转录重编程是癌症进展和复发的因素,然而肿瘤转录重编程机制不甚明了,导致有效药物的研发十分困难,而基因表达特征有助于将遗传信息与药物治疗联系起来。到目前为止,基于基因表达特征的高通量药物发现方法有两种:L1000(测量 978 个“标志性”基因的 mRNA 转录本丰度)和基于高通量测序的高通量筛选(HTS 2),适用于针对转录重编程的抗癌药物发现。L1000 利用连接介导的扩增和与 Luminex 珠子的杂交,通过检测珠子颜色和藻红蛋白信号的荧光强度来突出显示基因表达变化。HTS 2 利用 RNA 介导的寡核苷酸退火、选择和连接以及高通量测序,通过直接测量基因序列来量化基因表达变化。本文综述了L1000和HTS 2 的技术原理和应用,并讨论了它们在抗癌药物研发中的优势和局限性。
*PPI 人群包括在预定的天数内接种所有 3 种疫苗的个体,未在很大程度上偏离研究方案,在第 6 个月和第 7 个月就诊间隔内符合预定标准,在第 1 剂之前对相关 HPV 类型(6、11、16 和 18 型)血清呈阴性,并且在 16 至 26 岁女性中,在第 1 剂之前至第 3 剂后一个月(第 7 个月)对相关 HPV 类型的 PCR 呈阴性。 § mMU=毫默克单位。 ¶ p 值 < 0.001。 # 证明非劣效性需要 GMT 比率的 95% CI 的下限高于 0.67。 CI=置信区间。 GMT=几何平均滴度。 cLIA=基于 Luminex 的竞争性免疫测定。 N=随机分配到相应疫苗接种组并接受至少一针注射的人数。 n=参与分析的人数。
高血压是与遗传和环境风险因素相关的最常见和最复杂的疾病之一。血管紧张素转换酶(ACE)在肾素 - 血管紧张素系统途径中很重要。ACE的基因表达已被研究为可能的高血压标记。这项研究调查了约旦人口中ACE1中的多态性与ACE2基因的多态性与高血压敏感性之间的关联。该研究总共包括200名高血压患者和180个健康控制。进行了聚合酶链反应(PCR),以基因型的基因型ACE1GENE的候选多态性(RS4646994)。使用ACE1和ACE2基因的Luminex DNA阵列技术用于基因分型SNP(RS4359,RS4344,RS4341,RS4343和RS2106809)。我们的发现表明,SNP与高血压之间没有有关理和基因型频率的关联。然而,rs4359与饮食(PP = 0.049),知识HTN(P = 0.042)和DM年数(P = 0.003)显着相关。rs4341与饮食(p = 0.032),周围血管疾病(p = 0.005)和慢性肾脏病有关(p = 0.049)。虽然rs4343与饮食(p = 0.031),糖尿病(p = 0.032)和其他药物(p = 0.025)相关。此外,ACE1基因的四个SNP的单倍型与HTN患者和健康对照没有显着关联。我们的发现表明,ACE基因中的多态性与约旦成年人口的过度张力发展的风险之间没有关联。
Sos S. Agaian,德克萨斯大学圣安东尼奥分校 F. Jack Agee,莱斯大学 Bjørn F. Andresen,Elbit Systems Electro-Optics EIOp Ltd.(以色列) Roger Appleby,QinetiQ Ltd.(英国) Misty Blowers,空军研究实验室 Howard E. Brandt,陆军研究实验室 J. Thomas Broach,美国陆军 RDECOM CERDEC NVESD Randall W. Brown,空军研究实验室 Edward M. Carapezza,康涅狄格大学和 DARPA John C. Carrano,Luminex 公司 David P. Casasent,卡内基梅隆大学 Tien-Hsin Chao,喷气推进实验室 Zhongyang Cheng,奥本大学 Hong-Liang Cui,史蒂文斯理工学院 Belur V. Dasarathy,顾问 Peter J. Delfyett,康涅狄格大学光学与光子学学院佛罗里达州中部 Michael James DeWeert、BAE Systems Sohail A. Dianat、罗切斯特理工学院 Eric J. Donkor、大学康涅狄格州马克·A·杜宾斯基 (Mark A. Dubinskii) 陆军研究实验室。