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Rosalind富兰克林医学与科学大学AI ...
本项目提议实施软件平台，以识别Kaposi肉瘤相关的疱疹病毒（KSHV）的G-四链体（G4）结合蛋白（G4BPS） - 相关的癌症，目的是提高治疗效果。G4结构是参与重要基因组功能和癌症生物学的高度稳定的DNA或RNA结构。了解G4bps和G4之间的相互作用可以为疾病机制提供有价值的见解，并可以导致新的治疗方法。拟议的项目将利用信息检索和人工智能的技术来构建一个软件平台，以有效地有效地识别G4和G4BP匹配，以帮助研究和发现药物和治疗。该平台将收集包含G4，G4BP和G4-G4BP交互数据的现有数据集，并将索引它们以实现有效的检索。然后，它将从G4S，G4BPS和G4-G4BP相互作用中提取相关功能，并将使用机器学习来学习排名算法，该算法将返回最佳的G4和G4BP匹配，因为用户提供了G4S和G4BPS的列表，一种疾病和药物。我们将使用所提出的平台在KSHV相关的癌症中识别G4和G4BP匹配，重点关注AS1411及其潜在的G4和G4BP目标。
Keytruda®（帕博利珠单抗）
o 原发性纵隔大 B 细胞淋巴瘤 (PMBCL) o 胆道癌（胆囊癌或肝内/肝外胆管癌） o 尿路上皮癌（膀胱癌） o 三阴性乳腺癌 (TNBC) o 成人中枢神经系统 (CNS) 癌症 o 宫颈癌 o 食管癌和食管胃/胃食管连接处癌 o 胃癌 o 头颈部鳞状细胞癌 (SCCHN) o 肝细胞癌 (HCC) o 成人经典霍奇金淋巴瘤 (cHL) o 儿童经典霍奇金淋巴瘤 o 卡波西肉瘤 o 肾细胞癌 (RCC) o 皮肤黑色素瘤 o 默克尔细胞癌 (MCC) o 肾上腺肿瘤 o非小细胞肺癌 (NSCLC) o 卵巢癌、输卵管癌和原发性腹膜癌 o 原发性皮肤淋巴瘤 o 软组织肉瘤 o 皮肤鳞状细胞癌 (cSCC) o 胸腺癌 o 子宫内膜癌（子宫癌） o 微卫星不稳定性高 (MSI-H) 癌症 o 肿瘤突变负担高 (TMB-H) 癌症
细胞周期抑制剂激活缺氧诱导的DDX41 ...
引言肝细胞癌（HCC）是世界上第六个最常见的癌症，也是全球癌症死亡率的第三个常见原因（1）。细胞周期扰动通常与癌发生和恶性转化有关，并且是癌症的已知特征（2，3）。化学疗法是通过通过细胞毒性或靶向方式诱导程序性细胞死亡来治疗癌症超过50年的方法之一（4）。The classical cytotoxic therapies involve the use of paclitaxel (microtubule stabilizer) and palbociclib (cyclin-dependent kinase [CDK] 4 and 6 inhibitor), which have been approved by FDA for treating ovarian car- cinoma, breast carcinoma, non–small cell lung carcinoma, AIDS-related Kaposi's sarcoma (5) ,和乳房cer（6）。然而，它们对HCC的影响仍然尚不清楚，因为它们仍在II期临床试验中（紫杉醇对Palbociclib的NCT02423239和NCT04175912）（NCT01356628）。其他细胞周期抑制剂，例如Aurora激酶抑制剂（GSK1070916和AZD1152），现在正在进行临床试验，并被研究为潜在疗法（7）。然而，一些研究表明，HCC对紫杉醇建立了抵抗力（8，9），而II期临床研究表明，紫杉醇对HCC患者没有任何生存优势（10）。此外，终止了AZD1152的3项AZD1152的3个临床试验，因为AZD1152单一疗法的疗效不足以支持研究的连续性（NCT00497679，NCT00338182，and NCT00497731），这表明该细胞循环不可能是有益的。单一疗法
