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对 12 种用于检测结核病的人工智能解决方案进行独立评估
尽管可用的 CAD 解决方案种类繁多，但对用于结核病 (TB) 筛查的计算机辅助检测 (CAD) 软件的独立评估却很少。我们开发了一个胸部 X 光 (CXR) 图像测试库，由两名具有不同经验水平的结核病临床医生盲读，然后通过 12 种 CAD 软件解决方案进行处理。使用 Xpert MTB/RIF 结果作为参考标准，我们将每种 CAD 软件的性能特征与专家读者和中级读者进行了比较，使用的截止阈值是根据每个人体读者的敏感度选择的。六个 CAD 系统的表现与专家读者（Qure.ai、DeepTek、Delft Imaging、JF Healthcare、OXIPIT 和 Lunit）相当，另外一种软件（Infervision）的表现仅与中级读者相当。Qure.ai、Delft Imaging 和 Lunit 是唯一表现明显优于中级读者的软件。大多数 CAD 软件在有结核病史的参与者中表现明显较差。用于捕获 CXR 图像的放射线设备也对某些 CAD 软件的性能有影响。结核病计划实施者现在有多种优质 CAD 软件解决方案可供选择，可用于他们的 CXR 筛查计划。
抗抑郁药舍曲林为增强结核病治疗提供了一种新的宿主导向治疗模块
摘要 长期治疗是导致结核分枝杆菌 (Mtb) 产生耐药性的主要原因，因此任何新的结核病治疗方案不仅要缩短治疗时间，还要逃避病原体的耐药机制。为了利用宿主反应为现有治疗方案提供支持，我们使用舍曲林 (SRT) 来抑制巨噬细胞对感染的促致病性 I 型干扰素反应。虽然 SRT 单独只能抑制细菌生长，但它能有效增强异烟肼 (H) 和利福平 (R) 在巨噬细胞中的杀菌活性。在这些一线结核病药物对耐药菌株或休眠结核分枝杆菌控制无效的情况下，SRT 增强抗生素效力的作用更为明显。SRT 可显著与标准结核病药物结合，增强感染药物敏感/耐药结核分枝杆菌菌株的小鼠组织中的早期病原体清除能力。此外，我们证明了联合疗法对高度敏感的 C3HeB/FeJ 小鼠的急性结核病感染具有增强的保护作用，这表明 SRT 可作为标准结核病治疗方案的有力辅助手段，对抗不同生理的细菌群。本研究提倡一种新型宿主导向的结核病辅助治疗方案，并使用临床批准的抗抑郁药，以更快、更好地控制感染。
抗结核 (TB) 药物的长效胰岛素 (LAI) 制剂。注意事项...
Vivian Cox 医学博士，杨森结核病研发临床负责人“杨森 LA/ER 结核病管道现状”背景 – 结核病 (TB) 药物的 LAI 制剂。用途。• 潜伏性结核感染 (LTBI) 治疗与纳入结核病 (TBD) 治疗方案。• 用于预防或治疗的伴随 LA 药物。提高依从性的潜力。• 必须考虑注射剂 (IM 或 SC) 的可接受性，尤其是对于受益于 TPT 的幼儿。• 应将患者偏好研究和患者报告的结果纳入临床开发。可能的结核病指征。• 单剂量或间歇性 TPT 非常适合目前的 ART 服务提供模式。• 缩短疗程的 TBD 治疗（例如，口服引导以进行培养转化，然后服用一到两剂 LAI 制剂）。理想的肠外 LTBI 方案 (TPP) 的关键属性。 • 针对药物敏感 (DS) 和耐药 (DR) 结核病的活性。• 单次注射（体积 2mL；≤25 号针头）或植入。开发用于 TPT 的 LAI Bedaquiline (BDQ) 的考虑因素。良好的化学、制造和控制 (CMC) 特性。• 低水溶性 (0.0002mg/mL)；低血浆清除率 (0.04mcg/h/kg)；以及对 Mtb 的低 MIC（0.03mcg/mL；高
纳米技术支持生物材料
