arrowia lipolytica 属于子囊菌门、酿酒菌亚门和双足菌科 (1)。除了工业用途 (2) 之外,Y. lipolytica 还广泛存在于食品、环境和动物中 (1)。由于其能够在 32°C 以上不稳定地生长,因此通常认为该菌种可安全用于工业用途 (1)。Yarrowia lipolytica 是一种机会性病原体,可引起侵袭性念珠菌病 (3)。在体外,该菌种被认为对氟康唑敏感 (4)。第一个 Y. lipolytica 基因组 (CLIB122) 于 2004 年发布 (5)。我们报告了对氟康唑有抗性的 Y. lipolytica 临床分离株的基因组草图,该分离株是从溃疡性结肠炎手术后的血培养中采集的。有趣的是,尽管之前曾接触过唑类药物,但使用梯度浓度试纸法(Etest;bioMérieux),该菌株的氟康唑 MIC 为 0.256 mg/mL。患者成功地用卡泊芬净治疗。该菌株在 35°C 的显色琼脂平板(CAN2;bioMérieux)上生长,并使用 Vitek 基质辅助激光解吸电离 - 飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 仪器(bioMérieux)进行鉴定。在溶菌酶细胞壁消化后,使用 QIAmp DNA minikit(Qiagen)提取基因组 DNA。使用 Illumina DNA 制备标记试剂盒(Illumina)构建文库。简而言之,使用珠状转座子技术和集成 DNA 技术 (IDT) 的 Illumina DNA/RNA 独特双重 (UD) 索引集将 30 ng 总 DNA 片段化并进行索引。使用 Qubit 高灵敏度试剂盒 (Thermo Fisher Scienti ) 对文库进行扩增、纯化和定量。最后,将 9 pM 汇集和变性文库放入 2 250-bp v2 试剂盒 (Illumina) 中,并使用 MiSeq 仪器 (Illumina) 进行测序。使用 CLC Genomics Workbench v22.0 (Qiagen) 中的 Trim Reads v2.5 和 De Novo Assembly v1.5 工具对原始读取进行修剪、组装成重叠群并进行搭建。使用覆盖率与长度图丢弃覆盖率为 , 10 且长度为 , 500 bp 的重叠群 (6)。使用 QUAST v5.0.2 对最终的 scaffold 集进行质量分析 (7)。总基因组大小为 20,255,408 bp,分布在 521 个 scaffold 上(覆盖率为 100 ),N 50 值为 105 kbp(最长 scaffold,397 kbp),GC 含量为 49.03%。AUGUSTUS v3.4.0 (8) 使用白色念珠菌训练数据集预测了 6,151 个蛋白质编码基因,使用 tRNAscan-SE 2.0 检测到了 484 个 tRNA 基因 (9)。使用 BUSCO v5.3.2 和 saccharomycetes_odb10 谱系数据集 (10) 估计基因组完整性为 95.3%。平均核苷酸同一性 (ANI) 计算
突触体传统上是从啮齿动物或死后人类脑组织中富集的,但啮齿动物模型缺乏人类特有的突触特征,而死后组织中突触体的功能受到死后间隔的限制,并且通常仅显示疾病终点。此外,由于道德问题和可用性问题,只有少数研究针对人类样本。然而,神经类器官 (NO) 已成为分离完整和活的人类神经末梢以研究人类特有的突触传递方面的可能新来源。此外,突触体的富集通常使用密度梯度离心进行,这需要大量的起始材料。在本研究中,我们开发了一种应用差速离心方案从人类 NO 中富集突触结构的方法。然后,我们使用基于质谱的定量蛋白质组学来记录突触和生长锥特异性蛋白的富集,并在 KCl 刺激下进行定量磷酸化蛋白质组学来证明衍生突触结构的活力和生理功能。
(1)应根据应用程序的特定设备隔离标准来应用蠕变和间隙要求。应注意保持板设计的爬路和间隙距离,以确保隔离器在印刷电路板上的安装垫不会降低此距离。印刷电路板上的蠕变和清除相等。技术,例如在印刷电路板上插入凹槽和/或肋骨来帮助增加这些规格。(2)此耦合器仅适用于最大工作等级内的基本电绝缘材料。应通过适当的保护电路确保对安全等级的遵守。(3)明显电荷是由部分放电(PD)引起的电气放电。(4)屏障每一侧的所有销钉都绑在一起创建了两个末端设备
摘要:细胞外囊泡的分泌,EVS,是原核生物和真核细胞的常见过程,用于细胞间交流,生存和发病机理。先前的研究表明,来自细菌纯培养物的上清液中的EV存在,包括革兰氏阳性和革兰氏阴性的聚糖降解肠道分子。但是,复杂微生物群落分泌的电动汽车的隔离和表征尚未清楚地报告。在最近的一篇论文中,我们表明,木材衍生的复杂β -mannan与常规饮食纤维具有结构性相似,可用于调节猪肠道肠道菌群的组成和活性。在本文中,我们研究了24小时在复合β -Mannan富集后,猪粪便菌群分泌的EV的产生,大小,组成和蛋白质组。使用透射电子显微镜和纳米颗粒跟踪分析,我们以165 nm的平均大小识别电动汽车。我们利用猪蛋白的基于质谱的元蛋白质蛋白基于猪蛋白的数据库,并从猪群中鉴定出355个元基因组组装的基因组(MAG),从而鉴定出303蛋白。对于从β -mannan生长的培养物中分离出来的EV,大多数蛋白质映射到两个MAGS MAG53和MAG272,分别属于梭菌和细菌。此外,具有第三次蛋白质的MAG为MAG 343,属于肠杆菌阶。在β -Mannan EV蛋白质组中检测到的最丰富的蛋白质参与了翻译,能量产生,氨基酸和碳水化合物转运以及代谢。总体而言,这项概念验证研究表明,从复杂的微生物群落中释放出的电动汽车的成功隔离。此外,电动汽车的蛋白质含量反映了特定微生物对可用碳水化合物源的响应。