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Pablo Siliceo Anniina Färkkilä Medicine Meilahti 同源重组缺陷肿瘤的时空分析 Riku Somermäki Susanna Fagerholm Biol Env Sci Viikki 研究树突状细胞机械免疫反应以改善癌症免疫疗法。 Samara Souza Kalle Saksela Medicine Meilahti使用Sherpabody平台PeytonStaabpäalaojala ojala Meililahti重新设计了抗癌双旋转式免疫细胞，Meilahti在KSHV Genome Replication and Kaposiiki intron primia tamerron segiiki strone nigiiki nigiaki nightiike nutiake nutiake Ary相互作用影响抗癌药物的肠道吸收Vandhana sundar usha jette lengefeld hilife viikki关于维生素C，细胞大小和急性基质性白血病Srividhya Sundaresan sundaresan liisa liisa kauppi kaauppi Medicin Meilahti brimist in the the the ther the therry conry of the the the the therry conrimist of the the the the the therry conrimisist-血液学癌症中的AHTI计算细胞形态学Martina Timonen Mikko Niemi医学Meilahti药物相互作用和用于精确抗癌疗法的转运蛋白生物标志物Uladzislau Vadadokhau Mohieddin Jafari Jafari Jafari Medicia
基于数据挖掘与网络药理学的肺经风热型痤疮中药用药研究
摘要 ：肺经风热证痤疮是一种常见皮肤病，中药方剂较多，但其作用机制仍不明确。本文收集整理了近二十年治疗肺经风热证痤疮的文献及专利方剂，采用Excel 2019进行用药频次统计，使用IBM SPSS 25.0进行聚类分析，获取核心方剂。运用网络药理学收集药物与疾病相关靶点，构建作用网络，进行富集分析，共获取137首方剂、167种药物，核心方剂为桑白皮、枇杷叶、黄芩、甘草、栀子、生地、丹皮。治疗肺经风热型痤疮应从清热泻肺、凉血解毒入手，核心方药主要通过AKT1、IL6、TP53、TNF、VEGFA、EGF靶点及卡波西肉瘤相关的疱疹病毒感染、麻疹、弓形虫病、EB病毒感染、IL-17、MAPK等信号通路发挥作用，以期为进一步的临床研究提供参考。
INF1764/1 - NHSBT/BTS联合共识文档，用于管理固体器官移植（SOT）
目标本文档旨在作为对英国移植专业人员的实体器官移植（SOT）中人类疱疹病毒8（HHV-8）生物学生物学的简明更新。为已故捐助者引入HHV-8筛查计划已经在社区内有必要为专家意见告知的临床医生提供共识文件，同时承认没有足够的证据来制定准则。这是一项共识的陈述，旨在补充但不取代本地和地区专家临床建议。人类疱疹病毒8（HHV-8）HHV-8是一种大型的双链DNA病毒，在1994年在卡波西肉瘤中被发现为病因（1）。像其他疱疹病毒一样，HHV-8经历裂解和潜在阶段，建立了终身感染，即一旦建立了感染，它就会生命。在裂解阶段，宿主细胞的复制和裂解大大增加。激活病毒编码的“裂解开关”基因RTA导致HHV-8进入裂解阶段，其中表达了病毒编码的基因（至少85个基因和miRNA），并将宿主细胞机械重新定向到后代病毒体的制造和组装。裂解相促进了新细胞的感染和新宿主的向前感染。HHV-8被认为主要感染内皮细胞，单核细胞和B淋巴细胞。大多数非SOT传播被认为是通过唾液发生的，但是在SOT接受者中，与同种异体相关的传播被认为主要是由乘客单核细胞发生的（2）。