CRISPR-CAS9是一种用于基因组编辑和工程的既定方法,包括在对特定基因组裂解事件不完善的修复后,基因表达敲除诱导。Invitrogen™Lentipool V2人CRISPR文库已开发用于功能丧失研究,以确定基因在调节细胞过程中的作用以及对化合物,药物或任何可能影响这些过程的任何扰动者的细胞反应。Lentipool V2人类CRISPR库中包含的CRISPR-CAS9指南RNA(GRNA)是基于专有GRNA设计算法设计的,该算法选择指南以最大程度地敲除效率而不牺牲特异性。每个库包含每个基因的四个序列验证的不同的GRNA矢量构建体,包装为慢病毒颗粒。Lentipool V2人CRISPR库由定制或预定义集合的grnas组成,以特定基因家族为目标,以慢病毒合并格式进行功能基因组学筛选,请参见第29页。
为了更好地了解Truecut Hifi Cas9的高保真度,我们评估了HEK293基因组中的其他基因。使用TEG-Seq进行了更多全基因组筛查,以检测HEK1,HEK4,VEG1和VEG3基因中的靶标。数据表明,Truecut Hifi Cas9比WT-CAS9和供应商I高保真CAS9蛋白产生的脱离目标较少(图1)。将每个编辑位点的脱靶编辑百分比与靶向编辑的百分比进行了比较,以确定相应站点的脱靶/靶向概率比。每个编辑事件均与其概率比(图1A)绘制,并根据概率将OFF目标的总数分组(图1B)。结果表明,与WT-CAS9和供应商I高保真CAS9相比,Truecut Hifi Cas9产生的脱靶编辑明显少得多。truecut hifi cas9只有一个非目标编辑的概率> 10%。相比之下,WT-CAS9和供应商I高保真CAS9分别具有16和6折叠目标(图1B)。
批量描述01263642 0.5 KU TAQ DNA聚合酶(rec。)2655825 2 x 1.25 ml 10x TAQ缓冲液(NH4)2SO4 2667128 2 x 1.25 ml 10x TAQ缓冲液与KCl 2655522 2 x 1.25 ml 25mm 25mm 25mm mgcl2
