Altai 团队业务遍及非洲、中东和中亚的 50 多个国家。自 2003 年成立以来,Altai 在治理、公民社会以及项目监测和评估研究方面积累了丰富的专业知识。
MLSEQ是用于应用机器学习算法在下一代RNA-sequecting(RNA-SEQ)数据中应用的综合软件包。研究人员出于各种目的呼吁MLSEQ,其中包括疾病结果的预测,最佳特征子集(基因,转录本,其他同工型)的识别以及根据其预测重要性对特征进行分类。使用此软件包,研究人员可以上传其原始的RNA-seq计数数据,预处理数据并执行各种机器学习算法。预处理方法包括DESEQ平均值(TMM)归一化方法的DESEQ中值和修剪平均值,以及每毫米读取计数的对数(log-CPM),方差稳定转换(VST),正规化对数转换(RLOG)和方差模型在观察级别(voy)级别(voy)变换(voy)。归一化方法可用于纠正系统变化。转换方法可用于使离散的RNA-seq数据在层次上更接近微阵列,并进行基于微阵列的层化算法。当前,MLSEQ软件包包含90多个基于微阵列的分类器,包括最近开发的基于VOOM的判别分析分类器。除了这些分类器外,MLSEQ软件包还包括基于离散的分类器,例如Poisson线性判别分析(PLDA)和负二项式线性判别分析(NBLDA)。在预处理数据上,研究人员可以构建分类模型,对这些模型进行参数优化,评估模型性能并比较不同分类模型的性能。此外,可以通过构建模型预测测试样本的类标签。MLSEQ是用户友好,简单,目前是文献中针对RNA-Seq分类开发的最全面的软件包。要开始使用此软件包,用户需要上传其计数数据,其中包含每个样本映射到每个成绩单的读数数。可以从RNA-SEQ实验中获得此类计数数据,也可以从其他测序实验(例如芯片测序或元基因组测序)中获得。提出了此小插图,以指导研究人员如何使用此软件包。
TABLE OF CONTENTS Remark by the Head of Department - - - 12 Brief History of the Department - - - - 14 1.0 Introduction - - - 14 2.0 Philosophy of the Programme - - - 15 3.0 Need Assessment - - - - 15 4.0 Objectives - - - - 16 5.0 Course Duration - - - - 16 6.0 Admission Requirements - - - 17 7.0 General Regulation of the Programme - - 17 8.0 Academic Misconduct - - 18 9.0 Course Code - - 27 10.0 Students' Guidance和咨询 - 28 11.0大学卫生服务--- 28 12.0从一个级别到另一个级别 - 28 13.0尼日利亚医学实验室科学委员会的学生注册-30 14.0考试 - 34 15.0项目 - 项目 - 36.0 - 36.0标准,将安置到各种专业 - 37 17.0毕业-37 17.0毕业-38 18.0 cours -38 18.0 - 38-38-38-4-4-4-4-4-4-4-38 188 188 18.6 18.6 18.6 18.6 18.6 18.6 18. 38 18. 38 18. 38 18. 38 18.6 18. 38 18. 38 18. 38 18.6 18. 38 18.6 18.6部门图书馆服务 - 95 21.0工作人员名单 - 98 23.0行政人员名单 - 101 24.0物理设施--- 104
机器学习(ML)彻底改变了许多领域。这一进展在很大程度上被认为是ML算法和模型的开发,但是这种重点使在现实世界中有效部署,扩展和维护这些模型所需的工程掩盖了所需的工程。随着机器学习系统变得越来越复杂和广泛,需要专门的学科来解决这一差距,即机器学习系统工程(MLSE)。mlse。ce是为了响应计算系统的日益增长的复杂性,该计算系统需要一种集成方法,即电气工程(EE)或计算机科学(CS)都无法自行解决。ee贡献了硬件专业知识,而CS为算法和软件开发奠定了基础。但是,随着这些系统变得越来越复杂,出现了一项新的学科,计算机工程,以应对设计,构建和优化这些系统的挑战。机器学习在类似的十字路口。CS继续推动机器学习算法,而EE则推进了机器学习任务的专用硬件。但是,两项纪律都没有完全解决部署,优化和维持ML系统所需的工程原则。此差距强调了对MLSE的需求,专注于ML系统的工程,涵盖了从数据获取和模型培训到部署,优化和维护的所有内容。换句话说,我认为“如果ML算法开发人员就像宇航员探索空间一样,ML Systems工程师是火箭科学家和任务控制专家,他们可以将他们带到那里并保持任务。”该类比强调了MLSE在使ML系统在现实环境中运行和可持续性的关键作用。为了满足这一需求,mlsysbook.ai是概念化和形式化MLSE的一步。mlsysbook.ai旨在弥合理论ML概念与实践工程原理之间对于建立,部署和维护强大的ML系统所必需的差距。mlsysbook.ai解决了对工程师的需求,既有对ML的深刻理解,又是建立可扩展系统的实用技能的深刻理解。随着ML变得更加集成到关键基础架构中,这种双重专业知识越来越重要。