埃姆雷·埃尔廷 (Emre Ertin),俄亥俄州立大学Augustus W. Fountain III,美国 RDECOM ECBC Gabor F. Fulop,Maxtech International Inc. Douglas W. Gage,XPM Technologies Frederick D. Garber,莱特州立大学Patrick J. Gardner,通用动力武器和技术产品 Thomas George,ViaLogy Corp. Grant R. Gerhart,美国陆军 TARDEC/RDECOM G. Charmaine Gilbreath,海军研究实验室。 Jeff J. Güell,波音公司
摘要:目的 美泊利单抗是一种人源化抗白细胞介素-5单克隆抗体,可有效治疗嗜酸性重症哮喘。然而,需要更多的生物标志物来预测患者在开始治疗前对美泊利单抗的反应。本研究旨在鉴定一种能够准确预测患者对美泊利单抗反应性的血清新生物标志物。方法 本研究招募了11名患者,所有患者均被诊断为重症嗜酸性哮喘,然后每4周接受一次美泊利单抗治疗至少4个月。在治疗前以及治疗4、8和16周后采集血液样本并进行肺功能测试和问卷调查。然后根据美泊利单抗治疗16周后哮喘生活质量问卷(AQLQ)评分与治疗前相比的差异来评估对美泊利单抗的反应。 AQLQ 评分增加超过 0.5 的患者定义为应答者。用 LUMINEX 200 和 ELISA 测量血液中的细胞因子水平。结果有 6 名应答者和 5 名无应答者。应答者的基线血清 CCL4/MIP-1 β 水平明显低于无应答者。使用基线血清 CCL4/MIP-1 β 水平区分应答者和无应答者的 ROC 曲线显示良好的 AUC 为 0.9。与基线相比,无应答者的 CCL4/MIP-1 β 水平在 4 周后显著增加。结论较低的基线血清 CCL4/MIP-1 β 水平可能有助于预测重度嗜酸性哮喘对美泊利单抗的良好反应。
试剂部分 # 5X 洗涤缓冲液 10 1X 洗涤缓冲液 11 HPV 包被缓冲液 12 DPBS 和 0.2% TWEEN® 20 (DPBS_0.2T) 13 2N H 2 SO 4 14 0.36NH 2 SO 4 15 柠檬黄溶液 16 293TT 解冻培养基 (293TT TM) 17 293TT 维持培养基 (293TT MM) 18 293TT 冷冻培养基 (293TT FM) 19 70% 乙醇 20 293TT VLP/PsV 转染培养基 (DMEM-TF/DMEM-10A) 21 293TT VLP 转染混合培养基 (DMEM 2%) 用于 Transporter 5 22 293TT VLP 转染混合培养基 (DMEM SF) 用于 PEI 23 DPBS-MGCl 2 10mM A/A (DPBS_MgCl_AA) 24 10% Brij58 25 DPBS/0.8M 盐缓冲液 (DPBS_0.8M) 26 46% OptiPrep 27 27% OptiPrep 28 33% OptiPrep 29 39% OptiPrep 30 293TT 假病毒中和试验培养基 (PBNA_M) 31 1M 硫酸铵 32 HPV VLP 转染裂解缓冲液 33 HPV 假病毒 (PsV) 转染裂解缓冲液 34 DPBS+1%BSA (稀释剂) 35 10% TWEEN® 20 (10_T20) 36 PBS+0.05% TWEEN® 20 (PBS_0.05T) 37 PEI 含5% 葡萄糖 (PEI) 38 DPBS/0.5M 盐缓冲液 (DPBS_0.5M) 39 50 MG Sulfo-NHS 40 DPBS+1% Triton X-100 (DPBS_1%TX) 41 50mM MES 42 组氨酸储存缓冲液 43 鞘液 44 PBST-BSA 缓冲液 (PBST_BSA_PAK) 使用干粉包 45 PBST-BSA 缓冲液 (PBST_BSA) 46 PBS+0.05% TWEEN® 20 (Luminex_Wash) 47 板涂层 48 封闭缓冲液 49 Luminex 珠储存缓冲液 50