kappaphycus alvarezii(doty)doty ex silva是一种广泛培养的针对角叉菜胶多糖的红色海藻,也是有价值的色素性脂素(PE)的潜在来源。因此,本研究的目的是从K. alvarezii中提取植料,评估其抗菌,抗氧化剂和抗癌活性,并确定其未来治疗应用的生物医学潜力。发现从K. Alvarezii提取的植物素化色素的蛋白质含量为69.84%,显示出极好的抗菌活性,抗杀菌性的oxytoca和Proteus mirabilis,最小抑制区为11 mm。使用总抗氧化剂,过氧化氢清除,减少功率,DPPH和ABTS测定法显示出显着的体外抗氧化活性。此外,颜料对人肺癌细胞系表现出有效的细胞毒性,IC 50值为131.7
抽象一种快速,简单和简单的方法,用于通过薄层色谱(TLC)和酶促测试的结合结合甲状腺素HIRSUTA(EATH)的乙酰乙酸乙酯提取物的α-葡萄糖苷酶抑制剂的分离和纯化。eath具有有效的α-葡萄糖苷酶抑制作用。在这项研究中,我们开发了一种简单的TLC-酶试验(TLC/EZ)组合,以分离出Eath的α-葡萄糖苷酶抑制剂。将eath分离在硅胶柱上,然后在TLC板上分离。TLC分离后,应用TLC/EZ组合方法。使用葡萄糖氧化酶过氧化物酶法(GOD -POD),直接在TLC板中直接检测α-葡萄糖苷酶抑制剂。 在有利于TLC/EZ方法的TLC中获得了活性化合物的良好检测。 然后使用高性能液相色谱质量光谱法(HPLC - MS)分析对活性化合物进行表征。 EATH中存在的主α-葡萄糖苷酶抑制剂具有分子离子[m + h] +在m/z = 543。 该提出的方法适用于Eath中存在的α-葡萄糖苷酶抑制剂的可靠分离和纯化。 它可以作为植物提取物中α-葡萄糖苷酶抑制剂分离和纯化的经典方法的有趣替代方法。α-葡萄糖苷酶抑制剂。在有利于TLC/EZ方法的TLC中获得了活性化合物的良好检测。然后使用高性能液相色谱质量光谱法(HPLC - MS)分析对活性化合物进行表征。EATH中存在的主α-葡萄糖苷酶抑制剂具有分子离子[m + h] +在m/z = 543。该提出的方法适用于Eath中存在的α-葡萄糖苷酶抑制剂的可靠分离和纯化。它可以作为植物提取物中α-葡萄糖苷酶抑制剂分离和纯化的经典方法的有趣替代方法。
图1。示意图(简化)CO 2(左)和COS(右)扩散途径成C 3叶片的表示,包括大气中这两种物种的摩尔级分(C A),细胞间空间(C I),Mesophyll细胞(C M),CO 2,CO 2,CO 2,CO 2,CO 2,氯Pllast(C C)。核糖-1,5-二甲氧醇羧化酶氧化酶(Rubisco,叶绿体内)和碳酸酐酶(CA,仅右图)催化CO 2和COS固定。
1天然产品化学和生物技术实验室,科学技术学院,LaRénounionof LaréUnion,15 AvenueRenéCassin,CS 92003大道,CS 92003,CEDEX 09,97744法国SAINT-DENIS,法国2号,法国2瑞士3日内瓦大学药学学院,CMU-RUE MICHEL-SERVET 1,CH-1211 Geneva,瑞士4 4自然物质化学研究所(ICSN),CNRS UPR 2301,UNIVER 2301,UNIGERITURITUAL 2301,UNIGERITUE PARIS PARIS-PARIS-SACACLAY,1,AV。 de la terrasse,Cedex,91198法国Gif-Sur-Yvette,5药物认知实验室,药学系,中心互联网互联网,li feherche Surche surche sur s sur s sur s s s s s s s s s sur s sur s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s sur leimédicament(cirm),李氏大学,夸蒂尔·H·皮塔尔(Quartier h),pitalier h pital pital hippocrate,hippocrate,hippocrate 15,bat,bat。 b36,校园du sart-tilman,B-4000 Liege,比利时 *通信:mireille.fouillaud@univ-reunion.fr1天然产品化学和生物技术实验室,科学技术学院,LaRénounionof LaréUnion,15 AvenueRenéCassin,CS 92003大道,CS 92003,CEDEX 09,97744法国SAINT-DENIS,法国2号,法国2瑞士3日内瓦大学药学学院,CMU-RUE MICHEL-SERVET 1,CH-1211 Geneva,瑞士4 4自然物质化学研究所(ICSN),CNRS UPR 2301,UNIVER 2301,UNIGERITURITUAL 2301,UNIGERITUE PARIS PARIS-PARIS-SACACLAY,1,AV。