移植后，HHV -8血清转化具有这解释了肝，肺和小肠移植受者的血清转化率明显更高。正如疱疹病毒感染中所预期的，实验和临床数据表明，T淋巴细胞的宿主免疫对于HHV-8的控制和调节很重要。尽管HHV-8对于引起某些恶性肿瘤是必要的，但也必须有其他共同因素，因为在非免疫抑制个体中很少有临床疾病。流行病学HHV-8血清阳性（抗体阳性）通常表明先前获得了病毒的感染和运输，通常是无症状的。在健康无症状个体的血浆或血清中病毒DNA的检测并不常见，因为HHV-8与细胞相关。血浆中HHV-8 DNA的检测与病毒复制状态有关，病毒载量与疾病表现水平之间存在相关性。然而，在没有可检测的病毒血症的情况下，可能会发生疾病（例如局部化的kaposi的肉瘤）。与其他疱疹病毒不同，HHV-8血清阳性在全球范围内差异很大。HHV-8的血清阳性接近撒哈拉以南非洲的50％，意大利南部的血清阳性接近约25％。非流行地区，例如美国（美国）和西欧报告，普通人群的血清阳性率为0至6％。在某些亚组中观察到较高的血清阳性，例如与男性发生性关系的男性（MSM）和静脉吸毒者（3）；这些是非流行地区传播的重要途径。在美国，估计有3-7％的献血者是血清阳性的，但检测到HHV -8 DNA的速率最低（未测试的684个供体）（4）。
UC Riverside 压力生物学_健康与疾病中的复杂性和多种多样性 Kaposi的肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）LANA可防止KSHV inpoyomes DNMT1，DNMT3A和DNMT3B DNA DNA甲基转移酶的域结构多样化的青少年的超凡思想预测了年轻人...
质膜富含受体和信号蛋白，这些受体和信号蛋白可从细胞外空间进行药理学干预。在这里，我们在多个癌症模型中使用人细胞表面蛋白质组和整合素家族文库进行了一系列CRISPR筛选。我们的结果确定了ITGAV（整合素αV）及其异二聚体伴侣ITGB5（整合素β5）是癌细胞扩张的必需蛋白α/β对。高密度CRISPR基因瓷砖进一步指出了整联蛋白αVβ5二聚体ITGAV的β-螺旋桨域内的积分袋。与硅化合物对接结合使用，我们开发了一个用于药物发现的CRISPR ting式实施计算机辅助（CRISPR-TICA）管道，并将CPD_AV2确定为靶向ITGAV的β-促销中央袋的主要抑制剂。CPD_AV2处理导致整联蛋白αVβ5和细胞凋亡的快速解偶联，提供了一类独特的治疗作用，从而消除了通过异二聚体分离消除整联蛋白信号传导。我们还预计，CRISPR-TICA方法将成为未来药物发现研究的一种可用方法。
KSHV（HHV8）疫苗：新型抗癌疫苗的前景和潜在缺陷
引言要跟进“癌症登月计划”的成功，就需要实用、新颖、有效的抗癌预防和治疗方法 1 。这一认识尚未得到广泛认可，但大约六分之一的人类癌症病例是由七种病毒引起的，每年造成超过一百万人死亡 2 。几十年前开发的针对人乳头瘤病毒 (HPV) 3 和乙型肝炎病毒 (HBV) 4 的预防性疫苗揭示了简单接种疫苗可有效减轻癌症负担。虽然这两种疫苗在全球公共卫生领域取得了巨大的成功，但令人惊讶的是，整个癌症研究界在将这些成果扩展到预防或治疗其他病毒性癌症方面却进展甚微。SARS-CoV-2 疫苗的快速成功开发迫使我们重新审视这个问题。 2021 年 10 月，美国国家癌症研究所艾滋病毒和艾滋病相关恶性肿瘤办公室组织了一场公开会议，有 100 多名专家和利益相关者参加，讨论疫苗控制卡波西肉瘤疱疹病毒 (KSHV)，又称人类疱疹病毒 8 (HHV8) 的可行性。这是首次探讨全球 KSHV 癌症负担并提出 KSHV 疫苗是否以及如何成为研究和公共卫生优先事项的问题的会议。目前，尚无完善的 KSHV 候选疫苗，KSHV 疫苗接种研究的资金也很少。这次会议讨论了有关 KSHV 癌症和疫苗的关键问题：KSHV 造成的癌症负担是什么？如果开发出有效的疫苗，谁应该接种疫苗？有效的疫苗是通过提供杀菌免疫来预防，还是通过控制感染后的病毒癌症来治疗？
口腔微生物组在肿瘤发育中的作用，...
