XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemLncRNA
长链非编码RNA Meg3介导干细胞分化过程中印迹基因的表达
摘要 印记的 Dlk1-Dio3 结构域包含发育基因 Dlk1 和 Rtl1 ，它们在不同细胞类型的母体染色体上处于沉默状态。在该亲本染色体上，该结构域的印记控制区激活多顺反子，从而产生 lncRNA Meg3 和许多 miRNA（ Mirg ）和 C / D-box snoRNA（ Rian ）。尽管 Meg3 lncRNA 位于核内并与母体染色体相关，但它是否控制顺式基因抑制尚不清楚。我们创建了携带异位 poly(A) 信号的小鼠胚胎干细胞 (mESC)，从而降低了多顺反子上的 RNA 水平，并产生了 Rian − / − mESC。在 ESC 分化后，我们发现 Meg3 lncRNA（而不是 Rian ）是母体染色体上 Dlk1 抑制所必需的。通过 CRISPR 介导的父系 Meg3 启动子去甲基化获得的双等位基因 Meg3 表达导致双等位基因 Dlk1 抑制，并导致 Rtl1 表达丧失。lncRNA 表达还与 Meg3 5′ 侧的 DNA 低甲基化和 CTCF 结合相关。使用 Capture Hi-C，我们发现这会产生拓扑关联域 (TAD) 组织，使 Meg3 靠近母系染色体上的 Dlk1。Meg3 对基因抑制和 TAD 结构的需要可能解释了人类 DLK1-DIO3 基因座处异常的 MEG3 表达如何与印记障碍相关。
PVT1 与多梳抑制复合物 2 相互作用，抑制多发性骨髓瘤中具有促凋亡和肿瘤抑制功能的基因组区域
多发性骨髓瘤是一种异质性血液病，起源于骨髓，以恶性浆细胞单克隆扩增为特征。尽管已有新的治疗方法，但多发性骨髓瘤在临床上仍然具有挑战性。预后不良患者的一个共同特征是表观遗传沉默子EZH2（PRC2的催化亚基）活性增强。值得注意的是，PRC2的募集缺乏序列特异性，迄今为止，确定哪些基因组位点是PRC2介导沉默的分子机制仍不清楚。EZH2上存在一个长链非编码RNA (lncRNA)结合口袋，这表明lncRNA可能介导PRC2募集到特定的基因组区域。本文，我们结合RNA免疫沉淀测序、RNA测序和染色质免疫沉淀测序分析了人类多发性骨髓瘤原代细胞和细胞系，以鉴定EZH2的潜在lncRNA伴侣。我们发现lncRNA浆细胞瘤变异易位1 (PVT1) 直接与EZH2相互作用，并且在预后不良的患者中过表达。此外，预测为PVT1靶标的基因表现出H3K27me3富集，并与促凋亡和抑癌功能相关。事实上，PVT1抑制独立地促进了PRC2靶基因ZBTB7C、RNF144A和CCDC136的表达。总而言之，我们的研究表明，PVT1是PRC2介导的多发性骨髓瘤中抑癌基因和促凋亡基因沉默的相互作用伙伴，使其成为一个极具吸引力的潜在治疗靶点。
长链非编码 RNA LUCAT1 是人类干扰素反应的负反馈调节剂
长链非编码 RNA 是包括免疫反应在内的生物过程的重要调节因子。lncRNA 的免疫调节功能主要在小鼠模型中得到揭示，而对 lncRNA 在人类免疫反应中的了解有限。在这里，我们鉴定出 lncRNA LUCAT1，它在受脂多糖和其他先天免疫刺激刺激的人类髓系细胞中上调。在髓系细胞中靶向删除 LUCAT1 会增加响应 LPS 的 I 型干扰素刺激基因的表达。相反，增加 LUCAT1 表达会导致可诱导的 ISG 反应降低。在活化细胞中，LUCAT1 在细胞核中富集，并与染色质结合。此外，LUCAT1 通过与细胞核中的 STAT1 相互作用来限制干扰素刺激基因的转录。总之，我们的研究强调了 lncRNA LUCAT1 作为诱导后反馈调节因子的作用，其功能是抑制人类细胞的免疫反应。
