描述 TCR 敲除 Jurkat 细胞系是通过 CRISPR/Cas9 基因组编辑生成的,以去除 TCRα 和 β 链的 TRAC(T 细胞受体 Alpha 常数)和 TRBC1(T 细胞受体 β 常数 1)结构域。背景 T 细胞受体 (TCR) 位于 T 细胞表面,负责识别与 MHC(主要组织相容性复合体)分子结合的抗原。TCR 的参与会启动下游 NFAT 信号传导,从而导致 T 细胞活化。TCR 由两种不同蛋白质链的异二聚体组成,其中 alpha(α)和 beta(β)链是主要链。CRISPR/Cas9 基因组编辑用于去除 α 和 β 链的 TRAC(T 细胞受体 Alpha 常数)和 TRBC1(T 细胞受体 β 常数 1)区域,导致 TCR 表达丧失。应用 在生成或表征 CAR-T 细胞时用作对照 提供的材料
注意:确保将Cas9蛋白添加为反应中的最后材料。在KO的情况下,无需添加HDRT。表中Cas9与SGRNA的比率为1:3,对于1.8kb dsDNA,HDR为1μg。强烈建议每种特定设计对CAS9的实验优化:SGRNA比和Cas9蛋白和HDRT的量。Genscript建议通过测试1:1至1:4之间的RNP比率开始优化。我们建议最初可以将DsDNA的量设置在0.5μg和3μg之间(对于0.5kb和4KB之间的HDRT;如果HDRT长度超过此范围,则可能需要适当调整试剂的量)。为第一个实验分别设置负面对照,阳性对照和转染控制是最好的做法。
凋亡(通常称为程序性细胞死亡)不断发生在人类中。随着癌细胞的酸度增加,诱发了凋亡。在健康细胞中,质子泵蛋白允许H +离子渗透到细胞膜,从而调节pH值。然而,质子泵抑制剂(PPI),例如奥美拉唑,防止质子运动,导致pH调节。在先前的研究中,奥美拉唑诱导了Jurkat T淋巴细胞的细胞死亡;但是,尚无证实细胞是通过细胞凋亡或通过坏死而死亡的,而细胞爆发。通过使用膜联蛋白-V染色,可以测量奥美拉唑,右氯唑唑和埃索美吡唑对凋亡诱导的影响。细胞死亡。右兰索拉唑和埃索美拉唑在18小时时均达到100%的凋亡,表明它们具有较早的凋亡激活点。为了测量细胞活力的程度,通过用小钙蛋白 - 乙酰氧基甲基(AM)染料染色细胞来测量胞质酯酶活性。Jurkat细胞暴露于Omeprazole,Dexlansoprazole和Esomeprazole六个小时,并监测30小时以测量生存能力。阿霉素是一种已知的化学治疗性,在测试凋亡诱导和生存力时也被用作阳性对照。使用荧光显微镜成像时,由于膜联蛋白V-FITC的结合而导致凋亡荧光的任何细胞以及由于PI的结合而导致的坏死细胞荧光。用钙软蛋白AM(如果细胞荧光,它们)被认为是可行的,而非荧光细胞被认为是坏死的。在30小时的标记下,右倾角唑的生存力最小(40.0±3.5%的细胞可行),其次是阿霉素(62.9±1.8%),埃索美普唑(66.2±1.6%)和欧洲普拉唑(69.29±2.01%)(69.29±2.01%),在比较(71%)中(71%)(71%)。右兰索拉唑的生存能力低,表明需要使用相同的PPI和暴露方法进行毒性研究,以确定最佳药物浓度。奥美拉唑和埃索美瑞唑的最佳浓度为1 µm,右兰索拉唑啉为0.5 µm。未来的研究包括使用膜联蛋白V-FITC和碘化丙啶(PI)染料在确定浓度下测试细胞死亡方法。
补充图 4:用 0.45 μM(JURKAT)和 0.72 μM(P12-ICHIKAWA)5Z7O 孵育 48 小时的 JURKAT 和 P12-ICHIWAKA 细胞的 DNA 含量分析。碘化丙啶 (PI) 染色的流式细胞术分析。
图 4. 72 小时 ENL 抑制剂处理后,(a) MOLM-13 (b) MV4-11 (c) Jurkat 和 (d) HEK293T 细胞的存活率。(e) 72 小时抑制剂 13 处理后,MOLM-13、MV4-11、Jurkat 和 HEK293T 细胞的细胞存活率比较。(f) MOLM-13 (g) MV4-11 和 (h) Jurkat 细胞在 10 µM ENL 抑制剂作用下的增殖。(i) 在指定温度下,用 10 μM (+) 或 DMSO (-) 中的 13 处理的 MOLM-13 (顶部) 和 MV4-11 (底部) 细胞中的 CETSA。β-肌动蛋白用作上样对照。用 13 或 DMSO 阴性对照处理的 (j) MOLM-13 和 (k) MV4-11 细胞中 HOXA9、MEIS1、MYB 和 MYC 基因表达的 qRT-PCR 分析。 *P < 0.05,**P < 0.01,***P < 0.001,****P < 0.0001。不显著 (ns) P > 0.05。
