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免疫微环境中的 m6A 修饰
血液系统恶性肿瘤的免疫治疗是一个快速发展的领域，近年来发展势头迅猛，主要包括嵌合抗原受体 T 细胞 (CAR-T) 疗法、免疫检查点抑制剂和其他治疗方式。然而，其临床疗效仍然有限，耐药性带来了重大挑战。因此，需要确定新的免疫治疗靶点和药物。最近，最常见的 RNA 表位修饰 N6-甲基腺苷 (m6A) 已成为各种恶性肿瘤的关键因素。据报道，m6A 突变会影响血液系统恶性肿瘤的免疫微环境，导致免疫逃避并损害血液系统恶性肿瘤中的抗肿瘤免疫反应。本综述全面总结了目前发现的m6A修饰在各种血液系统恶性肿瘤中的作用，特别关注其对免疫微环境的影响。此外，我们还概述了针对血液系统肿瘤治疗的m6A靶向药物的研究进展，以提供新的临床见解。
M6a − RNA抑制剂的基于结构的设计...
摘要：类似甲基转移酶的3（METTL3）和METTL14形成了一种催化最丰富的内部mRNA修饰的异二聚体复合物，N 6-甲基腺苷（M 6 A）。mettl3是结合二叶酸S-腺苷蛋氨酸（SAM）的催化亚基，而Mettl14参与mRNA结合。m 6修饰提供了对基因表达的转录后水平控制，因为它影响了mRNA生命周期的几乎所有阶段，包括剪接，核输出，翻译和衰减。有越来越多的证据表明Mettl3在急性髓样白血病中的致癌作用。在这里，我们使用催化亚基METTL3的结构和动态细节来开发与SAM竞争的小分子抑制剂。从通过高通量对接识别的命中开始，采用蛋白质晶体学和分子动力学模拟来指导抑制活性的优化。通过均匀分辨荧光测定法测量的效力成功提高了8000倍。优化化合物对脱靶RNA甲基转移酶METTL1和METTL16具有选择性。关键字：Mettl3/Mettl14，表面参考，计算机辅助药物设计（CADD），分子动力学，M 6 A-RNA，SAR■简介
n(6)-甲基腺苷（m6a）修饰在……中的作用
m6A修饰在真核生物中的作用已被证实 (Tavakoli et al., 2023; Chen et al., 2015)。m6A修饰与RNA相关生物过程的几乎所有方面密切相关，包括转录、前体mRNA剪接和加工、核输出、翻译、RNA稳定性和衰变 (Lesbirel et al., 2018; Wang et al., 2014; Wang et al., 2022d)。除此之外，m6A修饰还参与其他生物过程，如转录调控和信号转导 (Zhang et al., 2024b; Patil et al., 2016; Lee et al., 2021a, b)。m6A失调导致多种人类疾病的发展。值得注意的是，m6A修饰在人类癌症的发生发展中起着重要的调控作用。研究发现，m6A调控癌症
m6A RNA 甲基化对 STIM2 的修饰抑制了...
东方肝胆外科医院 (EHBH) 使用了 10 名接受根治性手术切除的 CCA 患者的 CCA 组织和邻近正常组织。本研究中涉及人类参与者的所有程序均符合《赫尔辛基宣言》（2013 年修订）。该研究经东方肝胆外科医院伦理审查委员会批准，所有患者均提供了书面知情同意书。人类 CCA 细胞系 HuCCAT1（ATCC，马纳萨斯，美国）在罗斯威尔帕克纪念研究所 (RPMI)-1640 培养基中培养，培养基中含有 100 g/mL 链霉素、100 U/mL 青霉素和 10% 胎牛血清（GE Healthcare，Life Sciences，美国）。第三方生物学服务使用短串联重复序列 (STR) 分析来表征所有细胞系（中国成都飞欧尔生物有限公司）。
果蝇 Nab2 RNA 结合蛋白抑制 m6A...
摘要 果蝇多聚腺苷酸 RNA 结合蛋白 Nab2 与一种因遗传性智力障碍而丢失的人类蛋白质同源，它通过一组基本上未定义的靶 RNA 控制成年运动、轴突投射、树突树枝化和记忆。在本文中，我们展示了 Nab2 在调节头部转录组中约 150 个外显子/内含子的剪接方面的特殊作用，并重点研究了在雌性神经元中富集的性别决定因子 Sex-lethal ( Sxl ) 中雄性特异性外显子的保留。先前的研究表明，这种剪接事件在雌性中受 Mettl3 复合物对 N6-甲基腺苷 (m 6 A) 的修饰调控。在分子水平上，Nab2 与神经元中的 Sxl 前 mRNA 结合并限制特定位点的 Sxl m 6 A 甲基化。同时，降低 Mettl3、Mettl3 复合物成分或 m 6 A 读取器 Ythdc1 的表达可挽救 Nab2 果蝇的突变表型。总体而言，这些数据表明 Nab2 是 m 6 A 甲基化的抑制剂，并意味着神经组织中 Nab2 和 Mettl3 调节的 RNA 之间存在显著重叠。
RNA m6A 修饰在作物改良中的应用策略