反义长期非编码RNA中的罕见遗传变异有助于强迫症
强迫症（OCD）是一种普遍的神经精神疾病，其遗传基础不完整，阻碍了靶向治疗方法。使用来自我们所有人队列的全基因组测序（2,276例OCD病例，13,517个对照），我们评估了反义长期非编码RNA（LNCRNA）中的稀有变体。OCD病例表现出这些变体的显着富集，尤其是在进化约束的反义转录本中（相对风险= 1.52，p = 0.005）。负担分析鉴定出与OCD：A2ML1-AS1（OR = 4.5，P = 0.001）和NFIB-AS1（OR = 3.6，P = 0.002）的两个LNCRNA。这些LNCRNA中的罕见变体位于影响相邻神经发育基因的调节区域，并与与OCD有关的脑区域中的基因表达相关。鉴于它们在基因调节，组织特异性表达和对细胞状态的反应性中的关键作用，反义LNCRNA代表了有希望的生物标志物和治疗靶标。我们的发现扩大了强迫症的遗传结构，并强调了基于RNA的精度疗法对个性化临床干预的潜力。
长的非编码RNA THBS1-AS1通过调节TGFBR1
引言心脏纤维化与心血管疾病的不良预后有关，是由急性或慢性刺激（例如心肌梗死和高血压）诱导的最重要的病理生理过程之一（1，2）。随着机械刺激，压力/体积超负荷，体液和其他病理因素，心脏成纤维细胞（CFS）增殖并转变为肌纤维细胞，导致细胞外基质（ECM）的分泌过多分泌，降低心脏合规性和心脏合规性和心脏稳定性和心脏重塑（最终）和最终的心脏失败（3）。当前，缺乏有效的CF激活和纤维化临床治疗方法。因此，发现心脏纤维化和阐明机制的关键分子对于心血管治疗具有很高的价值。新兴证据探索了长期的非编码RNA（LNCRNA）作为调节剂和各种心血管疾病的潜在治疗靶标（5-7）。lncRNA是一种非编码RNA类，长度超过200个核苷酸，可以通过蛋白质结合影响染色质结构和转录因子的功能（8）。lncRNA还通过其线性结构与microRNA（miRNA）或mRNA结合，影响mRNA翻译，剪接，降解和其他过程（9）。由于某些固有的困难，例如其保守主义，二级结构效应和细胞型特异性表达谱，只有少数具有与心脏纤维化相关的确定生物学功能的LNCRNA。但是，与心脏纤维化有关的关键LNCRNA仍有待确定。TGF-β信号通路通过调节细胞增殖分化和凋亡（10），在心脏纤维化中起着重要作用（10）。但是，TGF-β信号通路的广泛抑制剂，例如
基于WGCNA和LASSO回归的新型结肠腺癌中衰老相关LNCRNA的预后模型
。cc-by 4.0国际许可证是根据作者/资助者提供的，他已授予MedRxiv的许可证，以永久显示预印本。（未通过同行评审认证）
LNCRNA在大脑发育和发病机理中的作用 bárbaracarollo de almeida冬季crispr-cas9 e ... 使用EPCAM适体肿瘤抑制的乳腺癌免疫疗法 知识，态度和对登革热的实践 基于2- ... 的铜（ii）/diiminic复合物 病毒17-00035（1）.pdf
人类基因组被普遍转录，产生了大多数短而长的无编码RNA（LNCRNA），可以通过各种转录和转录后调节性机械性能影响细胞程序。大脑是长期非编码转录本的最富有的曲目，在中枢神经系统发育和体内稳态期间的每个阶段都起作用。功能相关的lncRNA的一个例子是在不同大脑区域中与时空组织的时空组织有关，这些物种在核水平以及特定神经元位点的其他转录本的运输，翻译和衰减中起着作用。在该领域的研究已经鉴定出了特定的LNCRNA对某些脑部疾病的贡献，包括阿尔茨海默氏病，帕克丁疾病，癌症和神经发育疾病，并赋予针对这些RNA的潜在治疗策略，以恢复正常现象的潜在治疗策略。在这里，我们总结了与大脑中LNCRNA相关的最新机械发现，重点是它们在神经发育或神经退行性疾病中的失调，它们用作中枢神经系统（CNS）疾病的生物标志物（CNS）疾病，体内和体内及其潜在的实用性及其对策略的潜在用途。