摘要：结核病仍然是一项巨大的全球健康挑战，需要发展创新的治疗策略来打击这种传染病。近年来，纳米技术已成为一个有前途的领域，具有彻底改变结核病治疗的潜力。本评论概述了纳米技术在诊断，药物输送和免疫疗法中的应用。纳米技术提供了新的途径，可通过在临床样品中快速和敏感的结核分枝杆菌的快速检测来改善结核病的诊断。纳米颗粒的生物传感器可以增强结核病诊断的敏感性和特异性。纳米级平台，例如量子点，碳纳米管和金纳米颗粒，可以检测MTB特异性生物标志物，从而促进早期和准确的诊断并及时的治疗开始。纳米制剂，其中包括脂质体，聚合物纳米颗粒和固体脂质纳米颗粒，可以将抗TB药物的靶向递送到感染部位。这些纳米载体可保护药物免受降解，提高其溶解度并延长循环时间，从而增强了药物生物利用度和改善的治疗结果。基于纳米技术的方法有可能通过彻底改变诊断，药物输送和免疫疗法来显着转化结核病治疗。利用纳米材料和纳米构造的独特特性实现精确和有针对性的干预措施，克服与常规方法相关的几个限制。随着该领域的研究的进展，预计纳米技术将继续在抵抗结核病的斗争中发挥关键作用，最终有助于全球控制和消除这种毁灭性疾病的努力。
使用挂锁探针解剖分子特征以解释病理状态 Anastasia Magoulopoulou
摘要 生命科学领域的最新技术进步极大地提高了我们以前所未有的深度在分子水平上解决科学问题的能力。自推出以来，下一代测序 (NGS) 实现了高通量分析，随着时间的推移，变得越来越普及和负担得起，塑造了研究和临床应用的未来。空间分辨转录组学 (SRT)，特别是原位测序 (ISS)，提供单细胞转录组数据，同时保留周围组织微环境的组织病理学背景。本论文探讨了挂锁探针与原位测序 (ISS) 或下一代测序 (NGS) 结合的应用，以解决与特定疾病相关的问题。在论文 I 中，我们研究了结核分枝杆菌 (Mtb) 与结核病感染小鼠肺中免疫细胞之间的空间相互作用，绘制了细菌簇和单个细菌附近的免疫相关转录本。我们的研究结果表明，在 Mtb 抗性的 C57BL/6 小鼠中，靠近单个细菌的巨噬细胞活化。相比之下，在易感染结核分枝杆菌的 C3HeB/FeJ 小鼠的肺组织中占主导地位的组织化肉芽肿未富集免疫激活转录本。这种方法提供了对结核病免疫反应的见解，并强调了空间分辨转录组学在研究宿主-病原体相互作用方面的能力。在论文 II 中，我们研究了非小细胞肺癌 (NSCLC) 中的肿瘤微环境，重点研究了 T 细胞克隆性的影响。我们将 TCR 克隆性与基因突变、肿瘤免疫特征和对免疫疗法的反应联系起来。我们的数据显示，高 TCR 克隆性与高肿瘤突变负担、发炎的肿瘤表型以及对检查点抑制剂的反应改善有关，这表明其有可能成为 NSCLC 个性化免疫治疗的生物标志物。在论文 III 中，我们在空间上探索了新辅助治疗期间选定的 NSCLC 组织中的 TCR 模式和免疫细胞分布，这些组织具有匹配的未受影响的淋巴结，以及 HER2+ 乳腺癌病例。我们注意到，与匹配的淋巴结相比，癌症组织中的 TCR 多样性较低。我们的数据进一步揭示了扩增克隆型（主要是 CD8 T 细胞）的区域优势，这些克隆型位于靠近癌症区。总体而言，这些结果证明了 ISS 在提供诊断组织样本中肿瘤免疫微环境中克隆 T 细胞扩增之间相互作用的关键空间细节方面的实用性，特别是在治疗环境中。在论文 IV 中，我们开发了一种基于分子倒置探针 (MIP) 的经济高效的检测血液样本中微生物病原体和抗菌素耐药性标志物的检测方法，即使在资源匮乏的环境中也能提供高特异性和灵敏度。MIP 方法简化了病原体检测，无需进行大量的样品制备或生物信息学分析，使其成为资源匮乏地区监测传染病的便捷工具。总的来说，这项工作展示了挂锁探针和先进技术的应用，以加深我们对疾病的了解并改善诊断和个性化治疗。
公共卫生行动