摘要 - 即使经过数十年的研究，癌症仍然是全球严重的健康问题。微生物在癌症发作和传播中发挥作用的部分受到了仔细检查。本评论的主要目的是强调各种癌症与人口细菌之间的重要关系。许多口腔细菌（例如核细菌核细菌，牙龈棒状棒状牙龈和链球菌Sp。），某些病毒（例如人乳头瘤病毒，Kaposi肉瘤疱疹病毒（KSHV），人疱疹病毒1和Epstein-Barr病毒（EBV）），成员也已与肺，胰腺，胃，胃，食管和冠状动脉，胃，食管和癌症抗衡。此外，当前的研究描述了几种致癌途径，这些途径是报道的与癌症的微生物联系的基础。在口腔中，大约有700种不同类型的细菌。唾液和各种口腔栖息地影响口腔微生物组的种群。如果使用了口腔癌的某些危险因素，例如酒精，烟草和槟榔，则口服微生物组的组成可能会发生变化。在口腔癌中，共生和致病细菌发挥了重要作用。 细菌产物及其代谢副产品具有永久修改宿主上皮细胞的DNA的潜力，从而促进其生存和/或增殖。 fusobacterium核和卟啉念珠菌改变了宿主细胞的DNA，该DNA支持炎性细胞因子的产生，细胞的增殖以及凋亡，细胞浸润和迁移的抑制。在口腔癌中，共生和致病细菌发挥了重要作用。细菌产物及其代谢副产品具有永久修改宿主上皮细胞的DNA的潜力，从而促进其生存和/或增殖。fusobacterium核和卟啉念珠菌改变了宿主细胞的DNA，该DNA支持炎性细胞因子的产生，细胞的增殖以及凋亡，细胞浸润和迁移的抑制。在这篇综述中，我们讨论了微生物组如何作为口腔癌的预测性和早期诊断生物标志物及其参与该疾病。索引项 - 口服鳞状细胞癌（OSCC），头颈鳞状细胞癌（HNSCC），口咽鳞状细胞癌（OPSCC），牙龈卟啉单胞菌（P. gingivalis）。
免疫系统和免疫学简介
• 严重联合免疫缺陷 (SCID)：一种影响产生 T 细胞和 B 细胞（可识别和应对病原体）所需基因的遗传性疾病。患有严重联合免疫缺陷的人容易受到多种感染，因为他们的身体无法识别病原体。他们还可能再次感染疾病，而人们通常只感染一次，然后就会产生免疫力，因为他们的免疫系统不会对它们产生记忆。 • HIV：一种感染免疫细胞（CD4+ T 细胞、单核细胞、巨噬细胞）的病毒，它通过插入 DNA 建立终身感染，这被称为潜伏期。获得性免疫缺陷综合征 (AIDS) 是 HIV 不受控制的最终结果，特别是通过禁用或杀死 CD4+ T 细胞。这会导致类似于严重联合免疫缺陷综合征的疾病，更容易感染和患上与艾滋病相关的癌症，如卡波西肉瘤。抗逆转录病毒疗法（即阻断病毒的药物）的进展显著改善了治疗效果。在治疗费用低廉且可获得治疗的地方，艾滋病毒已成为一种慢性病，艾滋病也成为罕见病。• 多发性骨髓瘤：产生抗体的 B 细胞（又称浆细胞）的癌症。浆细胞群失控生长，开始排挤骨髓中的健康细胞。这会导致疲劳和无法抵抗感染，因为您的健康血细胞无法正常发育。这些浆细胞还会产生许多异常抗体，这些抗体不能抵抗疾病，而只会堵塞血液并导致肾脏问题。与大多数癌症一样，肿瘤细胞会释放化学信使并与其他免疫细胞相互作用以“关闭”免疫反应。这会导致免疫系统激活不足，身体无法自行杀死癌细胞。