探究血液干细胞转化为白血病 主要指导老师姓名:Adam Wilkinson 主要指导老师的电子邮件地址:acw63@cam.ac.uk CRUK CC 研究主题:血液系统恶性肿瘤虚拟学院 学生注册部门:血液学系 研究所在部门或学院:剑桥干细胞研究所 研究生计划:MRes + PhD(仅限 1 + 3 年非临床申请者) MRes 项目概要:Wilkinson 研究小组专注于健康和恶性肿瘤中血液干细胞的生物学。作为长寿的干细胞群,血液干细胞会积累基因突变,并且是几种血液恶性肿瘤的细胞来源,特别是骨髓增生异常综合征 (MDS) 和急性髓细胞白血病 (AML)。MDS 和 AML 的预后仍然不佳,需要新的疗法来改善患者护理和生存。 MDS/AML 疾病风险预测测试的最新进展表明,预测和预防疾病的发生也是可能的。为了开发治疗和/或预防 MDS/AML 的新型有效疗法,我们需要更好地了解白血病转化过程中发生的分子变化。我们最近开发了新型聚合物培养系统,首次在体外稳定扩增血液干细胞。我们现在正在应用基因编辑技术和细胞/分子/遗传方法来更好地了解健康和恶性血液干细胞的生物学,并促进新的血癌治疗方法的开发。这个 MRes 项目的目的是开发一种血液干细胞白血病转化模型。该项目的总体目标是确定新的治疗靶点,以改善对患有血癌的患者的治疗,并降低血癌发生的风险。具体来说,该项目将专注于模拟染色体非整倍体的后果。染色体非整倍体在血液系统肿瘤中很常见,在约 50% 的新生 AML 中可观察到。该项目将重点研究 7 号单体,它见于约 40% 的儿童 MDS、约 5% 的儿童 AML 和约 30% 的治疗相关性髓系肿瘤。7 号单体在 MDS 和 AML 中预后不良。为了确定新的治疗策略,我们需要更好地了解 7 号单体对血液干细胞活性和血液生成的影响。MRes 实验计划:MRes 项目的主要目的是建立白血病转化的离体血液干细胞模型。首先,我们将优化在体外有效诱导原代血液干细胞 7 号单体的方法。这将通过基于 CRISPR 的技术实现,并使用下一代测序和 ddPCR 进行验证。其次,这些基因突变的后果将在体外功能试验(扩增试验和分化试验)中进行评估。第三,我们将使用多色流式细胞术和转录组分析来表征细胞和分子变化。这种易于处理的体外模型系统将为未来研究白血病转化的分子驱动因素和依赖性奠定基础。
纳米医学和纳米诊断是现代医学和医疗保健的最前沿,纳米颗粒可以为药物输送提供新的途径,并增强医学成像方式及其能力。新颖的纳米医学和纳米诊断者在设计中使用更复杂的化学物质来进行“触发”和“刺激反应性”药物输送,从而使有效载荷释放和降低毒性更大。与这些新的治疗剂和递送剂结合使用了医学成像技术,例如磁共振成像(MRI),正电子发射断层扫描(PET),超声和光学成像,以早日检测患病状态,增强生物治疗的基本理解分子过程和医疗治疗的基本了解。对这些临床成像技术必不可少的诊断成像剂在其靶向精度和准确性中继续发展,并将在非介入的临床成像,Precision Healthcare和治疗评估中发挥至关重要的未来作用。
Programme Regulations: 2024/25 Degree of Master of Research (MRes) offered in the Faculty of Medical Sciences: General Programme: MRes Medical & Molecular Biosciences (4807F) Subject Specialist Programmes: MRes Immunobiology (4813F) MRes Ageing and Health (4814F) MRes Cancer (4816F) MRes Regenerative Medicine and Stem Cells (4817F) MRes Neuroscience (4818F) MRes Biotechnology and Business Enterprise (4819F) MRes Toxicology (4820F)* MRes Translational Medicine and Therapeutics (4822F) MRes Animal Behaviour (4825F) MRes Epidemiology (4826F) MRes Medical Genetics (4827F) MRes Molecular Microbiology (4828F) MRes移植(4829F)MRES进化和人类行为(4832F)MRES线粒体生物学和医学(4834F)MRES糖尿病(4835F)MRES MRES神经肌肉疾病(4836F) (4840F)健康和疾病(4862F)MRES分子细胞生物学(4862F)MRES临床运动生理学(仅向内部互生候选者开放)(4863F)MRES生物制作和生物启动(4864f)(4864f)MRES(4864f)MRES药物输送和纳米赛(4869f)iSTERTARTY和DELTARS MISCISES(4869F)conciences(4869f)conciences(4869f)sciences(4869F)来自印度尼西亚大学的牙科学生(4872F)
轮换项目名称 使用 100 万个可诱导 DNA 条形码进行原位谱系追踪实验室主任 (PI) 姓名 Jamie Blundell 第二位指导老师(如适用) N/A 项目早期检测指导老师电子邮件 jrb75@cam.ac.uk 实验室位置 哈奇森 MRC 研究中心项目概要目的和目标维持血液、皮肤、肠道和其他组织的干细胞处于不断更新的状态,从而积累基因改变,其中一些导致克隆扩增和癌症 [1]。理解这一点需要能够测量组织维持期间发生的群体动态。在此,我们建议构建一个原位谱系追踪工具,该工具可以诱导生成数百万个 DNA 条形码组合,从而允许人们使用下一代测序以精确度并行追踪数百万个细胞谱系。与以前的半定量方法 [2] 不同,这项技术将能够定量追踪与体内组织维持相关的克隆动态,并深入了解如何实现体内平衡以及它在癌症早期阶段如何崩溃。我们之前在酿酒酵母中的工作已经证明,基于 cre-lox 系统的位点特异性 DNA 条形码和谱系动态的定量追踪可用于深入了解突变如何在大量细胞群体中产生、扩展和竞争 [3]。我们与长期合作伙伴 Sasha Levy 进一步开发了这项技术,现在可以原位生成条形码多样性,而无需转化质粒文库。这项改进的技术将利用 3 个串联 loxP“着陆垫”,每个“着陆垫”(在 Cre 诱导后)可以不可逆地整合存储在基因组其他地方的三个独立串联阵列中的约 100 个独特条形码序列中的一个。对于这个 MRes 轮换项目,我们计划扩大这项技术的规模,以在酵母中稳健地生成 100 万个独特的条形码组合。这将证明该技术能够以单细胞精度追踪体内细胞谱系,从而为干细胞生物学和癌症发病中的主要未解问题提供参考。实验计划 学生将首先构建由 loxP 位点分隔的约 100 个条形码组成的长串联阵列构建体,并使用标准同源重组将此构建体整合到已包含 cre-lox 着陆垫的酵母菌株的基因组中。然后,学生将研究此构建体可诱导的条形码多样性如何取决于串联阵列的诱导条件和基因组位置。优化后,学生将整合另外两个串联阵列,并尝试实现超过 100 万个独特条形码的多样性,将使用定制设计的 2 步 PCR 协议进行仔细量化,该协议使用唯一分子标识符 (UMI) 来标记单个 DNA 分子。