背景：结核分枝杆菌的表型药物敏感性测试 (pDST) 可能需要长达 8 周的时间，而常规分子检测只能识别有限的一组耐药突变。靶向下一代测序 (tNGS) 可快速预测全面耐药性，本研究旨在探索其在印度孟买公共卫生实验室内的操作可行性。方法：通过常规方法和 tNGS 对同意的 Xpert MTB 检测阳性患者肺部样本进行耐药性检测。研究团队成员的实验室运营和后勤实施经验如下。结果：在接受检测的所有患者中，70% (113/161) 没有既往结核病史或治疗史；然而，88.2%（n = 142）患有利福平耐药/耐多药结核病（RR/MDR-TB）。对于大多数药物，tNGS 和 pDST 的耐药性预测之间具有高度一致性，总体而言，tNGS 识别耐药性的准确性更高。tNGS 被整合并融入实验室工作流程；然而，分批样本导致结果周转时间显著延长，最快为 24 天。手动 DNA 提取会导致效率低下；因此进行了协议优化。需要技术专业知识来分析未知突变和解释报告模板。tNGS 每个样本的成本为 230 美元，而 pDST 为 119 美元。结论：在参考实验室中实施 tNGS 是可行的。它可以快速识别耐药性，应被视为 pDST 的潜在替代方案。
阿奇霉素对肺结核患者免疫力影响的评价
干预措施 本研究为前瞻性随机研究，旨在评估阿奇霉素对结核病患者的免疫调节作用。对有可疑结核病症状（包括咳嗽 > 两周、体重减轻、疲劳、发烧、夜间出汗）的患者，将进行痰涂片显微镜检查、Xpert MTB/RIF、分枝杆菌培养和胸部 X 光检查以诊断肺结核。将使用 Genotype MTBDR 测试（不再市售）进行在线探针测试 (LPA)，以将耐药结核病患者排除在研究之外。将根据结核病管理指南进行 HIV 检测，并将 HIV 阳性患者排除在研究之外。患者将在征得同意和伦理批准后入组。将使用手动随机化方法（抛硬币，掷出正面 = 有或反面 = 没）将患者分配到标准治疗（2HRZE/4HR）组，接受或不接受阿奇霉素治疗。该研究将以开放标签研究的形式进行。阿奇霉素的初始剂量为 500 毫克，随后每天一次 250 毫克，连续 28 天，形式为薄膜包衣片。两组患者将根据病情严重程度、年龄和性别进行分层。患者将在 12 个月内招募并随访 12 个月。该研究将招募 50 名首次患上肺结核、血清阴性、对所有一线药物敏感且居住在布拉柴维尔的男女成年人（>18 岁）。两组患者的病情严重程度、年龄和性别将尽可能匹配。每次随访咨询时都将通过胸部X光和肺功能测试来评估肺部表现。
脑脊液靶向测序快速鉴定耐药结核性脑膜炎
摘要 结核性脑膜炎 (TBM) 的死亡率仍然保持在 30% 左右，大多数死亡发生在开始治疗后的 2 个月内。耐药菌株的死亡率更高，因此及早发现耐药性 (DR) 至关重要。靶向下一代测序 (tNGS) 产生高读取深度，可以检测低频率的 DR 相关等位基因。我们将 Deeplex Myc-TB（一种 tNGS 检测）应用于 72 名经微生物学确诊的 TBM 成人的脑脊液 (CSF) 样本，并将其基因组药物敏感性预测与表型敏感性测试 (pDST) 和全基因组测序的综合参考标准以及临床结果进行了比较。Deeplex 在 24/72 (33.3%) 个 CSF 样本中检测到结核分枝杆菌复合体 DNA，并为 22/24 (91.7%) 生成了完整的 DR 报告。 Deeplex 生成的读取深度与 MTB/RIF Xpert 的半定量结果相关。在与一线 DR 相关的典型基因座上可以看到频率 <20% 的等位基因。忽略这些低频等位基因，Deeplex 与除吡嗪酰胺和链霉素以外所有药物的综合参考标准 100% 一致。三名患者在治疗 30 天后脑脊液培养呈阳性；参考测试和 Deeplex 在其中两名患者中鉴定出异烟肼耐药性，而 Deeplex 单独在一名患者中鉴定出低频利福平耐药等位基因。五名患者死亡，其中一名患者通过 pDST 鉴定出吡嗪酰胺耐药性。脑脊液 tNGS 可以快速准确地检测出耐药 TBM，但其应用仅限于细菌负荷较高的患者。对于细菌负荷较低的患者，需要开发诊断和耐药性检测的替代方法。
提高亚太地区患者获得癌症NGS检测的机会：