摘要:放线菌伴生细胞致死性膨胀毒素 (Cdt) 可诱导淋巴细胞发生细胞周期停滞和凋亡;毒性取决于活性 Cdt 亚基 CdtB。我们现在证明,p21 CIP1 / WAF1 对 Cdt 诱导的细胞凋亡至关重要。Cdt 可诱导淋巴细胞系 Jurkat 和 MyLa 以及原代人类淋巴细胞中 p21 CIP1 / WAF1 水平升高。这些增加取决于 CdtB 作为磷脂酰肌醇 (PI) 3,4,5-三磷酸 (PIP3) 磷酸酶发挥作用的能力。值得注意的是,Cdt 诱导的 p21 CIP1 / WAF1 水平升高伴随着磷酸化 p21 CIP1 / WAF1 水平的显著下降。通过双管齐下的方法来防止这些变化,评估了 Cdt 诱导的 p21 CIP1 / WAF1 增加的重要性;与新型 p21 CIP1 / WAF1 抑制剂 UC2288 预孵育,并使用成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) / cas9 基因编辑开发 p21 CIP1 / WAF1 缺陷细胞系 (Jurkat p21 − )。UC2288 阻断了毒素诱导的 p21 CIP1 / WAF1 增加,用这种抑制剂处理的 Jurkat WT 细胞对 Cdt 诱导的细胞凋亡的敏感性降低。同样,Jurkat p21 − 细胞未能发生毒素诱导的细胞凋亡。通过证明 Cdt 诱导的促凋亡蛋白 Bid、Bax 和 Bak 水平的增加依赖于 p21 CIP1 / WAF1,进一步证实了 Cdt、p21 CIP1 / WAF1 和细胞凋亡之间的联系,因为这些变化在 Jurkat p21 − 细胞中没有观察到。最后,我们确定 p21 CIP1 / WAF1 的增加依赖于毒素诱导的伴侣热休克蛋白 (HSP) 90 水平和活性的增加。我们提出 p21 CIP1 / WAF1 在介导 Cdt 诱导的毒性中起着关键的促凋亡作用。
最后,在悬浮液中生长的Jurkat细胞中,评估了吉赛克的敲除生理相关的内源基因。敲除靶向的CD81,该CD81编码在许多哺乳动物细胞中表达的细胞表面蛋白,并与丙型肝炎,HIV和流感发病机理有关。jurkat细胞用Cas9和CD81特异性SGRNA的表达质粒共转染,或用靶向CD81的Cas9 -Sgrna RNP复合物预加载的gesiles处理。通过抗体标记评估CD81的基因敲除效率,然后进行流式细胞仪分析(图4)。基于质粒的递送导致效率非常低。只有7%的细胞损失CD81表达。相反,吉塞拉(Gesicles)具有很高的效率,其中76%的Jurkat细胞缺乏可检测到的CD81水平。因此,吉质的表现优于基于质粒的技术,具有在难以转化细胞中有效靶向内源基因的能力。
图3。左上角:ADCC生物测定原则的插图。右上:在ADCC生物测定效应子Jurkat细胞系中FcγRIIIIA-F158过表达的流式细胞仪分析(F变体; BPS Bioscience#60540)。左下:在表达HER2 SKBR-3乳腺癌细胞的情况下,ADCC对抗HER2抗体药物曲妥珠单抗反应。右下:在SKBR-3和FcγRIIIIA-F158/NFAT荧光素酶报告基因jurkat细胞(EC50 = 28.1 ng/ml)的共同培养中,ADCC对增加剂量的曲妥珠单抗的反应。用biorender.com创建的插图。
它使用Jurkat T细胞(两者IC 50 = 0.05 µM)抑制记者测定中的NF-κB-和AP-1介导的转录,并且在Jurkat T细胞中抑制了IL-2和IL-8水平(两者IC 50 = 0.03 µm)。SP100030(每天20 mg/kg持续三天)可将嗜酸性粒细胞和T细胞浸润成支气管肺泡灌洗液(BALF),并降低卵巢蛋白 - 敏感性大鼠ASTHMA模型中分离的肺组织中AP-1和磷酸化的AP-1水平。2,它以每天每天1 mg/kg的剂量给药时,可防止骨骼肌,棕色脂肪组织,脾脏,肾脏和心脏肿块减少。3 SP100030(每天10 mg/kg)抑制博来霉素诱导的体重降低,湿干性肺重量比增加,并增加肺蛋白质蛋白质,脊髓过氧化物酶(MPO),弹性酶,胶原蛋白酶,胶原蛋白和IL-1β水平的肺纤维纤维纤维纤维纤维纤维化小鼠模型中的IL-1β水平。4
图 1.与其他修饰相比,具有 Alt-R HDR 修饰的供体寡核苷酸表现出更高的 HDR 效率。 图 1.与其他修饰相比,具有 Alt-R HDR 修饰的供体寡核苷酸表现出更高的 HDR 效率。 (A)供体寡核苷酸修改的示意图。 (B)每次修改的 HDR 效率。使用 4D-Nucleofector™ 系统(Lonza)将四个靶向基因位点的 RNP 复合物(2 µM)与 0.5 µM 单链 HDR 供体寡核苷酸通过电穿孔共转染到 Jurkat 和 HeLa 细胞中。使用的 RNP 复合物是 Alt-R Sp HiFi Cas9 Nuclease V3,以及 Alt-R CRISPR-Cas9 crRNA 和 tracrRNA。 使用了三种类型的供体寡核苷酸:未经任何修饰的寡核苷酸(未修饰的)、具有硫代磷酸酯键的寡核苷酸(PS 修饰的)和具有 Alt-R HDR 修饰的寡核苷酸(Alt-R HDR 修饰的)。 电穿孔后 48 小时 (HeLa) 或 72 小时 (Jurkat) 提取基因组 DNA。通过在 Illumina™ MiSeq™ 系统 (v2 化学、150 bp 双端读取) 上进行扩增子测序来测量 HDR 效率。