糖尿病是全球死亡和残疾的十大主要原因之一,每年有150万死亡归因于疾病,这是失明,肾衰竭,心脏病发作,中风和下肢截肢的主要原因(WHO WHO,在线)。最常见的是2型糖尿病(T2DM),在过去的三十年中,其患病率在所有收入水平的国家中都显着上升,而90%的人通常在以后的生活中发病(Who who在线; Sun等,2022年)。与高收入国家(HIC)相比,在低收入和中等收入国家(LMIC)中,T2DM的流行率更快地升级了,估计占LMIC的全球T2DM人口的79.4%(IDF,2021年,2021年。In 2021, the estimated global annual cost of diabetes treatment was 966 billion USD (IDF, 2021), imposing a substantial health and economic burden on individuals, their families, and healthcare systems (Seuring, Archangelidi & Suhrcke, 2015).This rise is driven by a complex interplay of socio-economic, demographic, environmental and genetic factors, including urbanisation, an ageing population,降低体育锻炼水平并增加超重和肥胖症的患病率(IDF,在线)。
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begomovirus具有传染性,并且严重影响了商业上重要的食物和粮食作物。棉叶卷曲的木木病毒(Clcumuv)是巴基斯坦棉花病毒最主要的特征之一,是对棉花产量的主要限制。目前,植物基因组编辑领域正在通过CRISPR/CAS系统应用(例如基础编辑,主要编辑和基于CRISPR的基因驱动器)进行革命。CRISPR/CAS9系统已成功用于模型和作物植物中的概念概念研究,以针对生物和非生物植物应力。CRISPR/CAS12和CRISPR/CAS13最近已在植物科学中应用于基础和应用研究。在这项研究中,我们使用了一种新型的方法,基于CRRNA的CAS12A工具箱,同时在多个位点靶向Clcumuv基因组的不同ORF。这种方法成功地消除了烟熏本尼亚娜和烟草的症状。从Clcumuv基因组设计了三个单独的CRRNA,针对四个不同ORF(C1,V1和C2和C3重叠区)的特定位点。基于CAS12A的构建体Cas12a-MV是通过金门三向克隆设计的,用于精确编辑Clcumuv Genome。cas12a-MV构建体是通过使用引物UBI-Intron-F1和M13-R1的整个基因组测序来确认的。通过农业纤维化方法,在4周大的尼古蒂亚纳本田植物中进行了瞬态测定。sanger测序表明,CAS12A-MV构建体在病毒基因组的靶位点上产生了相当大的突变。此外,对Sanger测序结果的潮汐分析显示了CRRNA1(21.7%),CRRNA2(24.9%)和CRRNA3(55.6%)的编辑效率。此外,Cas12a-MV构建体通过叶盘方法稳定地转化为烟草Tabacum,以评估转基因植物对Clcumuv的潜力。进行转基因分析,对烟草的转基因植物的DNA进行了PCR,以扩大具有特定底漆的Cas12a基因。传染性克隆在感染性测定中的转基因和非转基因植物(对照)中被农民接种。与具有严重症状的对照植物相比,含有Cas12a-MV的转基因植物表现出少数症状,并且保持健康。与对照植物相比,含有CAS12A-MV的转基因植物显示出病毒积累的显着降低(0.05)(1.0)。结果表明,多重LBCAS12A系统的潜在用途在模型和作物植物中针对贝诺维病毒中发展病毒抗性。
B274731 Partners Group 欧洲直接贷款策略 2021(欧元)L.P.S.C.Sp., SICAV-RAIF 35D, Avenue John F. Kennedy, L-1855 Luxembourg Partners Group (Luxembourg) S.A. 30/01/2023 06/04/2023
(根据 2016 年 7 月 23 日有关保留另类投资基金的法律第 34(3) 条)RCS 保留的保留另类投资基金 (FIAR) 清单
CRISPR、Cas12a、CPF1、大麦、诱变、单子叶植物、基因组编辑摘要我们报告了首次成功、高效使用大麦中的 Lb Cas12a,并描述了两种新型 Cas12a 变体的开发和应用。总共我们使用二十种不同的指南比较了五种编码序列 (CDS) 变体,包括两种新型变体和两种指南架构,针对 5 种不同的靶基因。我们发现不同 CDS 版本 (0-87%) 和指南架构 (0-70%) 之间的编辑效率存在很大差异,并且表明我们的两个新型 CDS 版本在该物种的测试中大大优于其他版本。我们展示了产生的突变的遗传性。我们的研究结果强调了优化单个物种的 CRISPR 系统的重要性,并可能有助于在其他单子叶植物中使用 Lb Cas12a。正文 毛螺菌科细菌 Cas12a (Lb Cas12a) 可能是继化脓性链球菌 Cas9 (Sp Cas9) 之后植物基因组编辑中第二广泛使用的可编程核酸酶,并且具有一些潜在优势。