图 2:BT7455 同时与 CD137 和 EphA2 蛋白结合(表面等离子体共振;SPR 显示),并特异性地与 CD137 阳性 T 细胞结合,导致体外产生强大的 EphA2 依赖性活性。(AB)生物素化的 hCD137 或 hEphA2 固定在 SPR 芯片上,每个循环都设置为用固定蛋白捕获 BT7455,然后注射第二种蛋白(2-3 倍稀释系列),然后再生表面。传感图显示固定的 hCD137-BT7455 复合物 (A) 捕获 hEphA2 或固定的 hEphA2-BT7455 复合物 (B) 捕获 hCD137。 (C、D) 用抗 CD3 刺激人类 PBMC,并用 AF488 标记的 BT7455 处理,流式细胞术监测发现,BT7455 可与 CD8+CD137+ T 细胞 (C) 和 CD4+CD137+ T 细胞结合,但不与 CD137 阴性细胞结合 (n=4 +/-SD;2 个独立 PBMC 供体各 2 个重复;****p<0.0001)。虚线表示平均背景 MFI(仅培养基孔)。(E) Jurkat-CD137 报告细胞与表达 EphA2 的 A549 肿瘤细胞共培养,用 BT7455 或非结合类似物 (BCY13626) 处理,通过发光测量下游 CD137 介导的 NF-k B 活化 (n=3,+/-SD)。 (FG) 用抗 CD3 刺激 PBMCs 并与 A549 细胞共培养,用 BT7455 或非结合类似物 (BCY14736、BCY14797 和 BCY14796) 处理,并通过 Luminex 测量分泌到培养基中的 IFN g 和 IL-2 水平 (n=3,+/-SEM)。 (H) 与 (G) 相同,但 PBMCs 与表达低水平 EphA2 的 ZR75-1 或 T47D 肿瘤细胞共培养。 BT7455 活性依赖于表达高水平 EphA2 的肿瘤细胞 (即 A549) 的存在。 使用 Quantibrite 参考标准通过流式细胞术估计 EphA2 受体表达。
摘要。- 目的:当前的研究旨在重新核能糖尿病2型糖尿病(DMT2)对经过固定正差治疗的个体的牙龈囊泡流体(GCF)中晚期糖基化最终产物(AGE)和促炎性趋化因子的结果。患者和方法:根据包含和排除十分组,将参与者分为糖尿病和无糖尿病人群。功率分析是从一项预先研究的研究中采用的,该研究报告了肥胖个体中GCF趋化因子。所有牙齿均用于临床牙周参数(CPP)。GCF和唾液。GCF的促炎细胞因子均以PG/mL表示。使用磁珠的多重分析对Luminex®平台进行趋化因子的定量。数据的非正态性由Mann-Whitney U检验评估。正态性。以标准偏差和均值的形式计算描述性数据。结果:与非糖尿病患者相比,糖尿病患者未刺激的整个唾液流量(UWSFR)明显降低(p = .021)。在不同的临床牙周化对象(CPP)之间,在二型和非糖尿病参与者之间没有发现斑块评分(PS)和探测深度(PD)的差异。与非二 - 基本组相比,观察到DMT2参与者的两种GCF趋化因子(P = .031)和年龄(p = .017)在DMT2参与者中显着高。CPP和GCF生物标志物在糖尿病患者中与探测(BOP)出血(BOP)之间的年龄和GCF抵抗素水平之间存在正相关。结论:与正畸设备进行DMT2对齐的参与者
肛门囊炎的发病机理尚未得到广泛的研究,尽管特应性狗似乎易于这种疾病。因此,这项研究的目的是在三组(健康的狗,未经治疗的狗,未经治疗的狗和特种狗接受抗精神病药或过敏性免疫疗法)中,在肛门症状上,在肛门症状上是否可以在SacciC上进行变化。通过使用Illumina Tech-nology测序15个健康狗的14只健康狗,14只未经治疗和6种经过治疗的特应犬的细菌群体的细菌种群,通过对16S rRNA基因的V4区域进行测序。通过Luminex多重测试分析促炎细胞因子。 在健康和未经处理的ATOPIC犬的肛门SAC之间以及未经处理和未经治疗的ATOPIC犬(分别为P = 0.012和P = 0.017)之间, commitition的成员和结构都显着差异(分别为p = 0.002和p = 0.003)。 