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环境DNA揭示了浮动海上风电场的鱼类和浮游生物多样性的空间模式
fi g u r e 3 mifish社区概况的β多样性。（a）样品重复级别的NMD图，（b）在Hellinger转换的Bray-Curtis成对差异的站点处的平均连锁聚类。采样深度表示为实心圆（10 m）或带有十字架（50 m）的开放正方形。样品以黄色为OWF或蓝色以显示参考区域。
使用环境DNA分析技术的淡水鱼类调查方法
综合分析方法（MIFISH方法）metabar缩合分析等。物种识别等。物种特定检测实时PCR分析等。成本（每个样品）约20,000至40,000日元 *3约30,000至50,000至50,000日 *4 *1参见试验调查（环境环境部工作部）。 *2监测站点1000湖：请参阅《淡水鱼类调查手册》。 *3尽管主要重点是分析成本（阅读），但数量取决于分析公司（分析结果的检查是单独的成本）。对于特定于物种的检测，
使用环境DNA分析技术的生物调查 - 原理，当前状况和前景 -
环境DNA分析吸引了作为一种创新技术，可以补充生态研究的全面和复杂性。环境DNA是从活生物体释放到土壤，水和大气等环境的DNA碎片。通过分析从环境样本中收集的环境DNA，可以澄清居住的生物的类型，数量和多样性。在过去的几年中，使用环境DNA的生物调查迅速扩散，因为与以前的调查相比，人力资源和成本负担要低得多，并且对生态系统没有负担。其中，已经检查了用于获取样品，数据处理方法以及利用所获得的栖息地信息数据的各种方法的方法，并且在所有领域（例如环境评估）中积极执行应用程序，超出了研究范围。该报告将介绍MIFISH方法的原理和前景，该方法促进了环境DNA技术的传播，以及将环境DNA分析应用于环境研究的示例，并对其可能性产生了鸟眼的看法。
atoplex metabarcoding库准备用户手册
ATOPLEX METABARCODING用户手册为MGI定制产品平台上的测序进行多个PCR扩增提供了指导。荟萃编码通常用于物种分类，丰度分析和各种生物样品的比较研究。The barcodes frequently used for biodiversity assessment include prokaryotic 16S ribosomal DNA (for bacteria and archaea), eukaryotic 18S ribosomal DNA (for diverse eukaryotes such as plants, protists, and fungi), eukaryotic ITS ribosomal DNA (for fungi), mitochondrial COI gene (for a wide range of eukaryotes including animals and生物）和线粒体12S DNA（专门针对鱼）。This user manual is only applicable to the use of the library construction products described in this document: ATOPlex 16S V3V4 rDNA Primer Pool, ATOPlex 18SV4 rDNA Primer Pool, ATOPlex ITS1 rDNA Primer Pool, ATOPlex COI mtDNA Primer Pool, ATOPlex Ac12S mtDNA Primer Pool, ATOPlex MiFish Primer Pool, and ATOPlex DNA Dual Barcode Library Preparation测序套件。
使用Edna metabarcoding建立河流恢复后淡水鱼组成的靶标
需要为鱼类社区组成建立现实的目标来评估河流修复项目的有效性。，我们使用了与米里什底漆的环境DNA（EDNA）元法编码，以获取估计位于日本Ehime ehime Prefecture的Shigenobu River System的上游，下游和恢复缓解项目区域（Kaihotsu - Kasumi）的17个地点（Kaihotsu - Kasumi）的估计。我们评估了使用Edna快速，敏感和广泛收集数据的好处，以在恢复区建立现有的鱼类群落组成，以及物种组合的潜在的短期，中期和长期目标，这些物种组合可能在分散到来自上游和下游群体的项目区域后现实地出现。我们将Edna Metabarcodod的结果与从同时捕获调查和历史信息获得的物种列表进行了比较。从埃德纳（Edna Surveys）获得的社区组成的非衡量多维标度图显示，Kaihotsu - Kasumi恢复区和周围的河流及其河流分为三个簇：上游，中层和下游及河口和河口。Kaihotsu - Kasumi恢复区位点包含在恢复区附近的流入和流出河流的中间和下到达的组中。我们在这一组中检测到了总共26种，二十一种本地物种和五个非本地物种。因此，这些本地物种被认为是短期目标物种，其散布到Kaihotsu - Kasumi恢复区域。相比之下，基于捕获调查和历史文献，只有14种被选为目标物种。增加了我们埃德纳调查的分辨率的一个因素是我们确定存在a anguillicaudatus（进化枝A和B）的种内谱系的能力，这些谱系被捕获调查遗漏了。这些结果表明，与捕获调查相比，EDNA Metabarcoding方法可以提供更全面和现实的短期目标物种估计，并通过种内谱系检测提供更高的分辨率监测。