首先,由于其对 TTTV PAM 的要求与 NGG 的 Sp Cas9 要求不同,它可用于 GC 沙漠,而 GC 沙漠通常存在于内含子、UTR 和启动子区域中。其次,Lb Cas12a 通常比 Sp Cas9 产生更大的缺失,这可能在缺失研究中有用。第三,虽然 Sp Cas9 在靶标的 PAM 近端切割产生平端,但 Lb Cas12a 在 PAM 远端区域切割产生粘端;这两个特征可能解释了使用 Lb Cas12a 实现的基因靶向发生率更高 (Wolter 和 Puchta,2019)。已知在植物中起作用的三种版本的 Lb Cas12a 针对一个大麦靶标进行了测试。首先,是水稻优化的编码序列 (CDS) (Os Cas12a) (Tang et al., 2017);其次是人类优化的 CDS (Hs Cas12a),在双子叶植物中具有功能 (Bernabé-Orts et al., 2019);第三是拟南芥优化的 CDS,包含 D156R“耐高温”突变 (tt At Cas12a) (Schindele and Puchta, 2020)。我们还创建了两个新版本,携带 D156R 突变的 Hs Cas12a (tt Hs Cas12a) 和携带 8 个内含子的 tt At Cas12 (tt At Cas12+int)。这些内含子之前曾显著提高过 Sp Cas9 的效率(Grutzner 2021),因此我们使用相同的在线工具(NetGene2 - 2.42 - Services - DTU Health Tech)在我们的 tt At Cas12+int 设计中为拟南芥选项获得了较高的剪接置信度。
CRISPR/LbCas12a系统(LbCpf1)被广泛应用于包括植物物种在内的基因组改造,但CRISPR/LbCas12a在不同植物物种和组织中的效率差异较大,编辑效率有待进一步提高。本研究通过优化crRNA表达策略和Pol II启动子,尝试提高CRISPR/LbCas12a在拟南芥中的编辑效率。值得注意的是,CRISPR/LbCas12a系统中tRNA-crRNA融合策略与RPS5A启动子的组合具有最高的编辑效率,而EC1f-in(crR)p驱动的CRISPR/LbCas12a的纯合突变体和双等位基因突变体比例最高。此外,所有纯合突变体和双等位基因突变体都可以稳定遗传到下一代,没有发生表型分离。本研究通过筛选出拟南芥中LbCas12a的最佳crRNA表达策略和启动子,提高了CRISPR/LbCas12a系统的编辑效率,为其他植物中CRISPR/LbCas12a方法的优化提供借鉴。
摘要:由柑橘黄单胞菌(Xcc)引起的柑橘溃疡病是全球大多数柑橘产区的重要经济病害。Xcc 分泌一种转录激活因子样效应物 (TALE) PthA4,与溃疡病易感基因 LOB1 启动子区的效应物结合元件 (EBE) 结合,激活其表达,从而引起溃疡症状。利用 Cas9/gRNA 编辑 EBE 区域已用于生成抗溃疡病的柑橘植株。然而,生成的大多数 EBE 编辑株系含有 1–2 bp 的插入/缺失,这更有可能通过 PthA4 适应来克服。TALE 的适应能力与与 EBE 的错配数量呈负相关。已知 LbCas12a/crRNA 产生的缺失比 Cas9 更长。在本研究中,我们使用了一种耐高温且更高效的 LbCas12a 变体 (ttLbCas12a),该变体含有单个替换 D156R,用于修改 LOB1 的 EBE 区域。我们首先构建了 GFP-p1380N-ttLbCas12a:LOBP,经证实,该变体在柚子 (Citrus maxima) 叶片中通过 Xcc 促进的农杆菌渗滤而发挥功能。随后,我们在柚子中稳定表达了 ttLbCas12a:LOBP。生成了八个转基因株系,其中七个株系显示 EBE 的 100% 突变,其中一个株系是纯合的。EBE 编辑株系具有高达 10 bp 的 ttLbCas12a 介导的缺失。重要的是,这七个株系具有抗溃疡病性,并且未检测到脱靶。综上所述,ttLbCas12a 可有效利用来生成具有短缺失的双等位基因/纯合柑橘突变系,从而为柑橘的功能研究和育种提供有用的工具。
摘要Nicotiana tabacum是一种非食品草药,有可能被用作生物基因生成药物,疫苗或有价值的小型代谢物。为了实现这些目标,可以改善预先设计的基因组修改的遗传工具是必不可少的。CRISPR/CAS核酸酶的发展允许诱导特定于特定的双链断裂,以增强同源重组介导的基因靶向(GT)。但是,对于包括烟草在内的许多农作物而言,GT的效率仍然是一个具有挑战性的障碍。最近,对几种植物物种的研究表明,通过用其他CRISPR/CAS基核酸酶代替SPCAS9,GT效率可能会大大增强。因此,我们测试了SACAS9以及温度不敏感的LBCAS12A(TTLBCAS12A)靶向烟草基因。同时,我们还优化了农杆菌介导的烟草转化和组织培养的方案。以这种方式,当使用TTLBCAS12A时,我们可以将GT效率提高到最高三分之一的接种子叶,而TTLBCAS12A的表现非常优于SACAS9。此外,我们可以证明GT反应的转化道长度可以长606 bp,在大多数情况下,它的长度超过250 bp。我们获得了多个可遗传的GT事件,主要是杂合的,但也是双重的GT事件,有些事件没有T-DNA集成。因此,我们不仅能够第一次获得基于CRISPR/CAS的可遗传性GT事件,而且第一次获得了TTLBCAS12A,而且我们的结果也可能是烟草中的基因编辑和GT的优越选择。