de la terrasse,Cedex,91198法国Gif-Sur-Yvette,5药物认知实验室,药学系,中心互联网互联网,li feherche Surche surche sur s sur s sur s s s s s s s s s sur s sur s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s sur leimédicament(cirm),李氏大学,夸蒂尔·H·皮塔尔(Quartier h),pitalier h pital pital hippocrate,hippocrate,hippocrate 15,bat,bat。b36,校园du sart-tilman,B-4000 Liege,比利时 *通信:mireille.fouillaud@univ-reunion.fr
叶际代表一个独特的生态位,其中微生物获得了降解木质纤维素 (1) 的能力,以便在贫营养条件下生存。从叶际回收的微生物中,存在属于类芽孢杆菌科和糖芽孢杆菌属的细菌 (2)。糖芽孢杆菌属菌株 WB 17 是从 2018 年 1 月从法国香槟-阿登地区采集的小麦麸皮叶际培养物中回收的。培养在 30°C 的 1 M3 培养基 (3) 上进行,培养基中添加了小麦麸皮,有氧培养。糖芽孢杆菌属 WB 17 是根据其 16S rRNA 基因序列进行鉴定的,与糖芽孢杆菌属有关。为了进一步表征糖芽孢杆菌属的代谢潜力。 WB 17 及其分离木质纤维素的能力,对其整个基因组进行了测序。Saccharibacillus sp. WB 17 在 Luria-Bertani 培养基中在 30°C 下生长 48 小时,并使用 PureLink 基因组 DNA 迷你试剂盒(赛默飞世尔科技)提取其基因组 DNA。使用 Nextera DNA 样品制备试剂盒(Illumina,美国加利福尼亚州圣地亚哥)按照制造商的用户指南进行全基因组散弹枪测序(2 150 bp),并在 NovaSeq 系统(MR DNA [Molecular Research],美国德克萨斯州 Shallowater)上进行测序。总共获得了 30,007,734 个读数。使用 FastQC (4) 对序列数据文件进行质量过滤,然后通过 SOAPdenovo(版本 2.04)(5)进行从头组装;所有软件均使用默认参数。共检测到47个contig,测序覆盖度为409倍。N 50 值为205,341 bp。组装基因组大小为5,391,836 bp。该菌株的基因组大小介于两个最接近的Saccharibacillus亲属之间(Saccharibacillus sacchari GR21 T 为6.08 Mbp,Saccharibacillus kuerlensis HR1 T 为4.69 Mbp)。Saccharibacillus sp. WB 17的GC含量为58.82%。该值在Saccharibacillus基因组已知值范围内。事实上,之前测序的基因组记录的 GC 含量值如下:58.4 mol% ( Saccharibacillus qingshengii H6 T ) (6)、57.8 mol% ( S. sacchari GR21 T ) (7)、50.5 mol% ( S. kuerlensis HR1 T ) (8) 和 55.5 mol% ( Saccharibacillus deserti WLJ055 T ) (9)。Saccharibacillus sp. WB 17 的基因组草图由 NCBI 原核生物基因组注释流程 (PGAP) ( https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok ) 注释;它包含 73 个 tRNA、4,826 个基因和 4,730 个编码序列 (CDS)。仅注释了 1,139 个 CDS,占基因组内容的 22%。根据碳水化合物活性酶数据库 (CAZy) 数据库 (10),基因组共编码 236 个碳水化合物活性酶,分为五类,即糖苷水解酶 (145 个 CDS)、糖基转移酶 (31 个 CDS)、多糖裂解酶 (3 个 CDS)、碳水化合物酯酶 (31 个 CDS) 和碳水化合物结合模块 (21 个 CDS);然而,
癌症免疫疗法的成功取决于诱导靶向MHC-I分子呈现肿瘤抗原(TA)的免疫保护反应。我们证明了剪接抑制剂Isoginkgetin及其在先锋翻译产品(PTPS)生产阶段的水溶性和无毒衍生物IP2 ACT。我们表明,IP2在体外增加了PTP衍生的抗原表现,并损害体内肿瘤的生长。IP2作用是持久的,并且取决于针对TA的CD8 + T细胞响应。我们观察到,在用IP2处理后,对MCA205纤维肉瘤表面的MHC-I分子显示的抗原库进行了修饰。特别是,IP2增强了肿瘤抑制剂nisadary的外显子衍生表位的表现。IP2的组合具有靶向Nischarin衍生的表位的肽疫苗在体内表现出协同的抗肿瘤作用。这些发现将剪接体确定为开发基于表位的免疫疗法的可药物目标。