非编码RNA在结直肠癌中的作用
摘要：结直肠癌是全球最常见的癌症死亡原因之一。尽管近年来对结直肠癌发病分子机制的认识不断进步以及更有效的药物治疗的实施，但患者的总体生存率仍然不令人满意。高死亡率主要是因为大约一半的癌症患者发生癌症转移以及癌细胞耐药群的出现。对癌症分子生物学认识的不断提高突出了非编码RNA（ncRNA）在结直肠癌发展和进化中的作用。ncRNA通过多种机制调控基因表达，包括表观遗传修饰和长链非编码RNA（lncRNA）与微小RNA（miRNA）和蛋白质的相互作用，以及通过lncRNA作为miRNA前体或假基因的作用。 LncRNA 也可在血液中检测到，循环 ncRNA 已成为结直肠癌诊断和预后以及预测药物治疗反应的非侵入性癌症生物标志物的新来源。在本综述中，我们重点关注 lncRNA 在结直肠癌发展、进展和化学耐药性中的作用，以及作为可能的治疗靶点。
长期的非编码RNA Charme通过控制发育中心的细胞分化程序来监督心肌细胞的成熟
抽象的长期非编码RNA（LNCRNA）成为心脏物理学和疾病的关键调节因子，尽管揭示其作用方式的研究仍然仅限于很少的例子。我们最近确定了PCHARME，这是一种与染色质相关的LNCRNA，其在小鼠中的功能敲除导致心脏肌肉的肌生成和形态重塑。在这里，我们结合了基因表达（CAGE），单细胞（SC）RNA测序和整个原位杂交分析的帽盖 - 分析，以研究PCHARME心脏的表达。自心肌生成的早期步骤以来，我们发现lncRNA专门局限于心肌细胞，在那里它有助于形成含有MATR3的特定核冷凝物，以及心脏发育的重要RNA。与这些活性的功能性意义一致，小鼠的PCHARME消融导致心脏囊肿的成熟延迟，这最终导致心室心肌的形态改变。由于心肌的先天异常在人类上与临床相关，并且患者倾向于重大并发症，因此控制心脏形态的新基因的鉴定变得至关重要。我们的研究为促进心肌细胞成熟的新型LNCRNA介导的调节机制提供了独特的见解，并与Charme基因座有关未来的疗法应用。
无偏 lncRNA 缺失 CRISPR-Cas9 筛选显示 RP11-350G8.5 是多发性骨髓瘤的新治疗靶点
Katia Grillone（意大利Catanzaro的Magna Graecia）Serena Ascrizzi（意大利卡塔萨罗大学的Magna Graecia）Paolo Cremaschi（计算生物学研究中心，意大利人类技术研究中心）意大利的人类technopole罗伯塔·罗卡（Roberta Rocca）（意大利卡塔扎罗大学的麦格纳·格雷西亚（Magna Graecia））Caterina riillo（意大利卡塔萨罗大学的Magna Graecia）Francesco Conforti（意大利Cosenza，Cosenza，Annunziata Hospital） Ele caracciolo（意大利卡坦扎罗大学的Magna Graecia大学）Stefano Alcaro（意大利卡塔萨罗的Magna Graecia” Bruno Pagano（那不勒斯大学）费德里科二世大学，意大利） Antonio Randazzo（那不勒斯费德里科二世大学，意大利） Pierosandro Tagliaferri（大希腊大学，意大利） Francesco Iorio（人类科技城，意大利） Pierfrancesco Tassone（大希腊大学，意大利）