ACE 护理效能机构 APAC 亚太地区 APCM 先进精准癌症医学 C-CAT 癌症基因组学和先进治疗中心 cDx 伴随诊断 CGP 综合基因组分析 CGT 临床遗传/基因组检测 CRC 结直肠癌 DALY 伤残调整生命年 DRUP 药物重新发现协议 EMR 电子病历 EU 欧洲 ESMO 欧洲肿瘤医学协会 FDA 食品药品管理局 GDP 国内生产总值 GEP 基因组学教育计划 GMC 基因组医学中心 GMS 基因组医学服务 HCP 医疗专业人士 HIRA 健康保险审查和评估服务 HTA 卫生技术评估 IVD 体外诊断 KPI 关键绩效指数 KPMNG 韩国精准医学网络小组 LDT 实验室开发测试 LIS 实验室信息系统 MIR 死亡率与发病率比 MFDS 食品药品安全部 MHLW 厚生劳动省 MSAC 医疗服务咨询委员会 MTB 分子肿瘤委员会 NCCP 国家癌症控制计划 NECA 国家循证医学医疗保健合作机构 NGP 国家基因组平台 NGS 下一代测序 NHS 国家医疗服务体系 NICE 国家健康与临床优化研究所 NSCLC 非小细胞肺癌 OS 总生存期 PAG 患者权益组织 PFS 无进展生存期 PMI 精准医疗计划 PPM 个性化和精准医疗 QALY 质量调整生命年 QoL 生活质量 RWE 真实世界证据 SGT 单基因检测 TMB 肿瘤突变负担 UK 英国 VAF 价值评估框架 WGS 全基因组测序
GB4.0平台，CRISPR/CAS ...
CRISPR/CAS能够同时瞄准多个基因座（多重）的能力是改变植物育种的游戏规则。多路复用不仅会加速性格金字塔，而且还可以揭示功能冗余所隐藏的特征。此外，多路复用增强了基于DCAS的可编程基因表达，并实现了类似级联的基因调节。然而，包含串联阵列导向RNA（GRNA）的多重构建体的设计和组装需要无疤的克隆，并且由于存在重复序列而仍然很麻烦，从而阻碍了更广泛的使用。在这里，我们介绍了软件辅助克隆平台Goldenbraid（GB）的全面扩展，其中除了其多基因克隆软件之外，我们将新的工具集成了新的工具，用于基于IIS的易于且六个串联阵容的GRNA，使用Cas9和cas12a，使用GRNA-trees-trees-trees-crrna-crrrna-crrrna和crrrnna crrrnna crrrnna crrrnna crrrna carrna-crrrna crrrna cas12a。作为新工具的应力测试，我们组装并用于农杆菌介导的稳定转化A 17 cas9-grnas构造，靶向烟草中的Squamosa-promoter结合蛋白样（SPL）基因家族的子集。14个选定的基因是miR156的靶标，因此在少年到成年和营养至生殖相变中可能起重要作用。使用17个grnas构建体，我们生成了一组无Cas9的SPL编辑的T 1植物，该植物携带了多达9个双重突变，并显示出叶少年和更多的分支。GB4.0 Genome Edition纳入了新的基于Web的工具和随附的DNA零件集合，为植物基因组工程提供了多合一的开放平台。使用荧光素酶lyanum lycopersicum mtb促进剂或Agrobacterium tumefaciens Nopaline benthase prospermers inice inice inice Amamaine inice Amamaine in NiceAtient在NICAPASE中，NICAPASE PROSSITER in NICAPASE in NICAPASE in NICAPASE in NICAPASE in NICAPASE in NICAPASE in NICASIEN中，NICAIN中的使用单个和多重GRNA的GB组装DCAS9和基于DCAS12A的CRISPR/CAS激活剂和阻遏物使用单一和多路复用GRNA的功能。使用单个和多重GRNA的GB组装DCAS9和基于DCAS12A的CRISPR/CAS激活剂和阻遏物使用单一和多路复用GRNA的功能。