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SARS-CoV-2 在人类群体中的复制由突变体的分布来定义,这些突变体在受感染宿主中以不同的频率存在,并且可以通过超深度测序技术检测到。在本研究中,我们检查了来自疫苗突破患者的 5 个鼻咽分离株的刺突编码 (S 编码) 区域的扩增子的 SARS-CoV-2 突变谱。有趣的是,所有患者都感染了 Alpha 变体,但在常驻病毒的突变谱中存在与 Delta Plus、Iota 和 Omicron 变体相对应的氨基酸替换。对来自疫苗突破患者的 SARS-CoV-2 进行深度测序分析揭示了丰富的突变类型库,并且还可以识别出可以代表流行病学显性变体的耐受替换。