从每毫升的ANJ -DNA-LVV滴度中稳定为“感染性滴度”(TU/mL),“粒子滴度”(LVV粒子数/mL),通过在LVV sibletestrantandsdated(a)中通过RT-QPCR评估的“基因组滴度”(A)。ong-项和估计在变形后第17天进行,并量化了进入Jurkat基因组的LVV(b)。.anjl anj-DNA具有完全功能性,能够稳定地整合到宿主细胞的基因组中。
T 细胞激活连接蛋白 (LAT) 是 T 细胞抗原受体 (TCR) 信号通路中一个关键的跨膜衔接蛋白 [1-4]。它由一个非常短的胞外结构域、一个具有两个棕榈酰化半胱氨酸残基的跨膜结构域和一个含有多个信号磷酸酪氨酸基序的胞内尾部组成 [1、2、5、6]。LAT 的重要性首次在 LAT 缺陷的 Jurkat 细胞系 JCaM2 和 ANJ3 中得到证实。这些细胞系在 TCR 激活后,钙信号传导和 ERK 磷酸化受损 [2、7]。LAT 缺陷的小鼠在早期胸腺 T 细胞发育中表现出严重的阻碍,导致外周 T 细胞数量低 [4、8、9] 和远端 TCR 信号传导缺陷 [2、4、10]。 LAT 胞内部分有 9 个保守的酪氨酸残基 (Y132、Y171、Y191 和 Y226,本文按照人类 LAT 编号),其中 4 个被鉴定为 TCR 信号级联中几个下游分子的重要停泊位点,如 Grb2、Gad 和 PLCγ1[1-3、6、10-13]。这些酪氨酸残基通过 ZAP-70 激酶进行磷酸化,是触发下游信号通路的关键步骤[1、2、13]。磷酸化的 Y132 是 LAT 中唯一能募集 PLCγ1 的基序。因此,Y132 对 Jurkat 细胞和小鼠的 TCR 下游信号转导至关重要[2、9、11-14]。令人惊讶的是,由于四足动物中所有已知的 LAT 序列中 131 位都有甘氨酸残基,Y132 不是 ZAP-70 的最佳底物 [ 12 , 15 ]。有人提出,低效的
,我们基于通过介电油中的水滴进行了短路,开发了一种新的方法,用于传递可渗透细胞的分子。将细胞悬架液滴放在具有强烈直流电场的一对电极之间,液滴弹跳和液滴变形,这会导致瞬时短路,这取决于电场强度。我们已经证明了使用短路成功地转移了各种哺乳动物细胞。但是,分子机械主义仍有待阐明。在这项研究中,用Jurkat细胞进行流式细胞仪测定。用液滴弹跳或短路处理含有jurkat细胞的水滴和带有荧光蛋白的质粒。短路可导致24小时孵育后足够的细胞活力和荧光蛋白表达。在很重要的情况下,液滴弹跳并未导致成功转染基因转染。通过摄取可耐细胞荧光染料yo-pro-1和钙离子的涌入来研究瞬态膜孔的形成。结果,短路增加了Yo-Pro-1氟-1荧光强度和细胞内钙离子浓度,但液滴弹跳没有。我们还研究了内吞作用对转染的贡献。用内吞作用抑制剂对细胞的预处理以依赖性的方式降低了基因转染的效率。此外,使用pH敏感的染料偶联物表明在短路后内体中形成了酸性环境。内吞作用是细胞内递送外源性DNA的可能机制。
图 2. 使用 MolYsis Complete5 试剂盒(A、B)和 DNeasy PowerSoil Pro 试剂盒(C、D)提取之前在 LOD 处加标的细菌和真菌样品的 C t 值。AB:巴西 A. ;CA:白色念珠菌;BS:枯草芽孢杆菌;CS:芽孢杆菌;PA:铜绿假单胞菌;SA:金黄色葡萄球菌。物种名称缩写后的数字表示在样品制备之前加标的滴度(以 CFU 为单位)。标有“+D”的样品包含含有 10 6 个 Jurkat 细胞的基质,这些细胞保存在冷冻保存介质中。
摘要 尽管已鉴定出许多免疫突触 (IS) 蛋白种类,但仍有许多 IS 定位蛋白种类未知。了解靶细胞和淋巴细胞之间 IS 的蛋白质组对于推进免疫肿瘤学至关重要。然而,IS 的低丰度和缺乏明确的富集标记阻碍了有效的蛋白质组学分析。在本研究中,我们利用 MicroscoopTM,这是一种集成显微镜、机器学习和光化学标记的创新系统,可以精确且空间特异性地富集 IS 蛋白,从而促进 IS 的蛋白质组学发现。我们使用 Raji B 细胞作为抗原呈递细胞 (APC),并用 Jurkat T 细胞诱导 IS 形成。该系统首先采用 CD3(Jurkat T 细胞中常见的 IS 标记)的免疫荧光成像,并利用基于卷积神经网络的深度学习算法从 CMTPX 染色的 Raji B 细胞中识别 IS 形成。我们的自动化系统通过多轮成像、深度学习驱动的模式生成和光化学标记,成功实现了 IS 处蛋白质的空间靶向生物素标记。随后的链霉亲和素下拉和质谱分析使 IS 特异性蛋白质得以鉴定。值得注意的是,我们的空间蛋白质组学方法分离和鉴定了 IS 界面上的数百种不同物种,包括与 T 细胞受体 (TCR) 信号通路关键成分相关的蛋白质,例如 TCR/CD3 复合物、Src 和 Tec 家族酪氨酸激酶和关键 NF-kB 信号蛋白。此外,我们还发现了大量以前与 IS 不相关的蛋白质。我们的研究不仅阐明了 IS 界面上免疫调节的未知方面,而且对癌症研究具有重要意义,特别是在理解和操纵免疫反应以用于治疗目的方面。