然而,在健康和经过治疗的狗中,社区结构相似(p = 0.332)。 Among the proinflammatory cytokines assessed, there was no significant difference between groups, except for interleukin 8 which was higher in the anal sacs of untreated atopic dogs compared to treated atopic dogs ( P = 0.02), and tumor necrosis factor-alpha which was lower in the anal sacs of healthy dogs compared to treated atopic dogs ( P = 0.04). 这些结果揭示了特应犬的肛门囊中的营养不良,这可能部分解释了特应犬的易感性,以发展细菌性肛门囊炎。促炎细胞因子。commitition的成员和结构都显着差异(分别为p = 0.002和p = 0.003)。然而,在健康和经过治疗的狗中,社区结构相似(p = 0.332)。Among the proinflammatory cytokines assessed, there was no significant difference between groups, except for interleukin 8 which was higher in the anal sacs of untreated atopic dogs compared to treated atopic dogs ( P = 0.02), and tumor necrosis factor-alpha which was lower in the anal sacs of healthy dogs compared to treated atopic dogs ( P = 0.04).这些结果揭示了特应犬的肛门囊中的营养不良,这可能部分解释了特应犬的易感性,以发展细菌性肛门囊炎。由Atopic Dogs(Oclaci-tinib,Desloratadine和过敏原特异性免疫疗法)接受的治疗方法将肛门囊的微生物群转移到健康狗的菌群中。需要进一步的研究来鉴定出特应犬的肛门囊炎的重要细胞。
摘要胰腺癌的肿瘤微环境(TME)是高度免疫抑制的。我们最近开发了一种转化的生长因子(TGF)β的免疫调节疫苗,该疫苗通过靶向TME中的免疫抑制和脱发,在胰腺癌的鼠模型中控制肿瘤的生长。我们发现,用TGFβ疫苗的治疗不仅降低了肿瘤中M2样肿瘤相关的巨噬细胞(TAM)和与癌症相关的成纤维细胞(CAF)的百分比,而且还降低了偏振CAF的偏光CAF,而且远离肌纤维纤维细胞样的表型。然而,TGFβ疫苗在TAM和CAF表型上的免疫调节特性是否是TGFβ特异性T细胞对这些亚群的识别和随后靶向的直接结果,还是TME内诱导的整体调节的间接结果。通过ELISPOT和流式细胞仪评估TGFβ特异性T细胞对M2巨噬细胞和成纤维细胞的识别。通过用肿瘤条件的培养基培养M2巨噬细胞或成纤维细胞,评估了TGFβ疫苗对这些细胞子集的间接和直接影响,或分别用从用TGFβ疫苗或对照疫苗的小鼠脾脏中分离出的T细胞。通过流式细胞仪和生物质量多重系统(Luminex)评估表型的变化。我们发现由TGFβ疫苗诱导的TGFβ特异性T细胞可以识别M2巨噬细胞和成纤维细胞。TAMS倾向于具有促进肿瘤功能,具有免疫抑制表型,并且与胰腺癌具有M2样表型时的总体生存率降低有关。此外,我们证明了M2巨噬细胞和CAF的表型可以由TGFβ特异性T细胞直接调节TGFβ疫苗诱导的TGFβ特异性T细胞,以及由于TME内疫苗的免疫 - 调节作用而间接调节。此外,肌成纤维细胞类似CAF会产生僵硬的细胞外基质,从而限制T细胞浸润,阻碍免疫疗法在去肿瘤肿瘤中的有效性,例如胰腺导管腺癌。通过用TGFβ的TAM和CAF靶向基于TGFβ的免疫调节疫苗,可以减少胰腺肿瘤中的免疫抑制和免疫排除。