•机器学习加速器(MLA) - 提供25-200台TERA操作,每秒(25-200个顶部),用于神经网络计算,并增强硬件,以提高精度,用于更快的Genai计算,硬件中的BF16,改进了DMA带宽和双电压支持。•应用程序处理单元(APU) - 八个ARM Cortex A65双线程处理器的群集以1.5 GHz运行,最多可提供32K DHRYSTONE MIPS。•视频编码器/解码器 - 支持MJPEG,H.264和H.265压缩标准,AOMEDIA视频1(AV1),支持主/高/专业配置文件,4:2:2:2:0像素和8位精度。编码器以高达4KP30的速率支持H.264,而解码器则以高达4KP60的速度支持H.264/265。•计算机视觉单元(CVU) - 由1GHz四核概念组成,弧EV74视频处理器,最多支持720位16位GOPS。•图像信号处理器(ISP)-ARM C -71以1.2GHz运行。RAW 8、10、12、14、16、20、22和24位输入来自CFA图像传感器。支持RGGB,RCCG,RCCB,RCCC和RGBIR颜色格式。支持24位宽动态范围(WDR)。•高速I/O子系统 - 提供四个10吉比特以太网端口以及PCIE GEN5 8车道接口可用作为根复合物或端点,并且具有分叉功能。•DRAM接口系统(DIS) - 支持八个32位LPDDR5,LPDDR4和LPDDR4X,并支持X32和X64 LPDDR芯片。目标速度6400 Mbps(LPDDR5)在所有DDR通道中提供102 GB/s的有效理论带宽。•引导和安全单元(BSU) - 在效率内存和密钥管理中提供安全的密钥存储。支持启动图像的解密和身份验证,并为用户代码提供安全性API。
在本课程中,我们将通过了解如何以高级语言编写的ML模型分解为低级内核,并以分布式方式跨硬件加速器(例如GPU)执行。本课程涵盖的主题包括:神经网络和反向传播,用于表达ML模型的编程模型,自动差异化,深度学习加速器,分布式培训技术,计算图优化,自动内核的生成,内存优化等。本课程的主要目标是就现有ML系统的工作方式提供全面的看法。在整个课程中,我们还将学习这些系统背后的设计原则,并讨论为下一代ML应用程序和硬件平台构建未来ML系统的挑战和机会。
摘要。随着机器学习(ML)场的迅速发展,ML管道的数量,复杂性和组件不断增长。在线平台(例如OpenML,Kaggle)旨在收集和传播ML实验。但是,可用知识的分散,每个平台代表ML过程的不同组成部分或相互区域的组件,但以不同的方式。为了解决这个问题,我们利用语义Web技术来建模和集成ML数据集,实验,软件和科学作品纳入MLSEA,这是一种资源:(i)MLSO,一种模拟ML数据集,管道和实现的本体论; (ii)MLST,分类法,其中包含ML知识的收集为受控词汇; (iii)MLSEA-kg,一个RDF图,其中包含来自不同来源的ML数据集,管道,实现和科学作品。MLSEA为改善ML管道的搜索,解释性和可重复性铺平了道路。
生物技术行业5.0正在通过整合机器学习(ML),物联网(IoT)和云计算等尖端技术的集成。,一个利用客户数据并可以改变生活的行业是各种攻击的目标。本章提供了机器学习安全操作(MLSecops)如何帮助保护生物技术行业5.0的观点。本章对生物技术行业5.0的威胁进行了分析,以及ML算法如何帮助保护行业最佳实践。本章探讨了生物技术行业5.0中MLSecops的范围,强调遵守当前的监管框架是多么重要。与生物技术行业5.0开发有关医疗保健,供应链管理,生物制造,制药部门等创新解决方案,本章还讨论了行业和企业应遵循的MLSecops最佳实践,同时也考虑了道德责任。总的来说,本章提供了有关如何将MLSecops整合到生物技术行业过程中的设计,部署和调节5.0的讨论。
PubMlST多人数据库中存在物种注释,例如非特异性Neisseria sp。已知属但未描述确切物种。如果观察到非特异性注释以及同一属中的物种注释,则计算出的LCTN是物种,例如奈瑟氏菌和奈瑟氏菌。,LCTN是奈瑟氏菌脑膜炎。 但是,如果Neisseria sp。 观察到与不同的属一起观察到,然后计算最低的公共节点。 例如 Neisseria sp。 和Kingella Oralis,计算出的LCTN是neisseriaceae家族节点。,LCTN是奈瑟氏菌脑膜炎。但是,如果Neisseria sp。与不同的属一起观察到,然后计算最低的公共节点。例如Neisseria sp。和Kingella Oralis,计算出的LCTN是neisseriaceae家族节点。
材料和方法:我们使用了来自 2020AA–2022AB UMLS Metathesaurus 连续版本的训练测试数据集。我们的启发式“瀑布”方法采用了 7 种不同的 SG 预测方法。不符合方法的原子被传递给下一种方法。DL 方法为原子名称生成 BioWordVec 和 SapBERT 嵌入,为源词汇表名称生成 BioWordVec 嵌入,为原子源层次结构中倒数第二节点的原子名称生成 BioWordVec 嵌入。我们将 4 个嵌入的连接输入到完全连接的多层神经网络中,该网络的输出层有 15 个节点(每个 SG 一个)。对于这两种方法,我们都开发了方法来估计它们预测的原子 SG 正确的概率。基于这些估计,我们开发了 2 种混合 SG 预测方法,结合了启发式方法和 DL 方法的优势。