图1。Alt-R A.S. CAS12A超蛋白在TTTV目标位点选择方面表现出卓越的性能。 DOTS代表了216个指南的等级编辑效率,该指南靶向TTTV(深色阴影)或TTTN(浅色阴影)PAM站点,并且在输送到HEK-293细胞(96个位点)和陪同下(96个位点)和陪同细胞(96个位点)和野生型CAS12A V3(绿色)V3(绿色)或Cas12a Ultra(蓝色)。 如Alt-R CRISPR-CAS12A用户指南中所指示的RNP 人类细胞使用4D-Nucleofector™System(LONZA)的RNP电穿孔。 使用NGS(Rhampseq Amplicon测序)进行电穿孔后48小时编辑效率。Alt-R A.S. CAS12A超蛋白在TTTV目标位点选择方面表现出卓越的性能。DOTS代表了216个指南的等级编辑效率,该指南靶向TTTV(深色阴影)或TTTN(浅色阴影)PAM站点,并且在输送到HEK-293细胞(96个位点)和陪同下(96个位点)和陪同细胞(96个位点)和野生型CAS12A V3(绿色)V3(绿色)或Cas12a Ultra(蓝色)。人类细胞使用4D-Nucleofector™System(LONZA)的RNP电穿孔。使用NGS(Rhampseq Amplicon测序)进行电穿孔后48小时编辑效率。编辑效率。
Number Cas9-expressing cell lines 1, ATCC: CCL-185 A549 , adherent 2, Coriell Institute GM12878 , suspension 3, ATCC: CCL-247 HCT116 , adherent 4, ATCC: CRL-1573 HEK293 , adherent 5, ATCC: CCL-2 HeLa , adherent 6, ATCC: HB-8065 Hep G2 , adherent 7, ATCC: TIB-152 Jurkat , suspension 8, ATCC: CCL-243 K562 , suspension 9, ATCC: HTB-22 MCF7 , adherent 10, ATCC: HTB-132 MDA-MB-468 , adherent 11, ATCC: CRL-5807 NCI-H358 , adherent 12, ATCC: CRL-5872 NCI-H1437,遵守13,ATCC:CRL-5887 NCI-H1693,ADHERENT 14,ATCC:CRL-2577 RKO,RKO,RKO,辅助15,ATCC:CRL-2137 SK-N-AS,sk-n-as,ASCCC:CCL-235 SW837,ATCC:ATCC:ATCC:TIB:TIB:TIB:TIB:TIB:TIB:TIB:TIB:TIB:TIB:TIB:TIB-202: U-2 OS,附着
A. CD19在培养中连续的tafasitamab处理下瞬时降低,但可在治疗后24小时在淋巴瘤细胞表面治疗后用竞争的单克隆抗体(MAB)检测到。tafasitamab洗涤后,CD19在细胞表面重新表达。su-dhl-4是CD19+ DLBCL细胞系,Jurkat T淋巴细胞用作CD19阴性对照。在培养物中,未治疗或用tafasitamab 50 mg/ml处理24小时的细胞。洗涤3次后,将细胞培养为2或5 h,并通过通过1 µg/ml抗CD19克隆HIB19的流式细胞仪分析CD19表达水平,与Tafasitamab竞争。CD19表达在24小时内逐渐增加到几乎未处理的水平(数据未显示)。2个独立实验的数据代表
图 3. Neon NxT 重悬基因组编辑缓冲液在不同细胞类型和靶标的 CRISPR-Cas9 基因组编辑实验中的表现。靶标位点包括 Jurkat 和 K562 细胞的 ACTN、活化原代 T 细胞的 TRAC、HSC 的 B2M 和原代 NK 细胞的 AAVS1。细胞在 10 µL 或 100 µL 反应中进行电穿孔。(A) GFP 供体 DNA 敲入效率报告为 GFP 阳性细胞的百分比。(B) GFP 供体 DNA 敲入后的细胞活力。(C) 敲除效率报告为与未处理对照相比特定靶标位点的减少百分比。对于原代 NK 细胞,通过基因组切割检测 (GCD) 测定确定的插入/缺失效率 (%) 可作为敲除效率的指标。(D) 敲除细胞的电穿孔后活力。
核定蛋白的蛋白质自组装偶氮修饰的蜘蛛丝蛋白用于制备具有固定在同一蛋白质涂层上的水凝胶样性能的纳米纤维网络中。在温和的水性环境中形成网络的厚度在2至60 nm之间,仅由蛋白质浓度控制。将蛋白质中的叠氮基团纳入纳米纤维上的短核酸序列,这些核酸序列可用于基于特定杂交的修饰,这是荧光标记的DNA互补证明的。使用脂质修饰符将DNA有效地掺入非辅助Jurkat细胞的膜中。基于核酸的互补性,可以使用可调细胞密度的纳米水凝胶上细胞上高度特异性的DNA辅助固定化。用竞争性寡核苷酸探针证明了DNA细胞到表面锚的可寻址性,从而迅速释放了75-95%的细胞。另外,我们开发了一个任意形状的微孔的基于光刻的图案,该图案在空间上定义了