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世界一流的科学顾问委员会
Parkin是一种高度验证的E3泛素连接酶，具有神经病学具有治疗潜力，Nysnobio的我们致力于研究它。使用Parkin基因治疗的神经保护症已经通过使用既定模型系统的动物研究来验证。也有一系列数据来验证帕克蛋白蛋白防止细胞应激的能力的有效性。由于这些原因，我们能够快速将临床前验证转化为我们目前的辅助研究状态。
使用综合方法预测金门组装 (GGA)
一锅法组装来自多个组成部分的长 DNA 序列是快速生成现代合成生物学构建体的关键。一锅法组装由短悬垂结构（例如 Golden Gate）连接的多个片段的方法取决于准确和无偏的连接。迄今为止，连接点的设计很大程度上取决于经验法则和经验成功，而不是连接酶保真度和偏向性的详细数据。在本研究中，我们应用 Pacific Biosciences 单分子实时测序技术在一次实验中直接测量每个可能的 5′-四碱基悬垂结构配对的连接频率。该综合数据集已用于预测使用 IIS 型限制性酶 BsaI 的 Golden Gate 组装 (GGA) 的准确性。根据连接数据设计了十个片段组装，其中连接点预测会导致高或低保真度组装。实验结果不仅证实了总体准确性，还证实了观察到的特定错配连接错误及其相对频率。这些数据还用于设计 12 或 24 个片段的乳糖操纵子组装体，结果表明组装体具有高保真度和高效率。因此，连接酶保真度数据可以预测高精度突出端对集，设计灵活性比经验法则更高，即使在定义的编码区域内也可以在高精度连接点组装 20 多个片段，而无需修改天然 DNA 序列。
使用综合性
多个组件部分的长DNA序列的一锅组装是现代合成生物学构建的迅速产生的关键。的一锅组装方法的方法是由短悬垂链接的多个片段（例如金门）取决于准确和公正的连接。迄今为止的连接设计很大程度上取决于使用经验法则和经验成功的使用，而不是有关连接酶保真度和偏见的详细数据。在这项研究中，我们应用了太平洋生物科学单分子实时测序技术来直接测量单个实验中每个可能的5'基础悬垂配对的连接频率。使用IIS类型限制酶BSAI，已应用此综合数据集来预测金门组装（GGA）的准确性。基于连接数据设计的十个片段组件，其连接数据预计会导致高或低的保真度组件。实验结果不仅证实了总体准确性，还确认了观察到的特定不匹配连接误差及其相对频率。数据进一步用于设计LAC操纵子的12-或24-片段组件，这些组件被证明以高忠诚度和效率组装。因此，连接酶保真度数据允许预测高准确的悬垂对套件的设计比经验法则更大的灵活性，即使在定义的编码区域内，也可以在没有天然DNA序列修改的情况下，在高准确的连接点上安装> 20个片段。
使用综合性
多个组件部分的长DNA序列的一锅组装是现代合成生物学构建的迅速产生的关键。的一锅组装方法的方法是由短悬垂链接的多个片段（例如金门）取决于准确和公正的连接。迄今为止的连接设计很大程度上取决于使用经验法则和经验成功的使用，而不是有关连接酶保真度和偏见的详细数据。在这项研究中，我们应用了太平洋生物科学单分子实时测序技术来直接测量单个实验中每个可能的5'基础悬垂配对的连接频率。使用IIS类型限制酶BSAI，已应用此综合数据集来预测金门组装（GGA）的准确性。基于连接数据设计的十个片段组件，其连接数据预计会导致高或低的保真度组件。实验结果不仅证实了总体准确性，还确认了观察到的特定不匹配连接误差及其相对频率。数据进一步用于设计LAC操纵子的12-或24-片段组件，这些组件被证明以高忠诚度和效率组装。因此，连接酶保真度数据允许预测高准确的悬垂对套件的设计比经验法则更大的灵活性，即使在定义的编码区域内，也可以在没有天然DNA序列修改的情况下，在高准确的连接点上安装> 20个片段。