提高作物产量和品质是应对气候变化和人口增长的永恒主题。改良作物品种的关键在于精准操控基因表达。近年来CRISPR/Cas9技术的进步使得基因敲除越来越简单，但对于与重要农艺性状相关的基因，适当调控其表达水平至关重要，完全敲除往往会导致其他方面的缺陷。此外，许多农艺性状的改良需要上调靶基因的表达。因此，开发新的精准上调或下调基因表达的方法，而无需改变基因蛋白序列或引入新的基因组片段，将大大增强作物遗传改良的技术基础。 N 6 -甲基腺苷 (m 6 A) 是真核生物 mRNA 中最丰富且可逆的内部化学修饰，分别由甲基转移酶 (写入酶)、去甲基酶 (擦除酶) 和 m 6 A 结合蛋白 (读取酶) 安装、移除和识别 ( Tang et al., 2023 )。目前，在植物中已鉴定出两种类型的 m 6 A 甲基转移酶：多蛋白复合物和单个蛋白质。该多蛋白复合体包括 MTA、MTB、FIP37、VIRILIZER (VIR)、HAKAI 和 HIZ2（HAKAI 相互作用锌指蛋白 2），可催化 mRNA 中大多数 m6A 修饰（Parker et al., 2021; Ruzicka et al., 2017; Shen et al., 2016; Zhang et al., 2022; Zhong et al., 2008）。单个蛋白质 FIONA1 在拟南芥中也表现出甲基转移酶活性（Wang et al., 2022; Xu et al., 2022），可催化 mRNA 中约 10% 的 m6A 修饰。植物中已鉴定出多种m6A脱甲基酶，它们属于Fe(II)/a-kg依赖性双加氧酶超家族，包括拟南芥AtALKBH10B和AtALKBH9B（Martinez-Perez等，2017）、水稻OsALKBH9（Tang等，2024）和番茄SlALKBH2（Zhou等，2019）。m6A可被m6A结合蛋白识别，如拟南芥中含有YTH结构域的ECT。在植物中，poly A+中m6A/A的比率
m6A 在氧化应激和炎症中的作用的叙述性综述
N6-甲基腺苷（m6A）是高等生物中最常见的修饰，研究表明m6A修饰广泛存在于哺乳动物、植物、真菌等生物体中（1），m6A修饰主要发生在DRACH序列的腺嘌呤上（2,3），高通量测序发现m6A主要分布在终止密码子、mRNA外显子、3'UTR及蛋白质编码区（4）。RNA的生物学功能依赖于多种修饰，其中甲基化占有很大比例（5,6）。m6A修饰在基因表达调控中起着基础性作用（7），同时m6A修饰还参与RNA的翻译、降解、剪接、去核和折叠等过程（5,8,9）。m6A的调控主要依赖于m6A的酶系统，包括“Writer”、“Eraser”、“Reader”。 “Writer”是一种甲基转移酶，主要包括METTL3、METTL14和WTAP，这些甲基转移酶将甲基从甲基供体S-腺苷甲硫氨酸（SAM）转移到RNA腺嘌呤的第六个N原子上。“Eraser”是一种去甲基化酶，主要包括脂肪质量与肥胖相关蛋白（FTO）和ALKBH5。FTO是第一个在m6A修饰中发现的去甲基化酶（9，10）。研究发现，用siRNA敲除FTO，mRNA中M6A含量增加，而过表达FTO则可降低细胞内m6A水平（11）。但也有学者认为FTO对m6A无明显影响，尤其是对核小RNA。相对于FTO作为去甲基化酶发挥作用的观点，有学者认为FTO和ALKBH5的调控位点为了逆转甲基化，倾向于维持非甲基化状态的稳定性（12）。在FTO被抑制或去除的情况下，异常的m6Am会干扰输出机制，可能导致mRNA的异常预剪接（13）。结合以上观点，FTO与m6A酶系统中其他蛋白的作用需要更加平衡和充分的研究。甲基化修饰要实现其生物学功能，需要与相应的识别蛋白结合，也就是“Reader”，包括YT521-B同源结构域家族（YTHDF）蛋白（14）。目前的研究更多集中在YTHDF1/2/3上，虽然这三者被认为具有不同的作用，但由于其序列的相似性和结合靶标的趋同，它们很可能具有叠加或协同作用（15）。根据目前的结果，Reader 包括 YTHDF 和 IGF2BP3 等蛋白质，
m6a mRNA甲基化调节早期胰腺β细胞...
该预印本版的版权持有人于2023年8月3日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.08.03.551675 doi：Biorxiv Preprint
标题单细胞发现M6A RNA修改...
预印本（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。该版本的版权持有人于2023年12月13日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.12.06.570314 doi：Biorxiv Preprint
NMDAR 介导的 m6A 动态变化与神经元翻译呈负相关
表观转录组修饰在翻译调控中至关重要，对于维持细胞稳态至关重要。N6 甲基腺苷 (m 6 A) 是最丰富且保存良好的表观转录组修饰之一，已知其在神经元功能的各个方面发挥着关键作用。然而，m 6 A 修饰在活动介导的翻译调控和突触可塑性方面的作用尚未研究。在这里，我们研究了 m 6 A 修饰在响应 NMDAR 刺激时的作用。我们一直观察到 5 分钟 NMDAR 刺激会导致 eEF2 磷酸化增加。相应地，NMDAR 刺激在 5 分钟时间点导致 m 6 A 信号显著增加，与整体翻译抑制相关。NMDAR 诱导的 m 6 A 信号增加伴随着 m 6 A 标记 RNA 从翻译到非翻译核糖体池的重新分布。 m 6 A 水平的增加与 NMDAR 刺激下观察到的 FTO 水平降低有很好的相关性。此外，我们还表明，抑制 FTO 可防止 NMDAR 介导的 m 6 A 水平变化。总体而言，我们的结果建立了基于 RNA 的分子读数，它与 NMDAR 依赖的翻译调控相关，有助于理解蛋白质合成的变化。