-EF =弹性力常数,用于保留蛋白质二级和三级结构。应使用它来测试正常的所有原子构象,以保持所有原子和粗粒结构之间的相似性。应该测试几个值,并且必须使用研究信息来为您的系统选择更好的值。-EL =弹性下键切断。作为-ef标志,必须与晶体学结构进行测试或比较。-EU =弹性上键切断。作为-ef标志,必须与晶体学结构进行测试或比较。-pf =位置约束。用于避免原子运动以平衡系统。应与-p标志一起使用,以选择要约束哪种珠子。骨干是最常见的选择。- 突变=突变一个残基到另一个残基。一般而言,马提尼岛在识别他的HSD:HSD时始终构成始终突变的马提尼岛有一些问题。
Martini 粗粒度力场 Martini 3 的最新重新参数化提高了该模型在预测分子动力学模拟中的分子堆积和相互作用方面的准确性。在这里,我们描述了如何在 Martini 3 框架内精确参数化小分子,并提供了一个经过验证的小分子模型数据库。我们特别关注脂肪族和芳香族环状结构的描述,这些结构在溶剂和药物等小分子或蛋白质和合成聚合物等大分子的构成块中普遍存在。在 Martini 3 中,环状结构由使用更高分辨率粗粒度颗粒(小颗粒和微小颗粒)的模型描述。因此,本数据库构成了校准新 Martini 3 小颗粒和微小颗粒尺寸的基石之一。这些模型表现出出色的分配行为和溶剂性能。还捕获了不同本体相之间的可混溶性趋势,从而完成了参数化过程中考虑的一组热力学性质。我们还展示了新的珠子尺寸如何能够很好地表示分子体积,从而转化为更好的结构特性,例如堆叠距离。我们进一步介绍了设计策略,以构建复杂度更高的小分子的 Martini 3 模型。
在上次修订后的摘要(Efetov&Tarmann 2024b)之后,该亚家族由五个部落组成:Thyrassiini,Pollanisini,Artonini,Cleleini和Procridini。迄今为止,核型仅以Pollanisini和Procridini而闻名。本文介绍了有关单倍体染色体数(n = 31)的信息,该信息首次确定了Artonini Tribe Artonini的代表。Artona Martini Efetov,1997年。先前有关“ Artonini”的信息(Efetov等人2015)指2004年的Pollanisus commoni tarmann,现在是Pollanisini部落的一种。关键词单倍体染色体数; Zygaenidae,Procridinae; Artonini; Artona Martini。引言在鳞翅目中有一些小组,即使在密切相关的物种中,染色体数也有极大的染色体数。在蝴蝶中,我们知道诸如1822年的AgrodiaetusHübner(Lycaenidae)和Erebia Dalman,1816年(Nymphalidae)等群体就是这种情况。以前,我们已经发现Zygaenidae,尤其是在procridinae的家族中也存在极大的染色体数量(Efetov 1998b,2001b,c,2004; Efetov&Tarmann 1999a; Efetov 199a; Efetov等人;2003,2004,2015,2025; Efetov&Parshkova 2003,2004,2005)。在上次修订了Procridinae(Efetov&Tarmann 2024b)之后,该亚家族由五个部落组成:Thyrassiini Efetov&Tarmann,2024年; Pollanisini Efetov&Tarmann,2024年; Artonini Tarmann,1994年; Cleleini Efetov&Tarmann,2024年;和Procridini Boisduval,1828年。2019; Efetov 1996a,b,1997a,b,1998a,1999,2001a,b,2006,2010; Efetov等。对Zygaenidae的核型以及遗传学,形态和生物学的进一步研究对于理解该家族中物种的进化关系以及物种的系统位置可能非常重要(Can等人2006,2011,2014,2018,2019a – c,2022,2023,2024a,b; efetov
1分子微生物学和结构生物化学(MMSB,UMR 5086),CNRS&Lyon大学,法国里昂,里昂; 2法国斯特拉斯堡·塞德克斯大学(UMR 7177 CNRS,umr 7177 CNRS) 3 Pharmcadd,商,商,韩国; 4计算生物医学,高级模拟研究所(IAS-5)和神经科学与医学研究所(INM-9),德国尤利希的ForschungszentrumJülichGmbh; 5德国亚兴的亚历大学数学,计算机科学与自然科学学院生物学系; 6 Zymvol Biomodeling,西班牙巴塞罗那; 7JülichSuperComputing Center(JSC),ForschungszentrumJülichGmbH,Jülich,德国; 8德国亚兴大学rWth亚兴大学医学院神经病学系和韩国灌木丛大学的Pukyong国立大学物理学系91分子微生物学和结构生物化学(MMSB,UMR 5086),CNRS&Lyon大学,法国里昂,里昂; 2法国斯特拉斯堡·塞德克斯大学(UMR 7177 CNRS,umr 7177 CNRS) 3 Pharmcadd,商,商,韩国; 4计算生物医学,高级模拟研究所(IAS-5)和神经科学与医学研究所(INM-9),德国尤利希的ForschungszentrumJülichGmbh; 5德国亚兴的亚历大学数学,计算机科学与自然科学学院生物学系; 6 Zymvol Biomodeling,西班牙巴塞罗那; 7JülichSuperComputing Center(JSC),ForschungszentrumJülichGmbH,Jülich,德国; 8德国亚兴大学rWth亚兴大学医学院神经病学系和韩国灌木丛大学的Pukyong国立大学物理学系9