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价格 B0202S—T4 DNA 连接酶反应缓冲液 29.00 美元 27.84 美元 M0319L—耐热 5' App DNA/RNA 连接酶 336.00 美元 322.56 美元 E2610L—5' DNA 腺苷酸化试剂盒 50 次反应 563.00 美元 540.48 美元 M0486L—模板转换 RT 酶混合物 236.00 美元 226.56 美元 E5520S—NEBuilder HiFi DNA 组装克隆试剂盒 212.00 美元 203.52 美元 M0271L—快速加载 Taq 2X 预混液 277.00 美元 265.92 美元 R0176S--DpnI 77.00 美元 73.92 美元 N4040S—M13mp18 单链 DNA 50.00 美元$48.00 M2401S—ET SSB $190.00 $182.40 C3019H—10-beta 感受态大肠杆菌 (H. Eff) $269.00 $258.24 R0507S--ApaLI $77.00 $73.92 E2610S--5' DNA 腺苷酸化试剂盒 10 次反应 $140.00 $134.40 M0251S—T7 RNA 聚合酶 $75.00 $72.00 R0630S--AsiSI $80.00 $76.80 M0492L—Q5 高保真 2X 预混液 $868.00 $833.28 R3133M—SpeI-HF $331.00 $317.76 C3040H—NEB 稳定感受态大肠杆菌 381.00 美元 365.76 美元 M0530S—Phusion 高保真 DNA 聚合酶 131.00 美元 125.76 美元 E5360S—NEBExpress 无细胞大肠杆菌蛋白质合成系统 244.00 美元 234.24 美元 E2621S—NEBuilder HiFi DNA 组装主混合物 180.00 美元 172.80 美元 您可以随时通过 stockroom@utexas.edu 联系我们，查看任何特定商品的价格。
预测蛋白质靶向嵌合体的降解潜力
图 2：模型概述。所研究蛋白质的 PDB 文件用于生成其图形表示。然后，将 POI 和 E3 连接酶的这些图形表示传递到预先训练的 GearNet 进行特征提取，同时从 PROTAC 组件的 SMILES 中收集指纹。然后将各个特征连接起来，并将连接的向量传递到机器学习模型（XGBoost、随机森林或 MLP）以预测 PROTAC 的 DC 50 值。单个示例的多格式标签允许在回归和分类任务中训练所研究的模型。
新代理：Golcadomide（CC-99282）
在14/28天的时间表中接受0.6 mg治疗的三名患者，在7/14天计划的1例患者中，有0.6 mg的患者进行了基线后评估，并且截至数据截止日期，并且在功效摘要中未包括。celmod，Cereblon E3连接酶调节剂； CR，完全响应； DLBCL，弥漫性大B细胞淋巴瘤； FL，卵泡淋巴瘤； IMID，免疫调节药物； NHL，非霍奇金淋巴瘤； ORR，总体响应率； PR，部分反应； r/r，复发或耐火。
修复CRISPR引导的RNA断裂启用站点 -
。STHCSM的RNA裂解在每个切割位点生成2'，3'> P和5'-OH，我们假设RTCB的连接酶活性参与了图中确定的RNA修复。1（中间）。b）用抗RTCB或抗ACTB（加载对照）抗体的蛋白质印迹，用（+）或没有（ - ）RTCB耗竭的293T细胞的裂解物进行抗体。参见图中的未编写图像。S2。c）PARK7成绩单针对5
使用综合性
多个组件部分的长DNA序列的一锅组装是现代合成生物学构建的迅速产生的关键。的一锅组装方法的方法是由短悬垂链接的多个片段（例如金门）取决于准确和公正的连接。迄今为止的连接设计很大程度上取决于使用经验法则和经验成功的使用，而不是有关连接酶保真度和偏见的详细数据。在这项研究中，我们应用了太平洋生物科学单分子实时测序技术来直接测量单个实验中每个可能的5'基础悬垂配对的连接频率。使用IIS类型限制酶BSAI，已应用此综合数据集来预测金门组装（GGA）的准确性。基于连接数据设计的十个片段组件，其连接数据预计会导致高或低的保真度组件。实验结果不仅证实了总体准确性，还确认了观察到的特定不匹配连接误差及其相对频率。数据进一步用于设计LAC操纵子的12-或24-片段组件，这些组件被证明以高忠诚度和效率组装。因此，连接酶保真度数据允许预测高准确的悬垂对套件的设计比经验法则更大的灵活性，即使在定义的编码区域内，也可以在没有天然DNA序列修改的情况下，在高准确的连接点上安装> 20个片段。
