNS)的寄生虫,可以将蛋白质传递给宿主细胞。在这里,我们设计了T. gondii的内源性分泌系统,晶状体和致密颗粒,通过转化为毒素和gra16,将多个大型(> 100 kDa)治疗蛋白传递到神经元中。我们证明了使用成像,下拉测定,SCRNA-SEQ和荧光记者的培养细胞,脑器官和体内的递送以及探针蛋白活性。我们证明了小鼠腹膜内给药后的强大分娩,并表征了整个大脑的3D分布。作为概念证明,我们证明了GRA16介导的MECP2蛋白的大脑递送,MECP2蛋白是RETT综合征的假定治疗靶标。通过表征系统的潜在和当前局限性,我们旨在指导更广泛应用所需的未来改进。
图1。(a)Berghia stephanieae和(b)Hermissenda opalescens中的线虫细胞中的特殊吞噬作用(即,在(a)berghia berghia opalescens中。(c)从Goodheart等人修改的广义CNIDOSAC示意图。2018 [14](根据CC by 4.0 Creative Commons许可)突出了Cnidosac的主要功能。(插图)线虫细胞(n)是由cnidosac(CS)内的cnidophages吞噬的。缩写:C,Cerata; CI,Cilia Tufts; CP,Cnidophage,DG,消化腺; E,Cnidosac的入口; EP,上皮; ex,从cnidosac退出;他,血细胞; m,肌肉; n,黑头囊。
多宿主病原体犀牛Equi是一种巨噬细胞的寄生虫,可防止吞噬体的成熟,从而创造了一个热情好客的环境,支持细胞内生长。有毒r。equi分别是宿主特异性的毒力质粒,PVAPA,PVAPB和PVAPN,它们编码了属于七个单属进化枝的17个VAP蛋白的家族。我们检查了所有17种VAP蛋白,以补充A R的细胞内生长的能力。equiδVAPA菌株,并显示仅VAPK1,VAPK2和VAPN支持该菌株的鼠巨噬细胞的生长。我们表明,只有进化枝-1蛋白vapa,vapk1,vapk2和vapn位于r上。Equi细胞表面。PVAPB质粒编码三个进化枝-1蛋白:VAPK1,VAPK2和VAPB。后者无法支持细胞内生长,并且不在细胞表面。我们先前表明,无序的N末端VAPA序列与VAPA的细胞表面定位有关。我们在这里表明,尽管17个VAP蛋白的无序N末端的长度和序列高度可变,但它在进化枝内是保守的,这与我们的观察到,即进化枝-1 VAP蛋白的N末端在细胞表面定位中起作用。