任务主任卢西亚诺·马蒂尼(Luciano Martini)是意大利RSE的“传输和分销技术”部门的主任。他在研究和创新(R&I)活动方面拥有超过25年的经验,该活动涉及可再生能源网格集成,应用超导性和智能电网的经验。他是绿色动力未来任务的主任,这是Mission Innovation在其第二阶段启动的七个国际R&I任务之一,IEA TCP Isgan执行委员会主席,IEA TCP Isgan,国际智能电网行动网络,EERA JP的智能电网智能网格协调员和ETIP Snet的GB成员。马蒂尼为意大利环境和能源安全部提供了技术支持,在国际合作活动中拥有丰富的经验,并被一再招募为独立专家,以审查公共资助的R&I项目。
图1:粗粒模型和仿真设置。(A)全原子(AA)和Martini粗粒(CG)表示中的细胞色素P450和Petase酶。(b)四个单体的AA和CG Martini模型:苯乙烯,2-乙烯基吡啶(2VP),苯乙烯磺酸盐(SS)和Quaternized 2-乙烯基吡啶(Q2VP)。此处考虑的杂聚物是通过随机分布的这四个单体获得的。(c)基于聚苯乙烯的复合物的列表。用中性极性PS-2VP(i)测试带负电荷的(-15E)P450套装,并带正电荷(PS-Q2VP(II),PS-2VP-Q2VP(III))随机共聚合物;虽然用中性极性PS-2VP(i)研究了带正电的(+6E)PETASE共组合,并带负电荷(PSS(II),PSS-2VP(II))杂聚合物。F P和F C的分数通过更改极性(n极)的数量(n polar)的数量并分别在一个单一聚合物链中的单体总数(n TOT = 60)上,分别为电荷(n个带电)单体。
Andrea Timoncini、Federica Costantini、Elena Bernardi、Carla Martini、Francesco Mugnai、Francesco Paolo Mancuso、Enrico Sassoni、Francesca Ospitali、Cristina Chiavari,《对变化环境中户外青铜和大理石制品中细菌群落的洞察》,《整体环境科学》850 (2022) 157804,第 1-14 页。
I. Ge Sandols,Landra F,Chiantine B,School C,MC McAder,Focadad M,L,D’Asscene F,Bernacelas S,Make M,Valent M,Valent M,Valice M,Henein M.,Henein M.,Henein M. Heenein M. Hyperension Hypertension Hypertension Hypertension to to New Helet Heletannicalsic定义。Digents(巴塞尔)。2023; 13(16)。II。GES,Landra F,Chiantine B,Bonadiman L,MC Passer,Focardi M,Test F,Lisus M,Dievioe EE,Ee Martinium,L,L,L Bernal S,Valents,Macheeri M,Macheeri M,Macheri M,Macheri M,Henein MY。心肌工作指数hosplalized在专利晚期心力衰竭中。Digents(巴塞尔)。2024; 14(11)。iii。GE Sandols,Landra F,Lands L,L Martini C,Future C,Scake C,Dieviance EE,Barilli M,MC Passors,MC Pocudardi M,Berrazal S,Macheri M,Macheri M,Camel M,Camel M,Henein My。转换写作工作的引用移植心中的索引。心脏J成像甲基实践。2024; 2(3):Qyae091。iv。ges ge,Coarelli G,Cartoks A,Cartacks C,Salvatics A,Restacles A,Minasi V,Chapter,E,MC Pastoes,Zito A,Zito A,Zito A,Zito A,Macheri S,Machidels S,Machidels M,Machidels M,Machidels M,Machere S,Machere S,Machere S,Henein My,Henen My,Henen My,Henel My,Heneni My,Heneni My,Heneni My,Heneni My,Heneni My,Heneni My,Heneni My,Heneni My,Heneni My,Heneni My,Heneni My。长处和传教士协助。提交。